生物软件大全.docx
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生物软件大全
生物类相关软件大全
RASMOL2.7.2.1
观看生物分子3D微观立体结构的软件。
非常有名，巨棒！
RasTop
为RasMol2.7.1的图形用户界面软件
CHIMESP5
直接在浏览器中观看3D分子。
MolMol
将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件。
CrystInfo
用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3d结构。
PDViewer
PDB格式文件的查看程序。
DSViewerProtrail
3维分子浏览工具。
ICMLite
3维分子浏览工具，有一些其他软件没有的功能。
VMD
3维分子浏览工具，可以进行动态显示。
CN3D
3D分子结构观察软件。
WPDB
PDB文件检索显示分析软件。
DTMMDemo
3维分子模型显示、编辑与构建程序。
显示并分析分子结构及其特性的软件。
POV-Ray
生成三维图像工具软件。
WinMegaPov
3D渲染软件POV-Ray非官方编译软件。
MolPOV2.0.8
将PDB文件转化为POV格式文件的软件。
Mol2Mol5.2.1Demo
分子文件格式转换软件。
PovChem2.1.1
将PDB文件转化为POV格式文件的软件。
Ortep-3forWindows
生成分子的热椭圆形点图软件。
通用结晶学软件工具。
Mage
读取并演示Kinemage格式文件的专用软件。
Prekin
将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件的软件。
Swiss-PdbViewersp5
PDB文件显示与分析软件。
DINAMO
蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具软件。
PCMolecule2Lite
查看PDB格式文件的免费软件。
StrukEdDemo
化学分子编辑与三维模型生成软件。
JMVC4PreAlpha
使用JAVA技术编写的三维分子查看器。
Re_View
读取及分析XYZ格式三维分子文件的软件。
OscailX
用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包。
MoilinX
分子构建与观察软件。
Tinker
与Moilin配套的DOS下的分子设计建模软件。
Biodesigner
免费的分子建模与显示软件。
MoluCADDemo02年11月版
全功能的分子建模与显示工具软件。
ViewerActivexControl
三维分子显示控件。
ACD/3DViewerforISIS
免费的ISISDraw三维显示插件。
AmiraDemo
高等三维显示建模系统。
PyMOL
免费且公开源代码的三维分子显示、动画、编辑程序。
Qmol
基于OpenGL的三维分子显示软件。
ProteinAlpha
RASMOL衍生出的软件。
WinMGM
分子图像程序。
Chimera
免费的交互式分子模型显示程序；和
Jmolv9
java语言写成的开放源代码的免费三维分子显示程序；
RamachandranPlotExplorer
蛋白分子显示软件；
YASARAView4.4.28
免费分子显示软件
ProteinScopeLE1.0.1
免费PDB蛋白三维显示软件
DNAuser
DNA序列处理软件。
JaMBW
分子生物学软件包。
DNATool
功能很全面的DNA序列分析工具包。
pDRAW
分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图。
ANNHYB4b22
用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件。
ABIView
ABI格式文件显示与编辑软件。
Chromas
ABI格式文件显示与编辑软件。
DNAssist
DNA序列分析工具。
DNAProbe
核苷酸序列设计工具。
DnaSP
基因多态性分析软件。
DFW
DNA分析软件。
ArtemisR5
以Java语言写成的序列查看工具。
ACTR2
以Java语言写成的序列比较查看器。
GDA
主要用来进行不连续基因数据的统计分析。
RDP
从一组比对核酸序列中查找可能的重组序列软件。
Sequencher4.1.4Demo
序列拼接软件。
MeltCalc
自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件。
基因探索者Demo
中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件。
ConsInspector
DNA蛋白结合位点预测识别软件。
MatInd与MatInspector
快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具。
GBuilder
JAVA语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件。
GenomePixelizer版
帮助理解基因组中的簇基因（clusteringgene）之间的相互关系的软件。
LabBookGenomicXMLViewer3.3.0.41
图形化显示并处理GenBank序列数据的免费软件。
GeneConstructionKitDemo
管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件。
Genalysis2.1.2评估版
比较基因组或大量基因序列的工具软件。
GenescanView
