猪常见病PCR检测程序.docx
《猪常见病PCR检测程序.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《猪常见病PCR检测程序.docx(17页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
猪常见病PCR检测程序
猪
病
检
测
手
册
猪瘟检测程序3
猪繁殖与呼吸综合症检测程序5
高致病性猪繁殖与呼吸综合症检测程序7
猪流行性乙型脑炎检测程序9
猪伪狂犬病毒()检测程序11
猪细小病毒()检测程序13
猪圆环病毒Ⅱ型
(2)检测程序15
细菌学检测程序17
猪瘟检测程序
一、病毒的提取
1、阳性对照的提取
材料冻干猪瘟兔化弱毒疫苗、检测用病毒提取试剂盒(天跟公司产品)。
方法将1瓶猪瘟兔化弱毒冻干疫苗用1.5蒸馏水或液稀释,用1管分装,每管500µl,-20℃保存。
取出冻存的猪瘟病毒,解冻后离心,取上清用于的提取。
提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
2、疑似病料的提取
样品采集采集病死或扑杀的猪,取血清、扁桃体、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏、肾脏、流产胎儿等组织病变与健康部交界处组织;待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
附:
通常木乃伊胎不能作为检测样品。
对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。
对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。
胎儿的保存方法同上。
组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5(7.2)继续研磨制成1:
3的组织匀浆液,转至1.5灭菌离心管中,8000离心2,取上清液用于的提取;全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
提取待检样品的提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
二、反应
1、材料试剂盒(东洋纺产品)、试剂盒(天跟公司产品)。
引物序列:
F:
5’-3’,19,为61.88。
R:
5’-3’,20,为59.85。
扩增的目的片段为133。
2、体系及反应程序:
名称
弱毒疫苗阳性对照
检测病料
水
6µl
0
特异性下游引物
1µl
1µl
模板
5µl
11µl
12µl
12µl
置于仪上65℃10,立即冰浴5。
然后加入以下试剂:
变性后的溶液
12µl
5×
4µl
2µl
1µl
1µl
20µl
按以下程序反转录:
1、42℃,45
2、99℃,5
将-20℃保存。
3、反应体系及程序
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、56℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.8%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现133条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现133的条带,判定为猪瘟病毒阳性。
猪繁殖与呼吸综合症检测程序
一、病毒的提取
1、阳性对照的提取
材料冻干弱毒疫苗、检测用病毒提取试剂盒(天跟公司产品)。
方法将1瓶弱毒冻干疫苗用2生理盐水或液稀释,用1管分装,每管200µl,-20℃保存。
取出冻存的病毒,解冻后用于的提取。
提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
2、疑似病料的提取
样品采集病死或扑杀猪,取病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
附:
通常木乃伊胎不能作为检测样品。
对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。
对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。
胎儿的保存方法同上。
组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5(7.2)继续研磨制成1:
3的组织匀浆液,转至1.5灭菌离心管中,8000离心2,取上清液用于的提取;全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
提取待检样品的提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
二、反应
1、材料试剂盒(日本东洋纺产品)、试剂盒(天跟公司产品)。
引物序列:
F:
5’-3’,18,为59.58。
R:
5’-3’,20,为57.8。
扩增的目的片段为468。
2、体系及反应程序:
名称
弱毒疫苗阳性对照
检测病料
水
6µl
0
特异性下游引物
1µl
1µl
模板
5µl
11µl
12µl
12µl
置于仪上65℃10,立即冰浴5。
然后加入以下试剂:
变性后的溶液
12µl
5×
4µl
2µl
1µl
1µl
20µl
按以下程序反转录:
1、42℃,45
2、99℃,5
将-20℃保存。
3、反应体系及程序
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、56℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.2%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳50观察结果,在阳性对照出现468条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现468的条带,判定为病毒阳性。
高致病性猪繁殖与呼吸综合症检测程序
一、病毒的提取
