Gaussian中有用的IOp一览优选稿.docx
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Gaussian中有用的IOp一览优选稿
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(M928-T898-M248-WU2669-I2896-DQ586-M1988)
Gaussian中有用的IOp一览
*IOp(1/7=N)设定优化时的收敛限。
力的RMS收敛限设定为N*10^-6(即Threshold显示的值),最大受力被设为1.5*N*10^-6。
RMS位移会设为4*N*10^-6bohr,最大位移会被设为6*N*10^-6bohr。
*IOp(1/8=N)在优化的时候以N*0.01bohr/弧度为最初置信半径,如果优化中不动态更新置信半径,则每一步步长都不会大于这个值(并非是必须等于这个值)。
减小其数值有助于解决收敛震荡问题,如果势能面平缓,则应当加大以加快优化速度。
默认是30。
等价于opt关键词中maxstep选项。
IOp(1/9=x)设定对置信半径的处理。
默认对于寻找极小点会每步自动更新置信半径,对于过渡态寻找则不会。
=1代表不更新,=2代表更新,对应opt中NoTrustUpdate和TrustUpdate关键词。
当步长超过置信半径时处理方法用10和20来选择,10代表将位移向量乘以刻度因子使其模等于置信半径(对寻找过渡态是默认的),20代表在置信半径对应的超球面上寻找能量极小点(对寻找极小点是默认的)。
*IOp(1/11=x)=1即noeigentest关键词,=2为总是测试势能面曲率符号,错了就停止任务,即eigentest关键词。
默认对LST/QST方法找过渡态及寻找极小点不测试,对Z矩阵或笛卡尔下TS任务进行检测。
*IOp(1/40=N)每N步重新精确计算一次Hessian矩阵,期间只是使用一阶导数更新之前的Hessian矩阵。
IOp(1/111=N)设定温度为N/1000K,若N为负数则为N/1000000K。
IOp(1/111=N)设定压力为N/1000atm,若N为负数则为N/1000000atm。
IOp(2/12=x)默认是1,仅当距离为0时才报错,即geom=nocrowd。
=2是小于0.5埃就报错,即geom=crowd。
=3是即便原子间距离为0,L202也不报错,此选项似乎目前不能用。
IOp(2/14=x)使用内坐标时,控制是否测试内坐标线性依赖性,默认不做测试。
见手册geom=independent。
*IOp(2/15=x)控制L202对对称性处理的细节。
nosymm相当于1。
2是仍然将分子弄到标准朝向,但不利用对称性,3是根本不调用处理对称性的模块。
4是用较松的标准判断对称性,然后将体系严格地对称化成这种对称性。
IOp(2/16=x)如果优化过程中遇到点群改变怎么处理。
1是继续走但关了对称性,2是继续走仍使用旧对称性,3是继续走并使用新对称性,4是停止任务。
默认是3。
IOp(2/17=N)决定对称性时,距离比较的容差为10^-N。
IOp(2/18=N)决定对称性时,非距离比较的容差为10^-N。
当IOp(2/17=4,2/18=3)时相当于symm=loose。
*IOp(3/10=x)设定以何种基函数方式储存波函数信息。
1000和2000控制是否将指数相同的S和P壳层组合成SP壳层,默认是2000(组合),1000代表分裂开(SplitSP关键词)。
100000将收缩基组完全去收缩化,即基函数数目将与高斯函数数目一致。
IOp(3/18=1)输出赝势信息,和用了GFPrint关键词的效果一样。
*IOp(3/24=1)1、10、100可以分别以老方式、Gen的输入格式、某种易读的方式输出基组信息。
1000输出壳层所属中心坐标。
