发育生物学期末复习秘籍Word文档下载推荐.docx
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指细胞特性发生了不可逆的改变，发育潜力已经单一化。
Specification:
指一组细胞在中性环境下离体培养，它们仍按其正常命运图谱发育。
诱导信号在细胞之间传递的三种方式：
扩散性信号分子、跨膜蛋白的直接互作、间隙连接
信号传导特点:
传递距离有限；
并非所有细胞都能对某种信号发生反应；
不同类型细胞可对同一信号发生不同反应,e.g.,乙酰胆碱使心肌收缩频率下降，但促使唾液腺分泌唾液。
模式生物的主要特征：
取材方便；
胚胎具有较强的可操作性；
可进行遗传学研究
脊椎动物模式生物：
两栖类：
非洲爪蟾；
鱼类：
斑马鱼；
鸟类：
鸡；
哺乳动物：
小鼠。
1.非洲爪蟾主要优点：
1.取卵方便，不受季节限制；
2.卵D=1.4cm、胚胎体积大，易于操作；
3.发育速度快，抗感染力强，易于培养。
4、卵母细胞减数分裂。
主要缺点：
异源四倍体，突变难。
2.斑马鱼主要优点：
1.易于饲养，性成熟短，3个月；
产卵力强；
2.体外受精和发育，胚胎透明，易于观察;
3.易于遗传操作：
如杂交、诱变；
4.基因组测序已完成;
5、胚胎发育机理和基因组研究。
3.鸡主要优点：
1.体外发育，易于实验；
2.器官（肢、体节）发育的重要模型；
3.基因组测序已完成。
4.小鼠主要优点:
1.世代周期短2个月；
2.人类疾病的动物模型；
3.基因组测序已完成，遗传背景清楚，实验手段完善。
无脊椎动物模式生物：
果蝇；
线虫;
其他：
海胆；
海鞘；
文昌鱼；
水螅；
涡虫；
拟南芥
1.黑腹果蝇主要优点:
1.个体小，生命周期短，易于繁殖，产卵力强，操作简便，成本低；
2.染色体巨大，易于基因定位。
其胚胎和成体表型特征丰富。
胚胎发育图式；
2、线虫主要优点：
1.成虫体长1mm，结构简单，细胞数目少，谱系清楚；
2.性成熟短2.5-3d易于培养，便于突变筛选，两种成虫；
3、海胆主要优点：
1.最早的发育生物学模式动物；
2、早期发育的模型，受精；
3、已完成紫海胆Strongylocentrotuspurpuratus基因组的破译、分析工作。
希腊哲学家Aristotle在公元前第4世纪在对鸡胚和一些无脊椎动物胚胎观察后提出胚胎发育的两种假设：
后成论（epigenesis）与先成论（preformation）。
细胞的命运早在卵裂时，由细胞所获得的合子核信息决定——镶嵌型发育
发育生物学五大未解难题（中心问题）：
①分化难题：
相同的基因组怎样产生不同类型的细胞？
②形态发生难题：
细胞是如何组建自己又如何形成恰当的排序？
③生长难题：
生物体内的细胞如何知道它何时该长，何时该停？
④生殖难题：
生殖细胞是如何发出指令形成下一代的？
细胞核和细胞质中允许它们完成这一使命的指令又是什么？
⑤进化难题：
在发育中的变化怎样创造新体型呢？
哪些变化能够起到进化的作用？
第一章细胞命运的决定
细胞分化：
细胞表型多样化和功能多样化产生的过程。
细胞命运：
指正常发育情况下细胞将发育的方向，这种方向可因条件的改变而改变。
细胞定型（cellcommitment）----细胞在表现出明显的形态和功能变化之前，将发生一些隐蔽的变化，使细胞命运朝特定方向发展的过程。
（一）、定型的两个时相：
1、特化（specification）----当一个细胞或组织放在中性环境（如培养皿中培养）可以自主分化时，那么这个细胞或组织被认为是命运已经特化了。
