1、病毒学选择题笔记病毒学选择题笔记一、1.科赫法则科赫法则(Koch postulates)又称证病律,通常是用来确定侵染性病害病原物的操作程序包括:1 在每一病例中都出现相同的微生物,且在健康者体内不存在;2 要从寄主分离出这样的微生物并在培养基中得到纯培养(pure culture);3 用这种微生物的纯培养接种健康而敏感的寄主,同样的疾病会重复发生;4 从试验发病的寄主中能再度分离培养出这种微生物来。如果进行了上述4个步骤,并得到确实的证明,就可以确认该生物即为该病害的病原物。2.1)病毒微粒一般光镜下看不见2)爱德华.詹纳最早给一个病人接种疫苗对抗天花在1976年5.14 他只是给一个六
2、岁少年接种疫苗但是不是为了治病3)路易斯.巴斯德1890年发明了 “virus” 这个词4)迪米特里.伊万诺夫斯基表明病毒可以通过足够小的滤网只留下细菌(chamberland)5)可以感染细菌的病毒叫做噬菌体 。(bacteriophage)噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。3.研究病毒的免疫学手段1) 补体结合实验:利用抗原抗体复合物同补体结合,把含有已知浓度的补体反应液中的补体消耗掉使浓度减低的现象,以检出抗原或抗体的试验。比如梅毒病毒2)northern blot 检测R
3、NA3)southern blot 检测DNA4)western blot5)PCR4.1)超过1000000倍分辨率的电子显微镜可以直接观察到病毒2)X衍射观察纯化的病毒晶体结构可以被用来判断它们的微粒结构3)大部分的病毒微粒结构已经被发现了4)病毒不能自然发生5)NMR(核磁共振)的限制决定了只有有限的小分子可以被检测-甚至比最小的病毒颗粒还要小很多51)病毒是亚微观的、专性细胞内寄生。这种简单的定义包括了其他各种微生物2)病毒颗粒不能生长或经历分离3)病毒缺乏遗传信息能够编码提供新陈代谢必须能量的装备4)病毒能够编码核糖体的遗传信息5)prions(阮病毒)是一种由简单的蛋白组成的感染性
4、因子二、1.下面哪些病毒含有脂质包膜orthomyxoviruses 正粘病毒正粘病毒是指对人或某些动物红细胞表面的粘蛋白有亲和性的病毒,其实正粘病毒只有流行性感冒病毒一个种。流感病毒囊膜由内向外,可分为内膜蛋白、类脂和糖蛋白三层。糖蛋白层由两种糖蛋白刺突组成,一种是神经氨酸酶(NeuraminidaseNA),一种是血凝素(HemagglutininHA)。Paramyxoviruses副粘病毒 正、副粘病毒的分别以其核酸是否分节段为标准,分节段者为正粘病毒,不分节段者为副粘病毒;本科病毒可分为副粘病毒属、麻疹病毒属和肺病毒属。picornaviruses小核糖核酸病毒 病毒颗粒为直径253
5、0毫微米的正二十面体。其特征之一是不能清楚地看到壳微体。没有包膜,核酸为单链RNA,分子量为2106。分为肠道病毒群、心病毒群、鼻病毒群和其他Rhabdoviruses杆状病毒杆状病毒是一类具有囊膜包裹的双链环状DNA病毒,其基因组大小为80-180 kb,在自然界中以节肢动物作为专一性宿主进行感染和传播。杆状病毒区别于其他病毒的一个特点是其具有两种不同的病毒粒子形态:一种为出芽型的病毒粒子(budded virus, BV),主要介导细胞与细胞之间的系统感染,入侵细胞是通过受体介导的内吞作用;另一种为包埋型的病毒粒子Tobamoviruses烟草花叶病毒病毒质粒是长300纳米、直径15纳米的
6、棒状体,有一条分子量为2106道尔顿的单链(+)RNA。核酸被2130个分子量为17530道尔顿的蛋白质亚基所包裹。2.1)正粘病毒是多形的(多晶的),有包膜的病毒2)副粘病毒是多形的(多晶的),有包膜的病毒3)小核糖核酸病毒有二十面体对称结构4)杆状病毒是螺旋状的,有囊膜的病毒5)烟草花叶病毒是螺旋的,无囊膜的病毒3.1)病毒囊膜的脂质组成与宿主细胞的相似2)病毒囊膜在通过宿主细胞膜出芽的时候获得3)出芽只能从宿主细胞表面发生有的病毒在细胞表面膜出芽(粘液病毒、副粘液病毒等);有的病毒在细胞表面膜和液泡膜出芽(披盖病毒等);也有的在内侧核膜出芽(疱疹病毒)。4)一些包膜病毒有下面的二十面体对
