生物化学氨基酸.docx

生物化学氨基酸.docx

《生物化学氨基酸.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物化学氨基酸.docx（19页珍藏版）》请在冰豆网上搜索。

生物化学氨基酸

第十章生物化学氨基酸代谢

植物、微生物从环境中吸收氨、铵盐、亚硝酸盐、硝酸盐等无机氮，合成各种氨基酸、蛋白质、含氮化合物。

人和动物消化吸收动、植物蛋白质，得到氨基酸，合成蛋白质及含氮物质。

有些微生物能把空气中的N2转变成氨态氮，合成氨基酸。

第一节蛋白质消化、降解及氮平衡

一、蛋白质消化吸收

哺乳动物的胃、小肠中含有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶、弹性蛋白酶。

经上述酶的作用，蛋白质水解成游离氨基酸，在小肠被吸收。

被吸收的氨基酸（与糖、脂一样）一般不能直接排出体外，需经历各种代谢途径。

肠粘膜细胞还可吸收二肽或三肽，吸收作用在小肠的近端较强，因此肽的吸收先于游离氨基酸。

二、蛋白质的降解

人及动物体内蛋白质处于不断降解和合成的动态平衡。

成人每天有总体蛋白的1%～2%被降解、更新。

不同蛋白的半寿期差异很大，人血浆蛋白质的t1/2约10天，肝脏的t1/2约1～8天，结缔组织蛋白的t1/2约180天，许多关键性的调节酶的t1/2均很短。

真核细胞中蛋白质的降解有两条途径：

一条是不依赖ATP的途径，在溶酶体中进行，主要降解外源蛋白、膜蛋白及长寿命的细胞内蛋白。

另一条是依赖ATP和泛素的途径，在胞质中进行，主要降解异常蛋白和短寿命蛋白，此途径在不含溶酶体的红细胞中尤为重要。

泛素是一种8.5KD（76a.a.残基）的小分子蛋白质，普遍存在于真核细胞内。

一级结构高度保守，酵母与人只相差3个a.a残基，它能与被降解的蛋白质共价结合，使后者活化，然后被蛋白酶降解。

三、氨基酸代谢库

食物蛋白中，经消化而被吸收的氨基酸（外源性a.a）与体内组织蛋白降解产生的氨基酸（内源性a.a）混在一起，分布于体内各处，参与代谢，称为氨基酸代谢库。

氨基酸代谢库以游离a.a总量计算。

肌肉中a.a占代谢库的50％以上。

肝脏中a.a占代谢库的10％。

肾中a.a占代谢库的4％。

血浆中a.a占代谢库的1～6％。

肝、肾体积小，它们所含的a.a浓度很高，血浆a.a是体内各组织之间a.a转运的主要形式。

氨基酸代谢库

图

四、氮平衡

食物中的含氮物质，绝大部分是蛋白质，非蛋白质的含氮物质含量很少，可以忽略不计。

氮平衡：

机体摄入的氮量和排出量，在正常情况下处于平衡状态。

即，摄入氮＝排出氮。

氮正平衡：

摄入氮＞排出氮，部分摄入的氮用于合成体内蛋白质，儿童、孕妇。

氮负平衡：

摄入氮＜排出氮。

饥锇、疾病。

第二节氨基酸分解代谢

氨基酸的分解代谢主要在肝脏中进行。

氨基酸的分解代谢一般是先脱去氨基，形成的碳骨架可以被氧化成CO2和H2O，产生ATP，也可以为糖、脂肪酸的合成提供碳架。

一、脱氨基作用

主要在肝脏中进行

