生物化学课程实验指导书.docx
《生物化学课程实验指导书.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物化学课程实验指导书.docx(26页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
生物化学课程实验指导书
《生物化学》实验指导书
适用专业:
生物技术、生物工程、食品科学与工程
生物与食品工程学院生物科学系
生物化学实验细则
为了保证生物化学实验的顺利进行,培养同学们掌握良好、规范的生物化学基本实验技能,特制定以下实验细则,请同学们严格遵守。
1.实验前应提前预习实验指导书并复习相关知识。
2.严格按照生物化学实验分组,分批进入实验室,不得迟到。
非本实验组的同学不准进入实验室。
3.进入实验室必须穿实验服。
各位同学进入各自实验小组实验台后,保持安静,不得大声喧哗和嬉戏,不得无故离开本实验台随便走动。
绝对禁止用实验仪器或药物开玩笑。
4.实验中应保持实验台的整洁,废液倒入废液桶中,用过的滤纸放入垃圾桶中,禁止直接倒入水槽中或随地乱丢。
5.实验中要注意节约药品与试剂,爱护仪器,使用前应了解使用方法,使用时要严格遵守操作规程,不得擅自移动实验仪器。
否则,因非实验性损坏,由损坏者赔还。
6.使用水、火、电时,要做到人在使用,人走关水、断电、熄火。
7.做完实验要清洗仪器、器皿,并放回原位,擦净桌面。
8.实验后,要及时完成实验报告。
2006年1月
生物化学实验细则···································1
目录··············································2
实验1蛋白质的沉淀、变性反应······················3
实验2醋酸纤维素薄膜电泳分离血清蛋白·············6
实验3—聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子量···11
实验4凝胶过滤层析法测定蛋白质分子量·············16
实验5的琼脂糖凝胶电泳······················20
实验6唾液淀粉酶的性质和活力测定·················24
实验7生物氧化与电子传递·························25
实验8植物体内的转氨基作用·······················27
实验1蛋白质的沉淀、变性反应
(3学时)
目的要求
1.加深对蛋白质胶体溶液稳定因素的认识。
2.了解沉淀蛋白质的几种方法及其实用意义。
3.了解蛋白质变性与沉淀的关系。
4.了解蛋白质两性性质
原理
在水溶液中,蛋白质分子表面形成水化层和双电层而成为稳定的胶体颗粒,所以蛋白质溶液和其他亲水胶体溶液相类似。
但是,蛋白质胶体颗粒的稳定性是有条件的,相对的。
在一定的物理化学因素影响下,蛋白质颗粒失去电荷,脱水,甚至变性,则以固态形式从溶液中析出,这个过程称为蛋白质的沉淀反应。
这种反应可分为以下两种类型:
1.可逆沉淀反应
在发生沉淀反应时,蛋白质虽已沉淀析出,但它的分子内部、空间结构并未发生显著变化,基本上保持原有的性质,沉淀因素除去后,能再溶于原来的溶剂中。