1、阳性对照的提取
材料阳性对照病料为该病的活疫苗、检测用病毒提取试剂盒(天跟公司产品)。
方法提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
2、疑似病料的提取
样品采集病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
附:
通常木乃伊胎不能作为检测样品。
对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。
对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。
胎儿的保存方法同上。
组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5继续研磨,匀浆后转至1.5灭菌离心管中,8000离心5,取上清液用于的提取;
全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
提取待检样品的提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
二、反应
1、材料试剂盒(日本东洋纺产品)、试剂盒(天跟公司产品)。
引物序列:
F:
5’3’,18,为55.56。
R:
5’--3’,18,为61.11。
扩增的目的片段为230。
2、体系及反应程序:
名称
弱毒疫苗阳性对照
检测病料
水
6µl
0
特异性下游引物
1µl
1µl
模板
5µl
11µl
12µl
12µl
置于仪上65℃10,立即冰浴5。
然后加入以下试剂:
变性后的溶液
12µl
5×
4µl
2µl
1µl
1µl
20µl
按以下程序反转录:
1、42℃,45
2、99℃,5
将-20℃保存。
1、反应体系及程序
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、52℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现230条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现230的条带,判定为高致病性病毒阳性。
猪流行性乙型脑炎检测程序
一、病毒的提取
1、阳性对照的提取
材料阳性对照病料为该病的弱毒疫苗、检测用病毒提取试剂盒(天跟公司产品)。
方法提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
2、疑似病料的提取
样品采集采集病死或扑杀的猪,取血液、腹股沟淋巴结、脑脊髓液、死产胎儿的脑组织、分泌物、脾、肿胀的睾丸等组织病变与健康部交界处组织;待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
附:
通常木乃伊胎不能作为检测样品。
对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。
对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。
胎儿的保存方法同上。
组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5生理盐水继续研磨,匀浆后-20℃反复冻融3次,转至1.5灭菌离心管中,8000离心2,取上清液用于的提取;全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
提取待检样品的提取按试剂盒说明进行,最后用50µl水溶解,得到溶液。
三、反应
1、材料试剂盒(东洋纺产品)、试剂盒(天跟公司产品)。
引物序列:
F:
5’3’,18,为59.58。
R:
5’-3’,20,为57.8。
扩增的目的片段为238。
1、体系及反应程序:
名称
弱毒疫苗阳性对照
检测病料
水
6µl
0
特异性下游引物
1µl
1µl
模板
5µl
11µl
12µl
12µl
置于仪上65℃10,立即冰浴5。
然后加入以下试剂:
变性后的溶液
12µl
5×
4µl
2µl
1µl
1µl
20µl
按以下程序反转录:
1、42℃,45
2、99℃,5
将-20℃保存。
2、反应体系及程序
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、53℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现238条带、阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现238的条带,判定为猪流行性乙型脑炎病毒阳性。
猪伪狂犬病毒()检测程序
一、基因组提取及扩增
1、材料与试剂提取试剂盒,试剂盒购自天跟公司。
引物F:
5’3’18,为59.58。
R:
5’--3’19,为59.72。
扩增的目的片段为324。
2、的提取
2.1样品采集病死或扑杀猪,取血液、扁桃体、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿、神经系统如大脑等组织;待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
附:
通常木乃伊胎不能作为检测样品。
对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。
对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。
胎儿的保存方法同上。
2.2组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5继续研磨,匀浆后转至1.5灭菌离心管中,8000离心5,取上清液用于的提取;
全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
2.3的提取按试剂盒说明进行。
二、扩增
反应体系及程序:
