4.脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生色的物质,而其他氨基酸与茚三酮反应产生色的物质。
5.有三种氨基酸因含有共轭双键而有280nm处的紫外吸收,这三种氨基酸按吸收能力强弱依次为>>。
6.个以内的氨基酸残基所组成的肽称为寡肽。
16.一般来说,球状蛋白质的性氨基酸侧链位于分子内部,
性氨基酸侧链位于分子表面。
17.维持蛋白质一级结构的化学建是和。
18.维持蛋白质二级结构的化学建是。
19.维持蛋白质三、四级结构的化学建是、、
和。
22.当溶液中盐离子强度低时,增加盐浓度可导致蛋白质溶解,这种现象称为。
当盐浓度继续增加时,可使蛋白质沉淀,这种现象称。
26.蛋白质的二级结构有、、和四种稳定构象异构体。
32.根据蛋白质的组成成分可分为和
33.根据蛋白质的形状可分为和
四.判断题
3.自然界的蛋白质和多肽均有L-型氨基酸组成。
4.His和Arg是人体内的半必需氨基酸。
8.脯氨酸能参与α-螺旋,有时在螺旋末端出现,但决不在螺旋内部出现。
9.维持蛋白质三级结构最重要的作用力是氢键。
10.在具有四级结构的蛋白质中,每个亚基都有三级结构。
11.在水溶液中,蛋白质溶解度最小时的pH值通常就是它的等电点。
13.在多肽链分子中只有一种共价键即肽键。
16.溶液的pH值可以影响氨基酸的等电点。
20.某蛋白质在pH5.8时向阳极移动,则其等电点小于5.8。
21.变性的蛋白质不一定沉淀,沉淀的蛋白质也不一定变性。
22.SDS电泳、凝胶过滤和超速离心都可以测定蛋白质的分子量。
24.蛋白质和核酸中都含有较丰富的氮元素,但蛋白质根本不含有P,而核酸则含有大量的P。
五.名词解释
1.氨基酸的等电点(pI)2.蛋白质的一级结构
3.蛋白质的二级结构
5.蛋白质的三级结构
7.蛋白质的四级结构8.蛋白质的等电点
9.蛋白质的变性
11.盐析14.电泳
六.简答题
1.用下列哪种试剂最适合完成以下工作:
溴化氰、尿素、β-巯基乙醇、胰蛋白酶、过甲酸、丹磺酰氯(DNS-Cl)、6mol/L盐酸、茚三酮、苯异硫氰酸、胰凝乳蛋白酶。
(1)测定一段小肽的氨基酸序列。
(2)鉴定小于10-7g肽的N端氨基酸
(3)使没有二硫键的蛋白质可逆变性。
如有二硫键,应加何种试剂?
(4)水解由芳香族氨基酸羧基所形成的肽键。
(5)水解由Met羧基所形成的肽键
(6)水解由碱性氨基酸羧基所形成的肽键。
5.扼要解释为什么大多数球状蛋白质在溶液中具有下列性质。
(1)在低pH时沉淀。
(2)当离子强度从零逐渐增加时,其溶解度开始增加,然后下降,最后出现沉淀。
(3)在一定的离子强度下,达到等电点pH值时,表现出最小的溶解度。
(4)加热时沉淀。
(5)加入一种可和水混溶的非极性溶剂减小其介质的介电常数,从而导致溶解度的减少。
(6)如果加入一种非极性强的溶剂,使介电常数大大地下降会导致变性。
七.论述题
1.请你从蛋白质的一级结构与高级结构来阐述其含义、特点与化学键。
2.试论述蛋白质的分子结构与功能的关系
参考答案
一.单项选择题
1.A2.D3.C4.E5.D6.C7.B8.C9.B10.B11.D12.E13.C14.B15.B16.E17.E18.E19.B20.D21.D22.C23.D24.D25.D26.D27.C
二.多项选择题
1.ABD2.CD3.AC4.ABC5.ABCD6.AC7.AD8.ABCD
9.AC10.AD11.BD12.AD13.BC14.BC15.CD16.ABCD
三.填空题
1.赖氨酸(Lys)精氨酸(Arg)组胺酸(His)
谷氨酸(Glu)天冬氨酸(Asp)
2.
