王镜岩第三版生物化学下册课后习题答案docWord格式文档下载.docx
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第34章DNA的复制和修复
⒈生物的遗传信息如何由亲代传给子代?
答:
在细胞分裂间期,DNA分子边解旋边复制,分别以亲代DNA的两条母链为模板,以核中游离的脱氧核苷酸为原料,根据碱基互补配对原则,合成两条子链,它们分别与相应的模板链螺旋化就形成了两个与亲代DNA一样的子代DNA,在生物传种接代的过程中,亲代将复制出的一份DNA通过配子传给子代,从而实现了亲子代间遗传信息的传递。
接下来,在子代个体发育的过程中,将利用DNA(gene)来指导自身蛋白质的合成,从而表现出与亲代相似的性状。
也有一些生物如某些病毒,是通过将亲代的RNA复制后传给子代的方式进行遗传信息的传递。
⒉何谓DNA的半保留复制?
是否所有的DNA复制都以半保留的方式进行?
(双链DNA通常都以半保留方式复制。
)
DNA在复制时首先两条链之间的氢键断裂两条链分开,然后以每一条链分别做模板各自合成一条新的DNA链,这样新合成的子代DNA分子中一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式为半保留复制(semiconservativereplication)。
并非所有的DNA复制都以半保留的方式进行,但双链DNA通常都以半保留方式复制。
⒊若使15N标记的大肠杆菌在14N培养基中生长三代,提取DNA,并用平衡沉降法测定DNA密度,其14N-DNA分子与14N-15N杂合DNA分子之比应为多少?
这两者之比为1:
3。
⒋比较DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ性质的异同。
DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ的功能是什么?
有何生物学意义?
在E.coli中,共发现了3种DNA聚合酶,即DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ。
DNA聚合酶Ⅰ是个多功能酶,具有5’--→3’聚合功能;
3’--→5’外切功能以及3’--→5’外切功能。
DNA聚合酶Ⅱ与DNA聚合酶Ⅰ功能相似,但没有5’--→3’外切功能。
DNA聚合酶Ⅲ与DNA聚合酶Ⅱ功能相同,但其聚合活性比DNA聚合酶Ⅰ高1000倍,是E.coliDNA复制中的最主要酶。
DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ是在1999年才被发现的,它涉及DNA的错误倾向修复(errorpronerepair)。
当DNA受到较严重损伤时,即可诱导产生这两个酶,使修复缺乏准确性(accuracy),因而出现高突变率。
其生物学意义在于高突变率虽会杀死许多细胞,但至少可以克服复制障碍,使少数突变的细胞得以存活。
⒌DNA复制的精确性、持续性和协同性是通过怎样的机制实现的?
DNA聚合酶Ⅲ由10个亚基组成,这些亚基将催化DNA合成、校对和夹位DNA等功能有机地组合在一起,保证了DNA复制的精确性、持续性和协同性。
⒍何谓DNA的半不连续复制?
何谓冈崎片断?
试述冈崎片断合成的过程?
DNA的双螺旋结构中的两条链是反向平行的,当复制开始解链时,亲代DNA分子中一条母链的方向为5′~3′,另一条母链的方向为3′~5′。
DNA聚合酶只能催化5′~3′合成方向。
在以3′~5′方向的母链为模板时,复制合成出一条5′~3′方向的前导链,前导链的前进方向与复制叉的行进方向一致,前导链的合成是连续进行的。
而另一条母链仍以3′~5′方向作为模板,复制合成一条5′~3′方向的随从链,因此随从链会成方向是与复制叉的行进方向相反的。
随从链的合成是不连续进行的,先合成许多片段,即冈崎片段。
最后各段再连接成为一条长链。
由于前导链的合成连续进行的,而随从链的合成是不连续进行的,所以从总体上看DNA的复制是半不连续复制。
DNA复制时,在滞后链上,较短的DNA片段(大约1000-2000个核苷酸)是在分段合成引物的基础上,非连续合成的,这些不连续的DNA片段最先由日本科学家冈崎在电子显微镜下发现,故称为冈崎片断(Okazakifragment)。
引发体在滞后链上沿5'
→3'
方向不停的移动(这是一种相对移动,也可能是滞后链模板在移动),在一定距离上反复合成RNA引物。
DNA聚合酶Ⅲ从RNA引物的3,-OH端合成冈崎片段。
⒎DNA复制时双链是如何解开的?
