最新生物信息学常用基本词汇表Word文档格式.docx
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等位基因
一个基因的不同版本。
自制饰品一反传统的饰品消费模式,引导的是一种全新的饰品文化,所以非常容易被我们年轻的女生接受。
alphacarbon
α碳
在氨基酸中与侧链(R-基团)相连的中心碳原子。
4、“体验化”消费alternativesplicing
可变剪接
从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA分子的过程。
aminoterminus(N-terminal)
氨基端(N端)
在一个多肽中,具有自由氨基的分子端,对应于基因的5'
-端。
anti-parallel
反向平行
表示相反的方向;
在双链DNA中,这意味着如果一条链是5'
到3'
的,则其互补链方向是3'
到5'
的。
B
basepair
碱基对
(1)在双链DNA中嘌呤和嘧啶之间的相互作用(特别指A和T之间,G和C之间);
(2)双链DNA序列长度的基本单位。
betaturns
β转角
在反向平行的β折叠片中,当β链反转方向的时候蛋白质内部形成的U型结构
Bioinformatics
生物信息学
应用信息科学的理论、方法和技术,管理、分析和利用生物分子数据。
Biocomputing
生物计算
本书中特指用计算机技术分析和处理生物分子数据。
BasicLocalAlignmentSearchTool(Blast)
基本的局部比对搜索工具(Blast)
一种常用的序列数据库搜索工具。
blottingandhybridization
印迹和杂交
将分子(通常是核酸分子)从凝胶转移到膜上,接着用绑定有特定感兴趣的分子的标记探针进行洗脱的过程。
bootstraptest
自举检验
对置信程度进行量化的检验。
branchandboundmethod
分支约束法
一种空间搜索方法,通过约束条件减少搜索空间,提高搜索效率。
branches
分支
在系统发生树中,通过分支连接两个节点。
C
C(Cytosine)
胞嘧啶
作为碱基的两种嘧啶中的一种。
CAATbox
CAAT盒
大多数真核启动子具有的一段短序列,其片段模式为C-A-A-T,通常出现在转录起始位点上游80个核苷酸的地方。
许多因子可以与CAAT盒结合。
carboxyterminus
羧基端
在多肽链中,含有羧酸基团(—COOH)的分子端,对应于基因的3'
-端。
cDNA(ComplementaryDNA)
cDNA(互补DNA)
通过逆转录酶从RNA模板合成的DNA。
cDNAlibrary
cDNA文库
从mRNA序列中产生的所有DNA序列的集合。
这种类型的文库只包含编码蛋白质的DNA(基因)。
centraldogma
中心法则
从基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋白质的过程(DNA?
RNA?
protein)。
character
特征
在系统发生树中,具有有限状态数的特征。
chargedaminoacid
带电氨基酸
在一定的生物pH值下,带有正电或负电的氨基酸。
chromatin
染色质
在真核生物细胞核内部由大量DNA以及与此相关的组蛋白组成的近似均匀混合物。
chromosome
染色体
在原核生物,包含一个细胞基因组的DNA分子称为染色体。
在真核生物中,与蛋白质复合在一起、包含大量遗传信息的线型DNA分子。
clone
克隆
无性繁殖,如生物体克隆、基因克隆等。
cloning
在类染色体载体中插入特定的DNA一段,使得它们可以在活细胞中得以保存并复制。
Codingsequence
编码序列
DNA序列中为蛋白质编码的部分。
Codon
密码子
基因编码部分的三核苷酸组合,对应于一个特定的氨基酸。
Complementary
互补的
(1)通过氢键连接的核苷酸对(G和C;
A和T;
A和U);
(2)核苷酸链的反向平行对。
ComputationalMolecularBiology
计算分子生物学
主要研究分子生物学数据的分析方法,开发分析工具。
conformation
构象
蛋白质的空间构象。
consensussequence
一致序列
在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的核苷酸或氨基酸组成的序列
conservedsequence
保守序列
在进化过程中基本保持不变的核酸与蛋白质序列,它们往往与特定的功能相对应。
Contig
连续交叠群
基因组测序过程中将许多短的序列片段链接成很长的连续片段。
