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1、Set Ends 被打开（如右）。在 5框和 3框中键入 50 和 850钮。在 5框和 3框中键入 50 和 850击 OK。单击 Open 打开序列。击 OK。当 EditSeq 窗口打开时，序列长度显示在右上角。通过“setting ends,”现在你只有最初序列中的 801 bp 的片段。Set Ends 选择在全部Lasergene 应用程序中都可以使用。2生命经纬 寻找开放读框寻找开放读框 在这入门的一部分中，我们将确定序列中最大的 ORF，并翻译它。在这入门的一部分中，我们将确定序列中最大的 ORF，并翻译它。从 SEARCH MENU 找到 ORF，点击打开会出现右边的对话框。

2、单击 Find Next 寻找第一个ORF 的位置。继续点击 Find Next 直到你把 ORF 的位置选定在位置 183-455。ORF的坐标会出现在 EditSeq 窗口的顶端附近。DNA 序列翻译DNA 序列翻译 这一节中我们介绍如何翻译我们的 ORF，不过任何序列中的读框内部分翻译。如果你的选择是在三联码的读框内，三联码指示棒显示为实心黑线（如左图）。如果这一节中我们介绍如何翻译我们的 ORF，不过任何序列中的读框内部分翻译。如果都可以用下面的方法进行都可以用下面的方法进行 3生命经纬 你的选择是不在三联码的读框内，左边的箭头和右面的箭头显示向左或向右移动一个 bp，以使所选序列成为

3、三的倍数。你的选择是不在三联码的读框内，左边的箭头和右面的箭头显示向左或向右移动一个 bp，以使所选序列成为三的倍数。选定 ORF，从 GOODIES MENUranslate）。翻译的蛋白翻译的蛋白菜单中选择翻译（T 质序列出现在一菜单中选择翻译（T 质序列出现在一个新的未命名窗口中（如右图）。它是使个新的未命名窗口中（如右图）。它是使用标准的遗传密码翻译的。用标准的遗传密码翻译的。4生命经纬 使用其它遗传密码使用其它遗传密码 根据你的序列的来源，你可以选择使用非标准的遗传密码进行翻译等操作。在这节中，我们将标准的遗传密码转换成 Ciliate Macronuclear密码。根据你的序列的来

4、源，你可以选择使用非标准的遗传密码进行翻译等操作。从 GOODIES MENU 菜单选择 Genetic Codes打开，子菜单显示如左。单击“Ciliate Macronuclear”就实现了遗传密码的转换，EditSeq 现在使用的就是 Ciliate Macronuclear 的遗传密码。同样可以将遗传密码转换为其它类型。遗传密码的编辑遗传密码的编辑 这一节中我们修改 Ciliate Macronuclea这一节中我们修改 Ciliate Macronuclea?从 GOODIES MENU 菜单选从 GOODIES MENU 菜单选r 的遗传密码。择 Edit r 的遗传密码。择 Ed

5、it?点击 DNA点击 DNA?单击任何要编辑的密码，单击任何要编辑的密码，?密码子，单击 Set Starts 按钮。第二的遗传密码密码子，单击 Set Starts 按钮。第二的遗传密码Selected Code。这将打开右面的窗口，窗口显示遗传密码是怎样翻译DNA 和 RNA 序列的。如以 DNA 形式展示密码，Selected Code。如以 DNA 形式展示密码，按钮。编辑时，按钮。编辑时，从其目前的位置拖到新氨基酸对应的位置则可。如使用不同的启始从其目前的位置拖到新氨基酸对应的位置则可。如使用不同的启始窗就会被打开，可以进行起始密码子选择。窗就会被打开，可以进行起始密码子选择。5生