（一）氧化脱氨基

第一步，脱氢，生成亚胺。

第二步，水解。

P219反应式：

生成的H2O2有毒，在过氧化氢酶催化下，生成H2O+O2↑，解除对细胞的毒害。

1、催化氧化脱氨基反应的酶（氨基酸氧化酶）

（1）、Ｌ—氨基酸氧化酶

有两类辅酶，Ｅ—ＦＭＮ

Ｅ—ＦＡＤ（人和动物）

对下列a.a不起作用：

Gly、β-羟氨酸（Ser、Thr）、二羧a.a（Glu、Asp）、二氨a.a（Lys、Arg）

真核生物中，真正起作用的不是L-a.a氧化酶，而是谷氨酸脱氢酶。

（2）、D-氨基酸氧化酶E-FAD

有些细菌、霉菌和动物肝、肾细胞中有此酶，可催化D-a.a脱氨。

（3）、Gly氧化酶E-FAD

使Gly脱氨生成乙醛酸。

（4）、D-Asp氧化酶E-FAD

E-FAD兔肾中有D-Asp氧化酶，D-Asp脱氨，生成草酰乙酸。

（5）、L-Glu脱氢酶E-NAD+E-NADP+

P220反应式：

真核细胞的Glu脱氢酶，大部分存在于线粒体基质中，是一种不需O2的脱氢酶。

此酶是能使a.a直接脱去氨基的活力最强的酶，是一个结构很复杂的别构酶。

在动、植、微生物体内都有。

ATP、GTP、NADH可抑制此酶活性。

ADP、GDP及某些a.a可激活此酶活性。

因此当ATP、GTP不足时，Glu的氧化脱氨会加速进行，有利于a.a分解供能（动物体内有10%的能量来自a.a氧化）。

（二）非氧化脱氨基作用（大多数在微生物的中进行）

P221

①还原脱氨基（严格无氧条件下）

图

②水解脱氨基

图

③脱水脱氨基

图

④脱巯基脱氨基

⑤氧化-还原脱氨基

两个氨基酸互相发生氧化还原反应，生成有机酸、酮酸、氨。

⑥脱酰胺基作用

谷胺酰胺酶：

谷胺酰胺+H2O→谷氨酸+NH3

天冬酰胺酶：

天冬酰胺+H2O→天冬氨酸+NH3

谷胺酰胺酶、天冬酰胺酶广泛存在于动植物和微生物中

（三）转氨基作用

转氨作用是a.a脱氨的重要方式，除Gly、Lys、Thr、Pro外，a.a都能参与转氨基作用。

转氨基作用由转氨酶催化，辅酶是维生素B6（磷酸吡哆醛、磷酸吡哆胺）。

转氨酶在真核细胞的胞质、线粒体中都存在。

转氨基作用：

是α-氨基酸和α-酮酸之间氨基转移作用，结果是原来的a.a生成相应的酮酸，而原来的酮酸生成相应的氨基酸。

P223结构式：

不同的转氨酶催化不同的转氨反应。

大多数转氨酶，优先利用α-酮戊二酸作为氨基的受体，生成Glu。

如丙氨酸转氨酶，可生成Glu，叫谷丙转氨酶（GPT）。

肝细胞受损后，血中此酶含量大增，活性高。

肝细胞正常，血中此酶含量很低。

动物组织中，Asp转氨酶的活性最大。

在大多数细胞中含量高，Asp是合成尿素时氮的供体，通过转氨作用解决氨的去向。

转氨作用机制P224图16-2

此图只画出转氨反应的一半。

（四）联合脱氨基

单靠转氨基作用不能最终脱掉氨基，单靠氧化脱氨基作用也不能满足机体脱氨基的需要，因为只有Glu脱氢酶活力最高，其余L-氨基酸氧化酶的活力都低。

机体借助联合脱氨基作用可以迅速脱去氨基。

