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蛋白质的加工

第九章蛋白质的加工、易位及降解

1蛋白质的加工

2蛋白质易位

3蛋白质的降解

4小结

1蛋白质的加工

1.1N端fMet或Met切除

1.2二硫键形成

1.3特定氨基酸化学修饰

1.4新牛肽链中非功能片段切除

Back

1.1N端fMet或Met的切除

细菌蛋白质N端甲酰基能被甲酰化酶水解o

不管原核生物或真核生物,N端Met常在肽链合成完前被切除。

有些病毒mRNA可翻译成很长多肽链,经蛋白酶水解后得到几个功能蛋白质分子。

多駄

5'UTR

3'UTR

 

Genomicstructureofmaizedwarfmosaicvirus

1.2二硫键形成

mRNA中没有胱氨酸密码子,而不少蛋白质含有二硫键.这是蛋白质合成后通过两个半胱氨酸的氧化作用生成的。

1.3特定氨基酸的化学修饰

氨基酸侧链修饰作用包括磷酸化(如核糖体蛋白质)、糖基化(如各种糖蛋白)、甲基化(如组蛋白、肌肉蛋白质)、乙基化(如组蛋白)、径基化(如胶原蛋白)和竣基化等。

coo

h2n-c-hjo—p—

ch3

磷酸苏氨酸

甲基乙基乙基甲基

I丨I丨

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAP

小牛组蛋白H3前35个氨基体残基中的化学修饰

1.4新生肽链中非功能片段切除

不少多肽类激素和酶的前体需要经过加工才能变为活性分子,如胰蛋白酶原经过加工切去部分肽段才能成为有活性的胰蛋白酶。

APEPEPAPEPEAEADAEADPEAGIGAVLKVLTTGLPALISWIKRKRQQG

蜂毒毒蛋白的加工成熟

蜂毒蛋白只有经蛋白酶水解切除N端的22个氨基酸以后才有生物活性,该胞外蛋白酶只能特异切割X-Y2肽。

其中X是Ala,Asp和GluY是Ala或Pro。

2蛋白昏易位

2.1概述

2.2共翻译易位

2.3翻译后易位

2.4细菌蛋白质易位

2.5分子伴侣

Back

2.1概述

细胞中蛋白质合成:

绝大多数在细胞质中合成;

小一部分在细胞器(叶绿体和线粒体)中合成。

定位于细胞器内的大部分在细胞质中合成,细胞器内合成的留在细胞器内。

蛋白质插入或穿过生物膜的过程称为蛋宜质易位(proteintranslocation)。

共翻译易位

co-translationaltranslocationd是即将进入内质网的蛋白质的易位方式;蛋白质正合成的时候就可与易位装置结合;结果使核糖体定位于内质网表面,称膜结合核糖^(membrane-boundribosome)。

ProteinscanentertheERonlyduringsynthesis

ProteinscanentertheER・Golgipathwayonlybyassociatingwiththeendoplasmicreticulumwhiletheyarebeingsynthesized.

翻译后易位

post-translationaltranslocation

[蛋白质翻译完成后从核糖体上释放,然合

扩散至合适靶膜并与易位装置结合。

蛋白质合成时,其核糖体不与任何细胞器相连,称游离核糖体(freeribosome)

2.2共翻译易位

2.2.1信号肽假说

2.2.2信号肽及其特性

2.2.3信号肽与蛋白质转运的关系

2.2.4蛋白质共翻译易位的基本过程

r>

221信号肽假说

共翻译定位蛋白质定位信息存在于该蛋白质自身结构中(信号肽),并可通过与特殊受体相互作用,使蛋白质定位于靶位。

Specificsignalsdivertproteinsfromsecretion

ProteinsthatentertheER・Golgipathwaymayflowthroughtotheplasmamembraneormaybedivertedtootherdestinationsbyspecificsignals.

1/

Ribosomes

Nucleus

Theendoplasmicreticulumconsistsofahighlyfoldedsheetofmembranesthatextendsfromthenucleus・Thesmallobjectsattachedtotheoutersurfaceofthemembranesareribosomes.

