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遗传密码子表

1.遗传密码子表

第一个核苷酸(5′端)

第二个核苷酸

第三个核苷酸(3′端)

U

C

A

G

U

苯丙氨酸

丝氨酸

酪氨酸

半胱氨酸

U

苯丙氨酸

丝氨酸

酪氨酸

半胱氨酸

C

亮氨酸

丝氨酸

终止码

终止码

A

亮氨酸

丝氨酸

终止码

色氨酸

G

C

亮氨酸

脯氨酸

组氨酸

精氨酸

U

亮氨酸

脯氨酸

组氨酸

精氨酸

C

亮氨酸

脯氨酸

谷氨酰胺

精氨酸

A

亮氨酸

脯氨酸

谷氨酰胺

精氨酸

G

A

异亮氨酸

苏氨酸

天冬酰胺

丝氨酸

U

异亮氨酸

苏氨酸

天冬酰胺

丝氨酸

C

异亮氨酸

苏氨酸

赖氨酸

精氨酸

A

蛋氨酸

苏氨酸

赖氨酸

精氨酸

G

G

缬氨酸

丙氨酸

天冬氨酸

甘氨酸

U

缬氨酸

丙氨酸

天冬氨酸

甘氨酸

C

缬氨酸

丙氨酸

谷氨酸

甘氨酸

A

缬氨酸

丙氨酸

谷氨酸

甘氨酸

G

AUG位于mRNA启动部位时为启动信号。

真核生物中此密码子代表蛋氨酸,原核生物中代表甲酰蛋氨酸。

2.氨基酸的特性

氨基酸名称

三字母缩写

单字母缩写

质量

侧链电离的pHa值

结构式

丙氨酸(alanine)

Ala

A

89.09

 

精氨酸(arginine)

Arg

R

174.2

12.48

 

天冬酰氨(asparagine)

Asn

N

132.1

 

天冬氨酸(asparticacid)

Asp

D

133.1

3.86

半胱氨酸(systeine)

Cys

C

121.12

 

谷氨酰胺(glutamine)

Gln

Q

146.15

 

谷氨酸(glutamicacid)

Glu

E

147.13

4.25

 

甘氨酸(glycine)

Gly

G

75.07

 

 

组氨酸(histidine)

His

H

155.16

6.0

 

异亮氨酸(isoleucine)

lle

I

131.17

 

亮氨酸(leucine)

Leu

L

131.17

 

赖氨酸(lycine)

Lys

K

146.19

 

甲硫氨酸(methionine)

Met

M

149.21

 

苯丙氨酸(phenylanaline)

Phe

P

165.19

 

脯氨酸(proline)

Pro

P

115.13

 

丝氨酸(serine)

Ser

S

105.06

 

苏氨酸(threonine)

Thr

T

119.12

 

色氨酸(tryptophan)

Trp

W

204.22

 

酪氨酸(tyrosine)

Tyr

Y

181.19

10.07

 

缬氨酸(valine)

Val

P

117.15

 

 

1.核苷三磷酸的物理常数

化合物

分子量

λmax(pH7.0)

1摩尔溶液(pH7.0)中λmax时的最大吸收值

OD280/OD260

ATP

507

259

15400

0.15

CTP

483

271

9000

0.97

GTP

523

253

13700

0.66

UTP

484

262

10000

0.38

dATP

494

259

15200

0.15

dCTP

467

271

9300

0.98

dGTP

507

253

13700

0.66

dTTP

482

267

9600

0.71

 

2.常用核酸的长度与分子量

核酸

核苷酸数

分子量

λDNA

48502(双链环状)

3.0×107

pBR322

4363(双链)

2.8×106

28SrRNA

4800

1.6×106

23SrRNA

3700

1.2×106

18SrRNA

1900

6.1×105

19SrRNA

1700

5.5×105

5SrRNA

120

3.6×104

tRNA(大肠杆菌)