6、命经纬 ?就会变成绿色，而且 列的反向互补及反向转换就会变成绿色，而且 列的反向互补及反向转换单击任何氨基酸（或者 codon 位置），该密码子单击任何氨基酸（或者 codon 位置），该密码子旁边出现一个箭头，它就被设定为起始密码子了。如要去除，只需单击它即可。如不保存，则单击取消；如要保存，单击保存为。旁边出现一个箭头，它就被设定为起始密码子了。序序 列的正确输入。ENU 菜单，选反向互补序列（Reverse Complement），AST 检索 列的正确输入。ENU 菜单，选反向互补序列（Reverse Complement），AST 检索下面的步骤可以用于反向测定的序下面的步骤可以用于

7、反向测定的序?选定序列。从 GOODIES M从 GOODIES M或者把序列颠倒过来（Reverse Sequence）命令，则被选定的序列就被翻转互补或翻转过来了。或者把序列颠倒过来（Reverse Sequence）命令，则被选定的序列就被翻转互补或翻转过来了。BLBL NCBI 的 BLAST 服务器上对 TETHIS21 序列进行相似性比 NCBI 的 BLAST 服务器上对 TETHIS21 序列进行相似性比?数据库默数据库默下面我们将在下面我们将在较。注意为了进行 BLAST 查找必须保证因特网的连接。如果你没有连接因特网，跳过这部分，继续下一部分。较。选定序，或者从 EDIT

8、菜单中选择 Sel选定序，或者从 EDIT 菜单中选择 Select All。ect All。从网络检索菜单（NET SEARCH 从网络检索菜单（NET SEARCH MENU），选择 BLAST 查找。BLAST对话框就会出现。程序默认为 blastn，MENU），选择 BLAST 查找。程序默认为 blastn，认是 nr，参数转换请参照帮助。认是 nr，参数转换请参照帮助。单击 OK 开始查找。6?寻找结果显示为两部寻找结果显示为两部生命经纬 分（如下）。上边的部分是按可能性的顺序显示检索到的序列的名字，下面的部分显示上面部分具体结果。有关“scores 网点http:/www一般来说

9、，更主要的 score性。BLAST 结果窗最上边的 3 钮被用来打开，或者保存检索到的序列，或者让你了解更多的有关信息。分（如下）。选定序列与提交序列（上边序列）比较的”和“expectation”的详细的信息在 NCBI.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST.可以找到。和更低的 expectation 提示较好的相似选定序列与提交序列（上边序列）比较的”和“expectation”的详细的信息在 NCBI.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST.可以找到。和更低的 expectation 提示较好的相似?的对话框出现。序列。如果 EditSeq 提示至少 2 序一个单独的 E

10、ditSeq 窗口。下面的对话框出现。下面?小的灰色的对话框出现。下面我们从用“Create Document”钮来打开评分最高的 5 序列开始：单击 Create Document。一个小下面我们从用“Create Document”钮来打开评分最高的 5 序列开始：一个小?在左上角有一个下拉菜单显示在左上角有一个下拉菜单显示默认（default）。单击下拉菜单框中写入 5。默认（default）。，选顶端（Top）。并在右面的文本，选顶端（Top）。并在右面的文本?单击 OK，EditSeq 自动查对多余列是同一个，请点击 OK。EditSeq 将从因特网数据库下在单一的序列，并分别打开单

11、击 OK，EditSeq 自动查对多余列是同一个，请点击 OK。EditSeq 将从因特网数据库下在单一的序列，并分别打开 我们用“Batch Save”钮将 3-10 序列保存为 EditSeq 文件：选定从顶端起第 3 个序列。单击 Batch Save。我们用“Batch Save”钮将 3-10 序列保存为 EditSeq 文件：7生命经纬 ?单击下拉菜单，选 Next。并在右面的文本框中写入 8。点击 Set Location，显示文件夹对话框。选定你点击 Set Location，显示文件夹对话框。选定你?要保存序列的位置。单击 OK 回到灰色的对话框。EditSeq少 2 序列是同一个，请 最后我们可以使用“Launch Browser”钮查看序列的详细信息 要保存序列的位置。EditSeq少 2 序列是同一个，请 最后我们可以使用“Launch Browser”钮查看序列的详细信息 选择Launch 选择Launch?单击 OK 保存序列，文件扩展为“.