生物医药信息学.ppt

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生物医药信息学生物医药信息学BiomedicalInformatics课程主要内容课程主要内容1绪论（文献信息检索基础）绪论（文献信息检索基础）2中文医学数据库检索中文医学数据库检索3英文医学数据库检索英文医学数据库检索4引文数据库检索引文数据库检索5网络信息检索网络信息检索6综合检索与利用综合检索与利用学习要求学习要求o掌握文献信息检索的基本原理掌握文献信息检索的基本原理o掌握基本检索技能掌握基本检索技能o熟悉常用的生物医药数据库熟悉常用的生物医药数据库o能够按照要求进行检索，完成检索报告，并能够按照要求进行检索，完成检索报告，并对文献进行初步分析对文献进行初步分析考核方式：

完成检索报告考核方式：

完成检索报告o考试范围：

考试范围：

n检索基本原理检索基本原理n基本检索技能基本检索技能n检索应用检索应用o地点：

机房笔试地点：

机房笔试o时间：

最后一次课（随堂上机检索）时间：

最后一次课（随堂上机检索）第一章第一章绪论绪论问题问题o什么叫文献检索？

什么叫文献检索？

o为什么要进行文献检索？

为什么要进行文献检索？

o如何进行生物医药文献检索？

如何进行生物医药文献检索？

第一节、基本概念第一节、基本概念o知识o信息o文献信息信息Informationo指物质存在与运动的方式与状态的表现形式指物质存在与运动的方式与状态的表现形式或反映，是现实世界事物的反映或反映，是现实世界事物的反映o它提供了客观世界事物的消息、知识，是事它提供了客观世界事物的消息、知识，是事物的普遍属性物的普遍属性o一般指数据、消息中所包含的意义，它可以一般指数据、消息中所包含的意义，它可以使信息中所描述的事件的不肯定性减少使信息中所描述的事件的不肯定性减少oAllideas,facts,andimaginativeworksofthemindwhichhavebeencommunicated,recorded,publishedand/ordistributedformallyorinformallyinanyformat.信息信息InformationoInformationisatermwithmanymeaningsdependingoncontext,butisasarulecloselyrelatedtosuchconceptsasmeaning,knowledge,instruction,communication,representation,andmentalstimulus.Simplystated,informationisamessagereceivedandunderstood.Intermsofdata,itcanbedefinedasacollectionoffactsfromwhichconclusionsmaybedrawn.Therearemanyotheraspectsofinformationsinceitistheknowledgeacquiredthroughstudyorexperienceorinstruction.Butoverall,informationistheresultofprocessing,manipulatingandorganizingdatainawaythataddstotheknowledgeofthepersonreceivingit.http:

/en.wikipedia.org/wiki/Informationoa

（1）:

knowledgeobtainedfrominvestigation,study,orinstruction

（2）:

intelligence,news（3）:

facts,dataob:

theattributeinherentinandcommunicatedbyoneoftwoormorealternativesequencesorarrangementsofsomething（asnucleotidesinDNAorbinarydigitsinacomputerprogram）thatproducespecificeffectsoc

（1）:

asignalorcharacter（asinacommunicationsystemorcomputer）representingdata

（2）:

something（asamessage,experimentaldata,orapicture）whichjustifieschangeinaconstruct（asaplanortheory）thatrepresentsphysicalormentalexperienceoranotherconstructod:

aquantitativemeasureofthecontentofinformation;specifically:

anumericalquantitythatmeasurestheuncertaintyintheoutcomeofanexperimenttobeperformedhttp:

/www.merriam-derivedfromstudy,experience,orinstruction.oKnowledgeofspecificeventsorsituationsthathasbeengatheredorreceivedbycommunication;intelligenceornews.Seesynonymsatknowledge.oAcollectionoffactsordata:

statisticalinformation.oTheactofinformingortheconditionofbeinginformed;communicationofknowledge:

Safetyinstructionsareprovidedfortheinformationofourpassengers.oAnumericalmeasureoftheuncertaintyofanexperimentaloutcome.http:

/Retrievalo利用一定工具或系统，按照特定要求，从存利用一定工具或系统，按照特定要求，从存储的信息集合（数据库）中找出所需信息的储的信息集合（数据库）中找出所需信息的过程。

