1、G09流程1、用GVIEW构建分子模型2、选择工作类型，这里选结构优化，可以根据需要选择3、选择方法和基组一般情况下使用DFT里面的B3LYP方法，6-31G(d)基组，自旋设置为默认(default spin)即可，电荷可以根据实际情况设置，自旋（spin）系统会自动给出4、溶剂模型，默认是气相下的优化，可以自己设置溶剂模型5、add information，如果使用混合基组的话，可以把混合基组复制到下面的空白处6、点击edit，保存7、删除chk文件的路径，chk的名称可以任意设置，最好是英文名称，用汉字的话系统可能会报错。8、保存，GVIEW会提示是否提交到本机计算，如果要提交集群的话直
2、接cancel。9、使用ssh客户端登陆集群10、点击菜单栏的黄色图标出现如下的对话框，在新弹出的对话框新建自己的文件夹11、把最外面的g09.pbs文件复制到新建的文件夹下，把用GVIEW生成的文件也一并复制进来，后缀由.gjf改成.com在新文件夹下双击打开pbs，打开方式选择写字板12、修改pbs文件，下面三个路径全部改成上面新建文件夹的路径下面的文件名称改成输入文件的路径和名称（FILENAME那一行）13、关闭并保存pbs文件14、在原来的登陆集群的文字界面上提交作业 ls ：显示当前文件夹下的内容 cd+文件夹名称：进入该文件夹 qusb g09.pbs：提交g09.pbs文件到集群提交以后系统会给出job id，记下提交的作业号，方便以后查询 qstat: 查看作业状态，排队为Q，正在计算为R15、等待计算完成后，进入自己设置的文件夹下，可以看到如下内容16、包括错误日志文件（31509.m1.ER），输出文件（31509.m1.OU），chk文件（test.chk）等。下载输出文件17、在本地电脑把文件后缀名称由.OU改成.out，使用GVIEW打开18、输出文件也可以用记事本打开，查看里面的详细信息。
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