基于R语言的多重比较方法文档格式.docx
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LSD.test(y,trt,DFerror,MSerror,alpha=0.05,p.adj=c(&
quot;
none&
&
holm&
hommel&
&
hochberg&
bonferroni&
BH&
BY&
fdr&
),…)
其中y为方差分析对象,trt为要进行多重比较的分组变量,p.adj可以选定P值矫正方法。
当p.adj=”none”时,为LSD法,p.adj=&
时为Bonferroni法。
R代码:
library(agricolae)
#sweetpotato为agricolae自带数据集
data(sweetpotato)
#进行方差分析,分组变量为virus
model
#进行多重比较,不矫正P值
out&
lt;
-lsd.test(model,&
virus&
=&
&
p.adj=&
)
#结果显示:
标记字母法
out$group
#可视化
plot(out)
程序运行结果:
从运行结果看,四个处理,oo和ff处理无差异,与cc和fc彼此差异显著。
下图是可视化结果。
2.Bonferroni法
它是Bonferroni校正在LSD法上的应用。
将LSD.test中p.adj设置为&
即为Bonferroni法。
bonferroni&
运行结果与LSD法类似,不再展示。
3.Dunnett检验
用于多个试验组与一个对照组间的比较。
R语言中可利用multcomp包中的glht()函数进行包括Dunnett检验在内的多种检验,其调用格式为:
glht(model,linfct,alternative=c(&
two.sided&
less&
greater&
),...)
其中model为方差分析对象,linfct设置要进行多重比较的分组变量和方法。
library(multcomp)
rht&
-glht(model,=&
linfct=&
mcp(virus&
==&
&
dunnett&
),alternative=&
two.side&
#model是方差分析对象
#virus是分组变量
#方法为Dunnett
summary(rht)
plot(rht)
结果表明:
三个处理均与对照cc差异显著。
下图为可视化结果:
4.SNK法(Student-Newman-Keuls)
实质上是根据预先制定的准则将各组均数分为多个子集,利用StudentizedRange分布来进行假设检验。
推荐优先用Tukey检验
SNK法可用agricolae包中的SNK.test()函数实现,其调用格式为:
SNK.test(y,trt,alpha=0.05,…)
其中y为方差分析对象,trt为要进行多重比较的分组变量
-snk.test(model,&
)
程序运行结果与LSD.test类似。
5.Turkey检验
使用学生化的范围统计量进行组间所有成对比较。
Tukey的检验特点:
所有各组的样本数相等;
各组样本均数之间的全面比较;
可能产生较多的假阴性结论。
R中Turkey检验检验的函数为TukeyHSD(model),其调用格式为:
TukeyHSD(model)
其中model为方差分析对象
tuk=TukeyHSD(model)
tuk
plot(tuk)
可视化结果:
6.Duncan法(新复极差法)(SSR)
指定一系列的“range”值,逐步进行计算比较得出结论。
Duncan法可用agricolae包中的duncan.test()函数实现,其调用格式为:
duncan.test(y,trt,…)
#model为方差分析对象
-duncan.test(model,&
7.Scheffe检验
为均值的所有可能的成对组合执行并发的联合成对比较。
使用F取样分布。
可用来检查组均值的所有可能的线性组合,而非仅限于成对组合。
Scheffe检验特点:
各组样本数相等或不等均可以,但是以各组样本数不相等使用较多;
如果比较的次数明显地大于均数的个数时,Scheffe法的检验功效可能优于Bonferroni法
Scheffe法可用agricolae包中的scheffe.test()函数实现,其调用格式为:
-scheffe.test(model,&
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女人如春天的桃花。
阳春三月,春暖花开时,婀娜多情的桃花会竞相开放,如一片片红霞,与如纱的垂柳,形成了桃红柳绿的春日美景。
而青春靓丽的美女,正恰如春光明媚中盛开的桃花,缤纷绚烂,激情四射,充满青春的活力,充满青春的幻想,充满青春美妙的情怀。
青春岁月,容光焕发的美女,爽朗的笑声,轻盈飘逸的秀发,眉飞色舞的眼神,热情奔放的性格,恰如妩媚鲜艳的桃花,装扮了温暖的春天,惊艳了春天的美丽。
无论走到哪里,美女总会给人赏心悦目的感觉,总是一道靓丽的风景,使春天增添了无与伦比的靓丽,所以说女人如春天如霞的桃花!
女人如夏日的荷花。
“接天莲叶无穷碧,映日荷花别样红。
”炎炎烈日下,荷花亭亭玉立,静谧地开放,粉绿相间,分外妩媚。
“出污泥而不染,濯清涟而不妖.”清白闲逸,自由脱俗,清新淡雅,芬芳四溢的天然美丽。
远离喧嚣的尘市,在一方水土里,独享一份圣洁高雅,恬静安然的舒适,柔情似水的缠绵婉约,恰如一个静享清欢的善良女子。
“清水出芙蓉,天然去雕饰.”女人天生就是清纯、善良、静美、温柔如水的性格,拥有善良的心灵,宽容的心胸。
每天只求安静地做好自己,不斤斤计较,不张扬,以一颗博爱之心,宽容身边的人和事。
容忍于心,善存心间,用一颗感恩的心,温暖着身边的人和事,所以说女人如夏日清爽的荷花!
女人如秋天的菊花。
秋高气爽,硕果累累时,到处是丰收的喜悦景象。
一场秋雨一场寒时,百花凋谢,万物凋零的时刻,菊花却在风吹雨打中毅然绽放,用顽强的生命力,笑对风雨。
多姿多彩的菊花,傲然开放,装点了秋日的荒凉。
“采菊东篱下,悠然见南山。
”怡然自得的享受啊!
而如花的女人,一路走来,吃尽千辛万苦,历经曲曲折折,却毫不畏惧艰难。
照顾老人,陪伴孩子,洗衣做饭,工作加班,任劳任怨。
宁愿自己吃苦受累,从不抱怨。
在平凡的岁月,书写着女人们的精彩与不平凡。
即使韶华远逝,年青的容颜失去光彩,依然在为家人创造着温暖、快乐、幸福的家园,所以说女人如秋霜中绽放的菊花!
女人如冬日的梅花。
在白雪皑皑的冬季,天苍苍,野茫茫之时,大地一片衰败的景象。
行走在路上,寒风凛冽,刮到脸上如刀般的疼痛,但是女人依然在路上坚强地面对、承受。
这不正是无惧风雪、坚韧不拔、顽强不屈的梅花的品格吗?
“遥知不是雪,唯有暗香来.”梅花以它的弱小娇艳的身躯,凌寒傲雪,装点着寂寞荒凉的冬日!
在光阴的故事里,女人走过青春岁月,走过三十而立,走过四十不惑……此刻,正逐渐走在繁华落幕的路上,肩负着生活无奈的痛苦,品尝着人间聚散离合的悲欢。
无论条件多么的艰苦,女人们一如既往地在路上打拼、奋斗着,时刻承担着家庭和社会的责任,装扮着世界的美好和浪漫,正在骄傲地撑起自己的半边天。
“梅花香自苦寒来.”所以说女人如冬日火红的寒梅!
女人如花,四季都在竞相地绽放,闪烁着耀眼的光华;
女人又非花,漂亮、善良、宽容、感恩,是始终如一的信念。
女人如水,柔情似水,缠绵婉约;
女人又非水,坚强、勇敢、优雅、浪漫,是一生的追求。