生物信息学蛋白库查询doc.docx

生物信息学蛋白库查询doc.docx

《生物信息学蛋白库查询doc.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物信息学蛋白库查询doc.docx（10页珍藏版）》请在冰豆网上搜索。

生物信息学蛋白库查询doc

1、对该段序列进行同源性搜索

首先进入www.espasy.ory点击进入ResourcesA..Z点击

如下图

点击BLAST输入蛋白质序列

搜索得到同源性分析如下3图示：

Score分值越大，相似性越高。

E值越小，匹配度越好。

所以蛋白序列应与p04626相似性高匹配度好

二、对该段序列进行基本性质分析：

蛋白质的氨基酸组成、等电点、相对分子质量、亲水性、疏水性、消光系数、信号肽、跨膜区域等。

氨基酸组成

等电点、相对分子质量

消光系数

亲水性、疏水性

打开http:

//web.expasy.org/protscale

如下图（网速慢，读图等好久都读不出来）

TMPred跨膜区结构预测，打开http:

//www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html输入已知序列

三、分析该段序列的MOTIF

四、对该段序列进行三维结构的分析

选择符合条件的一个同源建模

5、分析该序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白，以及与疾病的相关性。

蛋白质的修饰后翻译

蛋白质的相互作用

所参与的代谢途径，相关疾病