查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件的小软件。
WinGene
分析核酸序列的多用工具软件。
Sequin
数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件。
Pyxis
分析一组功能相关的基因形成的基因簇是否具有统计学意义的软件。
GenomeComp
中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具
Apollo1.4.4
Java语言开发的基因组注释显示编辑软件
SNPHunter
SNP（单核苷酸多态性）查找软件。
SSRHunter
SSR（SimpleSequenceRepeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。
iCE
Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件。
RNAdraw
RNA二级结构分析软件。
RNAstructure
预测RNA二级结构图。
RnaViz
RNA二级结构图绘制程序。
loopDloop
Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件。
Circles0.1.0
使用比较的方法分析RNA二级结构软件。
RNAFold
RNA二级结构分析软件。
SStructView
用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件
ViennaRNAPackage
维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包
ANTHEPROT
蛋白序列分析软件包。
pSAAM
蛋白序列分析软件包。
VHMPT
螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件。
aminoXpress
免费的多功能蛋白分析软件包。
分析蛋白序列的工具软件。
MPEx
研究膜蛋白拓扑学结构和其它特性的JAVA软件。
Osprey1.0.1
蛋白质相互作用网络可视化系统
PIN
显示蛋白质交互作用网络和功能注释软件。
InterViewer
显示和分析蛋白交互作用软件
将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示出来。
线性酶反应模拟软件。
protlab
蛋白质纯化仿真软件。
生化基础概念演示教学程序。
生化教学文件。
photo
光合作用教学程序。
8个教学辅助程序
包括化学键教学、光合作用、减数分裂、有丝分裂，还包括日蚀等等。
《生物化学》练习题软件
本套题共包括14章内容，每章练习题有单项选择和多项选择两套题，题库总题数近700道。
Adrenalin
肾上腺素在肝糖原代谢中的作用演示。
VirtualCellLab
多媒体细胞生物学教学程序。
生物画板
专门用于编写生物类教学文档工具软件。
中文生物化学三大代谢图
Virtlab
用于教学目的的虚拟的分子生物学实验室软件
生物反应器（发酵罐）设计软件。
BioStat
BioStatB发酵罐控制程序。
PenSim
青霉素发酵模拟软件。
BioProSim
发酵实时模拟软件。
SuperProDesigner评估版
计算机辅助设计特别是生物工艺设计的软件包。
vised
序列输入分析和格式转换软件。
ForCon
多序列文件格式转换软件。
SeqVerter
序列格式转换软件。
GeneStudioProPublicBeta6
序列格式显示、编辑与转换工具软件。
FASTA/BLASTSCAN
FASTA与BLAST查询输出文件的处理软件。
RevComp
序列格式转换软件。
SeqnConverter
将不同格式的序列文件转换成FASTA格式软件。
将蛋白和核酸序列进行简单匹配和格式化输出的中文软件。
BioCocoa
提供给软件开发者Objective-C语言的各种序列格式的读写支持模块
DNACompress
免费的DNA序列压缩软件
primerPremierDemo
引物设计工具。
OligoDemo
引物分析著名软件。
PrimerD'Signer
专门用于pASK-IBA和pPR-IBA表达载体免费的引物设计辅助软件。
ArrayDesignerDemo
批量设计DNA和寡核苷酸引物工具，
BeaconDesignerDemo
实时荧光定量PCR分子信标（Molecularbeacon）及TaqMan探针设计软件。
NetPrimer
JAVA语言写成的免费引物设计软件。
PC-Rare
基于OFD（OctamerFrequencyDisparity）法的选择特定PCR引物的软件。
DNAWorks
帮助进行基因合成的设计寡核苷酸序列的免费程序。
TGGE-STAR
PCR结合梯度凝胶电泳实验引物设计软件。
ThePrimerGenerator
在线引物设计程序。
Primer3
比较有名的在线引物设计程序。
E-PCR
查找DNA序列的STSs（sequencetaggedsites序列标签位点）的在线工具软件。
PrimoPro
在线PCR引物设计java系列软件。
PrimerSelection
基于xprimer的在线引物设计软件。
PCRprimerselection
选择引物用来扩增序列的一段精确区域的在线程序。
WebPrimer
斯坦福大学提供的在线引物设计软件。
MACAW
多序列构建与分析软件。
ClustalW
用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件。
ClustalX
ClustalWWindows界面程序。
FASTA34t21b5d
数据库中查找同源序列软件。
GeneDoc2.6.02
对序列进行相关分析等操作。