7、称5)一些包膜病毒有下面的螺旋形对称4.icosahedron1)一个二十面体是由60个三角形面围成的立体形状。2)一个二十面体有一个两倍旋转对称轴通过每个边的中心3)一个二十面体有一个三倍旋转对称轴通过每个面的中心4)一个二十面体有一个五倍旋转对称轴通过每个角的中心5)所有的二十面体病毒衣壳只有60个亚基。5.有关于基因包装1)是病毒核酸特有的但是病毒会犯错2)需要宿主细胞蛋白的参与3)需要病毒基因组内的特别的核酸序列的参与,虽然基因的第二结构有时候也很重要4)需要正电荷消除病毒基因表面的负电荷5)TMV(烟草花叶病毒)中是从基因组的OAS序列开始61) 基质蛋白是病毒内部蛋白连接内部的核衣
8、壳组装到外部的囊膜2) 基质蛋白在病毒颗粒中一般非常丰富3) 外部的糖蛋白一般是囊膜病毒的主要抗原4) 外部糖蛋白一般是病毒囊膜病毒的黏附蛋白5) The Influenza virus 流行性感冒的M2多肽是一种跨膜蛋白7.helix1)一个螺旋对称可以由重复堆叠成分与另一个的固定联系构成2)一个螺旋对称可以被两种参数定义:Amplitude(振幅)和pitch(倾斜度)3)一个螺旋对称可以被一个数学公式定义:T=f2P4)螺旋结构的振幅是它的直径5)一些螺旋病毒颗粒的长度取决于他们有多少核酸。8.1)所有的植物病毒都有二十面体对称结构2)有不知道的动物的螺旋形病毒3)棒状病毒有螺旋形核衣壳
9、4)噬菌体M13是一种二十面体病毒5)噬菌体M13需要大肠杆菌表面的F鞭毛才能感染9.1)poxvirus(痘病毒)颗粒很复杂难以用简单结构定义2)小核糖核酸病毒包含超过100中不同的蛋白3)无尾的噬菌体从宿主细胞中通过出芽释放4)无尾的噬菌体有不同的装配通路从病毒外壳的头和尾部5)reovirus(呼吸道肠道病毒)由一对蛋白壳组成10.1.核酸对于物理性损害或是化学修饰比较敏感比如用机械力量剪除2.病毒外壳上的蛋白亚基非常丰富。存在于欸一个复制颗粒上3导致病毒颗粒装配的动力包括hydrophobic(疏水相互作用)和静电效应4.病毒衣壳上的蛋白亚基总是被(covalent)共价键结合在一起5
10、.除了保护基因以防物理、化学或是酶的破坏,外面的壳也保护以防结合到宿主细胞上的受体上去。三、1.1)herpesvirus(疱疹病毒)的突变频率很低,与细胞内基因组相近2)retrovirus(逆转录病毒)的突变频率很高因为逆转录过程的低保真率3)每一个新的HIV前病毒形成包含至少一个新的突变4)温度敏感突变趋向于非常稳固很少回复到原来的表型5)温度敏感突变总是会导致蛋白的错义突变2.1)缺失突变对于分派结构功能关系给病毒基因十分有用,因为它们很容易被物理分析标记2)缺失突变容易回复成野生型3)comlementation互补作用可以是不对称的也可以是对称的4)表型混合是个体的子代病毒从混合反
11、应包括基因来源于母代病毒5)只有痘病毒有完全双倍的基因(每个基因的等位基因)3.herpesvius(疱疹病毒)1)从105kbp到235kbp大小不同2)有线性、双链DNA3)疱疹单形病毒HSV,每个基因是从自己的启动子表达的4)HSV基因大约52KBP长5)HSV基因包涵包装基因用重叠阅读框4.plus-sense 正链 RNA病毒基因1)最长可以到30kbp2)总是在5端修饰,用methylated甲基化帽或是共价连接蛋白3)总是在3polyadenylated(多)聚腺苷酸化4)总是作为单链多聚蛋白表达5)不会有基因表达中的剪切5.1)parvovirus(细小病毒)基因包含线性单链D
12、NA2)细小病毒包含(palindromic)回文结构大概115nt需要复制3)polymavirus(多瘤病毒)基因大概有50kbp大小包含超过100基因4)在病毒颗粒里,polymavirus(多瘤病毒)DNA假定为一种超螺旋结构与细胞内组蛋白有关5)polymavirus(多瘤病毒)基因包含重叠阅读框在DNA双链上均有6.retrovirus(逆转录病毒)1)逆转录也能被hepadnaviridae肝病毒科和caulimoviruses花椰菜病毒科 表达2)逆转录病毒都是RNA病毒基因中基因是被细胞内转录机器表达的3)都是只有正链RNA病毒基因不直接被作为mRNA在感染后4)有低突变率,
