生物化学与分子生物学名词解释官方版.docx
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生物化学与分子生物学名词解释官方版
生物化学与分子生物学名词解释官方版
第一章
1.模体(motif):
蛋白质分子中具有特定空间构象和特定功能的结构成分。
2.锌指结构(zincfinger):
由蛋白质结构域围绕一个锌离子折叠形成的、保守的DNA结合蛋白模体。
3.纤连蛋白(fibronectin):
一类细胞外粘连蛋白,可与其他细胞外基质组分、血纤维蛋白、整合蛋白家族的细胞表面受体结合,其功能是连接细胞与细胞外基质,参与损伤愈合。
4.结构域(domain):
分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密且稳定的区域,并各执行其功能,称为结构域。
5.亚基(subunit):
组成具有四级结构的蛋白质的次级结构,每一条多肽链都有其完整的三级结构,称为亚基。
6.分子病(moleculardisease):
由于基因上DNA分子的缺陷,致使细胞内RNA及蛋白质合成出现异常,人体结构与功能随之发生变异的疾病。
7.蛋白质等电点(proteinisoelectricpoint/pI):
蛋白质静电荷为零时的溶液pH。
8.蛋白质变性(proteindenaturation):
多肽/蛋白质的特定空间构象的部分或完全,非折叠过程或形式。
9.电泳(electrophoresis):
在电场作用下,带电溶液向正极或负极的移动。
经常用于蛋白质、核酸或其他带电颗粒混合物的分离。
10.层析(chromatography):
利用物质分子在流动相与固定相之间分配比例不同,将不同物质分子的混合物分离的一种技术。
例如薄层层析、柱层析等。
第二章
1.碱基堆积力(basestackinginteraction):
DNA分子的两条多聚核苷酸链在旋进过程中,相邻的两个碱基对平面会彼此重叠,由此产生的疏水作用力。
2.DNA变性(DNAdenaturation):
在某些理化因素(温度、pH、离子强度等)作用下,DNA双链的互补碱基之间的氢键断裂,使双螺旋结构松散,形成单链的构象,不涉及一级结构的改变。
3.增色效应(hyperchromiceffect):
变性后DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应。
第三章
1.单体酶(monomericenzyme):
由一条多肽链构成的仅具有三级结构的酶。
2.酶的活性中心(activecenter)或活性部位(activesite):
是酶分子中能与底物特异性结合并催化底物转变为产物的具有特定三维结构的区域。
3.同工酶(isoenzyme/isozyme):
是指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。
4.酶的竞争性抑制作用(competitiveinhibition):
抑制剂与酶的底物结构相似,可与底物竞争结合酶的活性中心,从而阻碍酶与底物形成中间产物的作用。
5.别构调节(allostericregulation):
小分子化合物与酶蛋白活性中心以外的部位结合,引起酶蛋白分子构象变化,从而改变酶的活性的调节。
6.酶的共价修饰(covalentmodification):
酶蛋白肽链上的一些基团可以在其他酶的催化下,与某些化学基团共价结合或脱离,从而影响酶的活性,又称为酶的化学修饰。
7.酶原(zymogen):
有些酶在细胞内合成或初分泌时,在其发挥催化功能前只以其无活性前体形式存在,这个无活性前体称为酶原。
8.限速步骤(rate-limitingstep):
指需要最大激活能或具有最高自由能转换状态的酶促反应步骤,是一系列酶催化的代谢途径中反应速度最慢的反应。
第四章
1.细胞外基质(extracellularmatrix):
由细胞分泌的,包括各种多糖、纤维蛋白和黏着蛋白等的位于细胞间的组成成分。