这种作用称为可逆沉淀反应。
如大多数蛋白质的盐析作用或在低温下用乙醇(或丙酮)短时间作用于蛋白质以及利用等电点的沉淀,提纯蛋白质时,常利用此类反应。
2.不可逆沉淀反应
在发生沉淀反应时,蛋白质分子内部结构、空间构象遭到破坏,失去原来的天然性质,这时蛋白质已发生变性。
这种变性蛋白质的沉淀不能再溶解于原来溶剂中的作用称为不可逆沉淀反应。
重金属盐、生物碱试剂,强酸、强碱、加热、震荡、超声波、有机溶剂等都能使蛋白质发生不可逆沉淀反应。
蛋白质变性后,有时由于维持溶液稳定的条件仍然存在(如电荷)并不析出,因此,变性蛋白质不一定都表现为沉淀,而沉淀的蛋白质也未必都已变性。
试剂和器材
一、试剂
1.蛋白质溶液:
取5鸡或鸭蛋清,用蒸馏水稀释至100,搅拌均匀后用4—8层纱布过滤,新鲜配置。
2.蛋白质氯化钠溶液:
取20蛋清,加蒸馏水200和饱和氯化钠溶液100,充分搅匀后,以纱布滤去不溶物(加入氯化钠的目的是溶解球蛋白)。
3.其余试剂:
硫酸铵粉末,饱和硫酸铵溶液(150),3%硝酸银(280),0.5%乙酸铅(200),浓硫酸(5组),5%磺基水杨酸(100),0.1%硫酸铜(100),饱和硫酸铜溶液(400),0.1%乙酸(500),10%乙酸(500),饱和氯化钠溶液(25),10%氢氧化钠溶液(500)。
二、器材
试管,过滤漏斗,试管架,玻璃棒,沸水浴,量筒,烧杯,试剂瓶,移液管,滤纸,洗瓶,废液缸,药匙,移液管架。
操作方法
一、蛋白质的可逆沉淀反应—蛋白质的盐析作用(分级盐析)
二、蛋白质的不可逆沉淀反应
1.重金属沉淀蛋白质
2.酸沉淀蛋白质
1)
2)
3.加热沉淀蛋白质
取5支试管,编号,按下表加入有关试剂(单位/滴)。
蛋白质溶液
0.1%乙酸
10%乙酸
饱和氯化钠
10%氢氧化钠
蒸馏水
1
2
3
4
5
10
10
10
10
10
—
5
—
—
—
—
—
5
5
—
—
—
—
2
—
—
—
—
—
2
7
2
2
—
5
将各管混匀,观察记录各管现象后,放入沸水浴中加热10,比较各管的沉淀情况。
思考题
1.名词解释:
水化层;双电层;蛋白质变性;盐溶与盐析;蛋白质等电点沉淀。
2.将实验结果写在实验报告中操作方法的对应位置上并就实验现象作简要解释。
3.根据实验现象,讨论下列问题:
1)蛋白质可逆沉淀与不可逆沉淀的本质区别是什么?
2)简述蛋白质的沉淀反应、变性作用和凝固作用的相互关系。
4.作为杀菌剂,氯化汞是怎样起作用的?
实验2醋酸纤维素薄膜电泳分离血清蛋白
(4学时)
目的要求
1.学习蛋白质电泳的一般原理及方法。
2.掌握用醋酸纤维素薄膜电泳分离蛋白质的操作技术。
原理
带电颗粒在电场的作用下,向着与其电性相反的电极移动,这种现象称为电泳。
带电颗粒之所以能在电场中向一定的方向移动,并具有一定的迁移速度,是取决于带电颗粒本身性质的影响,以及电场强度、溶液的值、离子强度及电渗等因素的影响。
蛋白质具有两性性质,在溶液中可解离的基团除肽链末端的α—氨基和α—羧基外,还有很多侧链基团在一定的条件下能解离而使蛋白质带电。
当溶液的>(等电点)时,蛋白质带负电荷,在电场中向正极移动,而的<时,则带正电荷,电泳时向负极移动。
由于蛋白质分子在溶液中解离成带电的颗粒,所以在电场中除等电点外均能定向泳动,其电泳的方向和速度主要决定于所带电荷的性质,以及所带电荷数量、颗粒大小和形状。