13、因为高保真性5)有高重组率,因为逆转录7.minus-sense负链 RNA病毒基因组1)总是分段的(segmented)2)也许有ambisense 双义阅读策略3)总是在5端盖帽4)总是在3有聚腺苷酸链5)总是circular圆形的8.1)病毒基因大小从300核苷酸到大约300k对不等2)病毒的基因密码子一定与宿主本身的相似这样它才能被宿主细胞生化机制所识别3)病毒基因包含正链RNA的是有感染性的当纯化的vRNA被吸附到细胞上在任何病毒蛋白存在时(除了逆转录病毒)4)逆转录基因使得负链RNA病毒基因的操作成为可能5)细胞的感染是因为病毒核酸单独被称为转导9.1)病毒基因的分隔导致链由于剪切
14、造成的破坏的可能性2)hepadnavirus肝病毒科有大约3.5kbp的小基因组3)the cauliflower mosaic virus花椰菜镶嵌病毒(CaMV)基因包含有缺口环状双链DNA分子4)花椰菜镶嵌病毒(CaMV)基因被逆转录产生5)病毒超家族的存在证明一些病毒由共同的祖上10.1)superinfection重复感染是指的单个细胞被一个非常大的病毒外壳感染2)在两个基因标记中重结合的可能性与他们之间距离有关3)有分隔基因的病毒中,reassortment重配 组 总是equivalent等价于个体基因片段4)病毒基因总体包含分子变种混合物被称为变异株即准种5)位点专一的分子生
15、化标记法被用来诱变病毒基因四、1. 1)病毒受体分子总是蛋白质2) 大部分病毒不止一个受体分子3)尚未发现一种植物病毒使用一个细胞受体4)sialic acid唾液酸 是 influenze流感病毒受体5)细胞表面受体的表达是决定病毒趋向的重要因素2.病毒颗粒穿透pentrate 细胞的机制1)translocation 染色体易位2)transfection 转染 (不用病毒将DNA转入细菌内)3)exocytosis 胞吐作用4)endocytosis 胞吞作用5)fusion 融合3. single burst单胞裂解实验1)single burst单胞裂解实验是1989年ellis和d
16、elbruck做得2)单胞裂解实验证明新的病毒颗粒来自细胞内装配从原来的组成中3)单胞裂解实验证明病毒复制的本质4)单胞裂解实验证明基因复制的方式5)hershey-chase实验证明核酸是病毒的基因组成4.1)adenoviruses腺病毒 编码他们自己的DNA聚合酶2)poxvirus 痘病毒 编码自己的DNA聚合酶不需要细胞的酶用来基因复制3)reovirus呼肠孤病毒 被颗粒中的病毒酶转录4)所有的RNA病毒基因组都是在宿主细胞核内复制5)呼肠孤病毒 基因被细胞的RNA聚合酶转录5.病毒复制包括以下几个阶段phase1)intiation of infection感染开始2)病毒基因组
17、复制3)病毒基因表达4)病毒基因分离 cleavage5)成熟的病毒从被感染的细胞中释放6.1)有8种病毒基因结构2)class 1有双链DNA基因3)class 2有单链DNA基因4)class7病毒(逆转录病毒)有正链 单链 RNA基因 (复制过程有DNA中间体)5)class 8病毒有正链 单链 DNA基因 (复制过程有RNA中间体)7.1)突变总是包含病毒颗粒结构的改变2)突变总是包含 protease cleavage蛋白酶切割3)病毒囊膜获得脂质膜从细胞膜出芽的时候4)病毒囊膜蛋白在出芽的时候获得5)病毒囊膜蛋白 包含 释放当吸附在宿主细胞上时8.病毒在感染细胞的细胞质中复制基因1
18、)Picornaviruses,e.g.Polio virus. 小核糖核酸病毒-脊髓灰质炎病毒 2) Poxviruses,e.g.vaccinia virus. 痘病毒-牛痘病毒3 )Rhabdoviruses,e.g.Rabies virus. 逆转录病毒-狂犬病毒4)paramyxoviruses.e.g.Respiratory syncytia virus. 副粘病毒-呼吸道合胞病毒5)orthornyxoviruses,e.g.Influenza virua. 正粘病毒-流感病毒9.1)病毒渗透进入细胞是一个需要能量的过程2)influenza流感病毒 haemagglutinin
19、血凝素 是病毒融合蛋白3)incoating病毒脱壳 只发生在宿主细胞的核内4)病毒脱壳的产物总是核酸复合物和病毒蛋白5)核蛋白与病毒基因相连 负责细胞渗透10.病毒在感染细胞核内基因复制1)疱疹病毒 爱普斯坦一巴尔病毒。2)细小病毒 B193)正粘病毒 流感病毒4)轮状病毒 A家族5)冠状病毒 OC43五1. 病毒在进化中通过什么已经中和了他们的基因缺陷1)强大的积极cis-顺式和trans-反式作用信号促进表达2)强大的顺式作用负信号抑制基因表达3)高度压缩机因重合阅读框是常见的4)控制信号频繁嵌套在其他基因里5)许多策略设计来创造不同的多肽从单个mRNA中2.正链RNA基因病毒1)不需要
