浅论RANTESWord文档格式.docx
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RANTES-403A等位基因与RSV毛细支气管炎易感性相关,其可能是影响发病的一个重要候选基因;
未发现MCP-1-2518A/G基因多态性与RSV毛细支气管炎易感性存在关联。
【关键词】呼吸道合胞病毒;
毛细支气管炎;
基因多态性;
RANTES;
MCP-1
Abstract:
?
Objective:
Toexplorethecorrelationofregulatedonactivation,normalTcellexpressedandsecreted(RANTES)andmonocytechemotacticprotein1(MCP-1)genepolymorphismswiththesusceptibilityofrespiratorysyncytialvirus(RSV)bronchiolitis.Methods:
?
RANTES-403G/AandMCP-1-2518A/Gweregenotypedwithpolymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphismin150childrenwithRSVbronchiolitisand120healthysubjects.Results:
ThefrequencyofeachgenotypeforRANTES-403G/Awas%?
(GG),%?
(GA),%?
(AA)incasegroupand%?
(AA)incontrolone,respectively.Therewassignificantdifferencebetweentwogroups?
().Thefrequencyofeachallelewas%(G),%?
(A)incasegroup,and%(G),%?
(A)incontrolgroup.ThefrequencyofAallelewassignificantlyincreasedincasegroup?
();
ChildrencarryingwithAalleleincreasedriskforRSVbronchiolitiscomparedwiththosewithGallele(OR=,).TherewerenosignificantdifferencesforgenotypeandallelefrequencyofMCP-1-2518A/Gbetweentwogroups?
().Conclusion:
RANTES-403AalleleisassociatedwiththesusceptibilityandmaybeoneofcandidategenesforRSVbronchiolitis.NocorrelationisfoundbetweenMCP-1-2518A/GgenepolymorphismsandthesusceptibilityofRSVbronchiolitis.
Keywords:
respiratorysyncytialvirus;
bronchiolitis;
genepolymorphisms;
regulatedonactivation,normalTcellexpressedandsecreted;
monocytechemotacticprotein-1
呼吸道合胞病毒(RSV)是婴幼儿下呼吸道感染最常见的病原,研究显示,RSV感染的气道上皮细胞能产生调节激活正常T细胞表达、分泌的细胞因子(RANTES)和单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)等趋化因子,从而引发过度的气道炎症反应[1-2]。
RSV感染患儿鼻腔盥洗液及鼻咽分泌物RANTES水平明显增高,且与疾病严重程度相关[3-4],有低氧表现的RSV毛细支气管炎患儿鼻炎分泌物中MCP-1水平明显升高,提示趋化因子可能在RSV感染发病中发挥重要作用。
几乎所有儿童2岁时均感染RSV,但仅1%~2%需住院治疗,造成病情差异的原因尚不清楚,许多严重RSV感染患儿并不存在早产、先天性心脏病、支气管肺发育不良等高危因素,因此,宿主的遗传因素与RSV感染发病的关系正成为研究的焦点。
既往研究已证实调控RANTES和MCP-1的基因位点存在多态性[6-7]。
本研究通过病例-对照分析,探讨RANTES-403G/A、MCP-1-2518A/G的单核苷酸多态性(SNPs)与RSV毛细支气管炎易感性的相关性,筛选与疾病易感性相关的SNP位点。
1对象和方法
对象病例组为2006年11月-2007年3月入住温州医学院附属育英儿童医院呼吸科,诊断为RSV毛细支气管炎患儿150例,其中男111例,女39例,年龄1~24个月,有早产、双胎、先天性心脏病、支气管肺发育不良、免疫缺陷等基础疾病者除外。
对照组选择同期健康体检的儿童120例,男92例,女28例,年龄2~24个月。
两组均无特应性疾病史及家族特应性疾病史,均为汉族,无血缘关系。
方法
基因组DNA提取:
用Chelex-100快速提取法提取基因组DNA。
聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检测:
各位点信息、引物、产物长度、PCR反应条件及限制性内切酶见表1。
PCR反应体系为20μL:
PrimerF(10μmol/L)1μL,PrimerR(10μmol/L)1μL,dNTPMix(2mmol/L)2μL,MgCl2(25mmol/L)μL,10×
Buffer2μL,DNA模板2μL,TaqDNA聚合酶(1?
