Cytoscape软件画图说明书.docx

Cytoscape软件画图说明书.docx

《Cytoscape软件画图说明书.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《Cytoscape软件画图说明书.docx（10页珍藏版）》请在冰豆网上搜索。

Cytoscape软件画图说明书

Cytoscape软件画图说明

1、画图前，先准备两个输入文件。

2、打开cytoscape软件，导入数据。

导入edge.txt文件

点击File----Import----Network

点击ok得到原始图形

点击layout----ApplyPreferredOut改变图形排列方式

此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。

改变画布背景。

点击左侧ControPanel----Style---network---Backgroudpaint

设置节点之间连线的宽度和颜色

ControPanel----Style---Edge

导入node.txt个文件

点击File----Import----Table

设置节点图形属性

ControPanel----Style---Node

1、node大小

通过设置Height和Width来控制大小

2、Node性状

通过设置Shape来控制

3、Node填充色

通过设置FillColor来控制

4、Node标签的设置

点击Properties--LabelPosition

点击LabelPosition来设置标签位置。

这里是一个示范操作，要细致调整标签位置还是要设置Column和MappingType两个参数。

设置完成之后图形

调节节点之间的距离

点击layout----Scale

最后，画图导出成pdf文件

点击File----Export----NetworkViewasGraphics