Trizol法提取RNA实验步骤与原理新手详细注释版Word文档下载推荐.docx
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用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白
抑制剂都不能是RNase完全失活。
它广泛存在于人的皮肤上,因此,在与RNA制备
有关的分子生物学实验时,必须戴手套。
RNase的又一污染源是取液器,根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。
一般
情况下采用用DEPC(焦炭酸二磷脂,一种RNase抑制剂)配制的70%乙醇擦洗取液器
的内部和外部,基本达到要求。
取RNase-free的物品时必须戴手套。
1、料制品的处理
尽可能使用无菌,一次性塑料制品,已标明RNase-Free的塑料制品,如没有
开封使用过通常没有必要再次处理。
对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使
用。
处理步骤如下:
1))在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。
注意:
DEPC为剧毒物,活性很强,小心在通风柜中使用。
2)处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制
品的所有部分都浸泡到溶液中。
3)在通风柜中室温处理过夜。
4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住含已DEPC水处理过的塑料制品
的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少30分钟。
5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。
置于干净处备用。
2、璃玻和金属物品
250°
C烘烤3小时以上。
四、从组织中提取总RNA
1)液氮研磨:
组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再
加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg组织/mlTrizol加入Trizol,转入离
心管进行第2步操作。
(液氮既能使各种组织成分不易被破坏或降解,又能使组织变硬,脆性增加易于磨
碎。
终止细胞内外一切生物反应,防止RNA酶的降解反应)
2)匀浆:
组织样品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。
另外,组织体积不能超过
Trizol体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。
五、从细胞中提取总RNA
1)培养贴壁细胞:
不须消化,可直接用Trizol进行消化、裂解,Trizol体积按
10cm2/ml比例加入。
2)悬浮细胞可直接收集、裂解,每1mlTrizol可裂解5×
106动物、植物或酵母细
胞,或107细菌细胞。
六、操作步骤
1、、细胞或组织加Trizol后,室温放置5min,使其充分裂解。
注:
此时可放入-70℃
长期保持。
2、12,000rpm离心5min,弃沉淀。
3、按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置15min。
禁用漩涡
振荡器,以免基因组DNA断裂。
(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。
有机相中主要是酚和蛋白
结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)
4、4℃12,000g离心15min。
5、吸取上层水相,至另一离心管中。
千万不要吸取中间界面;
若同时提取
DNA和蛋白质,则保留下层酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,则弃下层酚相。
6、按0.5ml异丙醇/mlTrizol加入异丙醇(沉淀RNA)混匀,室温放置5-10min。
7、4℃12,000g离心10min,弃上清,RNA沉于管底。
8、按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇(沉淀RNA),温和振荡离心管,悬浮
沉淀。
9、4℃8,000g离心5min,尽量弃上清。
10、、室温晾干或真空干燥5-10min。
RNA样品不要过于干燥,否则很难溶
解。
11、可用50ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA样品,55-60℃,5-10min。
H2O、TE或0.5%SDS均须用DEPC处理并高压。
(TE缓冲液由Tris和EDTA配制而成,主要用于溶解核酸,能稳定储存DNA和
RNA。
用于酶切反应不能使用SDS)
12、测O.D值定量RNA浓度。
此方法提取RNAA260/A280值在1.6-1.8之间;
产率估计:
组织标本:
(ugRNA/mg组织)1-10ug,培养细胞(ugRNA/106
Cell):
5-15ug。
注:
组织或细胞量过少,可酌情减少Trizol用量;
组织或细胞用量过多,会引起
DNA对RNA的污染;
高蛋白、脂肪或多糖类组织,肌肉组织或块状植物组织等,组织匀浆或液氮研磨后
须4℃12,000g离心10min去掉不溶物,再进行下面操作,若顶层有脂肪物,则也
须去掉;
热天提RNA,带手套是必须的,手是RNase的主要来源;
可用手动匀浆器代替,
然后再充分研磨。
组织块用液氮研磨,效果最好,若没有液氮或电动匀浆器
此时组织块不宜过大,且需先用眼科剪刀将组织碱碱剪碎
6.1.2.1肝脏、肠道、肌肉总RNA提取方法
1使用已高温蒸汽灭菌的手术刀和镊子从鱼的腹部解剖开,从中取出完整的肝脏、
肠、肌肉等组织,置于离心管后立即放入液氮中;
2组织在液氮下研磨成粉,取少量至加有1mLTrizol的1.5ml离心管中,充分混合
后于4℃,12,000rpm离心15min;
3取上清移至新1.5ml离心管中,加入200ul氯仿,剧烈震荡直至呈乳白色,于
4℃,12,000rpm离心15min;
4取上清移至新1.5ml离心管中,加入500ul异丙醇,轻轻颠倒10次,冰上放置
20mins,于4℃,12,000rpm离心15min;
5弃上清,加入1ml75%乙醇(用DEPC水现配现用),于4℃,12000rpm离心
5min,重复此步骤一次;
6弃上清后,室温干燥5-7mins;
7加入适量(20-30ul)的DEPC水溶解沉淀65℃溶解,-20℃(最好-80℃)保
存,检测RNA浓度,并电泳检测。
6.1.2.2RNA浓度测定和电泳检测
取2ul提取好的RNA溶液,于Nanodrop2000Spectrophptpmeter测定RNA
浓度及A260/A280的相对吸光度,纯净RNA的A260/A280应在1.8-2.2之间。
电泳检测:
1%琼脂糖,1×
ATE缓冲液,90V电泳30min,凝胶成像系统观
察,分析结果。
6.1.2.3肝脏、肌肉、肠道样品cDNA的合成
反应按照TaKaRa公司的PrimeScript?
RTreagentKitWithgDNAEraser
(PerfectRealTime)反转录试剂盒说明书进行,合成cDNA模板。
①(残存的)基因组DNA的除去反应,在PCR管中配置如下缓冲液。
试剂用量
5×
gDNAEraserBuffer2.0μl
gDNAEraser1.0μl
TotalRNAX*ul
RNaseFreedH2Oupto10μl
(gDNA、genomicDNA、基因组DNA:
是指有机体在单倍体状态下的DNA全部
含量,是染色体DNA,与质粒等染色体外DNA区别。
)
X*:
根据检测到的RNA浓度来配置;
混合均匀后,室温放置20-30min
2反转录反应,在PCR管中配置如下缓冲液(20ulsystem),反应液配制在冰上
进行。
为了保证反应液配制的准确性,进行各项反应时,先按反应数+1的量配制
MasterMix,然后再分装到每个反应管中。
试剂
使用量
5×
PrimeScrpit?
Buffer2fo(rReal
4.0ul
Time)
PrimeScript?
RTEnzymeMixI
1.0μl
RTPrimerMix
①的反应液
10.0ul
upto20
RNaseFreedH2O
3混合均匀后,在PCR仪上进行逆转录反应,反应条件为:
85℃
37℃15min
5sec
然后将得到的cDNA存放于-20℃冰箱保存待用。