x0000、x00000可以控制输出的基组、密度拟合基组信息是否先做归一化。
IOp(3/26=11)控制L311、L314(scf=conventional时会在自洽场迭代前调用)的双电子积分精度,默认是计算到10^-10精度。
设为11可以做到尽可能精确。
IOp(3/27=N)扔掉数值小于10^-N以下的双电子积分信息,默认N=10。
IOp(3/29=N)使单电子积分(L302)的精度做到10^-N,默认是N=13。
*IOp(3/32=2)避免去除线性相关的基函数。
默认是检验重叠矩阵本征值,发现存在线性相关问题就去掉多余基函数。
*IOp(3/33=1)输出单电子积分,核哈密顿,势能,重叠矩阵(overlap那项)。
=3用标准格式输出双电子积分,=4则用debug格式输出(对半经验无效)。
=5同时输出单、双电子积分。
IOp(3/53=N)设定ECP积分精度为10^-N,-1则不截断。
*IOp(3/59=N)与3/32相关,控制扔掉重叠矩阵本征向量的标准为10^-N。
IOp(3/60=x)控制对广义收缩基组的正交化和简化处理。
-1是不做正交化和简化,默认是2,即做正交化并去掉系数小的GTF。
1是正交化并只去除系数为0的GTF,N是做正交化并去除系数小于10^-N的GTF。
在Gaussian与其它量化程序计算结果相比较时此选项有用。
IOp(3/74=x)设用什么密度泛函,负数都是交换和相关泛函组合好的,包括那些杂化泛函,如-5=B3LYP,-24=O3LYP,-33=X3LYP。
0-99以内的都是代表相关泛函,100及以上的都是代表交换泛函,这两个可以任意组合起来,比如402=BLYP。
*IOp(3/76=MMMMMNNNNN)将HF交换项和DFT交换项按照NNNNN/10000比MMMMM/10000的比例组合。
*IOp(3/77=MMMMMNNNNN)使LDA和高阶交换泛函按照NNNNN/10000比MMMMM/10000的比例组合。
*IOp(3/78=MMMMMNNNNN)使LDA和高阶相关泛函按照NNNNN/10000比MMMMM/10000的比例组合。
*IOp(3/86=N)扔掉角动量量子数>=N的基函数。
*IOp(3/93=1)设定核电荷用点电荷描述,而Gaussian对标量相对论计算默认用的是s型高斯函数描述,为了与文献比较有时需要设定此项。
IOp(3/111=1)PBC计算一开始额外输出每个晶胞与中心的距离。
IOp(3/116=x)具体控制SCF任务的类型,比如限制性、非限制性、实数、复数等问题。
IOp(3/118=N)给估计的直接积分任务所需内存量增加Nwords内存。
IOp(3/124=1)不管是什么交换相关泛函,都加上VDW校正项。
而默认情况下,只有所用泛函在定义中包括了色散校正项才会加上。
IOp(4/6=x)设定读入的初猜波函数是否做正交归一性检查、正交化和投影。
IOp(4/11=x)设置初猜类型、Harris初猜时所用的积分格点设定。
*IOp(4/15=N)设定初猜时的自旋多重度为N。
IOp(4/39=N)设定guess=mix时的角度为Pi/N,默认N=4。
*Iop(4/43=3)在CASSCF任务中且组态数很多时,使所有组态的信息都输出出来(默认是仅在组态数少的时候才输出)。
IOp(4/68=N)设定分子力学优化微迭代的收敛标准为10^-N。
*IOp(5/7=-1)MCSCF中不做迭代只做CI。
设为N时SCF和MCSCF最大迭代次数为N次。
IOp(5/9=1)使用SCF直接最小化(L503)使密度矩阵收敛到10^-3时切换到普通SCF过程。
*IOp(5/13=1)SCF不收敛时仍继续执行后续任务。
默认是0(等价2),不收敛就停。
*IOp(5/14=x)ForL502,=1对于RHF任务,迭代结束后以UHF波函数形式记录,对UHF任务起到跳过自旋湮灭的作用(注意得到的密度矩阵将完全错误);=2保存自旋湮灭后的密度矩阵,故波函数分析模块L607使用的波函数将会是自旋湮灭后的;10=在第一次迭代计算完双电子项后结束;=20仅从储存的实空间Fock矩阵重新计算能带结构。