1、以谷氨酸脱氢酶为中心的联合脱氨基作用

氨基酸的α-氨基先转到α-酮戊二酸上，生成相应的α-酮酸和Glu，然后在L-Glu脱氨酶催化下，脱氨基生成α-酮戊二酸，并释放出氨。

P225图16-3以谷氨酸脱氢酶为中心的联合脱氨基作用

2、通过嘌呤核苷酸循环的联合脱氨基做用

P225结构式：

次黄嘌呤核苷一磷酸（IMP）、腺苷酸代琥珀酸、腺苷酸

P226图16-4通过嘌呤核苷酸循环的联合脱氨基做用

骨骼肌、心肌、肝脏、脑都是以嘌呤核苷酸循环的方式为主

二、脱羧作用

生物体内大部分a.a可进行脱羧作用，生成相应的一级胺。

a.a脱羧酶专一性很强，每一种a.a都有一种脱羧酶，辅酶都是磷酸吡哆醛。

a.a脱羧反应广泛存在于动、植物和微生物中，有些产物具有重要生理功能，如脑组织中L-Glu脱羧生成r-氨基丁酸，是重要的神经介质。

His脱羧生成组胺（又称组织胺），有降低血压的作用。

Tyr脱羧生成酪胺，有升高血压的作用。

但大多数胺类对动物有毒，体内有胺氧化酶，能将胺氧化为醛和氨。

三、氨的去向

氨对生物机体有毒，特别是高等动物的脑对氨极敏感，血中1%的氨会引起中枢神经中毒，因此，脱去的氨必须排出体外。

氨中毒的机理：

脑细胞的线粒体可将氨与α-酮戊二酸作用生成Glu，大量消耗α-酮戊二酸，影响TCA，同时大量消耗NADPH，产生肝昏迷。

氨的去向：

（1）重新利用合成a.a、核酸。

（2）贮存Gln，Asn

高等植物将氨基氮以Gln，Asn的形式储存在体内。

（3）排出体外

排氨动物：

水生、海洋动物，以氨的形式排出。

排尿酸动物：

鸟类、爬虫类，以尿酸形式排出。

排尿动物：

以尿素形式排出。

（一）氨的转运（肝外→肝脏）

1、Gln转运Gln合成酶、Gln酶（在肝中分解Gln）

Gln合成酶，催化Glu与氨结合，生成Gln。

Gln中性无毒，易透过细胞膜，是氨的主要运输形式。

Gln经血液进入肝中，经Gln酶分解，生成Glu和NH3。

2、丙氨酸转运（Glc-Ala循环）

肌肉可利用Ala将氨运至肝脏，这一过程称Glc-Ala循环。

丙氨酸在PH7时接近中性，不带电荷，经血液运到肝脏

在肌肉中，糖酵解提供丙酮酸，在肝中，丙酮酸又可生成Glc。

肌肉运动产生大量的氨和丙酮酸，两者都要运回肝脏，而以Ala的形式运送，一举两得。

（二）氨的排泄

1、直接排氨

排氨动物将氨以Gln形式运至排泄部位，经Gln酶分解，直接释放NH3。

游离的NH3借助扩散作用直接排除体外。

2、尿素的生成（尿素循环）

排尿素动物在肝脏中合成尿素的过程称尿素循环

1932年，Krebs发现，向悬浮有肝切片的缓冲液中，加入鸟氨酸、瓜氨酸、Arg中的任一种，都可促使尿素的合成。

尿素循环途径（鸟氨酸循环）：

P230图16-6

（1）、氨甲酰磷酸的生成（氨甲酰磷酸合酶I）

肝细胞液中的a.a经转氨作用，与α-酮戊二酸生成Glu，Glu进入线粒体基质，经Glu脱氢酶作用脱下氨基，游离的氨（NH4+）与TCA循环产生的CO2反应生成氨甲酰磷酸。

