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43传密码的破译选学

4.3传密码的破译(选学)

第3节传密码的破译(选学)

                          

            一、教学目标  1.说出遗传密码的阅读方式。

  2.说出遗传密码的破译过程。

  二、教学重点和难点

  1.教学重点

  遗传密码的破译过程。

  2.教学难点

  尼伦伯格和马太设计的蛋白质体外合成实验。

  三、教学策略

  本节内容属于选学,可用1课时,由教师根据实际情况灵活安排。

本节的主要内容是遗传密码的破译过程,是对本章第1节的重要补充。

学生在第1节中已经学习了遗传密码,但并不了解遗传密码是如何破译的,本节引导学生认识遗传密码的破译过程,使学生通过这一研究过程学习其中蕴含的科学研究方法。

  1.采用类比的学习方法,使复杂的问题更容易理解。

  遗传密码对于学生而言是比较深奥的,教师可以从教材“问题探讨”栏目提供的“莫尔斯密码”入手,切入本节内容。

“克里克的实验”实际上是相当复杂的,对于其实验结果的分析,教学中可以采用与英文句子类比的方法来帮助学生分析理解,使复杂的问题更容易为学生接受。

  2.以分析“尼伦伯格和马太实验”的设计思路为突破口,初步理解遗传密码的破译方法。

  对尼伦伯格和马太实验的理解是本节教学难点。

尼伦伯格和马太设计实验的思路与克里克的完全不同。

他们的思路跳出了生物体的限制,通过生物化学手段,他们成功地建立了体外蛋白质合成系统,发现了一个特定的遗传密码所对应的特定的氨基酸,可谓“山重水复疑无路,柳暗花明又一村”。

  教材中安排了蛋白质体外合成的实验示意图,意在帮助学生理解这个实验的设计思路。

作为示意图,它只画出了4种氨基酸。

实际实验中,测试的是组成蛋白质的20种氨基酸。

在这20种氨基酸中,只有加入了苯丙氨酸的试管才出现多聚苯丙氨酸的肽链。

教材中的旁栏思考题意在让学生学会科学实验中对照组的设置。

只有对照设置正确,实验结果才无懈可击。

  在这个实验中,加入的多聚尿嘧啶核苷酸实际上起到了mrna的作用,再结合克里克得出的3个碱基决定1个氨基酸的实验结论,苯丙氨酸对应的密码子就应是uuu。

同理,如果分别加入多聚腺嘌呤核苷酸(polya)、多聚胞嘧啶核苷酸(polyc)、多聚鸟嘌呤核苷酸(polyg),在蛋白质体外合成系统中分别出现了多聚赖氨酸、多聚脯氨酸和多聚甘氨酸,则可推出与赖氨酸对应的密码子应是aaa,与脯氨酸对应的密码子应是ccc,与甘氨酸对应的密码子应是ggg。

对学有余力的学生,教师还可以作进一步的引导:

以上介绍的是单核苷酸重复序列(polyu、polya、polyc、polyg)作模板(mrna)得到的结果,如果以多核苷酸的重复序列作模板,其结果又是怎样呢?

例如,以cucucucu…(polycu)作模板,会得到什么结果呢?

具体分析参见“参考资料”部分。

  四、答案和提示

  

(一)问题探讨

  1.翻译成英文是:

wherearegeneslocated

  

(二)思考与讨论

  1.当图中dna的第三个碱基(t)发生改变时,如果密码是非重叠的,将影响1个氨基酸;如果密码是重叠的,将影响3个氨基酸。

  2.提示:

先写出改变后的碱基序列,再按照非重叠阅读的方式和重叠阅读的方式分别写出其对应的氨基酸序列,分别与原序列编码的氨基酸序列进行比较就可得出答案。

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  (三)旁栏思考题

  1.细胞中原有的mrna会作为合成蛋白质的模板干扰实验结果,细胞中原有的dna可能作为mrna合成的模板,而新合成的mrna也会干扰实验结果,因此需要除去细胞提取液中的dna和mrna。

