NGS实验室建设规范标准与要求规范标准Word格式.docx

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自动解析软件，实验室样本信

息管理系统等。

2.3检测人员必定经过特地的技术培训，并获得省级以上卫生计生行政部门

颁发的临床基因扩增检验技术上岗证书。

NGS实验室必定成立严格的实

验室管理制度、成立标准化操作程序（SOP）、成立系列质量管理文件

等，保证明验室平常运行吻合国家卫生部的要求，保证检测结果正确、

保证明验室卫生安全，保证明验室长远牢固运行。

2.4NGS临床应用必定在无菌无尘环境下进行操作。

三、NGS实验室建设基本要求

3.1主体结构

主体为彩钢板、铝合金型材。

室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝，从而解决简单污染、积尘、不易打扫等问题。

结构牢固，线条简短，雅观大方，密封性好。

3.2标准的各区分开平和压调治

将检测过程分成试剂准备、样本制备、PCR扩增和高通量测序四个独立的实

验区。

整个地域有一个整体缓冲走廊。

每个独立实验区设置有缓冲区，同时各区经过气压调治，使整个检测实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。

可打开缓冲区和PCR扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口，空气经过回风口向室内换气。

3.3消毒

在每个实验区和缓冲区顶部以及传达窗内部安装有紫外灯，供消毒用。

在各

区还设置搬动紫外线灯，对实验桌进行局部消毒。

3.4机械连锁不锈钢传达窗

试剂和标本经过机械连锁不锈钢（不建议使用电子连锁方式）传达窗传达，

保证试剂和标本在传达过程中不受污染（人物分流）。

3.5地面

地面建议使用PVC卷材地面或自流坪地面，整体性好。

便于进行打扫，耐腐

蚀。

没有条件的也可采用水磨石地面，或大块的瓷砖（最少800MM×

800MM）

接缝需要小于2MM。

3.6照明

灯具要采用净化灯具，能达到便于冲刷、不积尘的特点。

3.7平面布局

NGS实验室应依照自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定

分区的多少及各地域的空间大小，最少详尽需要多少个区，同样是“个体化”的，以“工作有序、互不搅乱、防范污染、报告及时”作为基根源则。

四、各项目实验室建设标准

产前筛查与产前诊断（全基因组低拷贝测序技术）

1.实验室平面图

图1：

产前筛查与诊断实验室平面图

2.技术流程图

图2：

产前筛查与诊断技术流程图

3.技术参数

分区

压力

温度

相对湿度

照明

专用走廊

0Pa

缓冲区

+5Pa

试剂准备室

+15Pa

标本与文库制

+10Pa

20-25℃

40%~60%

主实验室≥300LX，其

备区

余房间200～300LX

文库扩增与检

-5Pa

测区

测序区

-10Pa

4.分区功能

4.1试剂准备室

主要功能：

在NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。

4.2标本与文库制备区

血液办理、血浆制备、DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、

DNA浓度检测、尾端修复、接头连接、成立样本的测前言库。

4.3文库扩增与检测区

文库成立后的PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混杂及混

合后的质检解析。

4.4测序区

测序模板制备（乳液PCR与磁珠富集回收）、上机测序、数据解析、报告审察及发放。

5.仪器配置

5.1试剂准备室

主要仪器设备：

加样器、冰箱、解析天平、微量台式离心计、涡旋振荡器、

移液器、可搬动紫外灯和超净工作台等。

5.2标本与文库制备区

冷冻离心计、微量台式离心计、掌上三管离心计、涡旋震荡

器、垂直混杂仪、移液器、可搬动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、

Qubit2.0核酸定量仪、电脑（可连接互联网）、条形码打印机、一般打印

机、扫描枪、磁力架等。

5.3文库扩增与检测区

PCR仪、QPCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、可搬动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心计、涡旋振荡器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等。

5.4测序区

高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心计、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可搬动紫外灯、磁力架、PCR仪等。

胚胎植入前遗传学诊断（全基因组低拷贝测序）

图3：

PGD实验室平面图

图4：

PGD技术流程图

分区压力温度相对湿度照明

专用走廊0Pa

缓冲区+5Pa

WGA制备室

+10pa

主实验室≥

，其余

300LX

扩增一区

-5pa

房间200～300LX

标本检测区

-15Pa

电泳区

4.2WGA制备区

基因组DNA释放、全基因组DNA扩增。

4.3电泳区

DNA电泳检测及结果反响、DNA打断等

4.4扩增一区

DNA片段的尾端修复与纯化、接头连接与纯化、文库混杂、缺口

平移。

4.5文库检测区

文库浓度质检解析。

4.6测序区

5.1试剂准备区

冰箱、解析天平、微量台式离心计、涡旋振荡器、移液器、

可搬动紫外灯和超净工作台等。

5.2电泳区

电泳仪、微波炉、凝胶成像仪、冰箱、掌式离心计、涡旋振

荡器、移液器、可搬动紫外灯等。

5.3WGA制备区

PCR仪、超净工作台、冰箱、掌式离心计、涡旋振荡器、移

液器、可搬动紫外灯等。

5.4扩增一区

PCR仪、可搬动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心

机、涡旋振荡器、UPS、移液器、磁力架等。

5.5文库检测区

QPCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、可搬动紫外灯、超净工作

台、冰箱、微量台式离心计、涡旋振荡器、冰箱、移液器等。

5.6测序区

遗传病诊断+肿瘤诊断与治疗（杂交捕获测序技术+SANGER测序考据）

图5：

肿瘤诊断实验室平面图

图6：

肿瘤诊断技术流程图

图7：

一代测序实验流程图

洁净走廊

标本与文库

制备区

DNA打断区

主实验室

杂交捕获区

20-25℃

≥300LX，其余

房间200～

（扩增一区）

文库扩增区

（扩增二区）

文库检测区

0Pa

4.1试剂准备区

样本接收、样本前办理、全基因组DNA提取以及各种样本DNA或

者RNA的提取、DNA片段化、DNA纯化、DNA浓度测定、DNA片段的尾端修复与纯化、接头连接与纯化。

4.3DNA打断区

DNA打断（片段化）。

4.4电泳区

片段化DNA电泳检测及结果反响。

4.5杂交捕获区（扩增一区）

目的DNA片段的杂交捕获与纯化，Sanger测序目的片段扩增与纯化、Sanger测序PCR前准备。

4.6文库扩增区（扩增二区）

杂交捕获后扩增与纯化、文库浓度质检解析、及Sanger测序的

PCR扩增反响与纯化。

4.7测序区

测序模板制备（乳液PCR与磁珠富集回收）、上机测序、及Sanger测序。

微量台式离心计、掌上三管离心计、恒温金属浴、移液器、

可搬动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit2.0核酸定量仪、PCR仪、电脑（可连接互联网）、条形码打印机、一般打印机、扫描枪等。

5.3DNA打断区

CovarisS220超声波打断仪、冰箱、掌式离心计、涡旋振荡

器、移液器、可搬动紫外灯等。

5.4电泳区

电泳仪、微波炉、凝胶成像仪、冰箱、掌式离心计、涡旋振荡器、移液器、可搬动紫外灯等。

5.5杂交捕获区（扩增一区）

PCR仪、可搬动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心计、涡旋振荡器等。

5.6文库扩增区（扩增二区）

PCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、微量台式离心计、掌上三管离心计、涡旋震荡器、移液器、可搬动紫外灯、超净工作台、冰箱、磁力架等。

5.7测序区

高通量测序仪、Sanger测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒

温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心计、涡旋振荡器、移液器、超净工

作台、可搬动紫外灯、磁力架、PCR仪等。