氨甲酰磷酸是高能化合物，可作为氨甲酰基的供体。

氨甲酰磷酸合酶I：

存在于线粒体中，参与尿素的合成。

氨甲酰磷酸合酶II：

存在于胞质中，参与尿嘧啶的合成。

N-乙酰Glu激活氨甲酰磷酸合酶I、II

（2）、合成瓜氨酸（鸟氨酸转氨甲酰酶）

鸟氨酸接受氨甲酰磷酸提供的氨甲酰基，生成瓜氨酸。

P231反应式：

鸟氨酸转氨甲酰酶存在于线粒体中，需要Mg2+作为辅因子。

瓜氨酸形成后就离开线粒体，进入细胞液。

（3）、合成精氨琥珀酸（精氨琥珀酸合酶）

P231结构式

（4）、精氨琥珀酸裂解成精氨酸和延胡索素酸（精氨琥珀酸裂解酶）

精氨琥珀酸→精氨酸+延胡索素酸

P232结构式

此时Asp的氨基转移到Arg上。

来自Asp的碳架被保留下来，生成延胡索酸。

延胡索素酸可以经苹果酸、草酰乙酸再生为天冬氨酸，

（5）、精氨酸水解生成鸟氨酸和尿素

P232结构式

尿素形成后由血液运到肾脏随尿排除。

尿素循环总反应：

NH4++CO2+3ATP+Asp+2H2O→尿素+2ADP+2Pi+AMP+Ppi+延胡索酸

形成一分子尿素可清除2分子氨及一分子CO2，消耗4个高能磷酸键。

联合脱-NH2合成尿素是解决-NH2去向的主要途径。

尿素循环与TCA的关系：

草酰乙酸、延胡素酸（联系物）。

肝昏迷（血氨升高，使α-酮戊二酸下降，TCA受阻）可加Asp或Arg缓解。

3、生成尿酸（见核苷酸代谢）

尿酸（包括尿素）也是嘌呤代谢的终产物。

四、氨基酸碳架的去向

20种aa有三种去路

（1）氨基化还原成氨基酸。

（2）氧化成CO2和水（TCA）。

（3）生糖、生脂。

20种a.a的碳架可转化成7种物质：

丙酮酸、乙酰CoA、乙酰乙酰CoA、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸、草酰乙酸。

它们最后集中为5种物质进入TCA：

乙酰CoA、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸、草酰乙酸。

234图16-7氨基酸碳骨架进入TCA的途径

1、转变成丙酮酸的途径

P236图16-8Ala、Gly、Ser、Thr、Cys形成丙酮酸的途径

（1）、Ala经与α-酮戊二酸转氨（谷丙转氨酶）

（2）、Gly先转变成Ser，再由Ser转变成丙酮酸。

Gly与Ser的互变是极为灵活的，该反应也是Ser生物合成的重要途径。

Gly的分解代谢不是以形成乙酰CoA为主要途径，Gly的重要作用是一碳单位的提供者。

Gly+FH4+NAD+→N5,N10-甲烯基FH4+CO2+NH4++NADH

（3）、Ser脱水、脱氢，生成丙酮酸（丝氨酸脱水酶）

P235反应式

（4）、Thr有3条途径P235

①由Thr醛缩酶催化裂解成Gly和乙醛，后者氧化成乙酸→乙酰CoA。

②

③

（5）、Cys有3条途径

①转氨，生成β-巯基丙酮酸，再脱巯基，生成丙酮酸。

②氧化成丙酮酸

③加水分解成丙酮酸

2、转变成乙酰乙酰CoA的途径

P237图16-9Phe、Tyr、Leu

（1）、Phe→Tyr→乙酰乙酰CoA

P238图16-10Phe、Tyr分解为乙酰乙酰CoA和延胡索酸的途径

（2）、Tyr

产物：

1个乙酰乙酰CoA（可转化成2个乙酰CoA。

），1个延胡索酸，1个CO2，

（3）、LeuP240图16-12

产物：

1个乙酰CoA，1个乙酰乙酰CoA，相当于3个乙酰CoA。

反应中先脱1个CO2，后又加1个CO2，C原子不变。

（4）、LysP241图16-13

产物：

1个乙酰乙酰CoA，2个CO2。

在反应途中转氨：

a.氧化脱氨，b.转氨

（5）、TrpP242图16-14

产物：

1个乙酰乙酰CoA，1个乙酰CoA，4个CO2，1个甲酸。

3、α-酮戊二酸途径

P243图16-16Arg、His、Gln、Pro、Glu形成α-酮戊二酸的途径

（1）、ArgP244图16-17

产物：

1分子Glu，1分子尿素

（2）、HisP244图16-18

产物：

1分子Glu，1分子NH3,1分子甲亚氨基

（3）、Gln三条途径

①.Gln酶：

Gln+H2O→Glu+NH3

②Glu合成酶：

.Gln+α-酮戊二酸+NADPH→2Glu+NADP+

③转酰胺酶：

Gln+α-酮戊二酸→Glu+r-酮谷酰氨酸→α-酮戊二酸+NH4+

（4）、ProP145图16-19

产物：

Pro→Glu

Hpro→丙酮酸+丙醛酸

4、琥珀酰CoA途径

P246图16-20Met、Ile、Val转变成琥珀酰CoA

（1）、MetP246图16-21

给出1个甲基，将-SH转给Ser（生成Cys），产生一个琥珀酰CoA

（2）、IleP247图16-22

产生一个乙酰CoA和一个琥珀酰CoA

（3）、ValP247图16-23

5、草酰乙酸途径

Asp和Asn可转变成草酰乙酸进入TCA，Asn先转变成Asp（Asn酶），Asp经转氨作用生成草酰乙酸.