不同的带电颗粒在同一电场中泳动速度不同,常用迁移率来表示。
迁移率的定义是指带电颗粒在单位电场强度下的泳动速度。
其计算公式如下:
式中:
m为迁移率(2·s);v为颗粒的泳动速度();E为电场强度();d为颗粒泳动的距离();l为支持物的有效长度();V为实际电压 (V);t为电泳时间(s)。
各种蛋白质的等电点、分子量及颗粒大小各不相同,在某一指定的值溶液中,各种蛋白质所带的电荷不同,因而在电场中迁移的方向和速度不同。
根据这个原理,就可以从蛋白质混合物中将各种蛋白质分离出来。
因此,电泳技术在生物化学与分子生物学研究中被广泛用于生物大分子或小分子(如蛋白质、核酸、氨基酸等)的分离纯化与分析鉴定等。
同时此项技术也普遍用于临床诊断和工农业生产实践中,并已发展成为这些部门的重要分析分离手段。
醋酸纤维素薄膜电泳是以醋酸纤维素薄膜为支持物的一种区带电泳。
这种薄膜具有均一的泡沫状结构,厚度为120μm,渗透性强,对样品无吸附作用,用它作支持物进行电泳,电泳效果比纸电泳好,具有样品用量少,分离速度快,电泳图谱更为清晰,灵敏度也较高(5μg/以上)等优点。
目前已广泛应用于血清蛋白、血红蛋白、脂蛋白、同工酶的分离和测定等方面。
本实验以醋酸纤维素薄膜为电泳支持物,分离各种血清蛋白。
血清中含有清蛋白、α-球蛋白、β-球蛋白、γ-球蛋白和各种脂蛋白等。
各种蛋白质由于氨基酸组分、立体构象、分子量、等电点及形状不同(如图2-1),在电场中迁移速度不同。
分子量小、等电点低、在相同碱性缓冲体系中、带负电荷多的蛋白质颗粒在电场中迁移速度快。
例如,正常人血清在8.6的缓冲体系中电泳1h左右,染色后可显示5条区带。
清蛋白泳动最快,其余依次为α1,α2,β-及γ-球蛋白(如图2-2)。
这些区带经洗脱后可用分光光度法定量,也可直接进行光吸收扫描自动绘出区带吸收峰及相对百分比。
临床医学常利用它们间相对百分比的改变或异常区带的出现作为临床鉴别诊断的依据。
蛋白质名称
等电点()
分子量
清蛋白
α-球蛋白
β-球蛋白
γ-球蛋白
4.88
5.06
5.12
6.85——7.50
69000
α1-200000
α2-300000
90000——150000
156000——300000
图2-1人血清中5种蛋白质的等电点及分子量
图2-2正常人血清醋酸纤维素薄膜电泳示意图
1为清蛋白(或称为白蛋白),2、3、4、5分别为α1-、α2-、β-及γ-球蛋白,6为点样原点
试剂和器材
一、测试材料
未溶血的人或动物血清。
二、试剂
1.巴比妥—巴比妥钠缓冲液(8.6,0.07,离子强度0.06):
称取1.66g巴比妥()和12.76g巴比妥钠(),置于三角烧瓶中,加蒸馏水约600,稍加热溶解,冷却后用蒸馏水定容至1000。
置4℃保存,备用。
2.染色液(0.5%氨基黑10B):
称取0.5g氨基黑10B,加蒸馏水40,甲醇()50,冰乙酸()10,混匀溶解后置具塞试剂瓶内贮存。
3.漂洗液:
取95%乙醇()45,冰乙酸()5和蒸馏水50,混匀置具塞试剂瓶内贮存。
三、器材
醋酸纤维素薄膜(2×8),培养皿,镊子,直尺和铅笔,电泳仪及电泳槽,试管及试管架,普通滤纸。
操作方法
一、薄膜与仪器的准备
1.醋酸纤维素薄膜的润湿与选择
