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常用实验方法和所需试剂的配制.docx

1、常用实验方法和所需试剂的配制(一)Western-blot实验1. Western blot主要实验试剂溴酚蓝(Bromphenol Blue) 丽春红(Ponceau S) 考马斯亮蓝(Coomassie brilliant blue R-250) 吐温-20(Tween-20) -巯基乙醇(-Mercaptoethanol) 十二烷基硫酸钠(SDS ) 过硫酸铵(APS) TEMED 聚丙烯酰胺凝胶单体贮备溶液 4浓缩胶缓冲液 4浓缩胶缓冲液 甘氨酸 Tris碱 脱脂奶粉 牛血清白蛋白(BSA) 硝酸纤维素膜(NC膜) 蛋白质Marker和预染 Marker 通用蛋白裂解/提取试剂 BCA

2、法蛋白定量试剂盒 Bradford法蛋白定量试剂盒 兔源性抗抗体 辣根过氧化物酶标记羊抗兔IgG ECL超敏发光液 定影液、显影液、X光胶片曝光盒其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等)2. Western-blot主要实验试剂的配制方法(1)10%SDS溶液: SDS粉末1g,加双蒸水10mL使其溶解,室温保存。(2)10%APS:APS 20mg,加双蒸水200L,混匀,现配现用。(3)10电极缓冲液(PH8.3): SDS粉末10g、Tris碱30.4g、甘氨酸144g,双蒸水定溶至1000mL,4保存,用时10倍稀释。(4)考马斯亮蓝固定液:乙醇500mL、冰醋酸10mL、双蒸

3、水定溶至1000mL。(5)考马斯亮蓝脱色溶液:95%乙醇250mL、冰醋酸80mL,双蒸水定溶至1000mL。(6)考马斯亮蓝染色溶液:0.29g考马斯亮蓝,溶解于250mL脱色液中,过滤后室温保存。(7)转移缓冲液:甘氨酸2.93g、Tris碱5.812g、甲醇200mL、去离子水定溶至1000mL,4保存。(8)10TBS溶液:Nacl87.75g、Tris碱12.1g,用双蒸水溶至1000mL,4保存,用时10倍稀释。(9)TBST溶液: 1TBS溶液1000mL、Tween-20溶液1mL,混匀。(9)丽春红溶液:100g丽春红,5mL冰醋酸,双蒸水定溶至100mL,室温保存。 (1

4、1)5上样缓冲液:1mol/LTris-HCl(pH6.8) 0.6mL、甘油2.5mL、10% SDS溶液2mL、-巯基乙醇(使用前加)0.5mL、1%溴酚蓝溶液1mL,去离子水定溶至10mL,4保存。 (12)12%分离胶:聚丙烯酰胺单体贮备液3.2mL、4分离胶缓冲液0.5mL、10%SDS溶液80L、10%APS溶液25L、TEMED原液10L、双蒸水溶至8mL。 (13)5%浓缩胶:聚丙烯酰胺单体贮备液0.68mL、4浓缩胶贮备液0.25mL、10%SDS溶液40L、10%APS溶液15L、TEMED原液5L、双蒸水溶至4mL。(14)NC膜封闭液:脱脂奶粉1g,TBST溶液20mL

5、中溶解,4保存。(15)抗体稀释液:TBST溶液20mL、小牛血清白蛋白1g,混匀,4保存。(16)Striping Buffer:-巯基乙醇 35L、10%SDS 溶液1mL、0.5MTris溶液(pH6.7) 625L,去离子水定溶至5mL,室温保存。3. Western-blot实验步骤(1)总蛋白的提取 (采用北京普利莱公司蛋白质抽提试剂盒抽提)电子天平精确称取组织50mg(2mg),放入含有1mL细胞裂解液和适量的PMSF(终浓度为1mmoL/mL)的预冷玻璃匀浆器内,冰上匀浆。取0.5mL匀浆液移入新的2mLEP管内,加1mL蛋白抽提试剂并混匀,静置10min后(偶有颠倒混匀),1