比较类型Ⅰ和类型Ⅱ拓扑异构酶的作用特点和生理功能。
DNA复制起始的体外实验表明需要6种蛋白,DnaA、DnaB、DnaC、组蛋白样蛋白(HU)回旋酶及单链结合蛋白(SSB)形成起始复合物。
DnaA单体首先结合到复制起始点上4个含9bp的重复顺序上。
然后20~40个DnaA单体结合到复制起始点形成一个核心。
在DnaA蛋白的作用下位于复制起始点右侧的3个含13bp的重复顺序开始解链形成开放复合体。
DnaB/DnaC在复制起始区充当了起始的引发体(primosome)。
DnaB?
DnaC复合体转变为DnaB六聚物,形成复制叉。
DnaB提供解旋酶(helicase)活性,使DNA解旋,可能它识别复制叉上潜在的单链结构,从13bp的重复顺序上取代出DnaA,并开始解螺旋。
DnaB在复制起始区域以很少的量(1-2六聚物)担负着催化作用。
在那儿DnaB还具有激活DnaG引发酶的能力。
解旋反应还需要另外两种蛋白,旋转酶(Gyrase)和SSB(单链结合蛋白)。
旋转酶也就是TopⅡ,其作用是解旋,即让一条链绕着另一条链旋转。
若没有这步反应,解开双链就会产生DNA的扭曲。
SSB可使已形成的单链处于稳定状态。
拓扑异构酶Ⅰ(TopoⅠ),将环状双链DNA的一条链切开一个口,切口处链的末端绕螺旋轴按照松弛超螺旋的方向转动,然后再将切口封起。
拓扑酶I松弛超螺旋不需ATP参与。
拓扑异构酶Ⅱ(TopoⅡ),它的作用特点是切开环状双链DNA的两条链,分子中的断端经切口穿过而旋转,然后封闭切口。
TopoⅡ在ATP参与下,将DNA分子从松弛状态转变为负超螺旋,为DNA分子解链后进行复制及转录作好准备。
⒏天然双链闭环DNA(cccDNA)的比超螺旋(δ)为-0.05,复制时解螺旋酶将双链撑开,如果反应系统中无旋转酶,当比超螺旋达到+0.05时,DNA的扭曲张力将阻止双链解开,此时已解开的双链占DNA分子的百分数是多少?
此时已解开的双链占DNA分子的百分数是9.52%。
⒐何谓复制体?
试述其主要成分的功能。
与DNA复制有关的酶和蛋白质因子由30多种,他们在复制叉上形成离散的复合物,彼此配合,进行高度精确的复制,这种结构称为复制体。
复制体的主要成分有,DnaA、DnaB、DnaC、组蛋白样蛋白(HU)回旋酶、单链结合蛋白(SSB)、引物合成酶、RNA聚合酶、DNA旋转酶,Dam甲基化酶以及DNA聚合酶等。
复制体在DNA复制叉上进行的基本活动包括:
双链的解开,RNA引物的合成,DNA链的延长,切除引物,填补缺口,连接相邻的DNA片断,切除和修复尿嘧啶和错配碱基。
⒑DNA的复制过程可分为哪几个阶段?
其主要特点是什么?
复制的起始是怎样控制的?
