生物统计学第3版杜荣骞 课后习题答案 第十二章实验设计.docx

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生物统计学第3版杜荣骞课后习题答案第十二章实验设计

第十二章实验设计

12.1一项关于在干旱地区生长的一种杨树(Populuseuphratica),在土壤中的水分逐渐丧失后,其基因表达、蛋白谱、生态生理学及生长性能等方面产生可逆性改变的研究。

作者在本实验的5个时间点上(H5为对照),用qPCR方法度量了该杨树叶子中的三个基因的转录丰度比[83],表中给出的为阵列数据:

GenBankID

基因

H1

H2

H3

H4

H5

AJ780423

半胱氨酸蛋白酶

0.7

1.0

2.3

13.1

1.9

AJ780698

环核苷酸和钙调节的离子通道

1.5

1.2

3.0

4.3

1.5

AJ777362

核糖体蛋白

1.1

1.1

1.0

0.9

1.2

借用上述数据,以三个基因作为三个区组,计算在5个时间点上转录丰度比差异是否显著?

答:

随机化完全区组实验设计方差分析的程序,类似于两因素交叉分组实验设计。

以下是本题的程序和结果:

optionslinesize=76nodate;

datapoplar;

doblock=1to3;

dotime=1to5;

inputtrans@@;

output;

end;

end;

cards;

0.71.02.313.11.9

1.51.23.04.31.5

1.11.11.00.91.2

;

procanova;

classblocktime;

modeltrans=blocktime;

run;

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

ClassLevelInformation

ClassLevelsValues

block3123

time512345

 

Numberofobservations15

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

DependentVariable:

trans

Sumof

SourceDFSquaresMeanSquareFValuePr>F

Model672.556000012.09266671.530.2809

Error863.10133337.8876667

CorrectedTotal14135.6573333

 

R-SquareCoeffVarRootMSEtransMean

0.534848117.67452.8084992.386667

 

SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F

block218.825333339.412666671.190.3519

time453.7306666713.432666671.700.2416

从上表中的结果可以看出,如果按随机化完全区组设计进行分析,不同时间点之间的差异不显著。

归纳成一般格式的方差分析表如下:

变差来源

平方和

自由度

均方

F

P

区组

18.82533333

2

9.41266667

1.19

0.3519

时间点

53.73066667

4

13.43266667

1.70

0.2416

误差

63.10133333

8

7.8876667

总和

135.6573333

14

12.2测定了新疆维吾尔、哈萨克、柯尔克孜族乡村不同年龄的男生(n=100),50米跑的平均成绩(s),结果如下[10]:

年龄/a

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

维吾尔

10.54

10.16

9.58

9.41

9.11

8.83

8.65

8.24

7.89

7.85

7.70

7.41

哈萨克

10.27

9.70

9.38

9.21

8.84

8.74

8.32

7.92

7.69

7.48

7.40

7.40

柯尔克孜

11.19

10.66

10.12

9.84

9.48

9.24

8.94

8.50

8.27

7.91

7.76

7.63

该试验的目的,是为了推断不同民族间,男生50米跑的平均成绩差异是否显著。

首先判断该试验属于一种什么设计,然后再计算。

答:

该试验为随机化完全区组设计,年龄为区组。

程序不再给出,下面只给出结果。

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

ClassLevelInformation

ClassLevelsValues

block12123456789101112

people3123

 

Numberofobservations36

 

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

DependentVariable:

second

Sumof

SourceDFSquaresMeanSquareFValuePr>F

Model1338.513291672.96256090193.30<.0001

Error220.337183330.01532652

CorrectedTotal3538.85047500

 

R-SquareCoeffVarRootMSEsecondMean

0.9913211.4048260.1238008.812500

 

SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F

block1136.340275003.30366136215.55<.0001

people22.173016671.0865083370.89<.0001

从方差分析可知,不同民族间,男生50米跑的平均成绩差异极显著。

归纳成一般格式的方差分析表如下:

变差来源

平方和

自由度

均方

F

P

区组

36.34027500

11

3.30366136

215.55

<0.0001

民族间

2.17301667

2

1.08650833

70.89

<0.0001

误差

0.33718333

22

0.01532652

总和

38.85047500

35

12.3测试了新疆维吾尔、哈萨克、柯尔克孜族乡村不同年龄男生(n=100)立位体前屈的平均次数,结果如下[10]:

年龄/a

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

维吾尔

6.65

7.28

7.65

7.63

7.72

7.79

9.12

9.27

12.87

12.83

14.91

16.30

哈萨克

6.94

7.31

6.03

6.50

7.23

6.36

7.52

7.47

10.31

11.91

12.89

13.08

柯尔克孜

5.15

5.56

5.83

6.38

6.80

7.12

8.16

10.77

12.03

15.74

16.89

17.65

与上题类似,请推断三个不同民族间,男生立位体前屈平均次数差异是否显著?