IOp(5/16=x)ForL502,设定SCF中对角化方法。
IOp(5/17=x)ForL510,设定MCSCF中对角化方法,1000=为多参考态MP2生成数据,10000=试图控制根翻转。
*IOp(5/33=3)在每次迭代后输出核哈密顿矩阵、MO系数、本征值、密度/自旋密度矩阵、Fock矩阵等一大堆矩阵。
PBC计算时在最后迭代后还能输出不同k点的晶体轨道能。
IOp(5/37=N)每N次迭代完整构成一次Fock矩阵,而不是默认的每20次一次(期间通过增量方法构成Fock矩阵)。
-1则不用增量方法构成Fock矩阵。
*IOp(5/38=x)控制直接SCF过程(每次迭代重算积分)中积分精度。
默认=5,允许VarAcc(积分精度可变),=1不允许,=2比当前收敛情况精度高三位小数,=3在最终迭代前用当前收敛情况同样的精度,最终迭代时高两位小数。
=4首先收敛到10^-5(这个过程电子积分精度为10^-6),然后再完全收敛到期望精度,=7全精度双电子积分。
*IOp(5/70=N)设定解决SCF收敛问题的分数占据方法(温度展宽)的温度为N。
IOp(5/75=N)~(5/78=N)分别设定分数占据涉及的Alpha电子数、Alpha轨道数、Beta电子数、Beta轨道数。
IOp(5/80)、IOp(5/81)、IOp(5/82)设定SCF中共轭梯度法的选项,分别设定最大步长、所用方法和最大步数、收敛标准。
IOp(5/83=N)SCF中DIIS最大子空间维度,默认是20。
IOp(5/86=x)设定能量升高时是否降低DIIS子空间维度,何时开启能级移动及能级移动的量。
IOp(5/102=N)设CAS-MP2最大组态数是N,默认是1000。
*IOp(5/103=N)设置IOp(5/33=3)输出的每个k点的占据和非占据轨道数目都为N,默认是5。
*IOp(6/7=3)输出所有的分子轨道信息,即pop=full。
*IOp(6/8=3)输出密度矩阵。
*IOp(6/17=x)设定L602(诸如prop关键词会涉及)计算电场及梯度、静电势属性时包含哪些成分的贡献。
=0计算全部贡献,=1只计算原子核的贡献,=2只计算电子的贡献,-N只计算N号壳层的贡献。
IOp(6/20=x)设定拟合静电势电荷的方法和元素半径的定义。
-1=读入自行设定的拟合点,1000=只拟合重原子电荷,10000只拟合活性原子电荷。
*IOp(6/26=x)设定L602、L604模块中使用哪种密度,默认是1=总密度,2=Alpha密度(好像程序不认)、3=Beta密度、4=自旋密度。
IOp(6/27=22)不仅输出Mulliken电荷,还输出Mulliken键级矩阵,即pop=bonding,实际上只是把Gross布居对角元设成了0而已。
此选项数值千位数若是1,可以读入自定义权重而不是均分交叉项来做Mulliken分析。
*IOp(6/33=2)输出拟合静电势时的点(单位为埃)和每个点的精确静电势(a.u.)。
IOp(6/35~39、6/53~55)详细设定aim模块(L609)的任务类型和参数
*IOp(6/41=N)拟合ESP电荷时每个原子用N个同中心的点层为,默认N=4。
*IOp(6/42=N)拟合ESP电荷时每单位面积的点为N个,默认N=1。
17时每个原子大概用2500个点,对于大分子可以稍微降低这个值以减少计算量。
IOp(6/75=x)输出CM2电荷。
Lowdin电荷、Mayer键级也一起输出。
x应设为计算波函数所用的理论方法和基组,可以为以下值:
1=HF/MIDI!
(5D)
2=HF/MIDI!
(6D)
3=HF/6-31G*
4=BPW91/MIDI!
(5D)
5=BPW91/MIDI!
(6D)
6=B3LYP/MIDI!