75

2.5×104

 

3.常用核酸蛋白换算数据

  

(1)重量换算

  1μg=10-6g     1pg=10-12g

  1ng=10-9g     1fg=10-15g

  

(2)分光光度换算:

  1A260双链DNA=50μg/ml

  1A260单链DNA=30μg/ml

  1A260单链RNA=40μg/ml

  (3)DNA摩尔换算:

  1μg100bpDNA=1.52pmol=3.03pmol末端

  1μgpBR322DNA=0.36pmol

  1pmol1000bpDNA=0.66μg

  1pmolpBR322=2.8μg

  1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿

  1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿

  1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿

  (4)蛋白摩尔换算:

  100pmol分子量100,000蛋白质=10μg

  100pmol分子量50,000蛋白质=5μg

  100pmol分子量10,000蛋白质=1μg

  氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿

  (5)蛋白质/DNA换算:

  1kbDNA=333个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质

  10,000MW蛋白质=270bpDNA

  30,000MW蛋白质=810bpDNA

  50,000MW蛋白质=1.35kb

  100,000MW蛋白质=2.7kbDNA

 

4.常用蛋白质分子量标准参照物

(1)高分子量标准参照

(2)中分子量标准参照

(3)低分子量标准参照

肌球蛋白

分子量

磷酸化酶B

97,400

碳酸酐酶

31,00

肌球蛋白

212,000

牛血清白蛋白

66,200

大豆脻蛋白酶

21,500

β-半乳糖甘酶B

116,000

谷氨酶脱氢酶

55,000

抑制剂

 

磷酸化酶B

97,400

卵白蛋白

42,700

马心肌球蛋白

16,900

牛血清白蛋白

66,200

醛缩酶

40,000

溶菌酶

14,400

过氧化氢酶`

57,000

碳酸酐酶

31,000

肌球蛋白(F1)

8,100

醛缩酶

40,000

大豆脻蛋白酶

21,500

肌球蛋白(F2)

6,200

 

 

抑制剂

 

肌球蛋白(F3)

2,500

 

 

溶菌酶

14,400

 

 

 

5.常用蛋白质等电点参考值(单位:

pH)

蛋白质

等电点

蛋白质

等电点

鲑精蛋白[salmine]

12.1

α1-粘蛋白[α1-mucoprotein]

1.8-2.7

鲱精蛋白[clupeine]

12.1

卵黄类粘蛋白[vitellomucoid]

5.5

鲟精蛋白[sturline]

11.71

尿促性腺激素[urinarygonadotropin]

3.2-3.3

胸腺组蛋白[thymohistone]

10.8

溶菌酶[lysozyme]

11.0-11.2

珠蛋白(人)[globin(human)]

7.5

肌红蛋白[myoglobin]

6.99

卵白蛋白[ovalbuin]

4.71;4.59

血红蛋白(人)[hemoglobin(human)]

7.07

伴清蛋白[conalbumin]

6.8;7.1

血红蛋白(鸡)[hemoglobin(hen)]

7.23

血清白蛋白[serumalbumin]

4.7-4.9

血红蛋白(马)[hemoglobin(horse)]

6.92

肌清蛋白[myoalbumin]

3.5

血蓝蛋白[hemerythrin]

4.6-6.4

肌浆蛋白[myogenA]

6.3

蚯蚓血红蛋白[chlorocruorin]

5.6

β-乳球蛋白[β-lactoglobulin]

5.1-5.3

血绿蛋白[chlorocruorin]

4.3-4.5

卵黄蛋白[livetin]

4.8-5.0

无脊椎血红蛋白[erythrocruorins]

4.6-6.2

γ1—球蛋白(人)[γ1-globulin(human)]

5.8;6.6

细胞色素C[cytochromeC]

9.8-10.1

γ2—球蛋白(人)[γ2-globulin(human)]

7.3;8.2

视紫质[rhodopsin]