6、2000g 4离心10min。弃去上清保留蛋白质膜,加2%SDS溶液500L,100水浴10min,4放置2小时使蛋白质膜充分溶解。(2)总蛋白浓度的测定(BCA法)配制统一的蛋白质标准品:以牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)的标准品溶液(浓度为1mg/mL)制作蛋白质标准曲线。分别吸取BSA标准品溶液0、100、200、400、800、1200、1600和2000L,各自加入0.01MPBS溶液补足到2000L,配成梯度浓度的标准品溶液,分装后-20备用。配制BCA工作液:按50:1的比例将BCA试剂盒内的A试剂与B试剂进行混合,配成BCA工作液。室温保存,1d

7、内使用。样品处理:取各样品10L,加0.01MPBS溶液490L,配成待测样品。加样:先于酶标板上样孔内加入200L BCA工作液,再分别加入倍比稀释的标准品及待测样品各20L,酶标仪上震荡3min,充分混匀。测定:将酶标板置于恒温水浴箱中,37孵育30min。用MRK3型酶标仪测定562nm波长下各孔吸光度值(optical density,OD),采用Softmax5.2软件计算各样本蛋白质浓度。 (3)样品浓度的配平和制备配平:按测定的各样品蛋白质浓度,用2%SDS溶液配平各样品总蛋白浓度。根据预实验结果,将组织的总蛋白浓度调为1mg/mL。制备:将配平后的样品与5上样缓冲液按4:1的比

8、例混合。 100水浴10min,部分4保存用于电泳,部分-20保存备用。(4)样品内蛋白含量的检测凝胶的配制:配制12%分离胶和5%浓缩胶(配制方法见附录)。上样:分别用Eppendorf微量移液器吸取蛋白质Marker或样品各10L,将枪尖的插入加样孔的底部,缓慢地将样品或Marker加入加样孔,避免有气泡产生。电泳:浓缩胶:电压100V、电流400mA,电泳20min;分离胶:120V,400mA,电泳50min,待溴酚蓝到达凝胶底部,关闭电源。蛋白质转膜:恒压转移,转膜参数:电压100V,电流350mA,转移23min。结束后,将硝酸纤维素膜(nitrocellulose,NC膜)于丽春

9、红染液中染色10 min,可见清晰的红色条带,表明转膜成功。去离子水冲洗,根据蛋白质Marker的位置将含有目的蛋白的膜条带上下各0.5cm)裁下。 封闭:把NC膜置于封闭液内室温封闭4h(摇床上进行),TBST液洗膜2min3次。免疫反应:将封闭好的膜置于一抗溶液中4孵育过夜,TBST溶液洗3min5次后,NC膜再于辣根过氧化物酶标记羊抗兔IgG溶液中孵4育1h,用TBST溶液洗膜3min5次。以上步骤均在摇床上进行。曝光:将ECL超敏发光液中的A液和B液按1:1比例混合后滴于NC膜上,暗室内曝光30s,X-光片在显影液中显影2min,定影液中定影5min。分析结果:将NC膜上肌动蛋白染色条

10、带结果扫描后输入电脑,IPP5.0图像分析系统分析结果。(二)免疫组化(荧光)染色实验1. 免疫组化(荧光)染色主要实验试剂防脱片剂一抗抗体免疫组化试剂盒(SP或SABC)DAB试剂盒 罗丹明标记的羊抗兔IgG 组织自身荧光淬灭剂 其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等)均为国产分析纯2. 常用试剂的配制(1)0.01MPBS溶液:中衫公司的PBS粉末一包,加蒸馏水2000mL,混匀,室温保存。(2)4%多聚甲醛溶液:500ml 0.01MPBS液加40g多聚甲醛在2000 ml的烧杯内加热至60,边搅拌边加热,至溶液呈澄清,另加500 ml 0.01MPBS液至1000 ml。冷却后

11、过滤, 4冰箱保存备用。(3)苏木素:(4)伊红:3. HE染色方法(1)二甲苯脱蜡10min(2)二甲苯、脱蜡各5min(3)无水乙醇洗1min2次(4)95酒精1min(5)90酒精1min(6)85酒精1min(7)自来水洗2min(8)苏木素染色15min(9)自来水洗1min(10)1盐酸酒精分化20s(11)自来水洗1min(12)稀氨水(1)反蓝30s(13)自来水洗或蒸馏水洗1min(14)伊红染色20s5min(15)自来水洗30s(16)85酒精脱水20s(17)90酒精30s(18)95酒精1min(19)95酒精1min(20)无水乙醇2min(21)无水乙醇2min(