(1)酪氨酸(Tyr)
(2)苯丙氨酸(Phe)色氨酸(Trp)
(3)甲硫氨酸(Met)半胱氨酸(Cys)
(4)甘氨酸(Gly)脯氨酸(Pro)
(5)丝氨酸(Ser)苏氨酸(Thr)酪氨酸(Tyr)
3.兼性离子负正
4.黄蓝紫
5.色氨酸(Trp)酪氨酸(Tyr)苯丙氨酸(Phe)
6.10
7.催产素
8.上海生物化学研究所上海有机化学研究所北京大学
9.苄氧羰基(Cbz基)叔丁氧羰基(Boc基)
联苯异丙氧羰基(Bpoc)芴甲氧羰基(Fmoc)
10.赖氨酸(Lys)精氨酸(Arg)
11.色氨酸(Trp)酪氨酸(Tyr)苯丙氨酸(Phe)
12.甲硫氨酸(Met)
13.β-巯基乙醇
14.Cα-CCα-N
15.3.60.540.15
16.疏水性亲水性
17.肽键二硫键
18.氢键
19.疏水作用离子键(盐键)氢键范德华力(VanderWaals力)
20.吴宪
21.协同别构(变构)
22.盐溶盐析
23.16%
24.透析超滤法
25.蛋白质二级结构的基本单位相互聚集,形成有规律的二级结构的聚集体ααβαββββ
26.α-螺旋β-折叠β-转角无规卷曲
27.分子外面有水化膜带有电荷
28.长短大
29.密度形状
30.圆二色光谱(circulardichroism,CD)α-螺旋
31.X射线衍射法磁共振技术
32.单纯蛋白质结合蛋白质
33.球状蛋白质纤维状蛋白质
四.判断题
1.×2.×3.×4.√5.√6.√7.×8.√
9.×10.√11.√12.√13.×14.√15.×16.×
17.×18.×19.×20.√21.√22.√23.×24.×
五.名词解释
1.氨基酸的等电点(pI):
在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH叫氨基酸的等电点(pI)。
2.蛋白质的一级结构:
在蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸残基的排列顺序称为蛋白质的一级结构。
3.蛋白质的二级结构:
是指蛋白质分子中,某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
4.模体(或膜序):
在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在一级结构上总有其特征性的氨基酸序列,在空间结构上可形成特殊的构象,并发挥其特殊的功能,此结构被称为模体。
5.蛋白质的三级结构:
是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
6.结构域:
分子量大的蛋白质三级结构常可分割成1个和数个球状或纤维状的区域,折叠的较为紧密,各行其功能,称为结构域。
7.蛋白质的四级结构:
蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
8.蛋白质的等电点:
在某一pH的溶液中,蛋白质解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH叫蛋白质的等电点(pI)。
9.蛋白质的变性:
在某些理化因素的作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,称为蛋白质变性。
10.盐溶:
加入少量盐时,很易离解成带电离子,对稳定蛋白质所带的电荷有利,从而增加了蛋白质的溶解度。
11.盐析:
是将盐(中性)加入蛋白质溶液,使蛋白质表面电荷被中和以及水化膜被破坏,导致蛋白质在水溶液中的稳定性因素去除而沉淀。
12.透析:
利用半透膜原理把大分子蛋白质与小分子化合物分开的方法叫透析。
13.超滤法:
应用正压或离心力使蛋白质溶液透过有一定截留分子量的超滤膜,达到浓缩蛋白质溶液的目的,称为超滤法。
14.电泳:
蛋白质在高于或低于其pI的溶液中为带电的颗粒,由于不同的蛋白质带电的性质、数量、分子量和形状等的不同,在电场的作用下而达到分离各种蛋白质的技术,称为电泳。
15.等电聚焦电泳:
用一个连续而稳定的线性pH梯度的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳,从而根据蛋白质不同的pI而在电场中加以分离,这种电泳称为等电聚焦电泳。
六.简答题
1.
(1)苯异硫氰酸
(2)丹磺酰氯
(3)尿素,如有二硫键应加β-巯基乙醇使二硫键还原.
(4)胰凝乳蛋白酶(5)溴化氰(6)胰蛋白酶
5.