6、延胡索酸途径

Phe、Tyr可生成延胡索酸（前面已讲过）。

五、生糖氨基酸与生酮氨基酸

生酮氨基酸：

Phe、Tyr、Leu、Lys、Trp。

在分解过程中转变为乙酰乙酰CoA，后者在动物肝脏中可生成乙酰乙酸和β-羟丁酸，因此这5种a.a.称生酮a.a.

生糖氨基酸：

凡能生成丙酮酸、α-酮戊二酸、琥珀酸、延胡索酸、草酰乙酸的a.a.都称为生糖a.a，它们都能生成Glc。

而Phe、Tyr是生酮兼生糖a.a。

六、由氨基酸衍生的其它重物质

1、由氨基酸产生一碳单位

一碳单位：

具有一个碳原子的基团，包括：

亚氨甲基（-CH=NH），甲酰基（HC=O-），羟甲基（-CH2OH），亚甲基（又称甲叉基，-CH2），次甲基（又称甲川基，-CH=），甲基（-CH3）

一碳单位不仅与a.a.代谢密切相关，还参与嘌呤、嘧啶的生物合成，是生物体内各种化合物甲基化的甲基来源。

Gly、Thr、Ser、His、Met等a.a.可以提供一碳单位。

一碳单位的转移靠四氢叶酸（5，6，7，8-四氢叶酸），携带甲基的部位是N5、N10

P249结构式：

FH4与N5、N10-亚甲基FH4

2、氨基酸与生物活性物质

P251表16-1氨基酸来源的生物活性物质

（1）、Tyr与黑色素

（2）、Tyr与儿茶酚胺类

可生成多巴、多巴胺、去甲肾上腺素、肾上腺素，这四种统称儿茶酚胺类。

前二者是神经递质，后二者是激素

P252图16-24Tyr形成多巴、多巴胺、去甲肾上腺素、肾上腺素

（3）、Trp与5-羟色胺及吲哚乙酸

P252图16-25Trp形成5-羟色胺及吲哚乙酸

5-羟色胺是神经递质，促进血管收缩

（4）、肌酸和磷酸肌酸（Arg、Gly、Met）

肌酸和磷酸肌酸，在贮存和转移磷酸键能中起重要作用。

它们存在于动物的肌肉、脑、血液中。

P253图16-26Arg、Gly、Met形成磷酸肌酸

肌酸合成中的甲基化：

S-腺苷Met

（5）、His与组胺

His脱羧生成组胺，是一种血管舒张剂，在神经组织中是感觉神经的一种递质。

（6）、Arg→水解→鸟氨酸→脱羧→腐胺→亚精胺→精胺

（7）、Glu与r-氨基丁酸

Glu本身就是一种兴奋性神经递质（还有Asp），在脑、脊髓中广泛存在。

Glu脱羧形成的r-氨基丁酸是一种抑制性神经递质。

（8）、牛磺酸和CysP254-255

Cys的SH氧化成-SO3-，并脱去-COO-就形成了牛磺酸，牛磺酸与胆汁酸结合，乳化食物。

七、氨基酸代谢缺陷症

P255表16-2

苯丙酮尿症（PKU）

图

第三节氨基酸合成代谢

一、氨基酸合成中的氮源和碳源

1、氮源（无机氮不行）

（1）生物固氨（微生物）

a.与豆科植物共生的根瘤菌

b.自养固氮菌兰藻

在固氮酶系作用下，将空气中的N2固定，产生NH3

图

（2）硝酸盐和亚硝酸盐（植物、微生物）

图

（3）各种脱氨基酸作用产生的NH3（所有生物）

前面已讲过

2、碳源

直接碳源是相应的α-酮酸，植物能合成20种a.a.相应的全部碳架或前体。

人和动物只能直接合成部分a.a.相应的α-酮酸。

主要来源：

糖酵解、TCA、磷酸已糖支路。

必需氨基酸：

Ile、Leu、Lys、Met、Phe、Thr、Trp、Val、（Arg、His）

3、植物、部分微生物a.a.合成方式

①α-酮戊二酸衍生类型Glu、Gln、Pro、Arg、Lys（蕈类、眼虫）

与a.a.分解进入α-酮酸的途径比较，少了一种a.a.，即His。

