生物化学与分子生物学提纲人卫版第8版下.docx
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生物化学与分子生物学提纲人卫版第8版下
十四、DNA的生物合成
*1.DNA复制是以DNA为模板的DNA合成,是基因组的复制过程。
2.DNA复制的主要特征包括:
半保留复制、双向复制和半不连续复制。
还具有高保真性。
3.子代DNA中保留了亲代的全部遗传信息,亲代与子代DNA之间碱基序列高度一致,称遗传的保守性。
遗传的保守性是相对的。
4.原核生物基因组是环状DNA,只有一个复制起点(origin)。
复制从起点开始,向两个方向进行解链,是单点起始双向复制。
5.复制中的模板DNA形成2个延伸方向相反的开链区,称复制叉。
复制叉指的是正在进行复制的双链DNA分子所形成的Y形区域。
6.真核细胞每条染色体有多个复制起点,为多起点双向复制。
复制完成时,复制叉相遇并汇合连接。
7.从一个DNA复制起点起始的DNA复制区域称为复制子。
复制子是含有一个复制起点的独立完成复制的功能单位。
8.沿着解链方向生成的子链DNA的合成是连续进行的,称为前导链;另一股链复制方向与解链方向相反,不能连续延长,只能逐段地从5’→3’生成引物并复制子链,称后随链。
9.前导链连续复制而后随链不连续复制的方式称为半不连续复制。
沿着后随链的模板链合成的新DNA片段称为冈崎片段。
10.DNA复制的底物是dNTP,最靠近核糖的称为α-P,向外依次为β-P、γ-P。
在聚合反应中,α-P与子链末端核糖的3’-OH连接。
11.引物的作用是提供3’-OH末端使dNTP可以依次聚合。
DNA复制的反应可简示为:
(dNMP)n+dNTP→(dNMP)n+1+PPi
12.DNA聚合酶全称是依赖DNA的DNA聚合酶,简写为DNApol。
13.原核生物有3种DNA聚合酶,分别是DNApolⅠ、DNApolⅡ、DNApolⅢ,都有5’→3’的聚合酶活性和3’→5’的核酸外切酶活性。
14.DNApolⅢ是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶,由2个核心酶、1个γ-复合物和1对β亚基构成。
β亚基夹稳DNA模板链,并使酶沿模板滑动。
15.核心酶由α、ε、θ亚基共同组成,ε执行碱基选择功能,使DNA复制具有保真性。
16.DNApolⅠ可水解为2个片段,小片段共233个残基,有5’→3’核酸外切酶活性。
大片段(Klenow片段)604个残基,具有DNA聚合酶活性和3’→5’核酸外切酶活性。
17.DNApolⅠ在活细胞内的功能主要是对复制中的错误进行校对,对复制和修复中出现的空隙进行填补。
18.DNApolⅡ在polⅠ和polⅢ缺失情况下暂时起作用,故参与DNA损伤的应急状态修复。
19.真核生物的DNA聚合酶
DNApolα
引物酶
DNApolβ
DNA修复
DNApolγ
线粒体DNA合成
ΔDNApolδ
前导链和后随链的合成,错配修复
DNApolε
错配修复
真核生物的DNA链延长中起催化作用的主要是DNApolδ,相当于原核生物的DNApolⅢ;此外它还有解旋酶的活性。
20.生物体至少有3种机制实现保真性:
①遵守严格的碱基互补配对规律;
②聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能;
③复制出错时有即时的校对功能。
21.嘌呤核苷酸的化学结构能形成顺式和反式构型,但只有反式构型能与嘧啶形成氢键配对。
DNApolⅢ对嘌呤的不同构性表现不同亲和力,因此实现碱基选择功能。
22.原核生物的DNApolⅠ、真核生物的DNApolδ和DNApolε的3’→5’核酸外切酶活性很强,可以在复制过程中辨认并对复制错误进行校正,此过程称错配修复。
23.原核生物复制中参与DNA解链的相关蛋白质
蛋白质(基因)
通用名
功能
DNAA(DNA)
辨认复制起始点
DNAB(DNA)
解旋酶
解开DNA双链
DNAC(DNA)
运送和协同DNAB
DNAG(DNA)