U/μL)μL,去离子水μL。
取PCR产物5μL,限制性内切酶3U,10×
Buffer1μL,余用去离子水补齐,总体积为10μL,37℃水浴箱中酶切过夜。
30g/L琼脂糖凝胶鉴定基因型(见图1、图2)。
统计学处理方法基因型与等位基因频率Hardy-Weinburg平衡吻合程度用x2检验;
基因型及等位基因频率的比较用x2检验;
用Logistic回归模型判断等位基因型对发病危险度的影响。
2结果
/A基因型及等位基因分布病例组和对照组均可见GG、GA、AA3种基因型,以GA杂合子基因型为主;
经Hardy-Weinberg平衡检验,对照组的遗传平衡,表明该群体来自同一孟德尔群体(x2=,);
而病例组的遗传不平衡(x2=,)。
两组基因型频率差异有显着性(x2=,);
病例组A等位基因的频率明显高于对照组(x2=,)(见表2);
与G等位基因携带者相比,A等位基因携带者患RSV毛细支气管炎的风险明显增加(OR=,95%CI:
~,)。
/G基因型及等位基因分布病例组和对照组均可见GG、GA、AA3种基因型,以GA杂合子基因型为主;
经Hardy-Weinberg平衡检验,对照组的遗传平衡(x2=,);
两组基因型和等位基因型频率差异均无显着性(见表3)。
3讨论
RANTES基因位于人染色体,该区域与哮喘等特应性疾病基因连锁,目前,RANTES基因启动子区研究最多的3个多态性位点分别为-403G/A、-109T/C、-28C/G。
其中-403位点G/A的变异,可能对其基因转录造成影响,从而影响疾病的发生发展。
Fryer等发现白人哮喘和特应性个体-403A等位基因频率高于正常个体,推断-403A与哮喘易感性和特应性有关。
文惯宇等也报道-403A可能是特应性体质的易感因素,但未发现RANTES-403G/A位点基因多态性与RSV毛细支气管炎的相关性。
Amanatidou等[10]的研究则发现,RANTES基因-28C/G、-403G/A和/C位点与RSV毛细支气管炎的易感性均无关,但基因型同时为-28C/C、-403G/A和/T的个体易患该病。
本研究结果显示温州地区RSV毛细支气管炎患儿和正常儿童均存在GG、GA和AA3种基因型,两组基因型频率差异有显着性,RSV毛细支气管炎组RANTES-403A等位基因频率高于对照组,与携带G等位基因个体相比,携带A等位基因的个体患毛细支气管炎风险增加了倍,提示RANTES-403A等位基因与RSV毛细支气管炎易感性相关,可能是影响RSV毛细支气管炎发病的一个重要候选基因。
MCP-1编码基因位于人染色体,由3个外显子和2个内含子组成,该段基因亦与哮喘等特应性疾病基因连锁。
目前,MCP-1启动子区研究最多的两个多态性位点为-2518G/A和-2076A/T。
Rovin等报道MCP-1-2518位点基因多态性影响MCP-1的转录及表达水平,MCP-1-2518G等位基因能使MCP-1转录增多,从而使其蛋白表达水平上调。
Szalai等[11]发现MCP-1-2518G等位基因可增加婴幼儿哮喘的易感性,并与病情相关。
目前国内外尚无MCP-1-2518G/A基因多态性与RSV感染发病的报道,本研究未发现MCP-1-2518G/A基因多态性与RSV毛细支气管炎易感性之间存在关联。
综上所述,本研究结果提示RANTES-403A可能是影响RSV毛细支气管炎发病的一个重要候选基因,尽管未发现MCP-1-2518G/A基因多态性与RSV毛细支气管炎易感性之间存在关联,但RANTES和MCP-1位于同一染色体的同一区段,两位点所形成的单体型与RSV毛细支气管炎易感性是否相关,有待进一步探讨。
另外,RANTES基因多态性只能部分解释RSV毛细支气管炎的易感性,本课题组其他研究发现TNF-α-308A等位基因、IL-8-251A与781C等位基因形成的AC单体型均与RSV毛细支气管炎的易感性相关,这些易感基因相互之间是否存在联合或协同作用,目前尚不明了,有待今后进一步研究。
【参考文献】
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[10]AmanatidouV,SourvinosG,ApostolakisS,et genepolymorphismsandsusceptibilitytosevererespiratorysyncytialvirus-inducedbronchiolitis[J].PediatrInfectDisJ,2008,27
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[11]SzalaiC,KozmaGT,NagyA,etal.PolymorphisminthegeneregulatoryregionofMCP-1isassociatedwithasthmasusceptibilityandseverity[J].JAllergyClinImmunol,2001,108(3):
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