用镊子取一片薄膜,小心地平放在盛有缓冲液的平皿中。
若漂浮于液面的薄膜在15—30s内迅速润湿,整条薄膜色泽深浅一致,则此膜均匀可用于电泳;若薄膜润湿缓慢,色泽深浅不一或有条纹及斑点等,则表示薄膜不均匀应弃去,以免影响电泳结果。
将选好的薄膜用镊子轻压,使其完全浸泡于缓冲液中约30后,方可用于电泳。
2.电泳槽的准备
根据电泳槽膜支架的宽度,裁剪尺寸合适的滤纸条。
在两个电极槽中,各倒入等体积的电极缓冲液,在电泳槽的两支架上,各放一层滤纸条,使滤纸一端的边与支架前沿对齐,另一端侵入电极缓冲液内。
当滤纸条全部润湿后,用玻璃棒轻轻挤压在膜支架上的滤纸以驱赶气泡,使滤纸的一端能紧贴在膜支架上。
滤纸条是两个电极槽联系醋酸纤维素薄膜的桥梁。
用平衡装置连接两个电泳槽,使两个电极槽内的缓冲液彼此处于同一水平状态。
二、点样
1.制备点样模板
取一张干净滤纸(10×10),在距纸边1.5处用铅笔划一平行线,此线为点样标志区。
2.点样
用镊子取出浸透的薄膜,夹在两层滤纸间轻轻按压,吸去多余的缓冲液。
无光泽面向上平放在点样模板上,使其底边与模板底边对齐。
点样区距阴极端1.5处。
点样时,先用玻片一端截面沾取一定量的血清,然后将沾有样品的玻片截面垂直地与纤维素薄膜点样区处轻轻接触,样品即呈一条线“印”在薄膜上,(如图2-3)使血清完全渗透至薄膜内,形成细窄而均匀的直线。
此步是实验的关键,点样前应在滤纸上反复练习,掌握点样技术后再正式点样。
图2-3醋酸纤维素薄膜规格及点样位置示意图。
虚线处为点样位置
三、电泳
用镊子将点样端的薄膜平贴在阴极电泳槽支架的滤纸桥上(点样面朝下),另一端平贴在阳极端支架上,如图所示。
要求薄膜紧贴滤纸桥并绷直,中间不能下垂。
如一电泳槽中同时安放几张薄膜,则薄膜之间应相隔几毫米。
盖上电泳槽盖,使薄膜平衡10。
图2-4电泳装置剖视示意图
1.滤纸桥2.电泳槽3.醋酸纤维素薄膜4.电泳槽支架5.电极室中央隔板
用导线将电泳槽的正、负极分别连接,注意不要接错。
在室温下电泳,打开电源开关,用电泳仪上细调节旋扭调到每厘米膜宽电流强度为0.3(8片薄膜则为4.8)。
通电10—15后,将电流调节到每厘米膜宽电流强度为0.5(8片共8),电泳时间约50—80。
电泳后调节旋扭使电流为零,关闭电泳仪切断电源。
四、染色与漂洗
用解剖镊子取出电泳后的薄膜,放在含0.5%氨基黑10B染色液的培养皿中,浸染5。
取出后再用漂洗液浸洗、脱色,每隔10换漂洗液一次,连续数次,直至背景蓝色脱尽。
取出薄膜放在滤纸上,用吹风机的冷风将薄膜吹干。
注意事项
1.醋酸纤维素薄膜的预处理
市售醋酸纤维素薄膜均为干膜片,薄膜的浸润与选膜是电泳成败的重要关键之一。
将干膜片漂浮于电极缓冲液表面,其目的是选择膜片厚薄均匀,如漂浮15—30s时,膜片吸水不均匀,则有白色斑点或条纹,这提示膜片厚薄不均匀,应弃去不用,以免造成电泳后区带扭曲,界限不清,背景脱色困难,结果难以重复。
由于醋酸纤维素薄膜亲水性比纸小,浸泡30以上是保证膜片上有一定量的缓冲液,并使其恢复到原来多孔的网状结构。
最好是让漂浮于缓冲液的薄膜吸满缓冲液后自然下沉,这样可将膜片上聚集的小气泡赶走。
点样时,应将膜片表面多余的缓冲液用滤纸吸去,以免缓冲液太多引起样品扩散。