②草酰乙酸衍生类型Asp、Asn、Met、Thr、Ile（也可归入丙酮类）、Lys（植物、细菌）

经TCA中间产物（α-酮戊二酸、草酰乙酸）可合成10种a.a.，即Glu、Gln、Pro、Arg、Asp、Asn、Met、Thr、Ile、Lys。

③丙酮酸衍生类型Ala、Val（Ile）、Leu

④3-磷酸甘油酸衍生类型Ser、Gly、Cys

经酵解中间产物（3-磷酸甘油酸、丙酮酸），可合成Ser、Cys、Gly、Ala、Val、Leu等6种a.a。

⑤经酵解及磷酸戊糖中间产物（磷酸烯醇丙酮酸、4-磷酸赤藓糖），可合成Phe、Tyr、Trp等3种芳香族a.a。

⑥His有自己独特的合成途径，与其它氨基酸之间没有关系

二、脂肪族氨基酸生物合成途径

1、α-酮戊二酸衍生类型（Glu、Gln、Pro、Arg、Lys（蕈类、眼虫））

（1）、Glu的合成

由α-酮戊二酸与游离氨，经L-Glu脱氢酸催化。

对于植物和微生物，氨的来源是Gln的酰胺基。

（2）、Gln的合成

由α-酮戊二酸形成Glu，由Glu可以进一步形成Gln，

Gln合酶是催化氨转变为有机含氮物的主要酶，活性受8种含氮物反馈调控：

氨基Glc-6-P、Trp、Ala、Gly、His和CTP、AMP、氨甲酰磷酸。

除Gly、Ala，其余含氮物的氮都来自Gln。

P282

（3）、Pro的合成（Glu环化而成）P262图17-2

（4）、Arg合成P263图17-3

（5）、Lys合成

①α-酮戊二酸衍生型（蕈类、眼虫）P264图17-4

②天冬氨酸、丙酮酸衍生型（植物、细菌）P267图17-5

2、草酰乙酸衍生类型（Asp、Asn、Met、Thr、Ile、Lys（植物、细菌））

（1）、

Asp合成

（2）、Asn合成（转移酰胺基）

哺乳动物

（3）、Met合成P268图17-6

（4）、Thr合成P269图17-7

Lys、Met、Thr合成中，有一段共同途径，即生成Asp-β-半醛，是一个分枝点化合物。

（5）、Ile合成（与Val极为相似）P271图17-9

Ile的合成途径与Val极为相似。

6个C中4个来自Asp（Asp→Thr），2个来自丙酮酸，所以也可以归入丙酮酸衍生型。

（6）、Lys（植物、细菌）P267图17-5

3、丙酮酸衍生型（Ala、Val（Ile）、Leu）

4、3-磷酸甘油酸衍生型（Ser、Gly、Cys）

三、芳香族氨基酸及His的生成合成P274

1、Phe、Tyr、Trp的合成

（自己看）不要求

分枝酸：

2磷酸烯醇丙酮酸，1个赤藓糖4-P

2、His合成

四、氨基酸生物合成的调节

最有效的调节是通过合成过程的终端产物，反馈抑制反应系列中第一个酶的活性，即通过别构效应调节第一个酶的活性。

1、通过终端产物对aa合成的反馈抑制

（1）简单的终端产物反馈抑制

如由Thr合成Ile

图

（2）不同终端产物对共同合成途径的协同抑制

图

（3）不同分枝产物对多个同工酶的抑制

图

（4）顺序反馈抑制

图

终端产物E和H，只分别抑制分道后自己的分支途径中第一个酶的活性。

2、通过酶量调节

五、几种重要的a.a.衍生物的生物合成

（1）、谷光苷肽

（2）、肌酸

（3）、卟啉

血红素、细胞色素、叶绿素。

卟啉由Gly和琥珀酰CoA合成

（4）、短杆菌肽

本章重点

脱氨的几种方式

氨的去路

尿素的合成

氨的转运

脱氨后碳架的去向

a.a.合成中的碳源氮源

Gln、Glu合成

一碳单位及作用