技术需求项目背景本项目旨在满足首都医科大学附属北京Word文档下载推荐.docx

1、 先进性本系统方案所采用的技术既要符合业界的发展方向，又要在未来几年内仍具有很高的技术先进性，保持在同类系统中的领先地位。要求不仅具有符合要求的峰值性能（Peak Performance），更重要的是应具有稳定的应用性能（sustained performance）。各种复杂的研究课题在本系统中能够得到准确、快速的计算结果。 可扩展性高性能计算平台应具有较强的扩展能力，可以方便地实现节点增加、系统扩充和升级。计算节点的扩展不受硬件品牌限制。 开放性和兼容性系统应符合公认的工业标准，包括体系结构，硬件，I/O，网络，操作系统，开发环境和开发工具等。便于和其他平台上的系统兼容。 支持应用软件开发平

2、台能够兼容研究课题的解决方案和相应的软件系统，例如高通量基因组学数据处理相关软件及流程开发、智能病理影像识别算法移植等，提供并行计算应用分析。 管理简单，用户易用尽量减少数据中心的设备管理难度，简化架构，底层硬件对用户透明，实现应用简单易用的目的。三、设备采购清单设备名称：生物信息分析与基因检测系统高性能运算集群。数量：1套各分项指标如下：序号产品名称功能要求数量单位备注3.1生物信息分析计算系统1通用序列比对分析计算节点双路节点，运行bwa、clustal等生物信息学软件。详细要求见技术参数4.2.180台核心产品2通用节点刀片平台满足通用序列比对分析计算节点所需的配套刀片平台。详细要求见技

3、术参数4.2.283高主频序列比对分析计算节点双路节点，运行tophat、hisat2等生物信息学软件。详细要求见技术参数4.2.34高主频节点刀片平台满足高主频序列比对分析计算节点所需的配套刀片平台。详细要求见技术参数4.2.45序列拼接大内存计算节点四路和八路节点，运行大内存生物信息软件详细要求见技术参数4.2.56系统管理登录节点双路节点，系统管理和登录。详细要求见技术参数4.2.63.2测序数据存储测序数据存储与测序仪进行连接。详细要求见技术参数4.2.73.3主体在线分布式并行存储系统并行存储数据节点-86盘位在线数据存储。详细要求见技术参数4.2.8/916套缓存盘详细要求见技术参

4、数4.2.8/10128块数据存储详细要求见技术参数4.2.8/111280并行存储索引节点详细要求见技术参数4.2.8/123.4磁带库备份存储系统备份服务器详细要求见技术参数4.2.13FC交换机详细要求见技术参数4.2.14磁盘阵列详细要求见技术参数4.2.15备份软件详细要求见技术参数4.2.16磁带库主机详细要求见技术参数4.2.17磁带详细要求见技术参数4.2.1815007清洗带详细要求见技术参数4.2.19303.5系统网络与安全系统计算存储网络-IB交换机详细要求见技术参数4.2.20可为进口产品计算存储网络-IB网络页板计算存储网络-IB线缆135根管理监控网络-千兆交换机

5、详细要求见技术参数4.2.21管理监控网络-万兆交换机网络安全详细要求见技术参数4.2.22-253.6系统软件与在线运维系统软件与在线运维详细要求见技术参数4.2.263.7生物信息应用软件与工具生物信息分析平台软件详细要求见技术参数4.2.27/28基因位点数据库系统与可视化平台详细要求见技术参数4.2.27/293.8配套基础设施视频切换系统-集群控制台详细要求见技术参数4.2.30/31视频切换系统-KVM主控端视频切换系统-节点CIM模块54个工作站详细要求见技术参数4.2.1.30/32-344.2.33可为进口产品机柜详细要求见技术参数4.2.30/35UPS详细要求见技术参数4

6、.2.30/36四、参数要求4.1总体要求投标人须按照使用方要求，完成包括但不限于硬件设备安装、内部传输网络连接、软件安装调试等方面的工作。用于高通量测序数据的生物信息分析、存储、共享，以及精准医疗相关研究中大数据的分析、解读。参数条目4.2.1-4.2.8，以及4.2.32和4.2.34，相应设备所涵盖的的运算服务器、管理服务器，存储设备，需为同一品牌，运算集群搭建完成后需原厂协助调试，使集群整体性能达到最佳。双精度浮点峰值不低于400万亿次，投标人须分别给出CPU和GPU总峰值；存储系统所有硬盘裸容量不低于7.5PB，实际可用容量不低于硬盘容量的80%。运算集群需满足高通量基因组学数据处理

7、与智能病理影像识别方面的需求，整合高性能计算系统、存储系统、基础软件与并行环境、集群管理与作业调度系统。构建完整的、面向精准医学的生物信息与智能影像研究平台，并提供有效的软硬件系统及应用层面（包括但不限于软件并行化、数据分析和存储方面）的技术支持服务。投标人须协助使用方，提供运算集群运转时的产热量，并协助规划机柜摆放、制冷等基础设施的实施方案。4.2技术参数要求4.2.1通用序列比对分析计算节点功能或技术指标项详细技术参数要求*1合计80个计算节点，合计2240个物理核心*2架构采用刀片式架构，不接受例如2U4节点等高密度服务器或整机柜架构#3处理器每节点处理器（CPU）个数2颗，每颗CPU采

8、用Skylake架构，14纳米制程，每颗处理器物理核心数14，基础主频2.6GHz，每颗CPU的总体性能不得低于intel Xeon Gold 6132#4内存采用DDR4 2666MHz ECC REG内存，总内存192GB，平均每颗CPU配置6条内存，确保每CPU达到六通道硬盘每节点配置1块240GB SSD硬盘以太网络每节点配置2个内置千兆以太网接口#7高速网络采用EDR InfiniBand高速网络接口，配置1*100Gb 高速网络端口，所有节点必须做到100Gb全线速无阻塞；4.2.2通用节点刀片平台规格支持投标通用计算节点的标准机架式刀片机箱，附带上架套件。根据刀片节点数量匹配所需

9、的刀片机箱，数量满足刀片需求且数量8台以太网模块每机箱配置千兆以太网交换模块，每个对外提供4个RJ45千兆接口和2个SFP+万兆以太网上连端口，且保证上连万兆端口带宽刀箱内所有刀片千兆下行带宽，即万兆上联端口数量刀片数量*2/10。IB网络模块每机箱配置EDR IB网络模块，对外端口数量不低于机箱内部实际配置刀片数量。管理模块每机箱配置1个内置管理模块，实现远程虚拟介质、远程KVM、刀片状态、故障定位、远程开关机等功能。电源模块满配电源和风扇，保证有电源故障时所有刀片及内部配件不宕机。软件配置提供配套bwa、clustal等生物信息学软件，以及相应的通用序列比对分析解决方案4.2.3高主频序列比对分析计算节点#1合计80个计算节点，合计320个物理核心#2每节点配置1颗CPU，每节点支持2颗处理器（CPU），每颗CPU核心数4，基础主频3.5GHz.采用DDR4 2400MHz ECC REG内存，单节点内存16GB每节点配置1块500GB硬盘支持扩展EDR InfiniBand高速网络接口4.2.4高主频节点刀片平台支持投标高主频计算节点的标准机架式刀片机箱，附带上架套件。支持扩展EDR IB网络模块，每刀箱对外端口数量不低于机箱内部实际配置刀片数量。4.2.5序列拼接大内存计算节点