此类细胞发育命运是可变的。
2、决定（determination）----当一个细胞或组织放在胚胎另一个部位可以自主分化时，那么这个细胞或组织被认为是命运已经决定了。
此类细胞的发育命运是不可逆的。
（二）、定型的两种方式：
1、自主特化（autonomousspecification）------细胞发育命运完全由内部细胞质组分决定的细胞定型方式。
通过胞质隔离实现
胞质隔离cytoplasmicsegregation-----受精卵内特定的细胞质，随着卵裂被分配到特定的裂球中，这些特殊细胞质将决定裂球的发育命运，与邻近细胞无关。
镶嵌型发育（mosaicdevelopment），自主型发育-------以自主特化为特点的胚胎发育模式（栉水母、环节动物、线虫、软体动物、海鞘）
2、渐进特化（依赖型特化dependentspecification）------细胞的定型分化依赖于周围的细胞或组织。
同一种细胞可能因在不同的细胞或组织环境中，命运不同；
通过胚胎诱导实现
胚胎诱导Embryonicinduction-----胚胎发育中，一部分细胞或组织对其邻近的另一部分细胞或组织产生影响，并决定其分化方向（命运）的作用
调整型发育----以细胞依赖型特化为特点的胚胎发育模式（海胆、两栖类、鱼类等）。
海胆胚胎除了具有典型的调整型发育特点之外，也显示出某些镶嵌型的特点。
细胞定型方式及其特点：
自主特化依赖型特化
1、多数无脊椎动物具有所有脊椎动物及少数无脊椎动物
2、细胞命运由其所获得的卵内细胞命运由细胞之间相互作用决
特定的细胞质组分决定定，细胞的相对位置颇为重要
3、卵裂方式不可改变卵裂方式可以改变
4、裂球发育命运一般不可改变裂球的命运可改变
5、细胞特化发生在胚胎细胞大量的细胞重排和迁移发生在
大量迁移之前细胞特化之前或与细胞特化相伴
6、产生“镶嵌型”发育产生“调整型”发育
注：
一般两种细胞定型同时存在于胚胎发育中，但不同动物两种方式发挥作用的程度不同。
一般来说，在多数无脊椎动物胚胎发育过程中，主要是细胞自主特化在发生作用，细胞有条件特化次之；
而在脊椎动物胚胎发育过程中则相反，主要是细胞有条件特化在发生作用，细胞自主特化次之。
胞质定域Cytoplasmiclocalization：
形态发生决定子在卵细胞质中呈一定形式分布，受精时发生运动，被分割到一定区域，进而进入不同的分裂球中决定分裂球发育命运的现象。
①动物极区：
将发育为表皮；
②灰色新月区：
将发育成脊索和神经管；
③黄色新月区：
将发育成肌细胞；
④灰色卵黄区：
将发育为幼虫的消化道。
极叶与软体动物中胚层形成：
极叶----卵裂时细胞质向植物极迁移集中而成的细胞质突起。
环节、软体动物在卵裂早期均有极叶产生。
极叶中含有背-腹轴的决定子。
极叶→与中胚层形成（肌肉和壳腺）密切相关。
生殖质（极质，P颗粒）：
含有生殖细胞决定子的细胞质，获得生殖质的卵裂球将形成原生殖细胞。
（1）线虫：
副蛔虫Parascarisaequorum
染色体消减----卵裂时，染色体不同程度丢失在细胞质中的现象。
染色质消减者—体细胞；
染色质不消减者—原生殖细胞。
秀丽隐杆线虫——胚胎细胞命运主要由卵内细胞质决定，而非邻近细胞间相互作用决定
4、栉水母细胞质定域的重新排列
有些细胞质定域并不是预先存在于合子中，而是在卵裂中重新确立。
（一）、海鞘形态发生决定子（两类）：
1、可以激活基因转录的物质（蛋白因子）；
2、可能是以mRNA的形式存在于卵内一定区域。
