分子生物学名词解释Word文档下载推荐.docx
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基因转录调控序列:
与转录像关的、布局基因以外的序列
启动子(promoter):
是RNA聚合酶特异性识别和连系的DNA序列,位于布局基因转录起始点的上游,偶见位于转录起始点的下游.启动子自己其实不被转录.
终止子:
是布局基因3‘段下游的一段DNA序列,其中有GC富集区组成的反向重复序列,转录后在RNA分子中形成特殊的布局以终止RNA链的延伸.
把持元件(operator):
把持元件是被阻遏蛋白识别与连系的一小段DNA序列(阻遏蛋白与操正调控蛋白连系位点:
纵元件连系后抑制下游布局基因的转录)在弱启动子附近有一些特殊的DNA序列,转录激活蛋白可以识别并连系这种DNA序列,该蛋白可与RNA聚合酶作用,促进转录的启动.
顺式作用元件(cis-actingelement):
与转录调控有关的DNA序列,包含启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等.
上游启动子元件:
指TATA盒上游的一些特定的DNA序列,与TATA盒共同组成启动子,是反式作用因子(转录激活蛋白),识别与连系的位点
增强子(enhance):
是一种较短的DNA序列,可以被反式作用因子识别与连系.与增强子元件连系后可以增强临近基因转录.位于转录起始点上游-100~-300bp处
反应元件:
一类能介导基因对细胞外的某种信号发生反应的特异的DNA序列
poly(A)信号:
真核生物基因除了调控转录起始的序列外,在布局基因的3’端下游还有
加尾信号,由AATAA序列和GT丰富区,或T丰富区组成.作用:
终止mRNA转录和为其加上poly(A)尾
把持子(operon):
功能上相关联的数个布局基因串联在一起,由一套转录调控序列节制其转录,构成的基因表达单位.
帽子布局:
m7GpppNm:
真核mRNA的5´
结尾在转录后加上一个7-甲基鸟苷,同时第一个核苷酸的C´
2也是甲基化,形成帽子布局:
m7GpppNm-
三联体暗码或暗码子(codon):
mRNA分子从5-结尾的第一个AUG(起始暗码子)开端,每3个核苷酸为一组,决议肽链上一个氨基酸,称为三联体暗码或暗码子(codon).位于起始暗码子和终止暗码子之间的核苷酸序列称为开放阅读框(openreadingframe,ORF),可读框内的核苷酸序列决议了多肽链的氨基酸序列.
非编码RNA(non-codingRNA):
专指那些具有调节作用的小RNA,如siRNA、miRNA等
非信使小RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs):
除了上述三种RNA外,细胞内存在的许多其他种类的小分子RNA等
核酶(ribozyme)或催化性RNA(catalyticRNA):
一些小RNA分子具有催化特定RNA降解的活性,在RNA合成后的剪接中具有重要作用.这种具有催化作用的小RNA亦被称为核酶(ribozyme)或催化性RNA(catalyticRNA).
核酸的变性(denaturation):
指DNA双螺旋之间的氢键断裂变成单链、或RNA部分氢键断裂变成线性单链布局的过程.
解链曲线:
如果在持续加热DNA的过程中以温度对A260值作图,所得的曲线称为解链曲线.
Tm又称熔解温度(meltingtemperature,Tm):
变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度.
DNA复性(renaturation):
当变性条件缓慢地除去后,两条解离的互补单链可重新配对连系成为双螺旋布局,或恢复部分双螺旋布局.这一现象称为复性.
退火(annealing):
热变性的DNA经缓慢冷却后才可复性,这一过程称为退火(annealing)
杂化双链(heteroduplex):
将分歧来历的DNA混合在一起,经热变性后,让其渐渐冷却复性.若这些异源DNA之间在某些区域具有互补的序列,复性时就会形成杂化双链(heteroduplex)
核酸分子杂交(hybridization):
杂化双链可以在分歧的DNA单链之间形成,也可在RNA单链之间形成,还可以在DNA单链和RNA单链之间形成,其前提条件是两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系.
基因信息的传递
中心法则(geneticcentraldogma):
是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程.也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程.这是所有有细胞布局的生物所遵循的法则.
半不持续复制:
一条链(前导链)持续合成,另外一条链(随后链)不持续合成
冈崎片段(Okazakifragment):
随后链的合成方向与复制叉移动方向相反,先合成许多不持续片段,称冈崎片段.
先导链(leadingstrand):
顺着解链方向(复制叉移动方向)合成的子链为先导链,其合成是持续停止的.