过程。

o广义的检索还包括将信息组织成数据库的过广义的检索还包括将信息组织成数据库的过程。

程。

第二节、信息资源的类型第二节、信息资源的类型一、按照载体类型分类一、按照载体类型分类印刷型printed缩微型microfilm视听型audio-video数字型digital载体纸张胶卷音像磁盘、光盘等用途最传统图书馆过期文献历史、现场资料等越来越广优点便于阅读节省空间声像并茂存储量大查找便捷缺点占空间需阅读机需借助机器阅读二、按照出版形态分类图书期刊（70%）特种文献网页特征掌握某一学科的基本资料连续出版周期短非书刊非正式形式教科书教科书参考书参考书专著专著字典字典百科全书百科全书丛书丛书等等杂志杂志Journal学报学报Acta通报通报Bulletin综述综述Review文摘文摘Abstract索引索引Index,等等会议文献；会议文献；科技报科技报告；告；政府出版物；政府出版物；专利文献；专利文献；技术标准；技术标准；产品资料；产品资料；学位论学位论文；文；技术档案技术档案等等图书图书Bookso参考型（三次文献）参考型（三次文献）n字典、词典、年鉴、手册、字典、词典、年鉴、手册、百科全书等百科全书等n内容精炼、浓缩、可靠内容精炼、浓缩、可靠o阅读型阅读型n科技专著、教科书、论文科技专著、教科书、论文集、普及读物等集、普及读物等n内容全面、系统内容全面、系统国际标准书号国际标准书号oInternationalStandardBookNumber,ISBNoISBN7-117-06925-2n第一段：

代表国家、地区、语种，如第一段：

代表国家、地区、语种，如0，1英，英，2法，法，3德，德，4日，日，7中中n第二段：

出版者号第二段：

出版者号,由国家或地区由国家或地区ISBN中心分配；中心分配；n第三段：

书名号，由出版者按出版顺序所给第三段：

书名号，由出版者按出版顺序所给n第四段：

校验位第四段：

校验位o唯一性、专属性唯一性、专属性期刊期刊Periodicalso有固定的名称（刊名）、相对固定的版式、有固定的名称（刊名）、相对固定的版式、篇幅和内容范围，按一定的卷期号或年月顺篇幅和内容范围，按一定的卷期号或年月顺序号连续出版序号连续出版o每期发表多个作者的多篇文章，内容不重复、每期发表多个作者的多篇文章，内容不重复、新颖新颖o信息量大，是最重要的信息源信息量大，是最重要的信息源期刊名称可出现如下字样：

期刊名称可出现如下字样：

o杂志杂志Journal（s）（of）（6542）o学报学报Acta（529）o通报通报Bulletin（918）o年刊年刊Annals（131）o会刊会刊Proceedings（225）o综述综述（述评述评）Reviews（1101）o进展进展Progress（Advances,Frontiers）inoISSNo最早的期刊最早的期刊（1665）：

PhilosophicalTransactionofRoyalSocietyo19世纪初叶：

约世纪初叶：

约100种种o19世纪初叶：

约世纪初叶：

约1000种种o1900年：

约年：

约5000种种o1967年：

年：

26000种种o1970年：

约年：

约50000种种会议文献会议文献（Proceedings）o会议文献一般是指在学术会议上宣读的论文会议文献一般是指在学术会议上宣读的论文或书面发言。

会议论文集分或书面发言。

会议论文集分“会前会前”和和“会会后后”两大类两大类o会前：

（预印本）会前：

（预印本）nProgramandAbstracts（议程及发言摘要）议程及发言摘要）o会后：

期刊会后：

期刊增刊增刊（专辑）（专辑）（Specialissue）n专题论文集（会议录）专题论文集（会议录）n连续出版物（或作为丛书之一）连续出版物（或作为丛书之一）n科技报告科技报告o报道会议消息的期刊：

报道会议消息的期刊：

nWorldMeeting（美国）美国）nCallsforPapers（美国）美国）nScientificMeetings（美国）美国）nInternationalCongressCalendar（比利时）比利时）o检索学术会议文献的期刊：

检索学术会议文献的期刊：

nUSConferencePapersIndexnUSIndextoScientificandTechnicalProceedings即即ISTPnCN中国学术会议文献通报中国学术会议文献通报专利专利（Patent）o专利文献一般是指发明专利说明书。

专利文献一般是指发明专利说明书。

o在实行专利制度的国家里，发明者为获得专在实行专利制度的国家里，发明者为获得专利权，向专门的专利机构递交的阐述发明内利权，向专门的专利机构递交的阐述发明内容的法律文件，称为专利说明书容的法律文件，称为专利说明书（Specification）科技报告科技报告（TechnicalReport）o科技报告主要是在科技报告主要是在“二战二战”期间迅速发展起期间迅速发展起来的一种独立的科技文献类型。

来的一种独立的科技