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生物信息学蛋白库查询doc.docx

生物信息学蛋白库查询doc1、对该段序列进行同源性搜索 首先进入www.espasy.ory 点击进入Resources A.Z 点击如下图点击BLAST 输入蛋白质序列 搜索得到同源性分析 如下3图示:Score分值越大,相似性越高。E值越小,匹配度越好。所以蛋白序列应与p04626相似性高匹配度好二、对该段序列进行基本性质分析: 蛋白质的氨基酸组成、 等电点、相对分子质量、亲水性、 疏水性、消光系数、信号肽、跨膜区域等。氨基酸组成等电点、相对分子质量消光系数亲水性、疏水性打开http:/web.expasy.org/protscale如下图(网速慢,读图等好久都读不出来)TMPred 跨膜区结构预测,打开http:/www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html输入已知序列三、分析该段序列的MOTIF四、对该段序列进行三维结构的分析选择符合条件的一个同源建模 5、分析该序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白,以及与疾病的相关性。蛋白质的修饰后翻译蛋白质的相互作用所参与的代谢途径,相关疾病

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