随从链(laggingstrand):
复制方向与解链方向相反的子链为随从链,其合成是不持续的,由许多冈崎片段(1000-2000个核苷酸)组成.
端粒(telomere):
是指真核生物染色体线性DNA分子结尾的布部分分,重复的DNA序列,通常膨大成粒状.
端粒酶(telomerase):
是一种RNA-蛋白质复合体,它可以其RNA为模板,通过逆转录过程对结尾DNA链停止延长.
逆转录(reversetranscription):
在逆转录酶的催化下,以RNA为模板合成DNA的过程,又称反转录.
突变(mutation):
是由遗传物质布局改变而引起的遗传信息的改变.从分子水平来看,突变就是DNA分子上碱基的改变.
DNA损伤(DNAdamage):
泛指一切DNA布局和功能的变更.包含各种突变类型、碱基的损伤和DNA链的断裂
点突变(pointmutation):
DNA分子上的碱基错配
缺失:
一个碱基或一段核苷酸链从DNA大分子上消失.
拔出:
原来没有的一个碱基或一段核苷酸链拔出到DNA大分子中间.
框移突变:
是指三联体暗码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸摆列顺序发生改变.
重组或重排:
DNA分子内较大片段的交换.
修复(repairing):
是对已发生分子改变的抵偿措施,使其回复为原有的天然状态.包含:
光修复(lightrepairing)切除修复(excisionrepairing)重组修复(recombinationrepairing)SOS修复
转录(transcription):
生物体以DNA为模板合成RNA的过程.
模板链:
双链DNA分子中能作为模板转录出RNA的链,又叫有意义链(sensestrand)或Watson链.另外一条互补链称为编码链,又叫反义链(antisensestrand)或Crick链
分歧错误称转录(asymmetrictranscription):
在DNA分子双链上某一区段,一股链可转录,另外一股链不转录;
模板链并不是永远在同一单链上.
反式作用因子(trans-actingfactors):
能直接或间接识别和连系转录上游区段DNA的蛋白质.反式作用因子中,直接或间接连系RNA聚合酶的,则称为转录因子(trans-criptionalfactors,TF).
断裂基因:
真核生物布局基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又持续镶嵌而成,去除非编码区再毗连后,可翻译出由持续氨基酸组成的完整蛋白质.
外显子(exon):
在断裂基因及其初级转录产品上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列
内含子(intron):
隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列.
翻译(translation):
蛋白质的生物合成过程就是将mRNA分子中由碱基序列组成的遗传信息,通过遗传暗码破译的方式转变成为蛋白质中的氨基酸摆列顺序.
顺反子(cistron):
遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为.
多顺反子(polycistron):
原核细胞中数个布局基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质
单顺反子(singlecistron):
真核生物一个mRNA只编码一种蛋白质.
翻译起始复合物(translationalinitiationcomplex):
指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体连系而形成的复合物,参与起始过程的蛋白质因子称起始因子(initiationfactor,IF).S-D序列或核蛋白体连系位点(ribosomalbindingsite,RBS):
在原核生物mRNA起始暗码AUG上游,存在4~9个富含嘌呤碱的一致性序列,如-AGGAGG-,称为S-D序列.
分子伴侣:
是细胞中一类守旧蛋白质,可识别肽链的非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠.)热休克蛋白(heatshockprotein,HSP)伴侣素(chaperonins)
信号序列:
所有靶向输送的蛋白质布局中存在分选信号,主要为N结尾特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位.
信号肽:
各种新生分泌蛋白的N端有守旧的氨基酸序列
基因表达调控
基因表达:
基因颠末转录、翻译,发生具有特异生物学功能的蛋白质分子的过程
基因表达调控:
生物体通过特定的蛋白质与DNA、蛋白质与蛋白质之间的相互作用来节制基因是否表达,或调节表达产品的多少以知足生物体的自身需求以及适应环境变更的过程.
基因表达的时间特异性(temporalspecificity):
按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生.
阶段特异性(stagespecificity):
多细胞生物基因表达的时间特异性
基因表达的空间特异性(spatialspecificity):
在个体生长全过程,某种基因产品在个体按分歧组织空间顺序出现.基因表达陪同时间顺序所表示出的这种分布差别,实际上是由细胞在器官的分布决议的,所以空间特异性又称细胞或组织特异性(cellortissuespecificity).