引物酶
催化RNA引物生成
SSB
单链DNA结合蛋白
稳定已解开的单链DNA
拓扑异构酶
拓扑异构酶Ⅱ又称促旋酶
解开超螺旋
24.拓扑酶既能水解,又能连接DNA分子中磷酸二酯键,可在将要打结或已打结处切口,下游的DNA穿越切口并作旋转,打开或解松结,然后旋转复位连接。
25.拓扑异构酶Ⅰ可以切断DNA双链中一股,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。
反应不需ATP。
26.拓扑异构酶Ⅱ切断DNA分子双链,使超螺旋松弛;然后利用ATP供能,连接断端。
27.DNA连接酶连接DNA链3-OH末端和相邻DNA链5-P末端,生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成完整的链。
消耗ATP。
28.连接酶只能连接双链中的单链缺口,不能连接单独存在的DNA单链或RNA单链。
*29.DNA连接酶功能
①在复制中起最后接合缺口的作用。
②在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。
③基因工程的重要工具酶之一。
30.三种催化生成磷酸二酯键的酶:
DNA聚合酶、DNA连接酶、拓扑酶。
31.复制的起始是装配引发体,形成复制叉并合成RNA引物的过程。
32.E.coli的复制起始点是一段DNA序列,包含有3组串联重复序列和2对反向重复序列。
上游的串联重复序列称为识别区;下游的反向重复序列碱基组以A、T为主,为富含AT区。
33.DNA的解链过程由DNAA、B、C三种蛋白质共同参与:
①DNAA蛋白辨认并结合于oriC的串联重复序列(AT区)
②DNAB在DNAC的协同下,结合并沿解链方向移动,使双链解开足够用于复制的长度,并逐步置换出DNAA蛋白。
③SSB结合到DNA单链上,使复制叉保持适当的长度。
34.含有解螺旋酶DNAB、DNAC、引物酶和DNA复制起始区域的复合结构,称为引发体。
35.引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子,为DNA的合成提供3’-OH末端。
36.复制的延长指在DNApol催化下,dNTP以dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上,其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。
37.同一复制叉上前导链和后随链在同一个DNApolⅢ催化下进行延长的。
38.引物的水解需靠细胞核内的DNApolⅠ,水解后留下的空隙也由DNApolⅠ催化修补;缺口则由连接酶连接。
*39.真核生物每个染色体有多个复制起始点。
复制有时序性,即复制子以分组方式激活而不是同步起动。
40.复制的起始需要DNApol(引物酶活性)和pol(解螺旋酶活性)参与,还需拓扑酶和复制因子。
41.增殖细胞核抗原(PCNA)在复制起始和延长中起关键作用,促进核小体的生成。
PCNA的蛋白质水平是检测细胞增殖能力的重要指标。
*42.在复制叉及引物生成后,DNApolδ通过PCNA的协同作用,逐步取代polα,在RNA引物的3-OH基础上连续合成前导链。
后随链引物也由polα催化合成。
然后由PCNA协同,polδ置换polα,继续合成DNA子链。
43.端粒是真核生物染色体线性DNA分子末端的结构,维持染色体的稳定性和DNA复制的完整性。
44.端粒的DNA和它的结合蛋白紧密结合,富含T-G短序列的多次重复。
45.端粒酶组成由3部分组成:
端粒酶RNA(hTR)、端粒酶协同蛋白1(hTP1)、端粒酶逆转录酶(hTRT),故端粒酶兼有提供RNA模板和催化逆转录的功能。
46.端粒酶催化作用的爬行模型
①hTR(AnCn)x辨认及结合母链DNA(TnGn)x的重复序列并移至3’端,以逆转录的方式复制;
②延伸至足够长度后,DNApol取代端粒酶,母链形成非标准的G—G发夹结构并使3-OH反折,同时起引物和模板的作用,在DNApol催化下完成双链末端的复制。