其为组织提供结构支持,并影响细胞的发育和细胞的生物化学功能。
2.糖生物学(glycobiology):
研究糖类及衍生物的结构、代谢以及生物学功能,探索糖链的生物信息机制与生命现象关系的专门领域。
第五章
1.微量元素(microelement):
指人体每日需要量小于100mg的化学元素,包括硒、碘【吸
(一)点】、铁、锰、锌、钼、铜【高中口诀去掉硼】、氟、钴、铬【腹股沟】等,主要功能是作为酶的辅助因子。
2.维生素(vitamin):
是一类人体内不能合成或合成量甚少,必须由食物供给的小分子有机化合物,按其溶解性质可分为脂溶性维生素和水溶性维生素。
主要功能是调节人体物质代谢和维持正常生理功能。
第六章
1.糖的无氧氧化(anaerobicoxidation):
缺氧时,G先经糖酵解生成丙酮酸,然后在胞质还原成乳酸,这一过程净生成2ATP,是糖的辅助产能途径。
2.糖酵解(glycolysis):
指G在胞质生成丙酮酸的过程,净生成2ATP和2NADH,是糖有氧氧化和无氧氧化的共同起始阶段。
3.底物水平磷酸化(substrate-levelphosphorylation):
指ADP或其他核苷二磷酸的磷酸化作用与底物脱氢作用直接相偶联的反应过程,是生物体内产能的方式之一。
4.糖的有氧氧化(aerobicoxidation):
有氧时,G依次经糖酵解生成丙酮酸,丙酮酸进入线粒体氧化脱羧生成乙酰CoA,乙酰CoA进行TAC彻底氧化成H2O和CO2,同时偶联电子传递并释放能量,此过程净生成30或32ATP,是糖的主要产能途径。
5.柠檬酸循环(citricacidcycle):
在线体内乙酰CoA进行八步酶促反应并构成循环反应系统。
共经历4次脱氢、2次脱羧,生成4分子还原当量(包括3分子NADH+1分子FADH2)、一分子GTP和2分子CO2,循环的各中间产物没有量的变化。
它是糖、脂肪、氨基酸(三大物质)的共同供能途径和物质转变枢纽。
6.巴斯德效应(Pasteureffect):
指糖有氧氧化抑制无氧氧化的现象。
7.Warburg效应(Warburgeffect):
指有氧时,肿瘤细胞不彻底氧化G而是无氧氧化生成乳酸的现象。
8.磷酸戊糖途径(pentosephosphatepathway):
指从糖酵解的中间产物G-6-P开始形成旁路,通过氧化、基团转移两个阶段生成F-6-P和3-磷酸甘油醛,从而返回糖酵解的代谢途径。
主要生理意义是提供NADPH和磷酸核糖(供给核苷酸合成)。
9.糖原(glycogen):
指G的多聚体,是体内糖的储存形式。
动物体内有肝糖原和肌糖原两种类型。
肝糖原能够补充血糖,而肌糖原主要为肌收缩提供能量。
10.糖异生(gluconeogenesis):
指在饥饿状态下,非糖化合物(乳酸、甘油、生糖氨基酸等)在肝和肾转变为G或糖原的过程。
11.乳酸循环(Coricycle):
肌细胞通过糖无氧氧化生成乳酸,乳酸通过血液运送到肝,异生为葡萄糖,葡萄糖入血后再被肌摄取,由此构成循环。
此过程能回收乳酸中的能量,又可避免因乳酸堆积而引起乳酸酸中毒。
第七章
1.必需脂肪酸(essentialfattyacid):
机体必需但自身又不能合成或合成量不足,必须靠食物提供的多不饱和脂肪酸。
2.脂肪动员(fatmobilization):
储存在脂肪细胞中的脂肪在脂肪酶的作用下,逐步水解,释放出游离脂肪酸和甘油供其他组织细胞氧化利用的过程。
3.激素敏感性脂肪酶(hormonesensitivelipase/HSL):
即脂肪细胞中的甘油三酯脂肪酶,在脂肪动员过程中催化甘油三酯水解成甘油二酯及脂肪酸,它受多种激素调节,是脂肪动员的关键酶。
4.酮体(ketonebodies):
脂肪酸在肝经氧化分解后转化形成的中间产物,包括乙酰乙酸、β-羟丁酸和丙酮。
酮体经血液运输至肝外组织氧化利用,是肝向肝外输出能量的一种方式。
5.磷脂酶A2(phospholipaseA2,PLA2):
参与磷脂降解的一种磷脂酶,能水解甘油磷脂2位酯键,生成1分子游离脂肪酸和1分子溶血磷脂。