(5D)
7=BPW91/6-31G*
8=HF/6-31+G*
9=HF/cc-pVDZ
10=BPW91/DZVP(6D)
11=AM1
12=PM3
14=ZINDO/S2
IOp(6/79=1)输出Hirshfeld电荷(第一列是Hirshfeld电荷,后三列分别是原子的x/y/z偶极矩(a.u.)),G09可以直接用pop=hirshfeld。
g03中必须用6d基函数,否则结果是NaN,g09没这个问题。
=3时还利用原子偶极、四极矩计算原子间相互作用能。
*IOp(6/80=1)输出Lowdin电荷、Mayer键级。
*IOp(6/83=111)输出每个原子的不同角动量原子轨道的布居数,以及每个分子轨道中各种角动量原子轨道的成分,分子轨道中d、f原子轨道的贡献和及具体组成也会被输出。
*IOp(6/84=-1)6/83默认只分析占据轨道,此指令让其分析所有轨道。
设为N是分析全部占据轨道和N个最低空轨道。
*IOp(7/32=x)将能量、核坐标、受力、力常数之类的信息输出到scratch/fort.7文件中,可以通过参数设定输出哪些内容,以及什么坐标下、什么格式。
IOp(7/33=1)做freq时,输出更多细节信息,如偶极矩导数、极化率导数、振动极化率来自各振动模式的贡献等。
*IOp(7/64=3)在freq任务中,将振动频率做洛伦兹展宽成为红外光谱x-y数据点,可以导入诸如origin等程序绘制红外光谱图。
如果也做了Raman,也会得到Raman光谱x-y数据点。
IOp(7/90=N)对大体系只分析最低N个振动模式,此功能似乎目前不能用。
IOp(9/25=x)控制每一次迭代、或是第一次和最后一次迭代,或是不输出电子对儿对相关能的贡献。
IOp(9/26=1)归一化后HF波函数(微扰波函数除外),即令总波函数的模Norm(A)=1,可参考手册CID关键词。
默认只是对参考态HF行列式波函数归一化(Intermediatenormalization)。
*IOp(9/28=-1)在CID/CISD迭代的最后一步把波函数的全部行列式的系数都打印出来。
由于用了中间归一化,所以还需要除以NORM(A)才是真正的系数。
-3是不输出系数,设为N是输出系数大于0.0001*N的行列式(默认N=1000)。
IOp(9/30=x)控制计算单粒子密度矩阵。
IOp(9/40=x)对于L906(半直接MP2),=1时MP2使用CASSCF波函数作为参考态,相当于CASSCF任务中同时写上MP2关键词。
对于L914(CIS、TDDFT等任务),输出每个激发态信息时将其中组合系数大于10^-x的组态输出出来,默认是x=1。
IOp(9/44=3)算基态密度以及来自基态的跃迁密度,还计算所有激发态间的跃迁密度。
默认是2,只算算基态密度以及来自基态的跃迁密度。
1是计算每个激发态密度。
这些结果会被填到rwf文件633位置内。
IOp(9/46=N)Davidson迭代中(在CIS、TDDFT等任务中都会用到),最低N个态系数收敛就宣告迭代阶数,而不是等所有要算的激发态的系数都收敛才结束。
IOp(9/47=x)Davidson迭代中,=1时不做任何迭代(只用初猜),=2时只做一次迭代后停止。
IOp(9/76=N)Davidson迭代中最大向量数。
IOp(11/18=N)将原子中心基函数下的2PDM(Two-particle-density-matrix)写入rwf文件N号位置里。
*IOp(11/28=x)x为负数:
计算指定类型的2PDM。
x为正数:
指定1PDM、W、2PDM信息分别储存到的rwf文件的x、x+1、x+2位置,默认是626。
IOp(11/29=x)=1将1PDM从MO转到AO,=10将2PDM从MO转到AO,=100将AO2PDM根据壳层排序。
*IOp(11/33=3)输出2PDM。
一般结合IOp(11/18=N),计算相应类型的2PDM。
*IOp(99/6=100)输出.wfn文件,=1100在.wfn中使用自然轨道,=1200/1300连带着磁轨道导数信息。
*IOp(99/13=x)控制这次调用L9999是否就是整个任务的结束,1=是,2=否,3=回到Link1。
*IOp(99/18=N)默认是0,即输出.wfn不包含虚轨道,-1包含所有虚轨道,N输出N个虚轨道。