(1)在低pH时,羧基质子化,这样蛋白质分子带有大量的净电荷,分子内正电荷相斥使许多蛋白质变性,并随着蛋白质分子内部疏水基团向外暴露使蛋白质溶解度下降,因而产生沉淀。
(2)加入少量盐时,对稳定带电基团有利,增加了蛋白质的溶解度。
但是随着盐离子浓度的增加,盐离子夺取了与蛋白质结合的水分子,降低了蛋白质的水合程度,破坏了电荷和水化膜,使蛋白质沉淀。
(3)在等电点时,蛋白质分子之间的静电斥力最小,所以溶解度最小。
(4)加热时使蛋白质变性,蛋白质内部的疏水性基团被暴露,溶解度降低,从而引起蛋白质沉淀。
(5)非极性溶剂减小了表面极性基团的溶剂化作用,促使蛋白质分子之间形成氢键,从而取代了蛋白质分子与水之间的氢键。
(6)介电常数的下降对暴露在溶剂中的非极性基团有稳定作用,结果促使蛋白质肽链的展开而导致变性。
6.Ala的pI=(pK1+pK2)/2=(2.34+9.69)/2=6.02
Glu的pI=(pK1+pK2)/2=(2.19+4.25)/2=3.22
Lys的pI=(pK2+pK3)/2=(8.95+10.53)/2=9.74
20种氨基酸的平均分子量约为138,在蛋白质分子中以小分子量的氨基酸较多,平均分子量大约为128,又由于氨基酸在缩合时失去一分子水,因此氨基酸残基的最终平均分子量大约为110。
所以氨基酸残基数为:
220000/110=2000,已知α-螺旋构象中,每个氨基酸残基上升的距离为0.15nm,β-折叠中上升0.35nm。
设此多肽链中α-螺旋的氨基酸残基数为x,则β-折叠的氨基酸残基数为2000-x。
0.15x+0.35(2000-x)=5.06×10-5×107
0.15x+7000-0.35x=560
x=970
所以α-螺旋占的百分数为970/2000×100%=48.5%
8.相同点:
主要都含有C、H、O、N,都主要以C元素为骨架原子连接成的大分子。
不同点:
(1)蛋白质的含N量平均16%,而核酸则不均一。
(2)蛋白质一般不含P,而核酸含大量的P。
(3)蛋白质一般含S,而核酸不含S。
(4)有些蛋白质还含有少量的金属元素,而核酸不含金属元素。
七.论述题
1.
(1)一级结构:
概念:
在蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸残基的排列顺序称为蛋白质的一级结构。
特点:
①蛋白质种类及其繁多,其一级结构也各不相同;②一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础;③一级结构并不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。
化学建:
①肽键②二硫键
(2)蛋白质的二级结构:
概念:
是指蛋白质分子中,某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
特点:
①是一种局部的结构;②仅仅是肽单元之间相互作用所形成的空间结构,而不包含氨基酸侧链及其α-H原子所形成的构象,但氨基酸残基的侧链对二级结构的形成有影响;③二级结构有较多的类型,有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲,其中α-螺旋和β-折叠是二级结构的主要形式,β-转角通常有四个氨基酸残基组成,而无规卷曲则是指没有确定规律的或根本就没有规律的一些二级结构;④二级结构还可成为超二级结构,如αα形式、βαβ形式和βββ形式等结构。
化学建:
氢键
(3)蛋白质的三级结构:
概念:
是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
特点:
一条多肽链的三维空间结构。
化学建:
①疏水键②盐键③氢键④范德华力。
(4)蛋白质的四级结构:
概念:
蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
特点:
两条或两条以上多肽链所形成的三维空间构象。
化学建:
①疏水键②盐键③氢键④范德华力。
2.