但也不能吸得太干,太干则样品不易进入薄膜的网孔内,而造成电泳起始点参差不齐,影响分离效果。
吸干的程度以不干不湿为宜。
为防止指纹污染,取膜时,应戴指套或用夹子。
2.缓冲液的选择
醋酸纤维素薄膜电泳常选用8.6巴比妥缓冲液,其浓度为0.05—0.09。
选择何种浓度与样品及薄膜的厚薄有关。
在选择时,先初步定下某一浓度,如电泳槽电极之间的膜长度为8—10,则需电压25膜长,电流强度为0.4—0.5膜宽。
当电泳时达不到或超过这个值时,则应增加缓冲液浓度或进行稀释。
缓冲液浓度过低,则区带泳动速度快,并由于扩散变宽;缓冲液浓度过高,则区带泳动速度慢,区带分布过于集中,不易分辨。
3.加样量
加样量的多少与电泳条件、样品的性质、染色方法与检测手段灵敏度密切相关。
作为一般原则,检测方法越灵敏,加样量越少,对分离更有利。
如加样量过大,则电泳后区带分离不清楚,甚至互相干扰,染色也较费时。
如电泳后用洗脱法定量时,每厘米加样线上需加样品0.1—5μL,约相当51000μg蛋白。
血清蛋白常规电泳分离时,每厘米加样线加样量不超过1μL,相当于6080μg蛋白质。
但糖蛋白和脂蛋白电泳时,加样量则应多些。
对每种样品加样量应先作预实验加以选择。
点样好坏是获得理想图谱的重要环节之一,以印章法加样时,动作应轻、稳,用力不能太重,以免将薄膜弄破或印出凹陷而影响电泳区带分离效果。
4.电量的选择
电泳过程应选择合适的电流强度,一般电流强度为0.4—0.5膜宽为宜。
电流强度高,则热效应高,尤其在温度较高的环境中,可引起蛋白质变性或由于热效应引起缓冲液中水分蒸发,使缓冲液浓度增加,造成膜片干涸。
电流过低,则样品泳动速度慢且易扩散。
5.染色液的选择
对纤维素薄膜电泳后应根据样品的特点加以选择。
其原则是染料对被分离样品有较强的着色力,背景易脱色;应尽量采用水溶性染料,不宜选择醇溶性染料,以免引起醋酸纤维素薄膜溶解。
应控制染色时间。
时间长,薄膜底色深不易脱去;时间太短,着色浅不易区分,或造成条带染色不均匀,必要时可进行复染。
思考题
1.通过本次实验,讨论下列问题:
(1)简述醋酸纤维薄膜电泳原理。
(2)根据人血清中血清蛋白各组分等电点,如何估计它们在8.6的巴比妥—巴比妥钠电极缓冲液中,移动的相对位置。
(3)醋酸纤维素薄膜与滤纸相比较,有哪些优点?
(4)电泳时为什么要将点样的一端靠近负极端?
实验4葡聚糖凝胶过滤层析法测定蛋白质分子量
(4学时)
目的要求
1.初步掌握利用凝胶层析法测定蛋白质分子量的原理。
2.学习用标准蛋白质混合液制作,对
的“选择曲线”以及测定未知蛋白质样品分子量的方法。
原理
凝胶是由胶体溶液凝结而成的固体,它们的内部有很细微的多孔网状结构。
目前关于凝胶层析的原理有许多假设和理论,普遍接受的是分子筛效应。
凝胶颗粒在合适的溶剂中浸泡,充分吸液膨胀,然后装入层析柱内,加入欲分离的混合物后,再以同一溶剂洗脱。
在洗脱过程中,大分子不能进入凝胶内部而沿凝胶颗粒间的空隙最先流出柱外,而小分子可以进入凝胶颗粒内部的多孔网状结构,流速缓慢,以至最后流出柱外,从而使样品中分子大小不同的物质得到分离。
对凝胶层析分离的简单过程可用图4-1表示。
图4-1小分子由于扩散作用进入凝胶颗粒内部而被滞留,
大分子被排阻在凝胶颗粒外面,在颗粒之间迅速通过。
外水体积、内水体积、柱床体积、洗脱体积