DNA的复制过程包括复制的起始、延伸和终止三个阶段。
(1)复制的起始
引发:
当DNA的双螺旋解开后,合成RNA引物。
引发体沿着模板链5’→3’方向移动(与冈崎片段合成的方向正好相反,而与复制叉移动的方向相同),移到一定位置上即可引发RNA引物的合成。
(2)DNA链的延伸
前导链只需要一个RNA引物,后随链的每一个冈崎片段都需要一个RNA引物,链的延长反应由DNApol.Ⅲ催化。
复制体沿着复制叉方向前进合成DNA。
DNApolⅠ的5,→3,外切活力,切除RNA引物。
DNApolⅠ的5,→3,合成活性补齐缺口。
DNAligase,动物、真核由ATP供能,原核由NAD供能。
(3)DNA合成的终止
环状DNA、线性DNA,复制叉相遇即终止。
DNA复制的调控主要是起始阶段的调控。
原核生物DNA复制的调控与其生长环境有关,真核生物DNA复制的调控与细胞周期蛋白等多种蛋白质因子有关,机制十分复杂,但复制起始点必须全甲基化后复制才能发生。
⒒真核生物DNA聚合酶有哪几种?
它们主要功能是什么?
真核生物DNA聚合酶有α、β、γ、δ等五种。
真核生物的DNA复制是在DNA聚合酶α与DNA聚合酶δ互配合下催化进行的,还有一些酶及蛋白质因子参与反应。
DNAPolα与引发酶共同起引发作用,然后由DNAPolδ催化前导链及随从链的合成。
在链的延长中,有PCNA(增殖细胞核抗原)参与,保障连续性DNAPol的性质与DNAPolδ有相似之处,在有些情况下,它可代替DNAPolδ起作用,例如在DNA损伤时,催化修复合成。
DNAPolγ是线粒体中DNA复制酶。
DNAPolδ及均有外切酶活性,因此也有编辑功能,校正复制中的错误。
它们的5′→3′外切酶活性可能在切除引物RNA中有作用。
真核生物DNA聚合酶的主要功能见下表:
酶活性
5′→3′聚合作用
3′→5′外切作用 α β γ δ e
+
- + +
细胞内定位功能 核
复制、引发 核
修复 线粒体
复制 核
复制
- +
+ +
⒓真核生物染色体DNA的端粒有何功能?
它们是如何合成的?
真核生物线形染色体的末端具有一种特殊的结构,称为端区或端粒。
端区结构中有核苷酸重复序列,一般在一条链上为TxGy,互补链为CyAx,x与y大约在1-4范围内,人的端粒区含有TTAGGG重复序列。
端区具有保护DNA双链末端,使其免遭降解及彼此融合的功能。
端区的平均长度随着细胞分裂次数的增多及年龄的增长而变短,可导致核生物染色体稳定性下降,并导致衰老。
其分子机制在于,线形DNA分子不能从末端核苷酸外合成RNA引物,如此染色体将逐代缩短。
但是在生殖细胞、胚胎细胞和肿瘤细胞中,由于有端粒酶,所以并不出现这种情况。
端粒酶是一种由RNA和蛋白质组成的酶,RNA和蛋白质都是酶活性必不可少的组分。
可看作是一种反转录酶。
此酶组成中的RNA可作为模板,催化合成端区的DNA片段。
端粒酶催化合成端区,在保证染色体复制的完整性上有重要意义。
⒔哪些因素能引起DNA损伤?
生物机体是如何修复的?
这些机制对生物机体有何意义?
一些物理化学因子如紫外线、电离辐射和化学诱变剂均可引起DNA损伤,破坏其结构与功能。
然而在一定条件下,生物机体能使这种损伤得到修复。
紫外线可使DNA分子中同一条链上两个相邻的胸腺嘧啶碱基之间形成二聚体(TT),两个T以共价键形成环丁烷结构。
CT、CC间也可形成少量二聚体(CT、CC),使复制、转录受阻。
细胞内具有一系列起修复作用的酶系统,可以除去DNA上的损伤,恢复DNA的双螺旋结构。
目前已知有4种酶修复系统:
光复活、切除修复、重组修复、SOS反应诱导的修复,后三种不需要光,又称为暗修复。
1.直接修复
1949年已发现光复活现象,可见光(最有效400nm)可激活光复活酶,此酶能分解由于紫外线形成的嘧啶二聚体。
高等哺乳动物没有此酶。
2.切除修复
在一系列酶