6.血脂(plasmalipids):
血液中脂类物质的总称,包括甘油三脂+游离脂肪酸、胆固醇+胆固醇酯、磷脂等。
7.脂蛋白(lipoprotein):
是脂质与载脂蛋白结合形成的复合体,是血浆脂质的运输和代谢形式。
一般呈球形,表面为载脂蛋白、磷脂、胆固醇的亲水基团,内核为甘油三脂、胆固醇酯等疏水脂质。
8.乳糜微粒(chylomicron/CM):
由小肠黏膜细胞利用从消化道摄取的食物脂肪酸再合成甘油三脂后组装形成的一种脂蛋白,经淋巴系统吸收入血,功能是运输外源性甘油三脂和胆固醇。
9.载脂蛋白(apolipoprotein):
脂蛋白中的蛋白质部分,分为A、B、C、D、E等几大类,在血浆中起运载脂质的作用,还能识别脂蛋白受体、调节血浆脂蛋白代谢酶的活性。
10.脂蛋白脂(肪)酶(lipoproteinlipase/LPL):
分布于骨骼肌、心肌以及脂肪组织等组织的毛细血管内皮细胞表面的一种脂(肪)酶,能水解CM和VLDL中的甘油三酯,释放出甘油和游离脂肪酸供组织细胞摄取利用。
11.低密度脂蛋白受体(LDLreceptor):
广泛分布于机体各组织细胞表面,能特异地识别和结合LDL,主要生理功能是摄取降解LDL并参与维持细胞内胆固醇平衡。
12.胆固醇逆向转运(reversecholesteroltransport/RCT):
新生HDL从肝外组织细胞获取胆固醇,使其酯化形成成熟的HDL,经血液运输至肝转化成胆汁酸排出体外,此过程称为胆固醇逆向转运。
13.卵磷脂:
胆固醇脂酰转移酶(lecithin:
cholesterolacyltransferase/LCAT):
催化HDL中卵磷脂2位上的脂酰基转移至游离胆固醇的3位羟基上,使位于HDL表面的胆固醇酯化,促成HDL成熟及胆固醇逆向转运。
第八章
1.P/O比值(P/Oratio):
电子经过呼吸链的传递作用最终与氧结合生成水,在此过程中所释放的能量用于ADP磷酸化生成ATP(氧化磷酸化过程)。
经此过程消耗一个原子的氧所要消耗的无机磷酸的分子数(相当于生成ATP的分子数)称为磷氧比值(P/O值)。
2.解偶联剂(uncoupler):
某些物质可破坏氧化呼吸电子传递过程形成的跨线粒体内膜电化学梯度,抑制ATP的生成,更多能量以热能散失。
3.细胞色素(cytochrome):
是一类以血红素为辅基的蛋白质,可在生物氧化呼吸链、光合作用以及其他氧化还原反应中作为单电子传递体。
4.氧化呼吸链(oxidativerespiratorychain):
又称电子传递链,指线粒体内膜中按一定顺序排列的一系列具有电子传递功能的酶复合体,可通过连续的氧化还原反应将电子最终传递给氧生成水。
5.氧化磷酸化(oxidativephosphorylation):
即由代谢物脱下的氢,经线粒体氧化呼吸链电子传递释放能量,偶联驱动ADP磷酸化生成ATP的过程。
第九章
1.γ-谷氨酰基循环(γ-glutamylcycle):
首先由谷胱甘肽的γ谷氨酰基与膜外的氨基酸结合,将其转运至胞内释放,然后再重新合成谷胱甘肽,此循环又称Meister循环,是小肠吸收氨基酸的一条重要途径。
2.氨基酸代谢库(aminoacidmetabolicpool):
食物蛋白质经消化而被吸收的氨基酸、体内组织降解产生的氨基酸、体内合成的非必需氨基酸,共同分布于体内参与代谢。
3.蛋白质的腐败作用(putrefaction):
未被消化的蛋白质及未被吸收的氨基酸,在大肠下部会受大肠杆菌的分解。
4.蛋白质的互补作用(complementaryaction):
营养价值较低的蛋白质混合食用,彼此间必需氨基酸可以得到互相补充,从而提高蛋白质的营养价值。
5.氮平衡(nitrogenbalance):
机体吸收氮与排泄氮之间的关系。
6.泛素(ubiquitin):
一种高度保守的小分子蛋白质。
在细胞内蛋白质的蛋白酶体降解途径中,在特异泛素化酶催化下,几个泛素分子串联地共价结合至靶蛋白的赖氨酸残基。
7.一碳单位(onecarbonunit):