12、22)二甲苯、透明各5min(23)中性树胶封片4.免疫组化染色(1)制作切片:组织切片的制作、切片脱蜡、脱水过程按HE染色步骤进行;(2)抗原修复:0.01M的枸橼酸缓冲液内、中火微波修复15min,冷却至室温后,PBS溶液洗3min3次;(3)封闭:封闭液室温封闭30min,弃去封闭液,不洗;(4)免疫反应:滴加一抗抗体,4孵育过夜(保湿盒内进行),PBS溶液洗切片3min5次后,滴加二抗,室温4孵育30min,PBS溶液洗切片3min5次;滴加DAB试剂、显色。显微镜观察切片,蒸馏水终止显色反应。脱水、透明、封片。(5)观察:每张切片随机选5个视野,扫描记录,并采用IPP5.0图像分析软

13、件分析图像。5.免疫荧光染色(1)制作切片:组织切片的制作、切片脱蜡、脱水过程按HE染色步骤进行;(2)抗原修复:0.01M的枸橼酸缓冲液内、中火微波修复15min,冷却至室温后,PBS溶液洗3min3次;(3)封闭:封闭液室温封闭30min,弃去封闭液,不洗;(4)免疫反应:滴加一抗抗体,4孵育过夜(保湿盒内进行),PBS溶液洗切片3min5次后,滴加罗丹明标记IgG,室温避光4孵育30min,PBS溶液洗切片3min5次;滴加组织自发荧光淬灭剂,室温孵育30min,PBS溶液洗3min3次;滴加抗荧光淬灭封片剂封片,4避光保存。(5)观察:荧光显微镜观察切片,每张切片随机选5个视野,扫描记

14、录,并采用IPP5.0图像分析软件分析图像。(三)RT-PCR实验1. RT-PCR主要实验试剂TRIzol ReagentDEPCOne Step RNA PCR Kit (AMV)DNA Marker琼脂糖TrisMOPSMGP试剂去离子甲酞胺去离子甲醛 其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等)均为国产分析纯2. 常用试剂的配制(1)DEPC水(v/v):在1000 ml去离子水中加入DEPC 1ml,37充分振荡过夜,高压灭菌。浸泡实验器具的DEPC水:在1000 m去离子水中加入DEPC 1ml,充分振荡后即可使用。(2)75%乙醇(DEPC水配制):无水乙醉375ml,加入D

15、EPC水定容至500ml。(3)0.5M EDAT (pH8.0): EDAT-2Na 186.1g,加DEPC水至800ml,充分搅拌。用NaOH约20g调pH至8.0,用DEPC水定容至1000ml。高温高压灭菌后分装,室温保存。(4)1Tri-HCl(pH8.0):Tris 121.1g,加DEPC水800ml搅拌溶解后,用浓HCl约42ml调pH至8.0,用DEPC水定容至1000ml。高温高压灭菌后分装,室温保存(5)10TE(pH8.0): 100mM Tris-HCI(pH8.0), 1mM EDAT(pH8.0), 加800mlDEPC水混合均匀后定容至IL。高温高压灭菌后分装

16、,室温保存。(6)EB染液(200g/l)I:澳化乙锭2.0mg,,加DEPC水至10ml,充分搅拌数小时完全溶解后室温避光保存。(7)1MM乙酸钠: 68g乙酸钠, 加DEPC水400ml,搅拌,用DEPC水定容至500ml。(8)10MOPS电泳缓冲液:41.8gMOPS溶解于700ml灭菌的DEPC水中,用2M的NaOH调整到pH7.0, 加20ml乙酸钠和20 ml MEDAT(pH8.0), 用DEPC水调整到1L, 避光保存。(9)10甲醛变性琼脂糖凝胶:加1.5g琼脂糖到72ml灭菌去离子水中,煮沸溶解琼脂糖,将溶液冷却到55同时加入10ml 10xMOPS电泳缓冲液和18ml去