  2.作为对照实验的试管中,所有成分都与实验组的试管相同,但是不加入多聚尿嘧啶核苷酸。

  (四)练习

  基础题

  1.d。

  2.提示:

可以从密码间有无分隔符、长度是否固定、阅读方式是否重叠、密码所采用的符号等多方面进行比较。

  拓展题

  克里克通过研究碱基的改变对蛋白质合成的影响推断遗传密码的性质,这种方法不需要理解蛋白质合成的过程,就能推断出密码子的总体特征,但是证据相对间接,并且工作量大。

尼伦伯格通过建立蛋白质体外合成系统,直接破解了遗传密码的对应规则,这种方法快速、直接,但是这种方法的建立需要首先了解细胞中蛋白质合成所需要的条件。

  五、参考资料

  1.遗传密码的特点

  不间断性mrna的三联体密码是连续排列的,相邻密码之间无核苷酸间隔。

所以,若在某基因编码区的dna序列或其mrna中间插入或删除1~2个核苷酸,则其后的三联体组合方式都会改变,不能合成正常的蛋白质,这样的突变亦称移码突变,对微生物常有致死作用。

  不重叠性对于特定的三联体密码而言,其中的每个核苷酸都具有不重叠性。

例如,如果rna分子ucagacugc的密码解读顺序为:

uca、gac、ugc,则它不可以同时解读为uca、cag、aga、gac……等。

不重叠性使密码解读简单而准确无误。

并且,当一个核苷酸被异常核苷酸取代时,不会在肽链中影响到多个氨基酸。

不过,在大肠杆菌噬菌体基因组中,确有部分遗传密码是重叠使用的,这可以看做一种例外现象。

  简并性绝大多数氨基酸具有2个以上不同的密码子,这一现象称做简并性,编码相同氨基酸的密码子称同义密码子。

由于简并性,某些dna碱基变化不会引起相应蛋白质的氨基酸序列改变,这对维持物种的稳定性有重要意义。

  通用性除线粒体的个别密码外,生物界通用一套遗传密码,细菌、动物和植物等不同物种之间,蛋白质合成机制及其mrna都是可以互换的。

例如,真核生物的基因可以在原核生物中表达,反之亦然。

  起始码与终止码uag、uaa、uga为终止码,它们不为任何氨基酸编码,而代表蛋白质翻译的终止。

aug是甲硫氨酸的密码,同时又是起始密码。

  2.遗传密码的破译

  早期有关基因功能的研究工作,如“一个基因一个酶”的假说,明确了基因的碱基顺序,规定了其蛋白质产物的氨基酸数目与排列顺序。

破译遗传密码实际上就是要找到基因中dna分子的碱基顺序与它编码的蛋白质氨基酸顺序的对应关系:

几个碱基决定一个氨基酸?

哪几个碱基决定哪种氨基酸?

  要判断哪个三联体密码决定哪种氨基酸,首先需要一种人工合成rna分子的方法和一个能够在体外合成蛋白质的实验系统,这样,在试管中加入已知序列的rna,再通过分析新合成的蛋白质产物的氨基酸排列顺序就可以推断密码子和氨基酸的对应关系。

  1955年,科学家发现一种被称为多聚核苷酸磷酸化酶的生物大分子,它能在试管中催化合成rna,而不需要dna模板。

1961年,尼伦伯格和马太利用大肠杆菌的破碎细胞溶液,建立了一种利用人工合成的rna,在试管里合成多肽链的实验系统,其中含有核糖体等合成蛋白质所需的各种成分。

当尼伦伯格把人工合成的全部由尿嘧啶组成的rna加入蛋白质体外合成系统后,得到的新合成的蛋白质只含苯丙氨酸,结果说明uuu是编码苯丙氨酸的密码子。

这是第一个被破译的三联体密码。

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  1966年,又有科学家发明了一种新的rna合成方法,通过这种方法合成的rna可以是以2个、3个或4个碱基为单位的重复序列,如aguaguaguaguaguaguagu等,用它们作模板合成的蛋白质的氨基酸序列同样是有规律重复的。