(1)一级结构与功能的关系
①一级结构不同,生物学功能一般不同
不同蛋白质和多肽具有不同的功能,根本原因是它们的一级结构各异,有时仅微小的差异就表现出不同的生物学功能。
如催产素与加压素(缩宫素)都是由垂体后叶分泌的九肽激素,它们分子中仅两个氨基酸差异,但两者的生理功能却有根本区别。
②一级结构中“关键”部分相同,其功能也相同
如促肾上腺皮质激素其1~24肽段是活性所必需的关键部分。
③一级结构“关键”部分的变化,其生物活性也改变
多肽的结构与功能的研究表明,改变多肽中某些重要的氨基酸,常可改变其活性。
④一级结构的变化有时使生物学功能降低或丧失,从而可能发生疾病,或者连同这种蛋白一起在地球上消失。
(2)蛋白质空间结构与功能的关系
一级结构是空间结构的基础,而空间结构则是完成生物功能的直接基础,也就是说蛋白质分子特定的空间构象是表现其生物学功能或活性所必需的。
其构象如果遭到破坏,生物学功能则会立即丧失。
有实验表明即使一级结构不同,只要空间构象相同,则其功能也相同。
第二章核酸的结构与功能
一.单项选择题
2.RNA和DNA彻底水解后的产物是
A.核糖相同,部分碱基不同B.碱基相同,核糖不同
C.部分碱基不同,核糖不同D.碱基不同,核糖相同
E.以上都不是
3.对于tRNA来说下列哪一项是错误的
A.5'端是磷酸化的B.它们是单链C.含有甲基化的碱基
D.反密码环是完全相同的E.3'端碱基顺序是-CCA
4.绝大多数真核生物mRNA5'端有
A.polyAB.帽子结构C.起始密码
D.终止密码E.Pribnow盒
6.核酸中核苷酸之间的连接方式是
A.2',3'磷酸二酯键B.3',5'磷酸二酯键
C.2',5'-磷酸二酯键D.糖苷键E.氢键
8.Watson-CrickDNA分子结构模型
A.是一个三链结构B.DNA双股链的走向是反向平行的
C.碱基A和G配对D.碱基之间共价结合
E.磷酸戊糖主链位于DNA螺旋内侧
9.下列关于B-DNA双螺旋结构模型的叙述中哪一项是错误的
A.两条链方向相反B.两股链通过碱基之间的氢键相连维持稳定
C.为右手螺旋,每个螺旋为10个碱基对
D.嘌呤碱和嘧啶碱位于螺旋的外侧E.螺旋的直径为20A°
10.在DNA的双螺旋模型中
A.两条多核苷酸链完全相同
B.一条链是左手螺旋,另一条链是右手螺旋
C.A+G/C+T的比值为1
D.A+T/G+C的比值为1
E.两条链的碱基之间以共价键结合
11.下列关于核酸的叙述哪一项是错误的
A.碱基配对发生在嘧啶碱与嘌呤碱之间
B.鸟嘌呤与胞嘧啶之间的联系是由两对氢键形成的
C.DNA的两条多核苷酸链方向相反,一条为3'→5',另一条为5'→3'
D.DNA双螺旋链中,氢键连接的碱基对形成一种近似平面的结构
E.腺嘌呤与胸腺嘧啶之间的联系是由两对氢键形成的
12.核酸变性后可发生哪种效应
A.减色效应B.增色效应C.失去对紫外线的吸收能力
D.最大吸收峰波长发生转移E.溶液粘度增加
14.下列关于DNA变性的叙述哪一项是正确的
A.升高温度是DNA变性的唯一原因
B.DNA热变性是种渐进过程,无明显分界线
C.变性必定伴随有DNA分子中共价键的断裂
D.核酸变性是DNA的独有现象,RNA无此现象
E.凡引起DNA两股互补链间氢键断裂的因素,都可使其变性
15.下列关于DNA双螺旋结构的叙述哪一项是正确的
A.磷酸核糖在双螺旋外侧,碱基位于内侧
B.碱基平面与螺旋轴垂直
C.遵循碱基配对原则,但有摆动现象
D.碱基对平面与螺旋轴平行
E.核糖平面与螺旋轴垂直
19.在下列哪一种情况下,互补的两条DNA单链将会结合成DNA双链
A.变性B.退火C.加连接酶
D.加聚合酶E.以上都不是
21.胸腺嘧啶与尿嘧啶在分子结构上的差别在于
A.C2上有NH2,C2上有OBC5上有甲基,C5上无甲基
C.C4上有NH2,C4上有ODC5上有羟甲基,C5上无羟甲基
E.C1上有羟基
22.DNA的二级结构是
A.α-螺旋B.β-折叠C.β-转角
D.超螺旋结构E.双螺旋结构
23.决定tRNA携带氨基酸特异性的关键部位是
A.-XCCA3'末端B.TψC环C.DHU环
D.额外环E.反密码环
26.腺嘌呤与鸟嘌呤在分子结构上的差别是
A.C6上有羰基,C6上有氨基B.C6上有甲基,C6上无甲基
C.C6上有氨基,C6上有羰基D.C2上有氨基,C2上有羰基
E.C6上有氨基,C2上有氨基
27.组成核酸的基本结构单位是
A.戊糖和脱氧戊糖B.磷酸和戊糖C.含氨碱基
D.单核苷酸E.多聚核苷酸
28.将脱氧核苷酸彻底水解时产物中含有
A.脱氧核苷和核糖B.核糖、磷酸
C.D-核糖、磷酸、含氮碱基D.D-α-脱氧核糖、磷酸、尿嘧啶
E.D-α-脱氧核糖、磷酸、含氮碱基
29.核酸溶液的紫外吸收峰在波长多少nm处
A.260nmB.280nmC.230nmD.240nmE.220nm
30.DNA的碱基组成规律哪一项是错误的?