（二）、果蝇极质（生殖细胞决定子，生殖质）由蛋白质和RNA组成：
1、gclmRNA（germcell-lessmRNA）；
2、Nanos蛋白；
3、oskarmRNA调控极质的形成和装配；
4、数个母源效应基因（maternal-effectgene）与之有关。
细胞命运通过相互作用渐进特化：
①自主特化中的每个细胞命运由其“祖先”决定，即不同细胞内含有不同的形态发生决定子，它们决定细胞的命运，构成镶嵌型发育类型。
如多数无脊椎动物发育。
②依赖性特化中的每个细胞命运取决于它遇到哪些细胞，每个细胞开始都有相似的潜能，构成调整型发育，细胞命运由胚胎细胞的相互作用决定。
如多数脊椎动物。
总结：
1、海胆胚胎存在植物极化和动物极化两个对立的梯度；
其正常发育依赖于两个梯度的平衡；
某些蛋白抑制剂（重金属、NaSCN和伊万斯蓝）可减弱植物极化因子的作用，而某些呼吸抑制剂（CO、KCN、NaN3、Li+）可减弱动物极化因子的作用。
2、裂球的预期命运只要还未决定，都是可以调整的。
裂球的发育命运一旦由于动物极细胞质和植物极细胞质彼此分裂而决定下来，便失去调整能力。
即使在调整型发育的胚胎中，总会从某一时期开始，胚胎细胞的发育潜能逐渐受到限制。
3、海胆胚胎在32细胞以后，多数裂球不能再形成完整胚胎。
三、两栖类发育调控
（一）、胚胎细胞的渐进决定
两栖类早期胚胎细胞核具有遗传等同性，每个细胞核都能产生完整的有机体
灰色新月区域物质的重要性在于，此区含有背唇，它具发动原肠作用的能力；
胚胎发育的关键性变化就发生在原肠作用过程中，迁移到一定位置的细胞的相作用。
蝾螈早期原肠胚细胞发育的预期潜能大于预期命运（命运尚未决定），即表现为依赖型发育，细胞的命运取决于其所处的位置。
随着发育，细胞的潜能逐渐受限，晚期原肠胚细胞为已决定细胞，表现为自主型发育
（二）、初级胚胎诱导Primaryembryonicinduction
Embryonicinduction：
胚胎发育中，一部分细胞或组织对其邻近的另一部分细胞或组织产生影响，并决定其分化方向（命运）的作用。
组织者：
能够诱导外胚层形成神经系统，并和其他的组织一起调整为中轴器官的胚孔背唇部分
诱导者：
产生影响并引起另一部分细胞或组织分化方向改变的这一部分细胞。
反应组织：
接受影响并改变分化方向的细胞或组织。
（）
Primaryembryonicinduction：
脊索中胚层诱导外胚层细胞分化成神经组织的过程（神经诱导）。
背唇为组织者。
形态发生决定子导致细胞的自主特化；
细胞间相互作用产生细胞的渐进特化。
如何区别细胞定型的两个阶段：
特化是指一个细胞或者组织在中性环境中也能自主分化的现象，通常这类细胞的分化命运是可逆的；
决定是指一个细胞或组织当改变在胚胎中的位置时，分化命运不发生改变的现象，通常这类细胞的分化命运是不可逆的。
实现定型的两种方式：
胞质定域（通过形态发生决定子的特异性定位，引发自主特化，如海鞘）和胚胎诱导（通过细胞相互作用，引发渐进性特化，大多数动物都有不同程度的调整型发育模式）。
第二章细胞分化的分子机制——转录前和转录的调控
第一节基因组相同和基因差异表达
细胞分化celldifferentiation：
是指同群结构与功能相同的细胞发生一系列的内外变化，成为结构与功能不同的细胞的过程。
分化过程涉及基因活性状态变化、细胞内物质组成的变化和功能的变化以及形态结构的变化。
细胞表型：
是细胞特定基因型在一定的环境条件下的表现，是细胞的特定性状。
全能细胞totipotentcell：
产生有机体全部细胞表型。