47.真核染色体DNA复制仅出现在细胞周期的S期,而且只能复制一次。
复制基因是指DNA复制起始所必需的全部DNA序列。
48.真核细胞DNA复制的起始分两步进行,即复制基因的选择和复制起点的激活。
(1)复制基因的选择出现于G1期,组装前复制复合物(pre-RC);
(2)复制起点的激活出现于S期,这一阶段将激活pre-RC,募集若干复制基因结合蛋白和DNA聚合酶,并起始DNA解旋。
49.在原核细胞中,复制基因的识别与DNA解旋、募集DNA聚合酶偶联进行。
而在真核细胞中,这两个阶段相分离可以确保每个染色体在每个细胞周期中仅复制一次。
50.真核细胞通过依赖细胞周期蛋白的蛋白激酶(CDK)严格控制pre-RC的形成和激活。
●激活pre-RC,以起始DNA复制;
●抑制形成新的pre-RC。
51.真核生物与原核生物DNA复制的差异
(1)真核生物复制子多、冈崎片段短、复制叉前进速度慢等;
(2)DNA复制从引发进入延伸阶段发生DNA聚合酶/转换
(3)切除冈崎片段RNA引物的是核酸酶RNAseHⅠ和FEN1
52.RNA病毒的基因组是RNA,其复制方式是逆转录,也称为逆转录病毒。
53.催化逆转录的酶是逆转录酶,全称是依赖RNA的DNA聚合酶。
该酶
●具有RNA或DNA作模板的dNTP聚合活性;
●具有RNase活性;
●合成反应按照5´→3´延长的规律。
54.逆转录分三步
①以病毒基因组RNA为模板,催化dNTP聚合生成DNA互补链,产物是RNA/DNA杂化双链;
②RNA被RNase活性组分水解;
③RNA分解后剩下的单链DNA再用作模板,由逆转录酶催化合成第二条DNA互补链。
55.RNA病毒在细胞内复制成双链DNA的前病毒。
前病毒基因组通过基因重组参加到细胞基因组内,并随宿主基因一起复制和表达,称为整合。
56.线粒体DNA复制特点
●环形线粒体DNA两条链(H和L)的复制不同步;
●线粒体DNA复制开始以H链作为模板合成新的L链,取代原来的L链并和H链互补,而原来的L链则保持单链状态,形成类似英文字母D的区域;
●两条链具有不同的复制起点和相反的合成方向;
●线粒体DNA复制也需要RNA引物。
57.化学诱变剂的细菌检测法(Ames)试验
(1)材料:
含有缺陷的沙门菌:
①组氨酸异养型,需加组氨酸才能生长。
②胞壁缺陷,化学物质易透入。
③修复系统不活化。
(2)沙门菌具有回复突变性,即致癌物质能使之突变为能自身合成组氨酸的菌种,由此间接判断致癌物质的致癌能力。
58.突变的分子改变类型包括:
错配、缺失、插入、重排。
59.DNA分子上的碱基错配称点突变,包括转换和颠换。
●转换:
发生在同型碱基之间,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。
●颠换:
发生在异型碱基之间,即嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤。
60.缺失或插入都可导致框移突变,即三联体密码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变。
61.DNA损伤(突变)可能造成两种结果:
①导致复制或转录障碍;②导致复制后基因突变
62.DNA损伤修复途径
修复途径
修复对象
参与修复的酶或蛋白
光复活修复
嘧啶二聚体
光修复酶(DNA光裂合酶)
碱基切除修复
受损的碱基
DNA糖基化酶
核苷酸切除修复
嘧啶二聚体、DNA螺旋结构的改变
大肠杆菌中UvrA、UvrB、UvrC和UvrD,人的XP(A~G)系列蛋白
错配修复
复制或重组中的碱基配对错误
E.coli:
MutH、MutL、MutS,人的MSH、MLH
重组修复
双链断裂
RecA
损伤跨越修复
大范围的损伤或复制中来不及修复的损伤
RecA、DNA聚合酶
63.碱基切除修复
①DNA糖基化酶水解去除受损的碱基;
②无碱基位点核酸内切酶将DNA链的磷酸二酯键切开,去除剩余的磷酸核糖部分;
③DNA聚合酶合成互补序列;
④DNA连接酶将