外文数据库.ppt

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外文数据库PUBMED,一、认识PubMed二、PubMed检索入门三、PubMed高级检索四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能六、PubMed个性化服务,外文数据库实习安排,课件下载：

（密码：

wxjs123456）QQ:

1580123718,认识PubMed让它融入您的科研,标引质量高,更新速度快,信息量大,使用方便,选择PubMed的n个理由,一、认识PubMed,网址：

http:

/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed或http:

/www.ncbi.nih.gov/pubmed或http:

/pubmed.gov（com;org;net）由美国国立医学图书馆（NationalLibraryofMedicine-NLM）国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务,一、认识PubMed,一、认识PubMed,收录从1946年至今80多个国家和地区37种文字的5400多种生物医学期刊上的文献2000多万条。

每日更新（周二到周六），每天增加20004000条完整记录。

PUBMED中90%的原文为英文文献，79%有英文摘要。

一、认识PubMed,PUBMED收录的文献包括4个数据库：

概况,A:

Medline是NLM最主要的文献数据库，覆盖了医学、兽医、卫生等各个学科。

收录1966年以来生物医学期刊上的文献。

该数据库文献的标识为：

PubMed-indexedforMEDLINE。

认识PubMed让它融入您的科研,B:

OldMedline收录1946年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献，标识为PubMed-OldMedline。

目前通过PubMed可查到的最早文献为1809年出版的Medico-chirurgicaltransactions上的文献，且为免费全文。

C：

InProcessCitationsPubMED中每天增加的数据先放在此库，新记录只提供基本的题录信息和文摘，没有标引主题词，其标识为：

PubMed-inprocess。

InProcessCitations中的数据经标引部门标引后再加入到Medline数据库之中。

标识改为：

PubMed-indexedforMEDLINE。

D:

Publisher-SuppliedCitations,此外，出版商在印刷版期刊出版之前向PUBMED传送的电子版内容将显示Epubaheadofprint标识。

由出版商以电子版形式直接传送到PubMed，标识为：

PubMed-assuppliedbypublisher，,大部分出版商提供的文献处于正在加工状态，经标引后加入到MEDLINE中。

此外，还有少部分出版商提供的文献不进行标引，保持PubMed-assuppliedbypublisher标识或PubMed标识。

检索提问区,文献匹配,临床咨询,特定主题咨询,期刊检索,主题检索,高级检索,一、认识PubMed,二、PubMed检索入门,1.检索字段及标识符2.逻辑运算3.自动匹配功能4.截词检索和禁用词5.限定字段检索6.短语检索7.检索结果,二、PubMed检索入门,1.检索字段及标识符,17,电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称,18,最后修订日期主题词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号,19,作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号,2.逻辑运算,多个检索词间需用逻辑运算符号组配。

逻辑运算符AND、OR、NOT必须大写系统将“空格”默认为AND,Vitaminccold,VitamincANDcold,在多个检索词间可使用布尔逻辑运算符“AND”、“OR”、“NOT”，需注意的是，逻辑运算符的优先顺序为从左向右的顺序，可通过加括号提高运算的优先级。

维生素C或维生素E与癌症的关系,1.VitaminCORvitaminEANDcancer,2.（VitaminCORvitaminE）ANDcancer,3.CancerAND（VitaminCORvitaminE）,4.CancerANDVitaminCORvitaminE,3.自动匹配功能（AutomaticTermMapping,ATM）,对于输入检索框中未加标识的检索词，PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容：

MeSHtranslationtableMeSH转换表Journalstranslationtable刊名转换表Phraselist短语词表Authorindex作者及合作者索引,当用户在基本检索界面输入检索词时，PubMed在后台将检索词依次到上面转换表中进行词语的核对，如果在第一个表中查不到相应的词，则到第二个表中检索，至到找到为止。

如果在上述几个表中都找不到匹配的短语，系统将短语拆开，继续到这四个表中搜索，短语断开部分为AND关系。

如果拆到的单词在上述几个表中还是找不到匹配词，将到所有字段中去搜索这些单词，单词之间的逻辑关系也是AND,Searchdetails:

ascorbicacidMeSHTermsOR（ascorbicAllFieldsANDacidAllFields）ORascorbicacidAllFieldsORvitamincAllFields,如不满意，可修改再search,二、PubMed检索入门,4.截词检索和禁用词,截词符：

