platon常用功能Word文件下载.docx

1、 PO（3）C（21）C（16）C（15）N（3） sp3 sp2 sp2Dev. （Ang） -0.2468 0.1930-0.0247-0.0898 0.0361 0.1322Cs（I）-Asym-Par （Deg）9.4717.7727.1127.11C2（I）-Asym-Par （Deg）41.0338.1832.2332.23Ring Bond Angle（Deg）91.46 125.24 122.00 122.78 127.35 121.97Tors（I-J） （Deg）33.15 -26.301.644.5412.84 -26.10Cs（I-J）-Asym-Par（Deg）38.

2、4428.9435.9835.98C2（I-J）-Asym-Par 7.9231.0826.117.9226.11Ring Bond Distance （Ang）1.9005 1.3627 1.4050 1.4777 1.2575 2.0189Weighted Average Ring Bond Distance = 1.5704（999,999） Ang. - NOTE: 1st esd. Internal, 2nd esd External.Weighted Average Abs. Torsion Angl. =17.43（ 41,528） Deg.see: e.g. Domenican

3、o et al., Acta Cryst.（1975）, B31, 221-234.Cremer & Pople Puckering ParametersQ（2）= 0.2978 Ang.,Phi（2）=191.7850 DegQ（3）-0.1922 Ang.: C & P - Puckering Analysis may be DUBIOUS since %（Bond Distance Range/Average） =48.5 25.0 %Puckering Amplitude （Q） =0.3544 Ang, Theta =122.84 Deg,Phi该六元环由Cu（1）N（3）组成计算结

4、果为Puckering Amplitude （Q） =但有时程序不能计算Puckering，如果计算的话就会给出数值。5.pi-pi等弱相互作用Short Ring-Interactions示例：Analysis of Short Ring-Interactions with Cg-Cg Distances 6.0 Angstrom and Beta Cg（J） or Cg（I）-Me vector and normal to plane I （Deg）- Gamma = Angle Cg（I）-Cg（J） vector and normal to plane J （Deg）- Cg-Cg =

5、 Distance between ring Centroids （Ang.）- CgI_Perp = Perpendicular distance of Cg（I） on ring J （Ang.）- CgJ_Perp = Perpendicular distance of Cg（J） on ring I （Ang.）- Slippage = Distance between Cg（I） and Perpendicular Projection of Cg（J） on Ring I （Ang）.- P,Q,R,S= J-Plane Parameters for Carth. Coord. （

6、Xo, Yo, Zo）Cg（I） Res（I）Cg（J）Cg-CgTransformed J-Plane P, Q, R, SAlpha BetaGamma CgI_Perp CgJ_Perp SlippageCg（1）- Cg（1）4.282（2）-0.9488 0.1535 0.2760-0.0349 0.0037.103.4152.5834.299（2）-6.912836.353.4632.548 Cg（2）5.489（3）-0.0914-0.4701 0.8779-1.688675.1251.2856.493.0303.4335.099（3）-2.351147.5162.332.368

7、3.445 Cg（3）4.267（2）-0.9528 0.1199 0.2790-0.4655 1.9537.1338.433.3423.4025.939（2）-7.372154.1753.123.5653.476 Cg（4）5.891（2）-0.9462 0.0999 0.3079-0.6473 3.5855.1355.823.3093.3674.357（2）-0里面的符号如Cg-Cg等在数据前面都有解释：Cg-Cg环重心间的距离CgI_Perp环I到环J的垂直距离6.氢键作用分析Potential Hydrogen Bonds示例：Analysis of Potential Hydroge

8、n Bonds and Schemes with d（D.A） R（D）+R（A）+0.50, d（H.A） 100.0 DegNote: - ARU codes inare with reference to the Coordinates printed above （Possibly transformed, when MOVE .NE. 1.555）Nr Typ Res Donor - H.Acceptor D - HH.AD.AD - H.A A.H.A* A.H.A Sum（XY,YZ）Sum（XZ）1 Intra 1 O（3）-H（37）.O（4） 0.91 2.242.6084

9、1042 1 O（3）.O（5） 2.112.976716185350.003 Intra 1 O（6）-H（38）.O（7） 0.89 2.182.60271084 1 O（6）.O（10）0.89 2.092.948216388359.005 1 O（5）-H（39）.O（1） 0.90 2.142.86161376.O（2）3.055715072-H（40）.O（3） 2.401228 2.122.948115370345.009 1 O（10） -H（41）.O（6） 2.5211010 2.082.956616668344.0011 1 O（10） -H（42）.O（8） 2.212

10、.960914112.O（9） 2.202.9627143356.003O（15） -H（44）. ?0.9013 1 C（1）-H（1）.N（7） 0.933.301216314 Intra 1 C（36） -H（36A） .O（3） 0.97 2.503.333414415 1 C（36） -H（36B） .O（11）0.97 2.493.3706151Translation of ARU-code to Equivalent Position Code= 2-x,-y,-z= 1-x,1-y,-z= 1-x,-y,-z分析出分子内氢键（intra）和分子间氢键（标有对称性代码的如2755.01，对称操作见底部的注释：= 2-x,-y,-z）需要指出，platon有时计算的值是错误的，最好用mercury检查一下，相差太大肯定就有问题。