Chemdraw技巧.docx

1、Chemdraw技巧第二章 Chemdraw 的使用及技巧输入温度摄氏度的方法：打开输入文本框viewshow character map window选择第一列倒数第五个，然后输入大写的C即可第一节 绪论1.1 安装ChemDraw 1.2 ChemDraw 界面结构ChemDraw的主操作界面如图2-2图2-2 ChemDraw 界面1.3 Undo和Redo命令 可以通过点击图标和来进行操作。下面是对结构工具栏主要部分的使用的描述。1.4 默认设置的变化 File菜单的下拉选项中Preference可以改变各种默认设置。1.5 ChemDraw文件操作 ChemDraw文件本身的格式是*

2、.cdx。在File /Apply Document Settings from中集成了国际很多通用的格式，经常用的会是ACS格式。不同的格式对ChemDraw画分子结构有不同的要求。 例如：下面是ACS（美国化学会）所有杂志包括JACS对ChemDraw画分子结构的要求： 1) As drawing settings select: chain angle 120 bond spacing 18% of width fixed length 14.4pt(0.508cm,0.2in.) bold width 2.0pt(0.071,0.0278in.) line width 0.6pt(0.

3、021cm,0.0084in.) margin width 1.6pt(0.056cm,0.0222in.) hash spacing 2.5pt(0.088cm,0.0347in.) 2) As text sttings select: Font Helvetica Size 10pt 3) Under the preferences choose: Units Points Tolerances 3Pixels 4) Set the page setup to 100% 5) Label the drawings: Reduce to 75% of current size for pub

4、lication. 每次打开一个文件就会出现一个新的文件窗口，如果打开多个文件，文件窗口只显示最后打开的文件，通过Ctrl+Tab可以进行窗口的变换。也可以用Window来切换。第二节 化学结构的绘制2.1键工具1. 固定键的长度，角度 软件对键的长度有一定的限制，在Object下拉菜单中，点击Fixed lengths，则画出的键长度固定。同样的方法Fixed angles用于固定键的角度，默认值15度为一个单位。如果需要临时改变键的长度或者角度，按下Alt键，同时按动键到所需长度和角度即可。对于画好的键只想改变方向不改变长度可以A、按住shift，光标移到键的一端移动即可B、用选取框Mar

5、quee2. 楔键工具点击楔键工具放在需要的地方单击，放开之前可以随意改变方向也可以放在已画好的键的中间（会出现相应的图标），将其改成楔形键3. 多重键的绘制 工具栏中双键图标中选择 4. 碳氢长链的绘制 使用无环链工具，选择。按住鼠标，上下移动可以改变长链的方向。2.2 环工具 环己烷椅式结构可以用两个方位进行绘制，选择工具，点击即可得到水平方向环，按住shift点击则得到竖直方向环。在放开之前可以随意改变方向。 除了环己烷椅式结构外，其他环工具在按住Ctrl键时点击均会得到不定域共轭结构，如图2-4。 图2-4 组合键对环工具的影响 对于苯环，双键可以绘制成任意两个方向之一，可以通过按下s

6、hift键同时单击进行切换。如图2-5。图2-5 shift键对于苯环方向的影响 或者在放开之前旋转改变方向。2.3 画原子 选择相应原子，旋转2.4 键的前后交叉把一个被交叉在前面的键移到后面的方法。用框选框选择键，点击object菜单中的bring to front 和 send to back实现。第三节 文本说明和文字标记4.1 文本建立文本的方法： 利用文本工具，在所希望处单击即可。(也可以在所需处双击出现输入框)需要重新编辑的话，在原文本处单击。在工具栏Text下拉菜单中，可以改变字体，字形，以及字号。 在字形子菜单中包括三种常见字的操作：Superscript、Subscript

7、、Formula，Superscript是上标，Subscript是下标，Formula字形，数字自动缩小，比如输入C6H6时，自动形成C6H6。 文本文件默认的是左对齐输入希腊字母和一些化学符号时A、在view菜单中，选择Show Character Map Window即可在弹出的对话框中选择；B、改变字形处选择symbol 然后根据所需符号的形声对应字母输入，例如字母与希腊字母对应关系-a,-b,-p,-w等等， 第四节 绘制轨道和符号4.1 轨道工具 点击会出现一系列子目录，使用方便，可以绘制各种轨道。4.2 化学符号即可进入，分别就一些并不常用的符号工具举例进行演示。1)和分别表示沿