BLAST2.2.9与
数据库中查找类似序列的软件及客户端软件。
SeqPup
生物分子序列编辑与分析软件。
K-Estimator
进化基因学研究软件，评估两条核酸序列核苷酸替代数。
BioEdit6.0.7
序列编辑器与分析工具软件。
DAMBE
综合性序列工具软件。
LaserGeneDemo
综合性序列工具软件。
SeaView
图形化多序列队列编辑器。
用Java语言写的多序列队列编辑器。
DNASISDemo
序列综合分析工具。
DNASISMaxTrail
序列综合分析工具。
GenamicsExpression演示版
是一个DNA与蛋白序列分析工具。
VectorNTIViewer4.0.1
载体查看软件。
Jellyfish
多功能序列分析软件。
ProSeqbeta
核酸序列编辑与种群遗传学分析软件。
SMS2
DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具集合。
DSGENETrail
核酸与蛋白序列综合性分析软件。
Staden
综合序列装配、编辑、分析软件包。
VectorNTISuite8Demo
综合性蛋白核酸分析工具包。
INCA
Java脚本语言写成的BLAST服务器客户端程序。
ISYSbuild#140
NCGR开发的用JAVA语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台。
DNAScriptor
DNA与蛋白序列综合分析软件。
SequenceQuickie-CalcDEMO
非常紧凑的分子生物学工具软件。
PhyloGrapher（）
用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件。
Woderful生物信息学系统试用版
综合中文序列分析软件。
bioxm
DNA序列资料的常规分析软件。
SeWeR
基于WEB的常用序列分析工具集。
WinBlastv.0.1.5
免费的NCBIBLAST程序windows界面程序。
BioRead
Blast和Fasta结果编辑处理程序
SeqVISTA
java语言编写的核酸或蛋白序列图像显示、比较软件
GENOMEEXPLORER
Java语言编写的生物信息学综合工具软件
phylip3.6a3
进化树分析软件，并可绘制进化树。
TreeView1.6.6
进化树处理软件。
GeneTree
比较基因与种系进化树的程序。
NDE0.5.0
用来编辑NEXUS格式文件的程序。
TreeMap
用来可视地比较主、从进化树的程序。
Spectrum
分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件。
Phyltools
计算与处理进化树数据的软件。
tree-puzzle
核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。
ATV
JAVA语言编写的显示"NewHampshire"与NHX格式的进化树文件软件。
TREECONDemo
构建和绘制进化树的软件包。
ProBiosys
比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件。
COMPONENT
分析进化树免费软件。
NJplot
小巧的显示进化树的免费软件NJplot。
MEGA
免费分子进化遗传分析软件
PAUP4
PAUP的快速使用手册
PlasmidProcessor
绘制质粒图软件。
PlasmidProcessorPro
绘制质粒图软件,与PlasmidProcessor是同一个作者。
WinPlasdemo
质粒绘图软件商业版。
DMUPbeta
环状质粒绘图软件测试版。
PlasmidToolkit
质粒绘制软件。
pDRAW
分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图。
RedasoftVisualCloning2000Demo
是有名的绘制质粒图RedasoftPlasmid软件的升级版。
SimVectorDemo
质粒图绘制软件。
CloneMapDemo
质粒作图软件演示版。
pCIRCLE2nd
FlashMX2004制作的用于绘制环状质粒的软件
ImageTool
科学用途的处理图像软件。
ImageJ
用Java语言写成的科学用途的处理图像软件。
CrossChecker
基因指纹图分析软件。
ALFmap
ALF（AmershamPharmacia）图像格式转换软件。
BandLeader
凝胶图像处理软件。
ScionImage
图像处理与分析工具。
OSIRIS
通用医学图像处理与分析软件。
Melanie4Viewer
免费Melanie图像查看器。
ChromoZoom
比较两个图像的相同与不同之处软件。
bandscanDemo
蛋白凝胶电泳图像分析软件。
SigmaScanProDemo
图像分析软件30天全功能演示版。
SigmaGelDemo
凝胶图像分析软件。
TotalLab评估版
图像分析软件。
LabImage评估版
凝胶图像分析软件。
QuantiScanDemo
使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件。
PDQuest30天试用版
分析2维凝胶并生成数据库的标准软件。
EngaugeDigitizer
图形数字化软件。
可以将曲线图转化为数据与等式。
Grafula3
图形数字化的软件；
GraphDigitizerversion
图形数字化软件。
PeakExplorer
处理试验图谱图像软件。
电泳图谱绘制器
处理电泳图谱图像软件。
VolocityLE
免费显微图像处理软件。
STATISTICA版Demo
著名的数据统计软件。
ClickItGraph
实验数据作图软件。