20、细胞机制来控制基因表达2)总是作为亚基因RNA表达3)总是翻译成单条长多肽4)总是聚腺苷酸化5)可以创造多种频率的多肽通过机制比如可以选择的聚蛋白体的解离和多种翻译效率3.1)不分段的病毒负链基因创造monocistronic单顺反子mRNA2)负链病毒总是有一个病毒特有的翻译/复制机制在病毒核衣壳中3)不分段的负链病毒翻译的产物常常是一个单条长聚蛋白4)逆转录病毒都是RNA病毒基因是通过细胞RNA聚合酶转录的5)肝病毒科和花椰菜病毒基因包含很多重叠阅读框4.1)papovaviruses乳头瘤状病毒 非常依赖于细胞的基因表达机制2) herpesvirus疱疹病毒 有三种mRNA:Immed
21、iate-Early(IE) mRNA;Early mRNAs;Late mRNAs.3)geminivirus 双粒病毒组 基因复制和表达在细胞核中因为他们需要宿主细胞机制4)逆转录病毒转录发生在病毒核心颗粒中5)分段病毒基因总是转录产生polycistronic 多顺反子的mRNAs5.噬菌体1)可以在lytic裂解与lysogenic溶源的生长周期中交替2)N蛋白作为消极转录调控机制3)N蛋白存在时,RNA聚合酶停止nut位点4)cI受体蛋白结合到OR和OL上5)溶源是通过cI 转录自调控维持6.1)核糖体移框frameshift 使得病毒可以从一个mRNA产生1种蛋白2)核糖体移框 使
22、得病毒可以从一个mRNA产生不同蛋白3)RNA假结pseudoknots 是反式作用蛋白比如HIVtat蛋白产生的4)RNA假结增加了核糖体移框的频率5)termination condon终止密码子的抑制使得一些病毒可以产生多个蛋白从一个polycistronic 多顺反子的mRNA7.1)SV40 大 T抗原结合到病毒的复制起点上2) SV40 大 T抗原 可以一直病毒早期基因表达3)SV40 大 T抗原 促进病毒mRNA 从核内到细胞质的输出4)HTLV tax蛋白结合到病毒mRNA上5)HIV tat蛋白结合到HIV mRNA TAR序列上8.1)eukaryotic真核细胞基因的转录
23、产生单顺反子的mRNA,每个转录从自己的启动子开始2)真核中基因表达转录后的调控是通过剪辑hnRNA和mRNA从核内到细胞质不同的输出完成3)真核mRNA翻译有着不同的效率主要是取决于AUG周围的序列被核糖体识别的效率4)真核mRNA的稳定性取决于他们延长的速度5)转录增强子作用的机制analogous 类似于翻译增强子9.1)病毒复制的过程取决于基因表达的控制2)转录启动子是顺式作用序列在他们控制的基因下游3)转录因子是反式作用蛋白结合到特定的序列存在于细胞的任何地方4)细菌operons操纵子转录产物是多顺反子的mRNA5)基因表达在细菌中是在转录和后来的(转录后)调控的10.1)没有RN
24、A病毒基因会剪切得到2)HTLV rex蛋白促进病毒结构蛋白mRNA从核中的输出3)abbreviation缩写词(IRES)代表 internal ribosomal entry site内部核糖体结合位点4)所有正链RNA病毒包含IRES元件5)所有真核细胞mRNA包含IRES元件六、1.1)subunit vaccine亚单位疫苗总是最有效率的至少昂贵的病毒疫苗2)乙型肝炎病毒疫苗现在已经用来通过基因工程3)不活跃的比刚度疫苗有时候不如活力疫苗有效率因为他们不能刺激mucosal黏膜和细胞免疫4)主要成功的病毒疫苗现在都是建立在attenuated 减毒病毒上5)逆转录病毒现在成功的作为
25、载体用作基因治疗2.1)黏膜膜是病毒结合到身体组织上的有利途径2)coughs咳嗽和sneeze打喷嚏传播疾病3)自然环境是病毒感染的重要屏障4)原始定位病毒感染是频繁跟随者系统的第二次感染5)病毒的传播到nervous system神经系统从来不会被viraemia原始病毒血症领先3. interferon干扰素1)interferon干扰素产品最早被chick chorioallantoic鸡胚绒毛尿囊膜上发现于19572)生化纯化干扰素从自然资源中是困难的因为干扰素非常有效所以不是很丰富3)有三种干扰素:alpha beta gamma4)干扰素只能被fibroblast成纤维细胞形成5