4.47-4.57

肌球蛋白A[myosinA]

5.2-5.5

促凝血酶原激酶[thromboplastin]

5.2

原肌球蛋白[myosinA]

5.1

α1-脂蛋白[α1-lipoprotein]

5.5

铁传递蛋白[siderophilin]

5.9

β1-脂蛋白[β1-lipoprotein]

5.4

胎球蛋白[fetuin]

3.4-3.5

β-卵黄脂磷蛋白[β-lipovitellin]

5.9

血纤蛋白原[fibrinogen]

5.5-5.8

芜菁黄花病毒[turnipyellowvvirus]

3.75

α-眼晶体蛋白[α-crystallin]

4.8

牛痘病毒[vacciniavirus]

5.3

β-眼晶体蛋白[β-crystallin]

6.0

生长激素[somatotropin]

6.85

胰岛素[insulin]

5.35

催乳激素[prolactin]

5.73

花生球蛋白[arachin]

5.1

胃蛋白酶[pepsin]

1.0左右

伴花生球蛋白[conarrachin]

3.9

糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶[chymotrypsin]

8.1

角蛋白类[keratins]

3.7-5.0

牛血清白蛋白[bovineserumalbumin]

4.9

还原角蛋白[keratein]

4.6-4.7

核糖核酸酶(牛胰)[ribonuclease或Rnase(bovinepancreas)]

7.8

胶原蛋白[collagen]

6.5-6.8

甲状腺球蛋白[thyroglobulin]

4.58

鱼胶[ichthyocol]

4.8-5.2

胸腺核组蛋白[thymonucleohistone]

4左右

白明胶[gelatin]

4.7-5.0

β-酷蛋白[β-casein]

4.5

α-酷蛋白[α-casein]

4.0-4.1

γ-酷蛋白[γ-casein]

5.8-6.0

α-卵清粘蛋白[α-ovomucoid]

3.83-4.41

 

 

 

 6.常用DNA分子量标准参照物

λDNA/HindⅢ

λDNA/EcoRⅠ

λ/HindⅢ+EcoRⅠ

pBR322/HaeⅢ

23130

21226

21227

587

123

9416

7421

5148

405

104

6557

5804

4973

504

89

4361

5643

4268

458

80

2322

4843

3530

434

64

2027

3530

2027

267

57

564

 

1904

234

51

125

 

1584

213

21

 

 

1375

192

18

 

 

974

184

11

 

 

831

124

7

 

 

564

 

 

 

 

125

 

 

 

7.核苷和脱氧核苷三磷酸的物化常数 

化合物

相对分子质量

最大吸收波长(pH7)×10-3

摩尔消光系数(pH7)

吸收比值(280/260)

碱基pKa

ATP

507.2

259

15.4

0.15

4.1

CTP

483.2

271

9.1

0.97

4.8

GTP

523.2

253

13.7

0.66

3.3,9.3

UTP

484.2

262

10.0

0.38

9.5

dATP

491.2

259

15.2

0.15

4.1

dCTP

467.2

271

9.1

0.97

4.8

dGTP

507.2

253

13.7

0.67

3.3,9.3

TTP

482.2

267

9.6

0.73

9.3

8.嘌呤、嘧啶碱基、核苷和核苷酸相对分子质量 

嘌呤、嘧啶碱基

核苷

核苷酸

H-型

Na2-型

腺嘌呤

135.11

腺苷

267.24

腺苷酸

347.22

391.22

鸟嘌呤

151.15

鸟苷

283.26

二磷酸腺苷

427.20

黄嘌呤

152.11

黄苷

284.24

三磷酸腺苷

507.20

次黄嘌呤

136.11

次黄苷

268.24

3’,5’-环腺苷酸

329.20

胞嘧啶

111.10

胞苷

243.23

鸟苷酸

363.24

407.22

尿嘧啶

112.09

尿苷

244.20

肌苷酸

348.22

胞腺嘧啶

126.11

脱氧腺苷

251.24

尿苷酸

323.21

367.31

脱氧鸟苷

267.24

脱氧腺苷酸

324.18

368.18

脱氧肌苷

252.24

脱氧鸟苷酸

331.22

脱氧胞苷

227.22

脱氧胞苷酸

347.23

脱氧尿苷

228.20

脱氧胞腺苷酸

307.20

脱氧胸腺苷

242.223

332.21

 