GraphPadPRISMDemo
著名的数据处理软件。
免费的Prism文件浏览器FreePrismViewer。
CrossGraphs
多变量数据库图形显示软件。
SigmaPlotDemo
绘图和数据分析软件包30天全功能评估版。
SYSTATDemo
数据统计分析与作图的利器30天全功能演示版。
SigmaStatDemo
智能统计软件30天全功能演示版。
PeakFitDemo
自动分离、拟合与分析非线性数据软件。
TableCurve2DDemo
自动两维曲线拟合与经验公式查找软件。
TableCurve3DDemo
自动三维曲面拟合与经验公式查找软件。
SPSS12eval
非常权威且有名的数据统计处理软件30天全功能演示版。
OriginDemo
易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件。
DATb
进行生物曲线拟合与数据分析的免费软件。
数据作图助手II
对实验结果进行数据分析和作图的专业软件。
正交设计助手II
正交实验设计辅助工具软件。
CurveExpert
实验数据处理绘图软件。
NoSA5版
中文非典型数据统计分析系统。
医学搜索2001
通用医学搜索软件。
超星图书阅览器
在线读取国家图书馆网上电子图书的客户端软件。
中国生物学文献数据库检索客户端软件。
PathDB
（代谢途径数据库）检索程序。
Medline文献库与GenBank核酸序列库检索软件。
国图网上图书浏览器插件。
PDGReader
超星图书本地阅览器。
NetRose
可以下载超星版本所有图书软件。
NetRoseBrowser
PDG格式浏览器。
BookExpress
专门用于超星数字图书下载的工具软件。
EndNoteDemo
专业参考文献查询软件。
ReferenceManager10Demo
专业参考文献查询软件。
Procite5Demo
参考资料检索管理软件。
CajViewer
读取中国期刊网电子期刊全文所必备的阅览器。
中国数图浏览器beta
浏览中国数图的必备软件。
中国数图欺骗程序
与中国数图浏览器配套使用，可以下载电子图书。
D-Library1.1.0
中国数图下载软件。
书生之家浏览器精简版与全字库版版
浏览书生之家数字图书馆的必备软件。
百博阅读软件Build1030
阅读百博数字图书馆的必备浏览器。
BookReaderforNLCBuild13
数字图书（NLC）阅读器。
MiniViewerV1.59a5
数图阅览器。
CompressIt
JBG（NLC）<->JPG转换功能软件。
Refs
参考文献管理软件。
Scholar'sAid2000
文献参考资料等日常资料的整理软件。
paperworks1.0.3
免费的参考文献管理软件。
维普浏览器
查看免费的维普期刊全文数据库专用软件。
下载数图图书软件；
nlcdownload0.9.9
国图图书下载系统。
医网打尽版
主要用于生物医学类和普通类搜索中文软件。
JaniSearch
智能搜索软件,包含16个医学、生物学相关的搜索引擎。
文献之星+
医学科研人员个人建立和管理文献信息软件。
PatentIn
用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件。
Checker
用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件。
易优专利检索软件
检索专利软件。
GetIPDL2.7.1
专利文献下载共享软件。
PatseePro
专利文献下载共享软件。
PatentOrderDesktop试用版
专利文献下载共享软件。
PatMate
专利文献下载共享软件。
PatentHunter
专利文献下载共享软件。
b6
用来帮助编制电子形式的PCT国际专利申请及最终以电子方式提交这种申请的软件。
alternatiff
阅读中文专利图形文件的IE插件。
exCITEr试用版
增加美国专利分析软件。
INAS3LITE试用版
根据专利地图理论开发的专利分析系统。
patentguider试用版
专利综合分析工具软件。
PatentWizard试用版
帮助用来撰写美国专利文本的软件。
GlobalIPEstimator试用版
用来估算在全球选定的国家申请专利、商标所需要的费用软件。
GETPATVER.试用版
意大利人编写的英文版专利检索与下载软件。
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查看、打印、保存美国专利的IE插件。
ScanAlyze
进行微阵列荧光图像分析软件。
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用图形来显示Cluster软件分析的结果软件。
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stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档。
J-Expresspro
分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据的软件。
ArrayVisionR4Demo
用来方便定量基因表达阵列分析的软件。
IconoClustDemo
用微阵列图像分析软件30天全功能演示版。
clusfavor
对微阵列数据进行聚类分析（cluster）并将图形存储成发表质量的JPG格式图形软件。
GeneCluster
进行聚类分析（cluster）软件。
MAExplorerVersion
基于JAVA程序的微阵列数据库数据采集软件。
FreeView和FreeOView
基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据。
dchip
DNA芯片分析软件。
SAM
升级会员 