如果用ugugugugugugugugug作模板,得到的新合成的蛋白质是由半胱氨酸和缬氨酸交替连接而成,则可以肯定ugu是半胱氨酸的密码子,而gug是缬氨酸的密码子。

利用这种方法破译的密码很多,其中包括终止密码uga、uag和uaa。

  1964年,尼伦伯格等找到了另外一种高效破译遗传密码的方法。

他们首先在体外合成全部64种三核苷酸分子(即长度为3个碱基的rna,如agc、ucc、uga等等),同时制备20种氨基酸混合溶液,每种混合溶液中分别含有一种用14c作放射性标记的氨基酸和其他19种氨基酸。

然后,向各混合溶液添加trna分子,使各种氨基酸分别与各自的trna分子结合,在溶液中形成各种氨酰trna,如甘氨酸-trna、赖氨酸-trna等。

实验时,取某一种三核苷酸分子(如cgu)和核糖体混合,再向其中分别加入上述氨基酸混合溶液。

如果cgu是某种氨基酸的密码子,它便会和带有这种氨基酸的氨酰trna分子以及核糖体结合形成体积稍大的复合体。

当使用硝酸纤维膜过滤反应溶液时,只有含核糖体的复合体可以留在膜上,而其他的氨酰trna分子将被冲洗掉。

从20种反应体系中找出有放射性的硝酸纤维膜,根据该体系所标记的是哪一种氨基酸,便可知道cgu所对应的氨基酸种类了。

利用这种方法破译的密码子约有50个。

  3.重叠基因

  长期以来,人们一直认为同一段dna序列内不可能存在着重叠的基因。

因为,如果存在这种2个基因彼此重叠的情况,那么在第一个基因上发生的突变,就往往会使第二个基因也伴随着发生突变。

但是,随着dna核苷酸序列测定技术的发展,人们已经在一些噬菌体和动物病毒中发现,不同基因的核苷酸序列有时是可以共用的。

我们称这样的两个基因为重叠基因(overlappinggenes)。

已知大肠杆菌φx174噬菌体单链dna共有5387个核苷酸。

如果使用单一的读码结构,那么它最多只能编码1795个氨基酸。

按每个氨基酸的平均相对分子质量为110计算,该噬菌体所合成的全部蛋白质的总分子量最多是197000道尔顿。

可实际测定发现,φx174噬菌体所编码的11种蛋白质总分子量竟为262000道尔顿。

1977年,英国分子生物学家桑格领导的研究小组,在测定φx174噬菌体dna的核苷酸序列时发现,它的同一部分dna能够编码两种不同的蛋白质,从而证明了重叠基因的存在。

  自我检测的答案和提示

  一、概念检测

  填表题

                      dna双链

                    1

                    c

                    g

                    t

                            2

                    g

                    c

                    a

                            mrna

      共4页,当前第3页1234

                    g

                    c

                    a

                            trna

                    c

                    g

                    u

                            氨基酸

                    丙氨酸(密码子为gca)

            

  选择题

  1.d。

  2.d。

  3.a。

  4.c。

  识图作答题

  

(1)氢键断裂;解旋酶;能量。

  

(2)acugaa;转录。

  (3)2。

  (4)碱基互补配对。

  画概念图

  二、知识迁移

  核糖体、trna和mrna的结合都是蛋白质的合成所不可缺少的。

抗生素通过干扰细菌核糖体的形成,或阻止trna与mrna的结合,来干扰细菌蛋白质的合成,抑制细菌的生长。

因此,抗生素可用于治疗因细菌感染而引起的疾病。

  三、技能应用

  1.提示:

可以通过查阅密码子表,写出每个氨基酸可能对应的碱基编码。

  2.这种方法只能推测出可能的碱基序列,而不能写出确定的碱基序列。

这种方法简便、快捷,不需要实验。

  3.推测不能代替用测序仪进行的基因测序。

因为推测只能得出几种可能的碱基序列,而不能得到确定的碱基序列。

  四、思维拓展

  1.c。

  2.提示:

此题旨在引导学生搜集生物科学史的资料,通过科学发现的过程认识理论推导和实验论证在科学发现中的作用。

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