细胞多潜能细胞pluripotentcell：
产生几种特定类型的细胞。
已分化细胞differentiatedcell：
多潜能细胞通过分离和分化发育成的特殊细胞表型。
个体发育的过程：
全能性细胞→多潜能性细胞→分化细胞，基因选择表达。
细胞分化过程中基因差异性表达的条件和原因：
前提条件：
携带有丰富的遗传信息及复杂的表达调控机制
细胞内环境：
卵质不均匀分布
原因细胞外环境：
细胞间相互作用（位置不同，接收的信息不同）。
差异基因表达的调控机制：
差异基因转录：
调节哪些核基因转录成RNA；
核RNA的选择性加工：
不同的拼接将导致同一条核RNA产生不同的转录子；
mRNA的选择性翻译：
调节哪些mRNA翻译成蛋白质；
差别蛋白质加工：
选择哪些蛋白质加工成为功能性蛋白质。
转化（metaplasia）：
已分化的细胞转分化（trandifferentiation）为其它类型细胞的现象。
三、基因组相同的例外——基因组的变化
1、基因删除：
原生动物、线虫、昆虫、甲壳动物。
2、基因扩增：
爪蟾的rDNA、果蝇多线染色体。
3、基因重排：
免疫球蛋白基因（106~108种抗体）。
第二节染色质水平基因活性的控制
常染色质和异染色质化（DNA高度螺旋化）
异染色质：
①结构型：
DNA序列的折叠状况始终不变也从不转录，但可调节基因表达；
②机动型：
某些情况下，DNA折叠可以改变，成为常染色质，进行转录，有些情况反之。
异染色质化过程：
指具有转录活性的常染色质失去转录活性（一种高度固缩状态），成为异染色质的过程（基因沉默）。
蜕皮素具有调控果蝇唾液腺细胞染色体蓬松区基因活性的作用（与染色体上的特殊部位结合）。
第三节基因转录水平的调控
基因表达的时间和空间特异性
基因种类（依其功能分为）：
1、结构Gene---编码结构蛋白和酶分子结构；
2、调控Gene---编码调节蛋白，调节结构基因表达；
3、转录而不翻译的Gene：
rRNAGene→rRNA→核仁形成区，核糖体组成。
tRNAGene→tRNA→转运氨基酸。
转录因子：
是基因转录调控的反式作用因子，是能与启动子和增强子结合的蛋白质；
它含有特异性DNA结合域，可与启动子或增强子等调节序列结合；
激活或抑制基因的表达。
种类:
通用转录因子（TFⅡD,TFⅡB,TFⅡA,TFⅡF）和组织特异性转录因子
转录因子进行调控的途经：
①蛋白质和DNA相互作用；
②蛋白质和配体结合；
③蛋白质之间的相互作用以及蛋白质的修饰（磷酸化）。
甾类激素（Steroidhormones）以两种方式激活基因的转录：
A：
受体在激素进入细胞前就结合在靶基因调控区上，但只有当激素与该受体结合后才激活转录。
Thyroidhormones甲状腺激素；
RA视黄酸。
B：
激素先与胞质中其受体结合，再进入核，激活转录。
glucocorticoid肾上腺皮质激素。
第三章细胞分化的分子机制——转录后的调控
第一节RNA加工水平的调控
大多数编码细胞特异性蛋白质的基因选择性表达的调控主要发生在转录水平，但转录后调控对决定蛋白质结构和功能重要。
真核生物：
DNA→nRNA（核）→mRNA（质）。
异质性核RNA（hnRNA）：
由于转录模板不同，nRNA的长度和性质差别较大。
前体mRNA的加工对早期发育的调控，RNA加工水平的调控
第二节翻译和翻译后的调控
mRNAmasking（掩蔽）：
mRNA与其它蛋白结合成ribonucleoprotein（RNP）complex,阻止与核糖体结合；
卵成熟或受精后，离子强度改变或蛋白磷酸化等导致RNP解体，翻译得以进行。
