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DNA损伤与修复主要的酶与途径

DNA损伤与修复,主要的酶与途径

感慨:

关于DNA修复:

在细胞中能进展修复的生物大分子只有DNA,反映了DNA对生命的重要性。

DNA分子的变化并不是全部都能被修复成原样的,正因为如此生物才会有变异、有进化。

DNA损伤的原因:

a)自发性损伤

(1)DNA复制中的错误

(2)DNA的自发性化学变化

碱基的异构互变 DNA中的4种碱基各自的异构体间都可以自发地相互变化(例如烯醇式与酮式碱基间的互变),使碱基配对间的氢键改变,可使腺嘌呤能配上胞嘧啶、胸腺嘧啶能配上鸟嘌呤等,如果这些配对发生在DNA复制时,就会造成子代DNA序列与亲代DNA不同的错误性损伤。

碱基的脱氨基作用 碱基的环外氨基有时会自发脱落,从而胞嘧啶会变成尿嘧啶、腺嘌呤会变成次黄嘌呤(H)、鸟嘌呤会变成黄嘌呤(X)等,遇到复制时,U与A配对、H和X都与C配对就会导致子代DNA序列的错误变化。

脱嘌呤与脱嘧啶 自发的水解可使嘌呤和嘧啶从DNA链的核糖磷酸骨架上脱落下来。

碱基的缺失位点

碱基修饰与链断裂 细胞呼吸的副产物O2、H2O2等会造成DNA损伤,能产生胸腺嘧啶乙二醇、羟甲基尿嘧啶等碱基修饰物,还可能引起DNA单链断裂等损伤。

此外,体内还可以发生DNA的甲基化,构造的其他变化等,这些损伤的积累可能导致老化。

甲基化

b)环境因素引发的损伤

(1)物理因素:

①DNA受到大剂量紫外线照射时,形成二聚体

②电离辐射损伤DNA有直接和间接的效应,直接效应是DNA直接吸收射线能量而遭损伤,间接效应是指DNA周围其他分子(主要是水分子)吸收射线能量产生具有很高反响活性的自由基进而损伤DNA。

电离辐射可导致DNA分子的多种变化:

DNA链断裂、DNA链蛋白质的交联、脱氧核糖分解、产生OH自由基,导致碱基变化。

(2)化学因素:

烷化剂引起DNA损伤

⏹碱基烷基化:

G–C→A–T

⏹碱基脱落:

甲基磺酸甲酯可使鸟嘌呤7N烷基化,活化β—糖苷键,连接碱基与五碳糖间的共价键变弱,容易折断缺失碱基,造成脱嘌呤作用。

⏹DNA断链:

磷酸二酯键上的氧被烷基化

⏹DNA链交联

碱基类似物、修饰剂对DNA的改变

•5-BrdU〔5-溴尿嘧啶〕〔酮式-A;烯醇式-G〕

•亚硝酸盐氧化脱氨〔C→U〕

•羟胺脱甲基〔T→C〕

•黄曲霉素B〔攻击碱基〕

DNA损伤的后果

DNA修复

1)直接修复

•在DNA5'-P端和3'-OH端未受损害的情况下,连接酶(ligase['lɪgeɪz])能够直接修复DNA的断裂口。

•DNA紫外线损伤的光复合酶〔photolyase,又称光解酶〕直接修复

•烷基化碱基的直接修复

大肠杆菌的Ada酶〔腺苷酸脱氨酶〕,可修复甲基化的碱基和甲基化的磷酸二酯键。

2)错配修复系统(MRS:

MismatchRepairSystem)

•识别标志:

-甲基腺嘌呤〔

的甲基化

在DNA中,天然的甲基化碱基有两种:

-甲基腺嘌呤〔

〕和5-甲基胞嘧啶。

后者与识别无关。

•组成:

DNA腺嘌呤甲基化酶(

甲基化酶)

DNApolymeraseⅢ填补单链DNA缺口

HelicaseSSB外切核酸酶(Ⅰ和Ⅶ)连接酶

MCE(mismatchcorrectenzyme)

•MCE

有三个亚基:

mutH,L,S,作用分别为

 

•修复流程:

3)重组修复

4)碱基切除修复

5)核苷酸切除修复(Nucleotide['njuːklɪətaɪd]excisionrepair,NER)

●体内识别DNA损伤最多的修复通路。

●主要修复扭曲双螺旋构造的DNA损伤以及阻断基因转录。

●不识别任何特殊的碱基损失,而是识别双螺旋形状的改变。

 

●主要过程

损伤识别---蛋白复合体结合到损伤位点----在错配位点上下游几个碱基的位置上〔上游5’端和下游3‘端〕将DNA链切开----将两个切口间的寡核苷酸序列去除----DNA聚合酶合成新的片段填补gap----连接酶将新合成片段与原DNA链连接起来

●关键蛋白:

大肠杆菌中,UvrA、UvrB、UvrC

uvrA是ATP水解酶,同时也是损伤部位的识别蛋白质。

它与UvrB形成AZBI复合物,结合到损伤部位,然后解开双螺旋并造成UvrB的构象变化,使其与损伤部位结合得更结实。

之后UvrA释放,UvrC结合到U-端的磷酸二醋键。

然后在UvrD作用下释放UvrC与切下的寡聚核昔酸,大肠杆菌的DNA聚合酶I对DNA缺口进展添补。

SOS应答〔SOSResponse)的概念、网络,促发因素

SOS由来:

SOS是英文“SaveOurSoul〞〔拯救我们的灵魂〕三个英文单词的首字母缩写,后转借用于海事危难时所发出的三长两短的呼救信号。

SOS应答引申到生物学领域,指生物细胞对严重危及生存环境所作出的一种生理反响,同时,也是细胞在严重危及生存环境中所表现出的一种生理状态。

细菌染色体DNA的大量损失可以诱导相距很远的基因表达,即所谓SOS应答。

许多被诱导的基因表达产物参与了DNA修复并诱发突变。

关键的调控因子是RecA蛋白和LexA阻抑物。

原核生物:

当细胞内出现过长的单链DNA〔ssDNA〕时,细胞内的RecA〔最早发现的参与大肠杆菌同源重组的蛋白〕与之形成一种特殊的RecA-ssDNA复合体。

RecA拥有蛋白水解活性,但并不是传统意义上的蛋白水解酶。

它可以对一种被用作五十几种基因转录的阻遏物〔Repressor)的LexA蛋白质进展相互作用,促进LexA的自切割反响,以解除LexA蛋白对基因转录的阻遏效应。

在所发现的受LexA阻遏的基因中,很多是负责DNA损伤修复〔包括切除修复和同源重组修复〕的蛋白质组分。

真核生物:

SOS-likeResponse〔类SOS应答〕,其中关键蛋白之一是P53。

DNA损伤修复的层次

●单碱基损伤、单链断裂时靠直接修复、切除修复、错配修复等机制修复

●复杂损伤靠重组修复、sos修复完成,为不准确修复,易产生突变

●损伤不可修复时,细胞凋亡

DNA损伤修复障碍与疾病

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