指某些氨基酸在体内进行分解代谢过程中产生的含一个碳原子的基团,包括甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基及亚氨甲基等。
8.营养必需氨基酸(nutritionallyeseentialaminoacid):
体内不能自身合成,必须由食物提供的氨基酸,包括:
亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、缬氨酸、苏氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和赖氨酸(口诀:
携一两本单色书来)。
9.转氨基作用(transamination):
在转氨酶作用下,可逆地把α-氨基酸的氨基转移给α-酮酸,结果使氨基酸脱去氨基生成相应的α-酮酸,而原来的α-酮酸则转变为另一种氨基酸。
第十章
1.核苷酸的从头合成(denovosynthesis):
利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位等简单物质为原料,经过一系列酶促反应合成嘌呤或嘧啶核苷酸的过程称之为从头合成。
第十一章
1.非蛋白氮(nonproteinnitrogen/NPN):
非蛋白质类含氮化合物中的氮总称,这些化合物主要有氨+尿素、肌酸+肌酸酐、尿酸、胆红素等。
2.初级胆汁酸(primarybileacid):
在肝细胞以胆固醇为原料合成的胆汁酸及其与甘氨酸或牛磺酸的结合产物,包括胆酸、鹅脱氧胆酸、甘氨~/~、牛磺~/~。
3.次级胆汁酸(secondarybileacid):
初级胆汁酸经肠菌作用产生的胆汁酸及其结合产物,包括脱氧胆酸、石胆酸、甘氨脱氧胆酸、牛磺脱氧胆酸、熊脱氧胆酸等。
4.胆汁酸的肠肝循环(enterohepaticcirculationofbileacid):
在肝细胞中合成的初级胆汁酸,随胆汁进入肠道并转化为次级胆汁酸。
肠道中约95%的胆汁酸可经门静脉被吸收入肝,并与肝新合成的胆汁酸一起再次被排入肠道,构成胆汁酸的肠肝循环。
5.结合胆红素(conjugatedbilirubin):
胆红素在肝细胞内与葡萄糖醛结合生成的胆红素称为结合胆红素,为水溶性,可从尿中排出。
6.未结合胆红素(unconjugatedbilirubin):
在血浆中主要与清蛋白结合而运输的胆红素称为未结合胆红素,为脂溶性,不能经尿排出,易透过细胞膜产生毒性作用。
7.生物转化(biotransformation):
机体对内、外源性的非营养物质进行的氧化、还原、水解(第一相)以及各种结合反应(第二相),增加其水溶性,利于从尿或胆汁排出体外。
8.细胞色素P450单加氧酶(cytochromeP450monooxygenase):
又称羟化酶、混合功能氧化酶,是存在于肝微粒体的氧化还原酶类,由细胞色素P450和NADPH-P450还原酶组成。
(回去复习)
第十三章
1.沉默子(silencer):
是可抑制基因转录的特定核苷酸序列,当其结合一些反式作用因子时对基因的转录起阻遏作用,使基因沉默。
2.增强子(enhancer):
可以增强真核基因启动子工作效率的顺式作用元件,是真核基因中最重要的调控序列,决定着每一个基因在细胞内的表达水平。
3.超家族基因(superfamilygene):
DNA序列相似,但功能不一定相关的若干个单拷贝基因或若干组基因家族可以被归为超家族基因。
4.断裂基因(splitgene/interruptedgene):
由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质。
5.多基因家族(multigenefamily):
是指由某一祖先基因经过重复和变异所产生的一组在结构和功能上相关的基因。
6.顺式作用元件(cis-actingelement):
DNA分子中的一些调控序列,调控控同一基因的转录活动,包括启动子、上游调控序列、增强子、加尾信号和一些细胞信号反应元件等。
第十四章
1.DNA聚合酶(DNApolymerase):
