Vector NTI学习报告.docx

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VectorNTI学习报告

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一，新序列的倒入

鼠标点击File然后点击LocalDatabase，截图一，然后出现新界面，点击图标（鼠标放在该图标上会显示newsubject）,结果如截图二，默认名是Group,可以自己重新命名。

截图一

截图二

再点击另为一个图标（鼠标放在该图标上会显示new）会出现新界面，如截图三，在此处编辑加入序列的名称。

截图三

截图四显示了DNA/RNA的一些特性，根据倒入序列自身的特性选择其中的选项。

截图四

在截图五的界面下（也就是Sequenceandmaps），点击EditeSequence

截图五

出现截图六的窗口

截图六

但是因为我的电脑安装的这个版本不能导入序列，所以点击Paste后，出现了截图七的界面

截图七

二，酶切位点分析

操作过程如截图八，

点击后出现截图九的窗口，这里可以删除和添加想要分析的限制酶。

截图九

我删除了绝大多数限制酶，仅保留三个，见截图十。

截图十

然后我又随机添加了三个，见截图十一，十二，十三

截图十一

截图十二

截图十三

最后点击OK，就可以分析这六个限制酶的酶切位点，见截图十四

截图十四

RFLP可以分析同一个限制酶对多个序列切出的片段数目

具体过程如下，

截图十五

按照截图十五的步骤，会出现如下窗口，

截图十六

我随机选择了两个分子，和一个限制酶，点击calculate

截图十七

结果如下图

截图十八

FindingCommonNon-CuttingEnzyme可以用来分析哪些限制酶不会切割序列

截图十九

按照上图操作，得到下图

截图二十

图二十的左边窗口可以多选，右边窗口也可以多选。

我随机选的几个，然后点击Start，过程与结果见下面两张图

截图二十一

结果可以打印和保存

截图二十二

RestrictionFragments可以分析现在没切的片段大小。

我安装的版本操作不了，所以也没有附上之后会出现的窗口。

截图二十三

截图二十四

RestrictionReport可以对所有限制酶对序列的酶切结果进行统计，操作和结果如下

截图二十五

这份表格可以打印保存

截图二十六

三，功能元件的标记

这个序列是我在软件数据库能随机找的，酶切位点已经被我删去，用来演示标记功能元件的过程。

截图二十七

点击图标

会出现图二十八，左边边是软件自带的图像，每一个图像都有特殊含义，代表特定的生物学功能，右边可以编辑图形的名称和范围

截图二十八

点击OK,结果如下图

截图二十九

如要更改图像显示方式，可点击按钮

会出现下图，选择后，点击OK即可

截图三十

按住Ctrl再点击图标

可以调整图像和文字

截图三十一

还可以点击图标

，就可以对图谱窗口内的图像和文字进行编辑

截图三十二

点击图像可以上下移动，改变形状

截图三十三

点击鼠标右键可以在Properties中进行编辑，见图三十四到三十六

截图三十四

截图三十五

截图三十六

文字也可以通过Properties选项进行编辑，如图三十七到四十

截图三十七

截图三十八

截图三十九

截图四十

点击回形针按钮可以进行批注，如下两图

截图四十一

截图四十二