17、离子甲醛后灌胶。(10)10甲醛凝胶缓冲液:甘油5ml, 25mg固体澳酚蓝, 25mg二甲苯青FF, 10mM EDAT(PH8.0) 5ml定容至10m。(11)1.5%琼脂糖凝胶:琼脂糖1.5g,加入100ml lTBE电泳缓冲液P(H8.3)后在微波炉内加热溶解,冷却至55左右加入EB染液(终浓度0.5g/l)充分混匀后灌胶。(12)5TBE电泳缓冲液(pH8.3): 54gTris碱,27.59硼酸,20ml 0.5M EDAT(pH8.0),定容至1L。(13)6凝胶载样缓冲液:0.25%嗅酚蓝(m/v)、0.25%二甲苯青(m/V), 30%甘油水溶液,4保存。3. RNA提取方

18、法(1)组织取出后立刻至于液氮中。(2)脑组织称取后在液氮存在下研磨3次成粉末状(需要磨成非常细的粉末,否则抽提效率会降低)。(3)待液氮挥发干,立即加入TRIzol,每100mg组织加1ml TRIzol,用加样枪吹吸,使样品充分裂解,移入1.5 ml EP管中,静止5min,以使核酸蛋白复合体完全分离。(4)在EP管中加200L氯仿,剧烈振荡15秒,静置5min。(5)将EP管在4 12000g,离心15min,离心后混合物分离成一个较低的红色苯酚-氯仿的有机相,一个中间相和一个无色的上层的水相。(6)用移液器小心吸出上层水相(不要吸取中间白色的中间层)300ml,加入另一EP管中。(7)

19、加入500 L预冷过的异丙醇,振荡混匀。-20沉淀过夜。(8)4 12000g,离心15min,此时在EP管中常常能看到白色沉淀,小自移出上清。(9)沉淀中加入lml预冷过的75%乙醇,振荡混匀后4 7500g,离心5min。(10)重复用75%乙醇洗涤RNA沉淀一次。(11)去上清,RNA沉淀于空气干燥5-10min,,加入DEPC水充分济解(难溶时可在55-60孵育10min助溶。4. RNA定量检测(1)提取适量总RNA用1xTE稀释200倍,以1xTE作为空白对照。(2)分别测定在260nm和280nm处的吸光值,纯RNA的OD260/OD280比值应接近2.0(比值最好在1.7-2.

20、0之间)。(3)在260nm处的吸光度,1OD=40g/ml NRA。浓度计算公式如下:A260光密度值40稀释倍数/1000=g/l RNA。5、琼脂糖变性凝胶电泳质检RNA(1)在EP管内建立变性反应:对照组总RNA(约5g)2.0 l 10MOPS电泳缓冲液 2.0 l 去离子甲醛 4.0 l 去离子甲酰胺 10.0l 澳化乙锭(200g/l) 1.0 l(2)将EP管置于水浴恒温器中65 温育5min,取出立刻置丁冰上10min,然后离心5s,将所有液体沉淀到EP管内底部。(3)加2.0 l 10甲醛凝胶缓冲液并重新置于冰上。(4)将1.5%甲醛变性琼脂糖凝胶放入水平电泳槽内,加入足量

21、1MOPS电泳缓冲液覆盖凝胶约lmm,加RNA样品到凝胶加样孔中。(5)5V/cm电压下电泳,直到溴酚蓝移出约8厘米,由于电泳过程中电泳缓冲液的pH值会发生变化,需每小时人工转变缓冲液。(6)紫外线下观察,拍照。提取质量较好RNA电泳结果为5s、18s和28s三条带清晰,没有明显的降解,28s RNA条带是18s RNA条带亮度的两倍。6、RT-PCR反应(1)按照试剂盒说明书加入试剂。(2)RT-PCR反应。(3)反应结束后,取PCR反应液各5l进行1.5%琼脂糖凝胶(含EB)电泳。(4)5V/em电压下电泳40min。(5)紫外线下观察,拍照。(四)ElISA实验1. RT-PCR主要实验

22、试剂2.ElISA操作步骤(1)取右心血液,在4下2000r/min离心10min,取上层血清。(2)取出ELISA试剂盒平衡至室温。(3)取出反应板每孔分别加入20l标准品、20l血清于反应板孔中。(4)每孔加入100l Zero Buffer,轻轻混匀30秒,室温温育30min。(5)洗板:甩尽板内液体,用蒸馏水或者洗涤液洗涤反应板,并去除水滴(在厚叠吸水纸上拍干),这样反复洗涤5次。(6)每孔加入150ul酶联物(Reagent),轻轻混匀10秒,室温温育30min。(7)洗板:与步骤5相同。(8)每孔加入IO0l TMB显色液,轻轻混匀10秒钟,置暗处室温温育20 min。(9)每孔加

