表观遗传学第七章siRNA与miRNA介导的调控精Word格式文档下载.docx
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r四、miRNA在癌症发生中的作用r五、siRNA的应用
mRNA水平上诱导具有特异性序列的基因沉默的过程
r2.转录后沉默:
Post-transcriptionalgenesilencing,PTGS
r3.表观遗传学中的一种重要现象生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
r1.RNA干扰:
生物体内通过双链RNA分子在
n
oitantemgip-oHyp生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
Epigenetics,2008-2009,Semester1,USTCr1.1990年,RichJorgensen将由强启动子控制的Chalconesynthasegene转入淡紫色的矮牵牛花->
加深紫色r2.Hypopigmentation:
许多花出现杂色,甚至紫色消失,变成白色r
3.Co-suppression
r1.1995年,SuGuoandKennethJ.Kemphues,线虫
r2.利用反义RNA技术阻断线虫中的par-1基因。
在对照实验中给线虫注射正义RNA以期观察到基因表达的增强。
效地抑制基因的表达!
r3.然而,正义RNA和反义RNA都能够有
r4.沉默的效应能够在被注射的动物及其后代中保持,虽然RNA转录本在胚胎早期就发生
降解
Epigenetics,2008-2009,Semester1,USTC生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物ControldsRNA
Epigenetics,2008-2009,Semester1,USTCds-gfp
RNA
Younglarva(幼虫)Adult(成虫)adultbodywallathighmagnification(高放大倍数的成虫体壁)
Nohybridizationandstaining
+antisense+hybridization
adultbodywallathighmagnification(高放大倍数的成虫体壁)Epigenetics,2008-2009,Semester1,USTC
生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物+hybridization(endogenousmex-3RNA)+dsmex-3RNA
+hybridization
r1.“RNAInterference”:
注入dsRNA能够有效地、长期的阻断基因的表达r2.给线虫喂食表达GFPdsRNA的细菌,线虫的GFP表达被抑制(a),但存在RNAi缺陷的则不被抑制(b)r3.之前的正义RNA抑制基因表达的现象,可能是由于体外转录所得RNA中污染了微量双链RNA而引起生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
r2.外源基因诱导的RNA沉默是植物对抗病毒和转座子的一个防御系统
r3.绝大多数的植物病毒具有单链RNA基因组,进入细胞之后从释放其基因组,由病毒编码的RNApolymerase产生正义和反义的RNA,并形成dsRNA,触发RNAi机制从而抵制其自身生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
r1.植物细胞可以通过降解病毒RNA的方式来对抗病毒的入侵,称为转录后沉默(PTGS)
r1.从双链RNA产生的小干扰RNA可以用不同机制关闭基因的细胞机器
r2.为什么外源的dsRNA能够抑制与其序列同源的基因的表达?
rA.Postinitiationmechanisms.miRNA物通过阻碍翻译的延伸,或者促使核糖体与mRNA生分离来抑制mRNA的翻译rB.Cotranslationalproteindegradation.做m在多肽链翻译后的同时使其降解心o
c
.
专o-o
i
秀b
b
物.w
生ww
rD.Argonaute招募eIF6,从而阻止大的核糖体亚基与小亚基的结合
rC.Argonaute与eIF4E竞争结合cap
rE.Argonaute通过脱腺苷化(deadenylation)阻止loopmRNA的形成rF.MicroRNA-mediatedmRNAdecay.miRNA触发脱腺苷化并使得底物mRNAdecapping
域的核糖核酸酶,将dsRNA切割成小的shortinterferingRNAs(siRNAs)ormicroRNAs(miRNA),并将这些产物加载到RISC上
r2.RISC(RNAinducedsilencingcomplexes)(RNA诱导的沉默复合体):
包含多个蛋白质的复合物,将与之连接的siRNA或miRNA定位到其靶点并抑制靶基因的表达
生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物r1.Dicer:
RNaseIII类似的,包含多个功能结构
r序列的结构组成:
物
生r1.一个PAZ结构域,与做m
dsRNA的末端结合心o贾第鞭毛虫
专o
r2.两个RNaseIII结构-o
r3.其他的功物.w
生能结构域ww
r1.PAZ有一个OB折叠,与ssRNAs的3’端有较弱的亲和力,允许PAZ与dsRNAs露在外面的两个核苷酸结合r2.Dicer的PAZ结构域能够识别Drosha切割的产物末端生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
r1.PAZ结构域与两个具有催化活性的RNaseIII结构域分离r2.PAZ结构域与RNaseIII结构域的距离为65angstrom,与25个bp的RNA长度一致
r3.Dicer是一个分子尺,负责识别dsRNA并在特异位点切断
的核心成员
2.AGO蛋白质一般包含PAZ和PIWI两种功能结构域
3.PAZ与双链siRNA3’-端露出的两个核苷酸结合
4.PIWI负责将双链siRNA切成单链
5.PAZ和PIWI对于SiRNA与底物mRNA之间的相互作用是必须的,并负责底物的断裂或转录抑制
6.不同的AGO具有不同功能,例如人类AGO2负责的RISCs能够割裂底物mRNA,而AGO1和AGO3则不能
rrrrr生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物r1.Argonaute(AGO):
大的蛋白质家族,为RISCs
生
做m
心o
-o
秀bb
做m心o
物.w生ww
r1.dsRNA首先需要被Dicer相关的复合物进行处理,然后在Argonaute相关的复合物的引导下发挥功能;
r2.Dicer和Argonaute家族的成员在RNA诱导的沉默通路中发挥功能,不同的组成通过不同的机制引起沉默r3.例如,不同的
Argonaute相关复合物能够引起不同的沉默过程(mRNA降解vs.翻译抑制)生物w秀w-w专.b心bioo做.c生om物
r1.MicroRNA(miRNA):
一种非编码小的RNA(~21–23bp),通过Dicer剪切其前体RNA(~70-90)所得r2.miRNA以RNA-蛋白质复合物的形式,在动物和植物的细胞中广泛的表达,也称为miRISCsr3.在发育的过程中起着关键性的作用,能够促使与miRNA序列同源的靶基因的mRNA的降解或者翻译的抑制
r(A)pri-miRNAs的结构r(B)人类pri-miR-30aRNA的发夹环;
Drosha切割位点(箭头),Dicer切割位点(三角)
r1.Pri-miRNA被Drosha切割
r2.pre-miRNA被Dicer切割r3.Exportin5(Exp5)将miRNA装运到胞质中
r2.Drosha和Dicer都具有RNaseIII和dsRNA结合结构域
Epigenetics,2008-2009,Semester