序列提交软件sequin使用方法.docx

1、序列提交软件sequin使用方法序列提交软件sequin使用方法1. 填写作者、联系方式等，可以将这一部分存为模板，以后修改时可以省去大量时间。2. 选择序列准备方法”use the normal submission dialog”3. 选择序列格式Submission type：single sequence（单条序列） Batch submission（批量提交，适用于相似的多条序列）4. 载入DNA序列： 将DNA 序列保存为FASTA格式（注意序列内不要有“”，尤其是多条序列时，较短的序列末端可能会用“”补齐，可以用记事本打开文件，删除）。 序列名称不要超过32个字符，可以用简单的编

2、号。5. 选择测序、拼接方法6. 添加物种名称7. 补充蛋白信息（如果序列是编码序列，则要提交蛋白序列信息）若为ITS序列见后 用MEGA或BioEdit将DNA序列翻译成蛋白序列，如果有内含子，则先要找出内含子并切除，否则不能翻译成功。（确定内含子位置方法：先从GenBank上下载一条该基因已经提交并注释好的序列，跟自己的序列比对一下，然后根据下载序列的注释确定自己序列的内含子位置）8. 注释9. 添加分类地位10. mRNA 添加“Name = 基因全称” CDS添加“product = 基因全称” 11. 更改序列标题（编号）；Source 添加“strain = ”：Modifiers organism12. 保存若点击Done之后可以保存，则说明序列修改成功，可以提交了；若有错误则会提示，修改好之后再保存。ITS序列7. 以下信息无需填写8.9. 此时进入预览页面会有错误提示，可以忽略。10. 添加miscRNA11.