指以双链DNA中的一条链为模板,dNTP为原料,按5’→3’方向催化DNA链不断聚合延伸的酶。
2.Klenow片段(Klenowfragment):
是原核生物DNApolⅠ经特异的蛋白酶水解后产生的大片段,具有3’→5’核酸外切酶活性和5’→3’聚合酶活性,实验室合成DNA及分子生物学研究上,常用Klenow片段代替DNA聚合酶。
3.半保留复制(semiconservativereplication):
DNA复制中,亲代DNA双螺旋解开成为两条单链各自作为模板,按照碱基互补配对规律合成一条与模板互补的新链,形成两个子代DNA分子。
每一个子代DNA分子中都保留有一条来自亲代的链。
这种复制方式称为半保留复制。
4.冈崎片段(Okazakifragment):
DNA复制过程中,在后随链上不连续合成的片段,称之为冈崎片段。
5.引发体(primosome):
是复制起始形成的,在原核生物DnaB(解旋酶)、DnaC、DnaG(引物酶)等蛋白质结合到DNA起始复制区域形成的复合结构。
6.端粒及端粒酶(telomereandtelomerase):
【端粒】覆盖在染色体两个末端,由短的GC丰富区特殊DNA重复序列及蛋白质组成的特殊结构称为端粒,对保护染色体及维持染色体线性长度有重要意义。
【端粒酶】端粒酶是由特殊RNA及蛋白质组成的复合体,能以自身的RNA为模板,催化端粒的延伸。
第十五章
1.DNA损伤(DNAdamage):
由辐射或药物等引起的DNA结构的改变,包括DNA结构的扭曲和点突变。
前者干扰复制、转录,后者则扰乱正常的碱基配对,从而改变子代细胞的DNA序列。
2.错配修复(mismatchrepair):
是切除修复的一种特殊形式,是维持细胞中DNA结构完整稳定的重要方式,主要负责纠正:
①复制和重组中出现的碱基配对错误;②因碱基损伤所致的碱基配对错误;③碱基插入与缺失。
3.切除修复(excisionrepair):
细胞内最重要的修复机制,主要由DNApolⅠ及DNA连接酶执行。
第十六章
1.RNA剪接(RNAsplicing):
初级RNA转录物切除内含子,连接外显子的过程。
属转录后加工形式之一。
2.不对称转录(asymmetrictranscription):
基因组中,按细胞不同的发育时序、生存条件和生理需要,只有少部分的基因发生转录。
在双链DNA分子上,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录。
3.单顺反子(monocistron):
真核基因的一个编码基因转录只生成一个mRNA分子,经翻译生成一条多肽链。
4.多聚核糖体(polyribosome/polysome):
由多个核糖体结合在一条mRNA链上同时进行肽链合成所形成的聚合物。
多聚核糖体的形成使一条mRNA链上同时有多个核糖体进行肽链合成,提高了肽链合成的效率。
5.多顺反子(polycistron):
原核生物几个功能相关的基因转录合成时受同一个控制区调控,被一起转录产生一条mRNA长链,为几种不同的蛋白质编码。
这样的mRNA分子携带了几个多肽链的编码信息,被称为多顺反子mRNA。
6.共有序列(consensussequence):
各种原核基因启动序列特定区域内,通常在转录起始点上游-10及-35区域存在一些共同的核苷酸序列。
7.核内小RNA(smallnuclearRNA/snRNA):
细胞核内的小RNA,在mRNA、tRNA、rRNA(三大RNA)的剪接反应中去除内含子过程发挥作用。
8.剪接体(spliceosome):
在真核RNA前体的剪接反应中,由核内小RNA(snRNA如U1、U2、U4、U5和U6等)和蛋白质组成的复合体。
9.内含子(intron):
位于外显子之间、可以被转录在初级RNA转录物中,但经过剪接反应被去除,最终不存在于成熟DNA的过程。
10.外显子(exon):
基因组DNA中表达在成熟mRNA分子的核苷酸序列,最终被翻译成蛋白质。
11.启动子(promoter):