1.放射性核素衰变表

3H

35S

32P

125I

131I

时间(年)

剩余活性(%)

时间(年)

剩余活性(%)

时间(年)

剩余活性(%)

时间(年)

剩余活性(%)

时间(年)

剩余活性(%)

1

94.5

2

98.4

1

95.3

4

95.5

0.2

98.3

2

89.3

5

96.1

2

90.8

8

91.2

0.4

96.6

3

84.4

10

92.3

3

86.5

12

87.1

0.6

95.0

4

79.8

15

88.7

4

82.5

16

83.1

1.0

91.8

5

75.4

20

85.3

5

78.5

20

79.4

1.6

87.2

6

71.3

25

82.0

6

74.8

24

75.8

2.3

81.2

7

67.4

31

78.1

7

71.2

28

72.4

3.1

76.7

8

63.7

37

74.5

8

67.8

32

69.1

4.0

71.0

9

60.2

43

71.0

9

64.7

36

66.0

5.0

65.2

10

56.9

50

67.0

10

61.2

40

63.0

6.1

59.3

11

53.8

57

63.6

11

58.7

44

60.2

7.3

53.4

12

50.9

65

59.6

12

55.9

48

57.4

8.1

50.0

12.3

50.0

73

56.0

13

53.2

52

54.8

 

 

 

 

81

52.5

14

50.7

56

52.4

 

 

 

 

87.1

50.0

14.3

50.0

60

50.0

 

 

2.放射性测定单位

单位

定义

换算

吸收放射线剂量(拉得rad)

100尔格/克(电离辐射传给单位质量物质的能量)

0.87rad=1r

伦琴(r)

使1克空气产生1.6×1012离子对的X或γ-射线的照射剂量

r/0.87=1rad

居里(Ci)

每秒放射性衰变3.7×1010个原子的量

1Ci=103mCi=106μCi

毫居(mCi)

千分之一居里

1mCi=10-3Ci=103μCi

微居(μCi)

百万分之一居里(每分钟衰变2.2×106次)

1μCi=10-6Ci=10-3MCi

伯克莱尔(Bq)

每秒衰变1个原子的量

1Bq=3.7×10-10Ci

千伯克莱尔(kBq)

 

1kBq=103Bq

百万伯克莱尔(MBq)

 

1MBq=106Bq

兆伯克莱尔(GBq)

 

1GBq=109Bq

每分钟衰变数(dpm)

每分钟衰变的原子数

2.2×106dpm=1μCi

每分钟计数(cpm)

测量仪测出每分钟β粒子数

Cpm=dpm×计数器效率

 

常用的缓冲液

[作者:

佚名转贴自:

本站原创更新时间:

2004-3-25编辑:

supi]

常用缓冲溶液的配制方法

测序凝胶加样缓冲液

常用的电泳缓冲液

2×SDS凝胶加样缓冲液

凝胶加样缓冲液

各种pH值的Tris缓冲液

常用缓冲液的pKa值

温度对常用缓冲液pH的影响

标准缓冲液pH值与温度对照表

常用作缓冲剂的酸解离常数

 

 

 1.常用缓冲溶液的配制方法

(1)甘氨酸–盐酸缓冲液(0.05mol/L)