答:

与上题类似,以下只给出结果。

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

ClassLevelInformation

ClassLevelsValues

block12123456789101112

people3123

 

Numberofobservations36

 

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

DependentVariable:

number

Sumof

SourceDFSquaresMeanSquareFValuePr>F

Model13418.889736132.222287422.21<.0001

Error2231.92336111.4510619

CorrectedTotal35450.8130972

 

R-SquareCoeffVarRootMSEnumberMean

0.92918712.692991.2046009.490278

 

SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F

block11405.385697236.853245225.40<.0001

people213.50403896.75201944.650.0206

从上述计算结果可以看出,不同民族间,男生立位体前屈平均次数,在α=0.05水平上差异显著。

归纳成一般格式的方差分析表如下:

变差来源

平方和

自由度

均方

F

P

区组

405.3856972

11

36.8532452

25.40

<0.0001

民族间

13.5040389

2

6.7520194

4.65

0.0206

误差

31.9233611

22

1.4510619

总和

450.8130972

35

12.4一项促进刺五加苗木木质化试验[84],选择4种生长刺激剂各选择3种浓度,设计方案见下表:

刺激剂

多效唑(A)

比久(B)

矮壮素(C)

富尔655(D)

稀释倍数

500

600

700

100

200

300

500

700

1000

500

600

700

重复数

3

3

3

3

3

3

3

3

3

3

3

3

按上述方案,每重复调查30株,记录木质化的株数,试验结果如下:

刺激剂

多效唑(A)

比久(B)

矮壮素(C)

富尔655(D)

稀释倍数

500

600

700

100

200

300

500

700

1000

500

600

700

重复

23

29

20

28

20

9

11

10

11

8

16

19

22

26

12

26

19

26

18

16

20

15

21

13

16

22

19

15

18

26

18

9

21

14

20

17

先考虑这是哪一种试验设计?

根据实验设计的要求做方差分析并解释所得结果。

答:

这是一个套设计,所得结果是服从二项分布的随机变量,需做反正弦变换。

optionslinesize=76nodate;

datanested;

doreagent=1to4;

domultiple=1to3;

dorep=1to3;

infile'e:

\data\er12-4e.dat';

inputnum@@;

number=arsin(sqrt(num/30))*180/3.14159265;

output;

end;

end;

end;

procanova;

classreagentmultiple;

modelnumber=reagentmultiple(reagent);

testh=reagente=multiple(reagent);

run;

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

ClassLevelInformation

ClassLevelsValues

reagent41234

multiple3123

 

Numberofobservations36

 

TheSASSystem

TheANOVAProcedure

DependentVariable:

number

Sumof

SourceDFSquaresMeanSquareFValuePr>F

Model112535.035123230.4577382.200.0513

Error242511.056137104.627339

CorrectedTotal355046.091260

 

R-SquareCoeffVarRootMSEnumberMean

0.50237619.7850910.2287551.69928

 

SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F

reagent31295.597384431.8657954.130.0171

multiple(reagent)81239.437739154.9297171.480.2160

 

TestsofHypothesesUsingtheAnovaMS

formultiple(reagent)asanErrorTerm

SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F

reagent31295.597384431.8657952.790.1095

从方程分析结果可知,不同刺激剂(reagent)的显著水平P=0.1095,套在刺激剂下之稀释倍数(multiple)的显著水平P=0.2160。

两者都是不显著的。

套设计,归纳成一般格式的方差分析表如下:

变差来源

平方和

自由度

均方

F

P

刺激剂

1295.597384

3

431.865795

2.79

0.1095

倍数(刺激剂)

1239.437739

8

154.929717

1.48

0.2160

误差

2511.056137

24

104.627339

总和

5046.091260

35

12.5为了研究不同稀释剂对活菌数的影响,设计了下述实验[85]:

吸取制备好的菌液,分别加入8种稀释剂中,每种1mL,控制各稀释剂中含菌量约为50cfu/mL。

在0,1,2,3,4,5小时,从每一稀释剂中取1mL倾入一个平皿内,再取1mL倾入另一个平皿内。

加入45℃营养琼脂培养基20mL,于34℃培养48h,计数。

请同学们分析一下,这是哪一种实验设计?

有没有更好的设计方法?