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、56℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.2%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现324条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现324的条带,判定为阳性。
猪细小病毒()检测程序
一、基因组提取
1、材料与试剂提取试剂盒,试剂盒购自天跟公司。
引物:
F:
5’3’22,为58.21。
R:
5’-3’21,为58.01。
扩增的目的片段为471。
2、的提取
2.1样品采集70日龄以内流产或产死胎儿的新鲜脏器(脑、肾、肝、肺、睾丸、胎盘及肠系膜淋巴结)等,其中以肠系膜淋巴结和肝脏的分离率最高,母猪的胎盘和阴道分泌物。
2.2组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5继续研磨,匀浆后转至1.5灭菌离心管中,8000离心5,取上清液用于的提取;
全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
2.3的提取按试剂盒说明进行。
二、扩增
反应体系及程序:
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、56℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.2%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现471条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现471的条带,判定为阳性。
猪圆环病毒Ⅱ型
(2)检测程序
二、基因组提取及扩增
1、材料与试剂50的溶液、1M(8.0)、扩增试剂盒(东洋纺产品)。
引物:
F:
5’3’20,为57.3。
R:
5’-3’20,为55.75。
扩增的目的片段为250。
2、的提取
2.1样品采集取血液、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏等组织病变与健康部交界处组织(圆环病毒检测必须包括淋巴结样品);待检活猪,用注射器取血5,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。
2.2样品处理
组织样品处理:
称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5继续研磨,匀浆后转至1.5灭菌离心管中,8000离心5,取上清液用于的提取;
全血样品处理:
待血凝后取血清用于的提取。
二、扩增
反应体系及程序:
2O
7.5µl
3µl
上游引物
1µl
下游引物
1µl
2×
12.5µl
25µl
反应程序:
1、94℃,3
2、95℃,30
3、53℃,30×35
4、72℃,1
5、72℃,10
三、电泳
用电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶,100加入5µl染色液。
8070电泳40观察结果,在阳性对照出现250条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现200多的条带,判定为2阳性。
细菌学检测程序
是一种多形态、非溶血性、不运动、依赖性的革兰氏阴性细小杆菌。
大小为1.5*(0.3~0.4),多单个、也有短排排列,新分离的菌株多呈球杆状或双球状,有时可成短链,并可形成荚膜,在陈旧培养物上呈多形态。
无鞭毛、芽胞,美蓝染色呈两极。
需氧或兼性厌氧,最适生长温度35℃~37℃,7.6~7.8。
初次分离培养时供给5102可促进生长,本菌培养需V因子或也可满足要求。
实验室使用血琼脂培养基中含有X因子及V因子,但血液中的V因子通常处于被抑制状态,通常不能在含有完整红细胞的血琼脂上生长,血液加热后,细胞膜上的抑制物被破坏,V因子释放,实验室分离通常使用巧克力琼脂培养基。
在巧克力琼脂平板上经37℃24~48小时培养,生长的菌落呈圆形、隆起、表面光滑、边缘整齐、灰白色半透明的菌落,在马血琼脂平板上(加了)生长良好,划线接种在有葡萄球菌的血平板上24小时后呈现卫星生长,在划线周围菌落生长良好(现象),远离葡萄球菌的菌落较小。
由于金黄色葡萄球菌等产色素的细菌及酵母菌,在生长过程中可合成V因子,并在培养中扩散,所以出现此现象[1]。
本菌对外界的抵抗力不强。
干燥环境中易死亡,60℃5~20被杀死;4℃中一般只能存活7~10天;常用消毒剂都易杀死;对结晶紫、杆菌肽、红霉素、林可霉素、卡那霉素、磺胺等药物敏感,已发现耐药菌株。
1.2流行病学
是猪上呼吸道的常在菌,能从健康动物的鼻腔、鼻分泌物、气管和扁桃体中分离到。
只感染猪,主要危害2周龄至4月龄的猪只,特别是断奶前后和保育期仔猪多发。
通常见于5~8周龄的猪,发病率一般在l0%~15%,死亡率可达50%。
人工感染猪后引起多浆膜炎以及多关节炎等。
主要存在于猪的上呼吸道(鼻腔、扁桃体和气管前段等)内,通过猪群间的接触和空气飞沫以及污染物而传播。
带菌猪和感染猪为本病的传染源[2]。
2007年等[3]在欧洲从野猪身上分离出,这是首次报道's病发生在野猪,究竟是野猪感染后传染到家猪,还是家猪感染后传染到野猪身上,还有待研究。
等[4](1997)研究表明,从鼻腔中部分离的副猪嗜血杆菌与急性化脓性鼻炎、鼻腔和气管粘膜的急性细胞肿胀以及纤毛丢失有关。
常和猪流行性感冒、圆环病毒、蓝耳病、链球菌、伪狂犬病、弓形体、附红细胞体等混合感染,但具体还不清楚是继发感染还是触发因子,目前正处于研究阶段。
培养基配制:
1.培养基:
胰蛋白胨17g;酵母提取物6g;葡萄糖2.5g;、氯化钠5g;磷酸氢二钾2.5g;大豆胨3g,双蒸水1000,调7.2-7.6。
121℃,15灭菌。
待培养基冷却至50℃,加入2.5过滤除菌后的(0.01g)与5%牛血清。
2.培养基:
胰蛋白胨17g;酵母提取物6g;葡萄糖2.5g;、氯化钠5g;磷酸氢二钾2.5g;大豆胨3g;琼脂15g,双蒸水1000,调7.2-7.6。
121℃,15灭菌。
待培养基冷却至50℃,加入2.5过滤除菌后的(0.01g)与5%牛血清。