X毫升0.2mol/L甘氨酸+Y毫升0.2mol/LHCI,再加水稀释至200毫升

pH

X

Y

pH

X

Y

2.0

50

44.0

3.0

50

11.4

2.4

50

32.4

3.2

50

8.2

2.6

50

24.2

3.4

50

6.4

2.8

50

16.8

3.6

50

5.0

甘氨酸分子量=75.07,0.2mol/L甘氨酸溶液含15.01克/升。

(2)邻苯二甲酸–盐酸缓冲液(0.05mol/L)

X毫升0.2mol/L邻苯二甲酸氢钾+0.2mol/LHCl,再加水稀释到20毫升

pH(20℃)

X

Y

pH(20℃)

X

Y

2.2

5

4.070

3.2

5

1.470

2.4

5

3.960

3.4

5

0.990

2.6

5

3.295

3.6

5

0.597

2.8

5

2.642

3.8

5

0.263

3.0

5

2.022

 

 

 

邻苯二甲酸氢钾分子量=204.23,0.2mol/L邻苯二甲酸氢溶液含40.85克/升

(3)磷酸氢二钠–柠檬酸缓冲液

pH

0.2mol/LNa2HPO4

(毫升)

0.1mol/L

柠檬酸

(毫升)

pH

0.2mol/LNa2HPO4

(毫升)

0.1mol/L

柠檬酸

(毫升)

2.2

0.40

10.60

5.2

10.72

9.28

2.4

1.24

18.76

5.4

11.15

8.85

2.6

2.18

17.82

5.6

11.60

8.40

2.8

3.17

16.83

5.8

12.09

7.91

3.0

4.11

15.89

6.0

12.63

7.37

3.2

4.94

15.06

6.2

13.22

6.78

3.4

5.70

14.30

6.4

13.85

6.15

3.6

6.44

13.56

6.6

14.55

5.45

3.8

7.10

12.90

6.8

15.45

4.55

4.0

7.71

12.29

7.0

16.47

3.53

4.2

8.28

11.72

7.2

17.39

2.61

4.4

8.82

11.18

7.4

18.17

1.83

4.6

9.35

10.65

7.6

18.73

1.27

4.8

9.86

10.14

7.8

19.15

0.85

5.0

10.30

9.70

8.0

19.45

0.55

Na2HPO4分子量=14.98,0.2mol/L溶液为28.40克/升。

Na2HPO4-2H2O分子量=178.05,0.2mol/L溶液含35.01克/升。

C4H2O7·H2O分子量=210.14,0.1mol/L溶液为21.01克/升。

(4)柠檬酸–氢氧化钠-盐酸缓冲液

pH

钠离子浓度

(mol/L)

柠檬酸(克)

C6H8O7·H2O

氢氧化钠(克)

NaOH97%

盐酸(毫升)

HCl(浓)

最终体积(升)①

2.2

0.20

210

84

160

10

3.1

0.20

210

83

116

10

3.3

0.20

210

83

106

10

4.3

0.20

210

83

45

10

5.3

0.35

245

144

68

10

5.8

0.45

285

186

105

10

6.5

0.38

266

156

126

10

①①使用时可以每升中加入1克克酚,若最后pH值有变化,再用少量50%氢氧化钠溶液或浓盐酸调节,冰箱保存。

 

(5)柠檬酸–柠檬酸钠缓冲液(0.1mol/L)

pH

0.10.1mol/L

柠檬酸

(毫升)

0.10.1mol/L

柠檬酸钠

(毫升)

pH

0.10.1mol/L

柠檬酸

(毫升)

0.10.1mol/L

柠檬酸钠

(毫升)

3.0

18.6

1.4

5.0

8.2

11.8

3.2

17.2

2.8

5.2

7.3

12.7

3.4

16.0

4.0

5.4

6.4

13.6

3.6

14.9

5.1

5.6

5.5

14.5

3.8

14.0

6.0

5.8

4.7

15.3

4.0

13.1

6.9

6.0

3.8

16.2

4.2

12.3

7.7

6.2

2.8

17.2

4.4

11.4

8.

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