2.2.2信号肽及其特性

■信号肽(signalpeptide):

能启动蛋白质运转的任何一段多肽。

■绝大部分被运入内质网内腔蛋白质都带有一个信号肽。

■信号肽结构特点:

(1)常位于蛋白质N末端,可切割;

(2)长度:

15-30个残基;

(3)序列内有一个全部或大部分疏水组成的疏水核心;

(4)靠近该序列N端常有几个正电荷氨基酸;

(5)其C-末端靠近切割处常带数个极性氨基酸,离切割点最近那个氨基酸常带很短侧链(Ala或Gly)

AnN-terminalsignaIsequenceishydrophobic

ThesignalsequenceofbovinegrowthhormoneconsistsoftheN-terminalaminoacidsandhasacentralhighlyhydrophobicregion,precededorflankedbyregionscontainingpolaraminoacids.

2.2.3信号肽与蛋白质转运的关系

(1)完整信号肽是保证蛋白质转运的必要条件;

(2)仅有信号肽不足以保证蛋白质转运发生;

(3)信号序列切除并不是转运所必需;

(4)并非所有运转蛋白质都有可降解的信号肽。

2.2.4蛋白质共翻译易位的基本过程蛋白质共翻译易位可分两个阶段:

首先:

带有新生肽链的核糖体与膜结合;然合:

新生肽链进入膜通道并易位。

核糖体与膜结合需要信号识别颗粒(signalrecognitionparticle,SRP)。

SRP有两种能力:

结合新合成的分泌型蛋白的信号序列;4可和位于膜上的SRP受体结合。

2.3翻译后易位

2.3.1前导肽及其特性

2.3.2蛋白质穿越不同器膜的过程

2-3J前导肽及其特性

翻译后跨膜易位的蛋白质,前体一般含前导肽(leaderpeptide),前导肽在跨膜运转中起重要作用。

过膜后,前导肽水解,蛋白质变为有功能的蛋白质。

前导肽的一般特性:

(1)带正电荷碱性氨基酸(Arg)较丰富,分散于不带电荷的氨基酸序列之间;

(2)缺少带负电荷的酸性氨基酸;

(3)轻基氨基酸(Ser)含量较高;

(4)有形成两亲(亲水和疏水)(X•螺旋能力。

TheleadersequenceofyeastcytochromecoxidasesubunitIVconsistsof25neutralandbasicaminoacids・Thefirst12aminoacidsaresufficienttotransportanyattachedpolypeptideintothemitochondrialmatrix・

Note

任何蛋白过膜须解决一个问题:

蛋白质表面常是亲水性的,而生物膜是疏水性的。

因此必须在膜上构建特殊的通道才能使蛋白质穿过膜。

2.3.2蛋白质穿越不同器膜的过程

(1)穿越内质网(endoplasmicreticulum)、线粒体(mitochondria)及叶绿体(chloroplast)膜

膜上含有镶嵌于膜的蛋白质样结构,它可以使蛋白质不与疏水性的类脂分子接触而穿过膜。

ProteinsentertheER,mitochondrion,chloroplastbybindingtoatransloconthattransportsthemacrossthemembrane.

(2)穿越过氧化物酶体膜(peroxisome)

膜上也有类似的装置,但底物蛋白质并不直接与其结合。

需载体蛋白协助穿过膜。

Proteinsaretransportedintoperoxisomesbyacarrierproteinthatbindstheminthecytosol,passeswiththemthroughthemembranechannel,andreleasesthemontheotherside・

(3)穿越细胞核膜

向核内转运需更大更复杂的装置,即核

孔(nuclearpore)。

由载体蛋白与底

物结合并进行跨核孔转运

Aproteiniscarriedthroughthenuclearpore

 

2.4细菌蛋白质的易位

细菌蛋白通过共翻译或翻译后可被定位于细胞膜或细胞周质空间,或被分泌出去。

Bacteriahavetwomembranes

SecBisachaperonethatbindsthenascentprotein

TheSecsystemhastheSecYEGtransloconembeddedinthemembrane,theSecAassociatedproteinthatpushesproteinsthroughthechannel,theSecBchaperonethattransfersnascentproteinstoSecA,andthesignalpeptidasethatcleavestheN-terminalsignalfromthetranslocatedprotein.

SecBtransfersanascentproteintoSecAzwhichinsertstheproteinintothechannel.TranslocationrequireshydrolysisofATPandaprotonmotiveforce.SecAundergoescyclesofassociationanddissociationwiththechannelandprovidesthemotiveforcetopushtheproteinthrough.

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