外水体积()是指凝胶柱中凝胶颗粒周围空间的体积内水体积()是指凝胶颗粒中孔穴的体积。
柱床体积是()凝胶柱所能容纳的总体积
洗脱体积()是指将样品中某一组分洗脱下来所需洗脱液的体积。
它包括自加入样品时算起,到组分最大浓度出现时所流出的体积。
一般是介于和之间的。
对于完全排阻的大分子由于其不进入凝胶颗粒内,故其洗脱体积
=
对于完全渗透的小分子由于它可以存在于凝胶柱整个体积内,故其洗脱体积
=
分子量介于二者之间的分子,它们的洗脱体积也介于二者之间。
洗脱容积是自加入样品时算起,到组分最大浓度峰出现时所流出的容积,它与V0的关系为:
式中为分子量不同的溶质在凝胶内部和外部的分配系数,只与被分离物质分子的大小和凝胶颗粒空隙的大小分布有关。
上式可改写成:
是有效分配系数,对交联度小的凝胶与差别较小,而对交联度大的凝胶二者差别较大。
可用下式表示:
根据凝胶层析原理,对同一类型化合物的特征与组分的分子量有关。
流过凝胶柱时,按分子大小顺序流出,分子量大的走在前面。
洗脱容积是该物质分子量对数的线性函数:
式中,
为常数,
为分子量。
也可以用
(有效分配系数)代替,与分子量的关系同上式,只是常数不同。
通常多以
对分子量的对数作图得一曲线,称为“选择曲线”。
如图4-2所示。
选择曲线的斜率说明凝胶性质的一个很重要的特征。
在允许的工作范围内,曲线愈陡,则分级愈好,而工作范围愈窄。
凝胶层析主要决定于溶质分子量大小,每一类型的化合物如球蛋白类等都有自己特殊的选择曲线,可用于测定未知物的分子量,测定时以使用曲线的直线部分为宜。
图4-2球蛋白分子量选择曲线
为了测定分子量,就必须知道一根特定柱的,V0和,从而计算出,等。
V0可用不被凝胶滞留的大分子物质的溶液,如血红蛋白,印度黑墨水,分子量约200万的蓝色葡聚糖—2000等有颜色的溶液,通过测定大分子物质的洗脱曲线,洗脱峰峰顶洗出的体积就是该柱的V0值。
选一种分子量小于凝胶工作范围下限的化合物,测出其洗脱体积,减去V0就是,常用硫酸铵来测定。
可用下式计算:
为常数3.14,
为柱直径,
为凝胶床的高度。
试剂和器材
一、试剂
1.标准蛋白质混合液:
1组
3蓝色葡聚糖,8肌红蛋白。
溶剂为含15%()甘油的洗脱缓冲液。
2.洗脱液[0.05—盐酸溶液(7.5),内含0.1]:
500.1溶液与40.30.1盐酸混匀后,溶解0.585克,加水稀释至100,即得洗脱液
3.75
二、器材
层析柱:
柱管(直径1.0~1.3cm;管长50cm)1个/组,试管,玻璃棒,滤纸,移液管,(721分光光度计)试管架、铁架台
操作方法
一、一般操作方法
1.凝胶的处理(教师准备)
将称好的干粉倾入过量的洗脱液中,在室温下放置,使之充分溶胀。
为了缩短时间,可在沸水浴中加热将近100℃,这样可缩短溶胀时间至几小时,而且可以杀死细菌和霉菌,并排除凝胶内气泡。
2.装柱
装柱前将凝胶上面过多的溶液倾出,用真空干燥器抽尽凝胶中空气。
关闭层析柱出水口,并向柱管内加入约1/3柱容积的洗脱液,然后在缓慢搅拌下,将浓浆状的凝胶连续地倾入柱中,使之自然沉降,待凝胶沉降约2—3cm后,打开柱的出口,调节合适的流速,使凝胶继续沉集,待沉集的胶面上升到离柱的顶端约5cm处时停止装柱,关闭出水口。