26、)双链DNA和RNA是干扰素形成的有效诱导物4.1)humoral immunity体液免疫反应的主要作用在病毒感染中是最终对于病毒的清除2)病毒颗粒直接被抗体识别可以被白细胞吞噬3)全部的,细胞免疫是比体液免疫更重要在控制病毒感染方面4)NK自然杀伤细胞是最早的细胞介导免疫机制控制病毒感染5)T细胞毒素CTL不是MHC限制性的5.病毒逃避免疫系统1)antigenic variation 抗原多样化2)MHC I 基因表达下的调控3)可接触的分子在免疫识别下的调控4)感染免疫功能不全immunocompromised 的区域5)感染皮肤细胞6.1)失败的感染细胞没有pathological
27、consequence 病理结果2)在急性感染中,很多病毒的复制发生在症状发生前3)在持久的感染中,病毒调节复制和致病性组织杀伤细胞4)慢性感染最后导致defective interfering缺损干扰(D.I)颗粒5)latent潜在的感染时典型的基因高度表达和复制7.1)运动蛋白允许植物病毒传送从一个宿主到另一个宿主中2)对病毒感染植物的损害发生在细胞necrosis坏死、hypoplasia发育不全、hyperplastic增生3)hypersensitive高度敏感反应在植物中机制与动物的反应analogous类似4)高度敏感在植物中导致限制系统感染发生5)病毒限制植物被基因操纵创造导
28、致病毒基因的内源性表达8.1)所有的干扰素有相似的抗干扰能力,但是作为细胞调控作用不同2)2,5-oligo A 使RNAseL活跃,消化所有的RNAs3)PKR蛋白激酶eIF2-alpha是翻译开始所必须的4)干扰素被用来治疗慢性病毒性肝炎5)没有病毒有包装机器使他们能够抵抗干扰素的作用9.1)治疗病毒感染用药物花费有效对于疫苗2) 任何病毒复制的类型可以作为antiviral抗病毒药物的潜在靶标3)大部分抗病毒药物使用时核苷类或核苷类似物4)ribavirin病毒唑,利巴韦林只能积极对抗流感病毒5)病毒可能抵抗抗病毒药物10 植物病毒1)导致了美国大约6000000美金的损失每年2)可以通
29、过感染的种子传播3)可以传染到新的宿主中作为wind-blown 风吹的尘土或是通过雨刷的泥土4)一些时候复制在insect昆虫载体中5)总是导致全身性的感染整个植株七1. transformed cell转化细胞可能发生1)失去anchorage dependence贴壁依赖性2)失去contact inhibition 接触抑制3)colony formation 群落形成在 semi-solid半固体培养基中4)减少对于生长因素的需求5)增加p53的表达2.1)shutoff突然停止或dramatic cessation戏剧化的停止病毒大分子合成2)突然停止在poliovirus脊髓灰质
30、炎感染细胞中发生由于protease degradation蛋白酶降解从p220组成来自eIF-4F,一个蛋白复合物在cap 依赖性的翻译中作为mRNA所必须的3)adenovirus腺病毒感染细胞的裂解是病毒编码分子导致的 toxin like action4)病毒诱导膜融合可能引起细胞转化5)HIV tat蛋白导致合胞体形成syncytium formation3. cytopathic effect细胞病变 由病毒感染导致的1)altered shape 变形2)detachment from the substrate 从基质中超脱3)lysis 裂解4)membrane fusion and altered permeability 膜融合和改变电导率5)apotosis 凋亡4.1)所有人herpesvirus疱疹病毒都是高cytopathic 细胞病变的2)逆转录病毒导致不同的pathogenic致病的情况除了细胞转化之外包括paralysis arthritis麻痹关节炎 、anaemia贫血症3)lentiviruses慢病毒 与细胞转化有关4)HIV和其他慢病毒逃避免疫识别通过感染单核细胞5)一些实验室分离的HIV容易引起CD4细胞的致病性但是一些原始分离的
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