A.分子中A=C,G=TB.分子中A+G=C+T
C.人与兔DNA碱基组成可有不同
D.同一个体不同组织器官其DNA碱基组成相同
E.年龄、营养状态及环境的改变不影响DNA的碱基组成
32.DNA两链间氢键是
A.G-C间为两对B.G-C间为三对C.A-T间为三对
D.G-C不形成氢键E.A-C间为三对
33.tRNA的分子结构特征是
A.有密码环B.有反密码环和3'-端C-C-A
C.3'-端有多聚AD.5'-端有C-C-A
E.有反密码环和5'-端C-C-A
34.DNA变性是指
A.分子中3',5'-磷酸二酯键断裂B.核苷酸游离于溶液中
C.链间氢键断裂、双螺旋结构解开D.消光系数值降低
E.粘度增加
35.DNA双螺旋的每一螺距(以B-DNA为例)为
A.4.46nmB.4.5nmC.5.4nmD.3.4nmE.0.34nm
36.B-DNA的双螺旋结构中,螺旋每旋转一周包括
A.10个核苷酸B.11个核苷酸C.12个核苷酸
D.13个核苷酸E.14个核苷酸
三.填空题
1.在典型的DNA双螺旋结构中,由磷酸戊糖构成的主链位于双螺旋的,碱基位于双螺旋的。
2.tRNA均具有二级结构和的共同三级结构。
4.DNA的基本功能是和。
5.Tm值与DNA的和所含碱基中的成正比。
8.嘌呤和嘧啶环中均含有,因此在有较强吸收。
9.和核糖或脱氧核糖通过键形成核苷。
四.判断题
1.核苷酸由三种成分组成:
一个碱基、一个戊糖和一个或多个磷酸基。
3.核苷酸去除磷酸基称为核苷。
4.脱氧核糖核苷在它的戊糖环3’-位置上不带羟基。
5.RNA链5’末端核苷酸的3’-羟基与倒数第二个核苷酸的5’-羟基参与磷酸二酯键的形成。
6.DNA双螺旋一经变性,分子内氢键断裂,两股链则彼此分离。
10.鸟嘌呤和胞嘧啶之间联系是由两对氢键形成。
11.如果DNA双螺旋的一股链的一小段脱氧核苷酸顺序是pGpApCpCpTpG,那么这一段的对立股的互补顺序就是pCpTpGpGpApC。
12.如果来自物种A的DNA其Tm值比物种B的Tm值高,则物种A所含的A-T碱基对的比例比物种B的低。
13.在原核细胞和真核细胞中,染色体DNA都与组蛋白形成复合体。
五.名词解释
1.核苷2.核苷酸
3.核酸4.核酸的变性
5.DNA复性或退火6.DNA一级结构
9.核酸的杂交10.碱基对
六.简答题
3.试述DNA双螺旋(B结构)的要点?
稳定DNA双螺旋结构主要作用力是什么,它的生物学意义是什么。
4.RNA分哪几类?
各类RNA的结构特点和生物功能是什么。
5.什么是DNA的变性?
什么是DNA的复性?
它们与分子杂交的关系。
参考答案
一.单项选择题
1.B2.C3.D4.B5.B6.B7.E8.B9.D10.C11.B12.B13.C14.E15.A16.B17.D18.C19.B20.B21.B22.E23.E24.C25.A26.C27.D28.E29.A30.A31.C32.B33.B34.C35.D36.A37.A38.D
三.填空题
1.外侧内侧
2.三叶草型倒L型
3.5’-末端的帽3’-末端的多聚A尾
4.以基因的形式荷载遗传信息作为基因复制和转录的模板
5.分子大小G和C所占比例
6.两条链互补碱基间