管家基因(housekeepinggene):
某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,无论表达水平高低,管家基因较少受环境因素影响,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达,或变更很小.区别于其他基因,这类基因表达被视为组成性基因表达(constitutivegeneexpression)
可诱导基因:
在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,基因表达产品增加,可诱导基因在特定环境中表达增强的过程,称为诱导(induction).
可阻遏基因:
如果基因对环境信号应答是被抑制.可阻遏基因表达产品水平降低的过程称为阻遏(repression).
沉默子或沉默基因(silencer):
连系阻遏物的调控序列;
阻遏物与沉默子的连系导致其附近的启动子失活,靶基因不被转录.
RNA编辑(RNAediting):
mRNA分子发生核苷酸的拔出、删除或碱基替换,改变DNA模板的遗传信息,从而翻译出氨基酸序列分歧的多种蛋白质.
核酸印迹与分子杂交
核酸分子杂交(nucleotidemolecularhybridization):
以DNA的变性、复性为实际基础;
指具有一定同源序列的两条核酸单链(DNA或RNA),在一定条件下按碱基互补配对原则颠末复性处理后,形成异源双链的过程.
Northern印迹(Northernblot):
是通过检测RNA的表达水平来检测基因表达,将RNA从凝胶中转印到硝酸纤维素膜上,定性分析mRNA的常常使用方法
Westernblot(蛋白免疫印迹)技术:
是将蛋白质从聚丙烯酰胺凝胶中转印到化学合成膜的支撑物上,操纵特异性抗体停止反应,定性分析蛋白质.
原位分子杂交技术:
操纵分子杂交技术来停止基因及其表达产品定位分析的一种技术.
聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PC):
是一种分子生物学技术,在体外特异地扩增已知基因的方法,用于放大特定的DNA片段.可看做生物体外的特殊DNA复制,可用于分析基因及其产品的水平变更,可停止实时、定量分析.
反转录PCR(reversetranscriptionPCR,RT-PCR):
是将RNA的反转录和PCR结合应用的一种技术.RT-PCR是从组织或细胞中获得目标基因及对已知序列的RNA停止定性及半定量分析的有效方法.
实时、定量PCR技术:
在PCR反应体系中加入荧光基团,操纵荧光信号积累实时检测整个PCR过程.通过尺度曲线对样品中的DNA的起始浓度停止定量的方法.
DNA自动测序:
用分歧荧光分子标识表记标帜四种双脱氧核苷酸,然后停止Sanger测序反应,反应产品经电泳分离后,通过四种激光激发分歧大小DNA片段上的荧光分子使之发射出四种分歧波长荧光,检测器收集荧光信号,并依此确定DNA碱基的摆列顺序.
DNA芯片(DNAchip)技术:
也称DNA微阵列(DNAmicroarray),在固相支持物上有序固化寡核苷酸或DNA探针,与待测荧光标识表记标帜样品停止杂交,通过对杂交信号的检测、比较和分析,得出样品的遗传信息,包含cDNA芯片和寡核苷酸微阵列.
基因工程
基因工程(geneticengineering):
特定基因(被称为目标基因或外源DNA片段)的制备、分离、鉴定、改造及其在分歧生物间的转移等多项技术.
限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease,RE):
是识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶.限制性核酸内切酶是重组DNA技术中重要的工具酶.分类:
Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型三大类(基因工程技术中常常使用Ⅱ型)
同尾酶:
有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,发生相同的黏端,这样的酶彼此互称为同尾酶.这两个相同的黏端称为配伍结尾(compatibleend).
载体(vector):
为携带外源DNA,实现外源DNA在受体细胞中的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采取的一些DNA分子.
克隆载体(cloningvector):
为使拔出的外源DNA序列被扩增而设计的载体称为克隆载体.如质粒,噬菌体等.
表达载体(expressionvector):
为使拔出的外源DNA序列可转录和翻译成多肽链而设计的载体,用于在宿主细胞中表达外源基因的载体.原核表达载体(prokaryoticexpressionvector)真核表达载体(eukaryoticexpressionvector).
标签(tag);
编码序列常构建于表达载体,与目标基因位于同一阅读框内,可以使所表达的蛋白上带上标签肽.标签肽大小不等,用于表达产品的分离、纯化与鉴定.
人工接头(adaptor/linker):
是借助化学合成[和(或)连系退火的方法]而得到的含有一种或一种以上限制性内切酶切点的平端双链寡核苷酸片段.