是DNA分子上能与RNApol结合并形成转录起始复合体的区域。
12.微RNA(microRNA/miRNA):
是一类没有可读框,长度约22个核苷酸的小分子RNA,可以通过与靶mRNA分子的3’端非编码区域特异结合,抑制该mRNA分子的翻译,对基因表达发挥调节作用。
13.转录(transcription):
遗传信息从DNA传递到RNA的(RNA聚合)酶促反应过程;以DNA序列为遗传信息模板,催化合成序列互补RNA的过程。
14.转录后加工(post-transcriptionalprocessing):
初级RNA转录产物的酶促反应过程,使RNA前体转变为有功能的成熟RNA的过程。
15.转录泡(transcriptionbubble):
具有RNA聚合酶活性的转录复合体发挥功能作用的过程中,结合并解开DNA双链,合成RNA链而形成的开放性体系,其外观类似于泡状。
16.转录因子(transcriptionfactor):
直接结合或间接作用于基因启动子、形成的具有RNA聚合酶活性的动态转录复合体的蛋白质分子。
第十七章
1.DNA重组(DNArecombination):
不同DNA分子断裂和连接而产生的DNA片段的交换并重新组合形成新DNA分子的过程。
2.D环复制(D-loopreplication):
是线粒体DNA的复制形式。
mtDNA为闭合环状双链结构,D环复制的特点是复制起始点不在双链DNA同一位点,内、外环复制有时序差别。
因复制中呈字母D形状而得名。
3.S-D序列(Shine-Dalgarnosequence):
mRNA翻译起始点AUG上游约8~13个核苷酸处,存在一段4~9个核苷酸的共有序列(-AGGAGG-),可被16SrRNA通过碱基互补而精准识别,也称为核糖体结合位点(RBS)是RNA小亚基与mRNA结合并形成前起始复合物的一段序列。
4.氨基酸-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase):
催化氨基酸活化的二步偶联反应,先将氨基酸连接到腺苷酸(AA➡AA-A)而生成氨基酰腺苷酸,再连接到tRNA(AA-A➡AA-tRNA)而生成氨基酰-tRNA。
该酶能识别特定氨基酸及其转运tRNA,通过其校正活性保证氨基酸与tRNA的正确结合。
5.蛋白质的靶向输送(proteintargeting):
具有信号序列的蛋白质新生肽链被定向运输送到其执行功能的靶部位的过程。
6.翻译后加工(post-translationalprocessing):
指新生肽链转变成为有特定空间构象和生物学功能的蛋白质的过程。
包括肽链的折叠和二硫键的形成、肽链的剪切、肽链中某些氨基酸残基侧链的修饰、肽链聚合及连接辅基等。
7.分子伴侣(molecularchaperon):
参与肽链的折叠、蛋白质穿膜进入细胞器、应激后蛋白质复性或降解、蛋白质与蛋白质的互相作用调控及信号转导等过程的一类保守的多肽结合性蛋白质。
8.核糖体循环(ribosomalcycle):
指从翻译起始复合物的形成至核糖体解聚的翻译全过程。
肽链合成开始时,核糖体的大小亚基解聚,小亚基与mRNA、起始氨基酰-tRNA结合后,大亚基与之结合而形成翻译起始复合物——再按照mRNA的密码子顺序经进位、成肽和转位合成肽链——之后核糖体大小亚基解聚,进入下一个循环。
9.开放阅读框架(openreadingframe/ORF):
从mRNA的5’-端起始密码子AUG开始至3’-端终止密码子前的一段能编码并翻译出氨基酸序列的核苷酸序列(不含终止密码子)。
开放阅读框架通常代表某个基因的编码序列。
10.框移突变(frameshiftmutation):
DNA上碱基的插入和缺失造成三联体密码子的阅读方式改变,进而造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变,其后果是翻译出的蛋白质可能完全不同。
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