5’Cap（7-甲基鸟苷酸）的调控：
如某些种类（moths），其卵中的部分mRNA的5`-鸟苷酸在受精后才甲基化，然后开始翻译。
mRNAsequester（隐蔽）：
指mRNA被阻隔于蛋白合成装置。
如海胆未受精卵的组蛋白mRNA定位于卵原核中，受精后原核破裂，mRNA才能进入胞质开始翻译。
Poly（A）对翻译的调控：
卵母细胞减数分裂成熟前后，mRNApolyA的长度发生变化（由3‘UTR调控）。
带长polyA的mRNA具翻译活性。
在小鼠的未成熟卵母细胞质中可以翻译的mRNA具有较长的poly（A）,减数成熟分裂后poly（A）降解，翻译终止。
在减数成熟分裂前不表达的mRNA的poly（A）较短（15-90A）,但其3`UTR具有胞质多聚腺苷酸化信号序列（CPEs）（UUUUAUinmiceandfrogs）。
减数成熟分裂后这些mRNA迅速加上一个长的polyA,开始翻译。
翻译效率的调控：
如将海胆卵母细胞裂解液的pH从自然状态下的pH6.9提高到pH7.4（受精后自然状态下的pH）,蛋白质合成量急剧增加。
受精后pH升高的作用可能包括去除mRNA的封闭蛋白和激活翻译起始因子。
4.、RNA编辑：
基因转录产生的mRNA分子中，由于核苷酸的缺失，插入或置换，基因转录物的序列不与基因编码序列互补，使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成，不同于基因序列中的编码信息，这种现象称为RNA编辑
5、mRNA寿命的不同对蛋白质合成的调控——通过mRNA稳定性不同和mRNA的选择性降解调控蛋白质的合成
不同基因的mRNA的半衰期不同，主要受其3`UTR控制。
短寿命mRNA的3’UTR通常含有一个或多个AU富集区，其作用是促进Poly（A）降解。
三、翻译后水平上的调控
①蛋白质的修饰激活e.g.,多肽链断裂（胰岛素）、磷酸化;
②蛋白质自身降解或与抑制性配体结合e.g.，DORSAL；
③亚细胞定位而激活e.g.,membraneproteins;
④与其它蛋白质装配成为功能单位e.g.,hemoglobin;
⑤与离子结合而激活e.g.,calmodulin。
第四章发育中的信号传导
信号传导（signaltransduction）：
是指靶细胞通过特异性受体识别细胞外信号分子，并把细胞外信号转变为细胞内信号，引起细胞发生反应的过程。
第一节参与早期胚胎发育的信号调节途径
TGFβ信号途径：
分泌性信号；
早期发育中起关键作用
Wnt信号途径：
早期胚胎发育
Hedgehog信号途径：
动物发育中起重要作用
Notch信号途径：
单跨膜受体蛋白；
NC分化，体节发育（脊）
酪氨酸激酶受体途径：
细胞表面受体；
早期发育
JAK-STAT信号途径：
膜受体结合蛋白；
血细胞及骨骼生长
视黄酸（retinoicacid，RA）途径：
小分子脂溶性信号
第二节信号活性的调控与相互关联
一、信号活性的调控：
对配体活性的调节如加工修饰（Wnt和Hedgehog被棕榈酰化）；
配体结合因子（BMP抑制因子：
Noggin、Chordin、Caronte等）；
对受体活性的调节与受体蛋白正确折叠加工有关的分子伴侣；
蛋白多糖（抑制FGF信号的活性）；
蛋白聚糖（促进Wnt、FGF辅助受体的活性）；
对信号途径中转录效应因子活性的调控浓度和稳定性的调节（泛素-蛋白酶体途径可调控Wnt中的β-catenin，TGFβ途径的Smad）；
向细胞核转运的调控（MAPK可磷酸化Smad抑制其向核内转运）；