答:

根据作者的初衷,本实验应当是一个裂区设计,目的是研究不同稀释剂对活菌数的影响。

根据裂区实验设计的特点,放在次区的因素检验效率更高,故主因素应当放在次区。

根据裂区设计的这个特点,更理想的设计是把时间放在主区,在每一时间下,配制8种稀释剂。

这样安排虽然增加了实验工作量,但得到的信息更可靠。

12.6试验采用六种密度(A,B,C,D,E,F)和四个年份(1996-1999)观察湿地松树高(cm)生长情况[86]。

以下是引用的部分原文内容:

A市密度试验,采用随机区组排列,设6个密度处理,即1m×1.5m,1.5m×2m,2m×2m,2m×2.5m,2m×3m,2.5m×3m分别用A,B,C,D,E,F表示,4次重复,小区面积600m2。

A市B镇C村6个不同密度处理的试验林4年的树高调查观测资料见下表。

A市密度试验林树高生长情况表

区组

年度

小区

A

B

C

D

E

F

I

1996

39.03

43.54

41.96

45.96

43.27

41.75

1997

83.5

90.5

99.5

81.5

85.2

84.8

1998

1.34

1.29

1.93

1.42

1.25

1.16

1999

2.20

2.10

2.0

2.0

1.4

1.9

II

1996

43.64

40.90

40.25

49.33

41.87

45.80

1997

83.8

95.0

90.0

104.5

87.5

94.2

1998

1.51

1.37

1.51

1.56

1.25

1.35

1999

1.7

2.0

2.2

2.3

1.4

1.7

III

1996

42.84

42.13

46.31

43.41

41.44

47.83

1997

81.1

82.3

92.2

90.1

77.3

99.2

1998

1.66

1.42

1.25

1.32

1.45

1.26

1999

2.1

2.3

2.2

2.1

1.9

2.1

IV

1996

39.24

38.22

43.28

38.36

37.39

39.55

1997

74.9

67.2

78.3

75.9

63.8

86.2

1998

1.31

1.41

1.34

1.30

1.05

1.44

1999

2.1

2.2

1.9

1.9

1.9

2.1

平均

1996

41.19

41.20

42.95

44.27

40.99

43.73

1997

80.83

83.75

90.0

88.0

78.45

91.1

1998

1.46

1.37

1.51

1.40

1.25

1.30

1999

2.03

2.15

2.08

2.08

1.05

1.95

注:

1996-1998年单位为cm,1999年单位为m。

“A市密度试验林树高方差分析表

年度

方差分析结果

离差来源

平方和

自由度

均方

均方比(F)

组间

41.79461

5

8.35892

0.8459

1996

组内

177.86267

18

9.88126

总的

219.65729

23

注:

另三个年度与1996年的分析方法完全一样,这里只引用了1996年一个年度的分析结果。

请读者考虑对于以上数据,是否有更好的处理方法。

答:

1.试验采用随机区组设计,但没有给出区组的排列,仅仅给出了4次重复。

2.在第1个表中将4个年度作为1个区组是不合适的。

根据区组的定义,区组内的条件应当是尽量一致的,不同年份间的条件差别是很大的,不能作为一个区组。

3.第1个表的“注”里1998年的单位也应当是“m”。

4.第2个方差分析表,并未采用随机区组方差分析方法处理数据,在方差分析表中未出现“区组”项。

5.表4是按完全随机化设计方法处理的数据,但不知在设计试验时是否在7个密度和4次重复间进行了完全随机化。

作为一个随机化完全区组设计,以年度作为区组会更合理一些。

因为在一个年度内的自然条件是一致的(前提是土壤条件一致),符合区组的要求。

虽然在年度间不能将密度进行随机化,但只要土壤条件一致,这点还是允许的。

每一个年度内有4次重复,由于增加了重复次数,即增加了误差自由度,使密度间的差异更容易检验出来。

下表是按年度整理出的结果,表中的数据为树的(cm)。

年度

重复

密度/(株·600m-2)

A

B

C

D

E

F

1996

1

39.03

43.54

41.96

45.96

43.27

41.75

2

43.64

40.90

40.25

49.33

41.87

45.80

3

高度42.84

42.13

46.31

43.41

41.44

47.83

4

39.24

38.22

43.28

38.36

37.39

39.55

1997

1

83.5

90.5

99.5

81.5

85.2

84.8

2

83.8

95.0

90.0

104.5

87.5

94.2

3

81.1

82.3

92.2

90.1

77.3

99.2

4

74.9

67.2

78.3

75.9

63.8

86.2

1998

1

134

129

193

142

125

116

2

151

137

151

156

125

135

3

166

142

125

132

145

126

4

131

141

134

130

105

144

1999

1

220

210

200

200

140

190

2

170

200

220

230

140

170

3

210

230

220

210

190

210

4

210

220

190

190

190

210

以年度作为区组进行方差分析的程序和结果如下:

optionslinesize=76nodate;

datanested;

doblock=1to4;

dodensity=1to6;

dorep=1to4;

infile'e:

\data\er12-6e.dat';

inputheight@@;

output;

end;

end;

end;

procanova;

classblockdensity;

modelheight=blockdensity;

run;

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