常见血液肿瘤FISH检测小册Word格式.docx

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免疫组化(IHC),流式细胞(FCM)

●细胞遗传学检查(Cytogenetics)

核型分析,荧光原位杂交(FISH)

●分子生物学检查(Molecular)

PCR,DNA测序

三.FISH技术的作用及优势

FISH作为一项很重要的分子遗传学检测技术,在血液肿瘤的诊断中有很大的作用,得到了NCCN等国内外各大血液肿瘤诊疗指南的认可和建议。

目前与血液肿瘤相关的FISH探针有接近100种,常用的就有60种左右,包括急慢性白血病、骨髓增生异常综合症(MDS)、多发性骨髓瘤(MM)、淋巴瘤等多种血液肿瘤。

FISH技术的相对优势:

●FISH技术更敏感,可检测出核型分析检测不出的细微缺失或易位,如MDS中的5q缺失综合征;

●FISH技术不需要中期分裂相细胞,而核型分析需要培养时间较长且需要较高的操作要求;

●FISH技术是在细胞形态的基础上进行结果判读,可有效地降低假阴性或假阳性的风险,而PCR技术经过倍增扩增,不能在形态的基础上判读,对实验要求高,易产生假阴性或假阳性。

四.常用的血液FISH检测探针

1

急性粒细胞白血病(AML):

样本建议骨髓

□AML1/ETO融合基因(M2b分型)

□PML/RARA融合基因(M3分型)

□CBFB基因断裂(M4分型)

□KMT2A(MLL)基因断裂(预后差,治疗失败风险高)

□其他:

□8号染色体、□CBFB/MYH11基因融合、□RARA基因断裂、□5q缺失、□7q缺失、□EVI基因断裂

2

慢性粒细胞白血病(CML):

样本优先骨髓

□BCR/ABL(DF)融合基因检测(指导格列卫用药)

□嗜酸性粒细胞增多症(格列卫作用靶标):

□PDGFRA基因断裂、□PDGFRB基因断裂、□FGFR1基因断裂

□BCR/ABL(ES)、□BCR/ABL(SF)、□i(17q)、□ASS基因缺失

3

急性淋巴细胞白血病(ALL):

□ETV6(TEL)/AML1融合基因(预后较好,但易复发)

□TCF3(E2A)基因断裂(标准化疗后易早期复发)

□BCR/ABL融合基因(易迅速复发,对挽救性化疗反应不佳)

□儿童急性淋巴细胞白血病染色体及基因异常(4、10、17、TEL/AML1、KMT2A基因断裂、BCR/ABL(DF),预后评估及治疗方案的选择)

□TCF3(E2A)/PBX1、□4、10、17;

□MYC基因断裂、□IGH基因断裂、□KMT2A基因断裂、□CDKN2A(P16)基因缺失

4

慢性淋巴细胞白血病(CLL):

样本优先外周血或骨髓

□慢性淋巴细胞白血病染色体及基因异常(P53、RB1(13q14)、ATM(11q22)、D13S25(13q14)、12,预后评估及治疗方案的选择)

□DLEU1(13q14)、□P53、□ATM(11q22)、□MYC基因扩增、□6q、□TERC、□GLI、□12、□BCL2/IGH、□CCND3/IGH

5

骨髓增生异常综合症(MDS):

□骨髓增生异常综合症染色体及基因异常(5q、7q、20q、8、X/Y,预后评估及治疗方案的选择)

□5q、□7q、□20q、□EGR1、□EVI1基因断裂、□X/Y

6

多发性骨髓瘤(MM):

□多发性骨髓瘤染色体及基因异常(P53、1q21、RB1(13q14)、D13S319(13q14)、IGH,预后评估及治疗方案的选择)

□CCND1(BCL1)/IGH、□MAF/IGH、□FGFR3/IGH、□MAFB/IGH、□CCND3/IGH、□11q23及DLEU1、□P53、□15q22及6q21、□1q21及1p36、□IGH基因断裂

7

淋巴瘤:

样本建议骨髓或淋巴结穿刺

□MYC/IGH融合基因(辅助诊断伯基特淋巴瘤、高分级B细胞淋巴瘤的治疗)

□BCL2/IGH融合基因(辅助诊断滤泡性淋巴瘤)

□ALK基因断裂(辅助诊断间变性大细胞淋巴瘤,指导克唑替尼用药)

□CCND1(BCL1)/IGH融合基因(辅助诊断套细胞淋巴瘤,鉴别诊断MCL和CLL)

□IGH基因断裂(发生于多种类型的淋巴瘤中,与超过50种基因融合)

□MALT1基因断裂(辅助诊断粘膜相关淋巴组织淋巴瘤,指导HP化疗方案)

□BCL6基因断裂(DLBCL中预后较佳,指导治疗方案)

8

骨髓移植后嵌合状态监测(X、Y)

□X和Y染色体检测

五.常见血液肿瘤FISH探针介绍

血液肿瘤中常见FISH探针有四种类型,应用于基因融合、断裂、扩增和缺失检测。

检测类型

探针举例

所含靶标

正常信号

典型异常信号

基因融合

BCR/ABL(DF)融合基因检测探针

GSPBCR

GSPABL

基因断裂

IGH基因断裂检测探针

GSPIGH

基因扩增

MYC基因扩增检测探针

GSPMYC

CSP8

基因缺失

P53基因缺失检测探针

GSPP53

CSP17

注:

*红色标记表示该基因探针标记红色荧光素(R),荧光显微镜相应滤块下观察为红色信号点(某些参数滤块下显示为橙色信号);

*绿色标记表示该基因探针标记了绿色荧光素(G),荧光显微镜相应滤块下观察为绿点信号点;

*黄色标记表示该基因探针包含一组分别标记了红、绿两种荧光素的探针组合,荧光显微镜单通道滤块下可观察到相应颜色信号点(绿色或红色信号点),双通道滤块下可观察到红绿相邻或重叠信号(融合,F)。

1.急性粒细胞白血病(AML)

常用FISH检测靶标:

AML1/ETO基因融合、PML/RARA基因融合、CBFB基因断裂、MLL基因断裂

●AML1/ETO融合基因检测—M2b分型的标志

1)辅助诊断:

AML1/ETO融合基因在M2患者中的发生率20%-40%,在M2b亚型中发生率高达90%,是M2b分型的标志,在M1和M4中少见。

2)判断预后:

AML1/ETO融合基因阳性是预后好的标志,患者对治疗反应佳,完全缓解率可达90%,5年无病生存可达50%-70%。

●PML/RARA融合基因检测—M3分型的标志

PML/RARA融合基因可见于95%以上的APL中,成为M3的一个特异标志,预后好,约占全部AML的9%。

2)指导用药:

全反式维甲酸(ATRA)和三氧化二砷能靶向降解PML/RARA融合蛋白,恢复野生型PML和RARA基因功能,解除其对基因转录的抑制,诱导细胞发生分化和凋亡,使APL得到有效治疗。

ATRA与化疗联合使用可使APL的完全缓解率达90%-95%,并可使70%以上的患者得到长期生存。

●CBFB基因断裂—M4E0特征性的遗传学改变

CBFB基因断裂重组是AML的特征性染色体异常,占总AML患者的5%-10%和23%的M4患者,通常见于AML-M4E0亚型,在M2,M5及M4(无嗜酸性粒细胞增多)中较少。

现在认为CBFB基因断裂重组是M4E0特征性的遗传学改变。

大多数CBFB基因断裂重组的AML患者对化疗敏感、预后较好。

●MLL基因断裂

在成人急性髓细胞白血病(AML)中,则主要见于M4/M5亚型。

除t(9;

11),t(10;

11)以外,大部分MLL重排白血病缓解率低,并且第一次缓解后极易复发,生存期短,预后很差。

在AML中单纯MLL断裂提示预后中等。

2.慢性粒细胞白血病(CML)

BCR/ABL基因融合

●BCR/ABL融合基因检测—CML诊断的“金标准”

t(9;

22)(q34;

q11)易位形成的BCR/ABL融合基因是CML的标志物,95%CML患者可检测出典型的t(9;

q11)易位,约5%的CML患者通过核型分析难以检测到Ph染色体,但可检测出融合基因存在,仍被归为Ph+CML分类。

对初诊患者进行BCR/ABL检测,可以进行酪氨酸激酶抑制剂受益人群筛查。

格列卫可用于治疗费城染色体阳性的慢性髓性白血病(Ph+CML)的慢性期、加速期或急变期。

3)疗效监测:

Ph染色体存在于CML的整个病程中,治疗缓解后,仍持续存在,只有消除Ph阳性克隆,才能达到最终治愈。

FISH可用于治疗期间患者体内BCR/ABL融合基因细胞量动态变化的检测,用于后续的治疗方案选择及药物使用效果评估。

3.嗜酸粒细胞增多症(HE)

PDGFRA基因断裂、PDGFRB基因断裂和FGFR1基因断裂

2008年WHO将具有PDGFRA、PDGFRB或FGFR1基因断裂异常,伴嗜酸性粒细胞增多的髓系和淋巴系肿瘤独立成一个新类“Myeloid/lymphoidneoplasmswitheosinophiliaassociatedwithrearrangementsofPDGFRA,PDGFRB,orFGFR1”。

这类患者具有PDGFRA基因重排、PDGFRB基因重排或FGFR1基因重排,即使不伴有BCR/ABL融合基因,依然对酪氨酸激酶抑制剂伊马替尼(imatinib)治疗敏感,治疗后完全缓解率高。

4.急性淋巴细胞白血病(ALL)

ETV6(TEL)/AML1基因融合,TCF3(E2A)基因断裂,BCR/ABL基因融合,KMT2A(MLL)基因断裂及4、10、17号染色体数目异常

ALL中遗传学改变发生的频率可达80%-90%,遗传学变异较大,但大部分是特异性改变,与特定的形态学和免疫学表型有关。

ALL中遗传学改变主要是两种形式,一是染色体结构异常,二是染色体数目的异常。

●ETV6(TEL)/AML1基因融合

ETV6(TEL)/AML1融合基因在儿童ALL中的发生率高达20%-25%,是目前儿童ALL最常见的染色体重排。

大多数研究发现ETV6(TEL)/AML1阳性的儿童ALL治疗效果很好,5年EFS和总生存率达到89%和97%,是预后良好的指标之一。

●TCF3(E2A)基因断裂

约3%-5%的儿童ALL携带E2A基因断裂。

早期研究认为TCF3(E2A)/PBX1阳性的ALL患儿易发生早期复发,预后不佳,故曾将其作为高危因素之一。

核型分析容易导致20%-25%漏诊,而FISH可克服这一缺点。

●BCR/ABL基因融合

22)易位形

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