convergentevolution
趋同进化
指相似基因型或表型性状的独立进化。
例如,眼睛在各种生物体(如哺乳动物、软体动物以及昆虫)中独立进化,结构各异。
corefold
核心折叠
构成蛋白质空间形状的基本模式。
CpGisland
CpG岛
在哺乳类动物基因组中的一个500bp到3000bp的区域,该区域中的二核苷酸CpG的含量比其他区域的正常水平要高。
通常,与此相关的是真核生物管家基因的启动子区域。
crystal
晶体
由分子的规则排列组成的固体结构。
D
degeneracy
简并性
指某些氨基酸可以被一个以上的三联密码子编码的特性。
denaturedprotein
变性蛋白质
指蛋白质因为受热作用或者去污剂或尿素等化学作用而失去了正常的三级结构和四级结构的结果。
deoxyribonucleicacid(DNA)
脱氧核糖核酸(DNA)
由相连的核苷酸组成的双链生物二聚体,其核苷酸含有脱氧糖基。
DNA是遗传的分子基础。
dipeptide
二肽
由一个肽键连成的两个氨基酸。
disulfidebond
二硫键
二硫键是蛋白质中两个半胱氨酸侧链之间形成的化学键。
DNA
参见脱氧核糖核酸。
domain
域(结构域)
指蛋白质结构中相对独立的、具有特定功能的空间区域。
dotplot
点阵图
对两条序列进行图形化比较的方法。
图形中的一系列的斜线对应于序列相似的区域。
dynamicprogramming
动态规划
一种可以有效地探求一定复杂问题的各种可能的解决方案的程序;
它将一个问题合理分解成一些小的子问题,然后利用部分计算解得到最终答案。
E
enhancer
增强子
可以与真核转录因子特异性结合的DNA序列片段。
增强子序列可以在任何一个方向上起到逐渐增加转录水平的作用。
enzyme
酶
一种生物催化剂(通常是蛋白质),能通过降低活化能使特定的化学反应可以更快地进行。
EST(Expressedsequencetags)
EST表达序列标签
从cDNA的5'
或3'
端获取的短的DNA片段。
euchromatin
常染色质
指真核生物中组蛋白高度甲基化(乙酰化?
)并且DNA低度甲基化的开放染色质。
exhaustivesearch
穷举搜索
对问题所有可能的解进行评估。
exon
外显子
一个hnRNA分子的各个部分,它们被剪接后连在一起形成mRNA。
expressionprofile
表达谱
基因在不同时空的表达模式。
F
family
家族
在整个长度范围内有多于50%的氨基酸序列相同的蛋白质称为一个家族。
fold
折叠
通常和术语“结构模体”有近似的含义,但是特别暗示在两个或更多的蛋白质中具有相似二级结构的大区域。
fourfolddegeneratesite
四重简并位点
指那些改变一个核苷酸为任何其它三个中的一个都对核糖体将氨基酸插入到蛋白质没有影响的密码子位点。
G
G(Guanine)
G(鸟嘌呤)
两种嘌呤中的一种。
gappenalty
空位罚分
为了减少序列比对中出现的空位,对空位进行减分的操作。
gaps
空位
在两个具有共同祖先序列的比对中,为了反映插入或删除所引入的一个或一些破折号。
GCcontent
GC含量
在DNA序列中,核苷酸G、C的组成相对于A、T的比例。
gelelectrophoresis
凝胶电泳
指在电场的作用下,使带电分子穿过聚丙烯酰胺、淀粉或者琼脂糖凝胶,从而根据其大小和带电性进行分离的过程。
gene
基因
DNA或RNA中,代表特定功能的某一段核苷酸序列;
一种遗传的功能单元,它控制着一个或多个性状的传递和表达。
genecontent
基因内容
一个基因组所包含的所有基因称为该基因组的基因内容。
geneexpression
基因表达
利用存储在DNA中的信息来合成RNA分子,进而生成相应蛋白质的过程。
geneidentification
基因识别
利用各种方法识别基因组中的基因序列。
geneontology
基因本体论
关于基因和蛋白质知识的标准词汇,是今后实现各种与基因相关数据的统一、进行数据转换、开展数据挖掘的基础。
geneorder
基因次序
基因在染色体上的排列顺序。
genetree
基因树
基于同源基因分析得到的系统发生树。
geneticmap
遗传图谱
以具有多态性的遗传标记为“路标”,以遗传学距离为图距的基因组图谱。
genome
基因组
一个生物体全部遗传物质的总和。
genomics
基因组学
研究基因组序列,研究序列与功能的关系,研究基因组中所包含的遗传信息。
genomiclibrary
基因文库
包含有基因组DNA插入的克隆片段集合。
genotype
基因型
一个个体或群体全部或部分的基因组成。
globalalignm