接着通过2—3倍柱床容积的洗脱液使柱床稳定,然后在凝胶表面上放一张滤纸片或一团脱脂棉,以防将来在加样时凝胶被冲起,并始终保持凝胶上端有一段液体。
3.加样
加紧上、下进出水口夹子,以防止操作压改变。
用1移液管吸取1样品混合液,将移液管尖端小心插入柱中液面下方1处,小心释放样品,使其在脱脂棉上端形成一个层面,过程大约需要2分钟完成。
看到样品层刚好完全流入凝胶床时,向柱上小心的添加缓冲液至合适高度(约5左右),以保证流速的稳定。
(注意:
不能使胶床上端无充裕的缓冲液,以防干裂)
4.洗脱
洗脱时,打开上、下进出口夹子,先收集10流出液,用洗脱液以每管4管流速洗脱,用试管收集流出液,并对每管编号。
当所有有色物质洗脱下来后,关闭螺旋夹停止洗脱。
然后在对应的波长下读各管的光吸收值。
二、蛋白质分子量的测定
1.测定V0和
将0.5蓝色葡聚糖—2000和硫酸铵混合液
(2)上柱、洗脱,分别测出蓝色葡聚糖的洗脱体积即为该柱的V0,硫酸铵的洗脱体积即为该柱的。
蓝色葡聚糖的洗脱峰可根据颜色判断,硫酸铵的洗脱峰用()2判断。
2.标准曲线的制作
按上述方法将1标准蛋白质混合液上柱、洗脱,用试管收集。
`收集后,于以下对应波长下读各管的光吸收值:
蓝色葡聚糖(蓝色):
650
肌红蛋白(琥珀色):
500
以洗脱体积为横坐标,光吸收值为纵坐标作洗脱曲线。
根据洗脱峰位置,量出每种蛋白质的洗脱体积(),然后以蛋白质分子量的对数为纵坐标,为横坐标,作出标准曲线。
同时根据已测出的V0和以及计算出的,求出。
也可以为横坐标,为纵坐标作出标准曲线。
3.未知样品分子量的测定
将未知样品按标准曲线的条件操作。
根据洗脱峰的位置,量出洗脱体积,也可以计算出,分别由标准曲线查得样品的分子量。
思考题
1.根据实验中遇到的各种问题,概述做好本实验的经验与教训。
2.凝胶过滤的介质有哪些,各过滤介质的异同是什么?
3.通过本次实验学习,讨论—和凝胶过滤法测定蛋白质分子量的异同。
实验5的琼脂糖凝胶电泳
(4学时)
目的要求
1.掌握琼脂糖凝胶电泳分离的原理和方法。
2.学习利用琼脂糖电泳方法测定片段大小。
3.学习有关建立限制性内切酶图谱的基本技术。
原理
分子在碱性环境中(8.3缓冲液)带负电荷,外加电场作用下,向正极泳动。
不同的片段由于其电荷、分子量大小及构型的不同,在电泳时的泳动速率就不同,从而可以区分出不同的区带,电泳后经溴乙锭染色,在波长254紫外光照射下,显橙红色荧光。
琼脂糖凝胶电泳对的分离作用主要依据的分子量及分子构型,同时与凝胶的浓度也有密切关系。
一定大小的片段在不同浓度的琼脂糖凝胶中,电泳迁移率不相同。
不同浓度的琼脂糖凝胶适宜分离片段大小范围见表1。
因而要有效分离大小不同的片段,主要是选用适当的琼脂糖凝胶浓度。
不同构型的在琼脂糖凝胶中的电泳速度差别较大。
在分子量相当的情况下,不同构型的移动速度次序如下:
共价闭环>直线>开环的双链环状。
在同一浓度的凝胶中,分子量较小的片段比较大的片段快。
片段的迁移距离(迁移率)与它的大小(分子量)的对数成反比。
将未知的迁移距离与已知分子大小的标准物的电泳迁移距离进行比较,即可计算出未知片段的大小。
琼脂糖凝胶浓度
可分辨的线性大小范围
0.3
60—5
0.6
20—1
0.7
10—0.8
0.9
7—0.5
1.2
6—0.4
1.5
4—0.2
2.0
3—0.1