8、Z轴向平面外伸和进入的H原子。如图2-8图2-8 H点H划的应用2)和阳离子阴离子符号，在对应原子附近定位，当出现反色的小方块时，点击即可，符号会自动集成到原字上。表示带电的基团。其他的仅举一例，如图2-9。图2-9 正电荷符号的应用另外，所有化学符号，按住shift键同时拖动鼠标可以进行旋转。第六节 绘制箭头，弧及其他图形 6.1 箭头工具所有箭头工具如图2-13 ，根据需要选择，点击放开之前可进行箭头的拉伸，缩短和转向。 选中箭头，出现相应的图标后也可以进行整体的旋转（还有相应的角度），。图2-13 箭头工具6.2 基元工具 内含一些球形工具，用于绘制3D分子结构，线工具，用于绘制直线虚线

9、等，可以画立体图形，如正八面体等。还有一些方框工具，可以把所绘结构放到方框中，更为正规。6.3 括号工具内含大小中括号6.4 弧形工具 可以绘制固定角度的弧，同样选中弧形出现相应图标后可以进行旋转和大小的调整。6.5 笔工具 笔工具可以绘制一些图形和曲线，图2-14是一些用笔工具绘制的图形。图2-14 笔工具的使用范例1.单击绘制在曲线开始处单击，移动光标，再次单击得到第二个点，两点以直线相连，依次类推，图2-15为用单击操作绘制的图形。图2-15 笔工具单击操作绘制的图形2.按动绘制曲线 在曲线开始处单击，移动光标，再次单击得到第二个点并且按动，通过控制柄的移动，得到不同弧度的曲线，继续单击

10、并按动，得到下一段曲线，依此类推。按ESC键或选择另一个工具退出编辑。此功能主要用于绘制化学反应机理等。第七节 选择应用7.1 选择应用及旋转、缩放和选择框，一个是任意形状选中，一个是规则矩形选中，选中物体后，同时具有缩放和旋转物体功能。选中物体后，光标指向在所出现矩形框的最上面的有上角的一个黑色的直角弧，出现一个具有双箭头的弧线，按住鼠标左键即可旋转所绘图形。鼠标移向右下角时出现一个双箭头拉伸符，按住既可缩放图形。如图2-17。而在双击双箭头符号时会出现一个对话框，可以设置拉伸的百分比和旋转的具体角度。便于操作。如图2-18。图2-17 矩形选择框的使用图2-18 拉伸旋转数字对话框7.2

11、移动结构1.选择结构后，光标移至结构处变为手形，此时按住鼠标左键即可拖动结构。2.按住shift键在进行以上操作可以进行限制在水平竖直位置的移动，绘制化学方程式的时候十分管用。3.另外，选中结构，通过键盘上的四个方向键可以在方向键所指方向上进行小幅度移动，同时按住alt键进行刚才的操作进行该方向上较大幅度移动。7.3 复制结构1.选中结构，按住Ctrl键同时按动鼠标左键拖动即可得到一个同样的结构2.Ctrl+shift+按动可以在水平方向进行复制。7.4 拉曲（rotate）被选结构 选中结构，按住shift，并把鼠标指向右下角改变尺寸的箭头处，即可以进行上下或者左右的拉伸。第八节 绘制技巧用

12、快捷键标记原子每次绘制键的时候，最后一个被绘制的原子将是快捷键。如绘制甲苯，在绘制一个苯环和一根键后直接按C，此时自动会出现CH3 。如图2-19。图2-19 最后原子的标注 俗名（nickname的应用）俗名的输入： 定位于已绘制的结构中的原子处。按“=”键从中选择所需要结构，回车或者点击OK即可。检查结构信息1. 检查结构structure/check structure 将会在对话框中给出出错信息。2. 分析信息view/show analysis information在其中会给出分子式（formula）,精确质量（exact mass），分子量（molecular weight）,元素分析（element analysis）,也就是结构中每种元素的质量百分比。可以有选择的进行复制粘贴。第十节 结构的整体处理 object菜单中的align子菜单可以对结构进行对齐处理。 第十一节 特别功能11.1 推测NMR谱 绘制结构，全部选中，在Structure中选择1H NMR Shift命令得到1H NMR谱，选择12C NMR Shift命令得到12C NMR谱11.2 实验仪器的绘制 在模板中有很多实验仪器，可以绘制装置图。画出结构得到名称：框选所画结构convert name to structure即可