信号活性的负反馈调节一个信号途径的活化激活相应信号途径的负调控因子的表达，从而抑制相应信号途径的过度活化（FGF信号途径中的Sef和Sprouty）。
第五章生殖细胞的发生
原生殖细胞（Primordialgermcell，PGC）----性别尚未分化的生殖细胞。
二、生殖质与生殖细胞的决定
生殖质Germplasm：
具有一定形态结构的特殊细胞质，主要由蛋白质和RNA构成。
原生殖细胞的决定从受精卵的第一次卵裂就开始了，到4次分裂以后，原生殖细胞将发生均等分裂；
含P颗粒（Posteriorgranules）的细胞构成生殖系，P1，P2，P3，P4……，P4为生殖细胞的始祖细胞；
P颗粒在受精过程和第一次卵裂过程中的不对称定位，26细胞期时全部P颗粒都在P4细胞中。
线虫原生殖细胞的命运决定于Pie-1：
Pie-1基因的功能涉及P细胞维持生殖干细胞的属性，其编码核蛋白，仅存于生殖干细胞中。
其缺失导致P1－P4也向体细胞分化。
其作用可能是抑制生殖细胞中体细胞相关基因转录活性。
2、果蝇（Drosophila）：
生命周期短，易于繁殖，操作简便，成本低；
产卵力强，其胚胎和成体表型特征丰富，遗传背景清楚。
果蝇的极细胞将分化为原生殖细胞，果蝇的原生殖细胞的命运决定于后部极质。
爪蟾生殖细胞命运也决定于生殖质，爪蟾生殖质定位于卵的植物极，富含RNA和蛋白质。
生殖质定位依赖于微管。
蛙受精的合子中生殖质成分（种质）靠近植物极。
极细胞（Polarcell）中含有极质（含生殖细胞决定子，又称生殖质颗粒），9次卵裂后，有5个细胞核移至未来胚胎的末端，分化为极细胞。
三、原生殖细胞的迁移
动物在生殖腺原基发生时，原生质细胞以不同的方式迁移进入生殖腺原基，在那里进行生殖细胞的分化。
果蝇原始生殖细胞起源于胚胎的后端，经后中肠穿过肠壁和中胚层，形成两个分离的队列，最终聚集在生殖腺中。
2、爪蟾原生殖细胞的迁移路线：
植物极→囊胚腔腹侧内层细胞形成PGCs→幼虫肠后部聚集→沿肠向背部迁移至中肠背部的生殖嵴中，每个生殖嵴约有30PGCs。
3、鸟类原生殖细胞：
生殖新月区形成血管时，PGC进入血管，通过血液循环到达生殖嵴所在处（后肠背系膜），然后穿出血管，再迁移进入生殖嵴。
4、小鼠原生殖细胞的迁移：
经过内胚层、尿囊、卵黄囊到达后肠，再沿后肠背壁向前迁移到达生殖嵴，此时的PGC达2500～5000个。
PGCs的迁移与其接触的上皮细胞有关，BMP，SCF；
通过变形运动实现迁移。
四、生殖细胞定向分化的两种决定：
①生精或生卵之间的选择（性腺内微环境决定）；
②有丝分裂（维持干细胞）和减数分裂（分化为配子）之间的选择
影响因素：
性染色体或常染色体上的基因；
性腺中的微环境（性激素）；
环境因子。
幼虫期离开生殖腺远端的细胞进入减数分裂，产生精子；
在成虫期离开生殖腺远端的生殖细胞通过减数分裂产生卵子。
Fem家族基因：
决定精子和卵子的定向分化，Fem表达FEM，GC→精子，反之，GC→卵子。
生殖腺近端的细胞进入减数分裂，而留在远端的细胞继续有丝分裂。
精子发生：
雄性哺乳动物，原生殖细胞一旦迁入生殖嵴，便与生殖嵴体细胞结合形成上皮样的生殖索（性索sexcord）。
在实现生殖腺的初步分化以后，生殖干细胞进入休眠状态。
在个体性成熟过程中，性索中空形成生精小管（seminiferousbubule）
生殖干细胞→雄配子；
体细胞→支持细胞
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