23、入50l终止液(stop solution),轻轻混匀30s;确定兰色变为黄色(重要),30min内在45Onm处读OD值。(10)以OD值为纵坐标,以标准品浓度为横坐标,绘制标准曲线。根据豚鼠血清样品的OD值可在标准曲线上查出其浓度。(五)原位杂交实验1. 原位杂交实验所需试剂TriS曲拉通X-100吐温-20DEPCmRNA原位杂交试剂盒及专用盖玻片原位杂交寡核昔酸探针2. 原位杂交所需试剂的配制方法(1)DEPC水:在1000ml去离子水中加入DEPC 1ml,37下充分振荡过夜,高温高压灭菌,浸泡实验器具的DEPC水:在1000ml去离子水中加入DEPC1ml而,充分振荡后即可使用。(

24、2)组织细胞打孔液:DEPC处理的构椽酸缓冲液(0.01mol)99.5ml,加入曲拉通X-100 0.5ml,混匀即可。(3)DEPC处理的PBS缓冲液:1000 ml PBS缓冲液(0.01mol)中加入DEPC 1ml,荡过夜,高温高压灭菌。(4)0.1 mol TBS: 8.5g NaCI、l.2g Tris用DEPC处理的去离子水定容至I000ml,混匀, 用乙酸调pH至7.5。(5)过氧化氢封闭液: 市售30%的过氧化氢10ml,加DEPC处理的PBS缓冲液定容至100ml, 此液现用现配。(6)4%多聚甲醛: 4g多聚甲醛溶于DEPC处理的双蒸水100ml中, 50加热搅拌,滴加

25、IN氢氧化钠直至白色的多聚甲醛完全溶解,3号定性滤纸过滤备用。(7)20SSC 缓冲液的配制:氯化钠 175.3g、柠檬酸三钠 88.2g 加 DEPC 处理的去离子水混合均匀后定容至 1L。2SSC、0.2SSC 依次稀释 10 倍。3. 原位杂交实验步骤(1)取组织,于DEPC处理的4%多聚甲醛中固定2h,15%蔗糖(4)脱水1天,冰冻切片12m。(2)原位杂交合成探针(8g/ml, 地高辛标记)(3)切片丙酮中浸泡10min,DEPC处理的PBS(0.01M, pH7.4)冲洗3min。(4)置打孔液中室温10分钟,以改变组织细胞的通透性使探针快速顺利地穿透细胞膜,0.01 M PBS冲

26、洗3次, 每次3min。(5)加过氧化氢封闭液室温20分钟,以封闭内源性过氧化氢酶,0.01 M PBS冲洗3min。(6)滴加复合消化工作液覆盖组织表面,4 20min,0.01M PBS冲洗3次,0.2SSC冲洗一次(室温3min)。(7)滴加预杂交工作液(25l/张)覆盖组织,37孵育盒孵育过夜。(8)预杂交后,揭去盖玻片,以0.2SSC 37洗3次,每次5min。以上步骤所用洗液均经DEPC处理。(9)滴加杂交工作液(25l/张)覆盖组织,37孵育盒孵育6h。(10)揭去盖玻片以2SSC 37洗3次,每次5min;0.2SSC 37洗3次,每次5min;0.l mol TBS 37洗4次, 每次5分钟。(11)滴加小鼠抗地高辛生物素标记的抗体工作液,37孵育30 min,0.0l M PBS冲洗3次,每次5min。(12)滴加高敏过氧化物酶链亲和素复合工作液,37孵育30 min,0.0l M PBS 冲洗3次,每次5min。(13)DAB显色,光镜下观察,当细胞浆内阳性颜色与细胞外背景色对比度反差明显时,蒸馏水洗终止反应。胞浆显棕黄色颗粒为阳性反应。80%酒精-90%酒精-无水乙醇-二甲苯脱水,每步4分钟,中性树胶封片,4保存。或(13) 滴加高敏荧光链亲和素复合物(FITC)工作液,4湿盒孵育 2h。 0.01M PBS 冲洗,5min3 次。甘油封片。

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