T-A克隆;
在使用TaqDNA聚合酶停止PCR时,扩增产品的3′结尾可加上一个单独的腺苷酸残基(A)而成为黏端,这样的PCR产品可直接与带有3′-T的线性化载体(T载体)毗连,此即T-A克隆.
细菌的感受态(competentbacterium):
细菌易于采取外源物质的一种天然状态.基因工程操纵中,通过物理化学的方法也可以使细菌处于感受态.处于该状态的细菌被称为感受态细胞.
亚克隆(subcloning):
通过以上分、择、接、转、筛五个步调,便完成了一次DNA克隆过程.有时为了达到某种新的目标,需要对已克隆的DNA停止再次克隆,该过程称为亚克隆.
(真核表达体系分为瞬时、稳定和诱导表达体系)
瞬时表达体系:
载体DNA不克不及整合到细胞基因组中,其随细胞分裂而逐渐丢失,目标蛋白的表达时限短暂;
稳定表达体系:
载体DNA整合到细胞基因组中而稳定存在于细胞内,目标蛋白能持久、稳定表达;
诱导表达体系:
目标基因的转录受外源小分子诱导后才得以开放.
转基因动物技术:
是指将外源基因导入到动物的组织细胞内,并使导入的基因通过遗传传给子代.
基因敲除(geneknock-out):
通过同源重组失活或剔除某一基因
基因敲入(geneknock-in):
通过同源重组使突变基因被置换
基因组布局与功能
基因组(genome):
细胞或生物体中,一套完整单倍体的遗传物质的总和.
布局:
指分歧的基因功能区域在核酸分子中的分布和摆列情况.
质粒(plasmid):
是细菌细胞内的,染色体外的共价闭合环状DNA分子.
单拷贝序列(单一序列):
在一个基因组中只出现一次或很少几次的碱基序列为单一序列,是布局基因的特点.布局基因编码的蛋白质包含布局蛋白、酶、激素、受体和调节蛋白等
重复多拷贝序列(重复序列):
重复顺序是指在一个基因组中有多个拷贝的碱基顺序.根据重复片段的长度及重复的频率分:
高度重复序列、中度重复序列
基因诊断与基因治疗
基因诊断:
用分子生物学技术对生物体的DNA序列及其产品(RNA和蛋白质)停止定性、定量分析,为疾病诊断提供依据.基因诊断的前提:
已明白疾病表型与基因型的关系.
单链构象多态性分析(single-strandconformationpolymorphism,SSCP):
DNA的突变造成DNA片段中碱基序列分歧,变性为单链后在中性聚丙烯酰胺凝胶中的构象分歧(单链构象多态性),操纵迁移率的不同可以使各种序列分歧的单链分分开来.
限制性片段长度多态性分析(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP):
由于DNA变异发生新的酶切位点或原有的酶切位点消失,在用限制性核酸内切酶消化时发生分歧长度或分歧数量的片段,并可借助核酸分子杂交或PCR停止检测.
基因治疗GeneTherapy:
指将目标基因通过基因转移技术(病毒载体介导或者非病毒载体介导的基因转移技术)导入靶细胞内,目标基因表达产品对疾病起治疗作用.
基因置换(geneWordStrment):
指将特定的目标基因导入特定细胞,通过定位重组,导入的正常基因,以置换基因组内原有的缺陷基因.
基因添加(geneaugmentation):
通过导入外源基因使靶细胞表达其自己不表达的基因.在有缺陷基因的细胞中导入相应的正常基因,而细胞内的缺陷基因并未除去,通过导入正常基因的表达产品,抵偿缺陷基因的功能;
向靶细胞中导入靶细胞原本不表达的基因,操纵其表达产品达到治疗疾病的目标.
基因干预(geneinterference):
采取特定的方式抑制某个基因的表达,或者通过破坏某个基因的布局而使之不克不及表达,以达到治疗疾病的目标.
自杀基因治疗(SuicideGeneTherapy):
将“自杀”基因导入宿主细胞中,这种基因编码的酶能使无毒性的药物前体转化为细胞毒性代谢物,诱导靶细胞发生“自杀”效应,从而达到清除肿瘤细胞的目标.应用:
是恶性肿瘤基因治疗的主要方法之一.
基因免疫治疗:
通过将抗癌免疫增强的细胞因子或MHC基因导入肿瘤组织,以增强肿瘤微环境中的抗癌免疫反应.
RNA干扰(RNAinterference,RNAi):
是一种由双链RNA诱发的基因沉默现象.在此过程中,与双链RNA有同源序列的mRNA被降解,从而抑制该基因的表达.