*一般只作“后截断”使用，系统最多截取600个匹配的单词如：

输入treat*检出treatment、treats、treated、treating等备注：

-不执行自动匹配功能；-截词检索只限于单词，对词组无效.,PubMed在检索时忽略一些常用的英语词汇，下表为禁用词列表,二、PubMed检索入门,5.限定字段检索,检索词字段名,例：

著者检索（authors）：

-姓全称在前，名首字母在后JohnSmithSmithJ-以AU作为限定字段如：

CooperSLau，”CopperSL”auYaoKTau（姓在前，名缩写在后）,二、PubMed检索入门,期刊检索（journals）：

-刊名全称检索例：

NewEnglandJournalofMedicineso-MEDLINE认可的标准刊名缩写检索例：

NEnglJMedso-国际标准期刊号检索例：

0028-4793so,二、PubMed检索入门,例：

检索JosephLeventhal研究干细胞移植的文献,直接输入检索式：

StemcelltransplantationANDLeventhalJAU,二、PubMed检索入门,6.短语检索,对于输入PubMed的多词词组，由于英文单词间存在“空格”，PubMed会默认运算“AND”，则将其拆分成单个词，分别进行检索并以AND进行组配，如：

singlecell相当于检索singleANDcell。

若不想进行逻辑组配，可通过加“”强制将其作为一个词组进行检索：

如：

“singlecell”,使用“”后，系统不进行自动转换匹配和扩展检索。

二、PubMed检索入门,二、PubMed检索入门,7.检索结果,文献类型分类,显示设置,FreeArticle:

提供免费全文的链接，但并不一定免费。

FreePMCArticle:

PUBMED提供的完全免费的全文链接。

二、PubMed检索入门,PMC（PubMedCentral，公共医学中心）,生命科学期刊资源中心免费提供约1199种期刊的200多万篇全文,http:

/www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,二、PubMed检索入门,三、PubMed高级检索,三、PubMed高级检索,限定字段检索,Searchingbyaspecificfield,三、PubMed高级检索,Searchingbyaspecificfield,三、PubMed高级检索,可选择逻辑运算符,增加一行或减少一行,系统会根据输入，生成检索式，通过edit修改。

检索历史History-Combiningsearchesusinghistory,检索史按检索式运行的顺序列出各检索式，包括检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条数。

检索史最多保存100条检索式，检索史将在离开PubMed或其他Entrez数据库8小时后消失。

三、PubMed高级检索,三、PubMed高级检索,History-Combiningsearchesusinghistory,点击检索式序号将弹出一选项菜单，提供的选项包括布尔逻辑操作符AND,OR,NOT,点击相应的操作符菜单，将把该条检索策略加入到检索框中，并与检索框中现有的检索式进行选中的逻辑组配。

三、PubMed高级检索,History-Combiningsearchesusinghistory,认识PubMed让它融入您的科研,文献太多，如何保证查全和查准？

四、PubMed医学主题词表检索,何为MeSH？

MeSH是MedicalSubjectHeadings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。

论述文献中心的主题词称主要主题词论述主题某一方面的内容的词称为副主题词,4.1MeSHDatabase的运用,四、PubMed医学主题词表检索,词义解释,四、PubMed医学主题词表检索,副主题词,四、PubMed医学主题词表检索,组建检索式：

1.先addtosearchbuilder2.Searchpubmed,认识PubMed让它融入您的科研,五、PubMed其他功能,实现单篇文章的一对一检索,实现多篇文章的一次性检索,一次最多可检索PubMed中100条文献纪录,获得文献的PMID,认识PubMed让它融入您的科研,选择相应类别,选择检索范围,检索结果更加贴近临床的需要,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,限定于各类不同的医学临床主题进行检索,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,实现PubMed与核酸和蛋白质序列数据库、基因组数据库、分类学数据、图书等数据库之间的多向链接,多向查询,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,与PubMed建立联系的网站，如某篇文献所对应期刊的出版商，文献全文、相关数据库及网站等。

五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,eUtils（EntrezProgrammingUtilities）通过eUtils这个程序设计模块,可以通过我们自己设计的应用程序平台,获取NCBI数据库的数据,从而实现这些数据资源的深度开发使用。

实现自动化的大批量的从Entrez数据库下载数据。

并且提供了几种常用的语言以供选择，像Perl,Python,Java,和C+等。

五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研