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如何利用化学名分子式结构式来检索化学文献.docx

1、如何利用化学名分子式结构式来检索化学文献如何利用化学命名/分子式/结构式来检索化学文献(Searching Chemical Literature: by Chemical Name/MolecularFormula/Chemical Structure)AbstractsSTN International is the online scientific and technical information network dedicated to meeting the information needs of scientists and information professionals

2、 throughout the world. The REGISTRY file of the STN database is a chemical dictionary and structure database that contains unique substance records identified by CAS Records contain CAS Registry Numbers, chemical name, molecular formulas and structure diagrams, all of which are searchable STN Expres

3、s is an advanced front-end software package that works with your personal computer to provide streamlined searching of databases on STN. It will guide you through efficient online searches and enable you need more quickly and easily than ever before.一、前言享有世界化学文献之钥美名的化学摘要,它是111美国化学摘要服务社 (Chemical Abs

4、tracts Service, CAS)所出版的,其在化学化工文献上的贡献地位是不 容忽视的。同时CAS也因应潮流所需,另外研发了一套STN线上检索系统,这 套检索系统包括了 200多种型型色色的数据库,在众多的数据库中,其最大的卖 点在于它有一个独门的数据库REGISTRY FILE,这个数据库的特色就在于它是 一个强大的化学字典数据库,它可以利用化学命名、化学分子式和化学结构式 来检索化学领域相关的资料,若再配合STN线上其它的数据库,则不论寻找参 考文献、专利、化学物质物化性、化学物质注册或商情资料都能无往不利。以REGISTRY FILE檢索各類型資料檢索點彳诉金名/分于试/堵出氏二、

5、关于 REGISTRY FILE由CAS所研发出的STN线上检索系统中,REGISTRY FILE为其最独特的数 据库,而其特色在于它具有化学字典功能的特性,为一含以化学物质来辨识进 而收集资料的数据库。REGISTRY HLE收录了 1,600万的化学物质,其中包含了 2,000万以上的化学品名称,同时它可以以化学名称、化学分子式或结构式来检 索资料,它更提供了一强有力的化学物质登录号(CAS Registiy number, CAS RNs), 以做为查询复杂化学物质的独特且具权威的入门。先来介绍什么是CAS RNs, 它对化学物质而言,好象是化学物质的身份证字号一样,为唯一且特定的一种

6、编号,每一种化合物都可能有很多种不同的命名,以一般IUPAC命名的 4,4,-sulfonyldianiline为例、它的商品名为Avlosulfon而它的实验名为NSC6091、 进而CA索引命名为Benzenamine,4,4,-sulfonyl bis-、至于其它的命名乂如: kT-sulfonylbis( 4-aminobenzene 等,在如此繁多的命名中,若以单一的命名来 查询资料,势必会造成资料收集不全的困扰,但以这个例子来看,其化学物质 登录号为80-08-01,以这唯一的信息来检索资料,可节省许多精力与时间,同 时资料也会收集较齐全。而CAS RNs不仅只出现在山CAS出版的

7、书籍或数据库 中,至于其它的出版品或数据库,也都采用CAS RNs来标明化学物质,如Merck Indexs Aldrich Catalogs Chem Sources、Dictionary of Organic/lnorganic Compounds 和期刊Angewandle Chemie等。同时U前进出口海关化学物品时,也会要求要具 备化学物质登录号的资料,由此可明显看出其重要性了。让我们先来了解什么叫做CAS RNs-化学物质登录号,它是以最多九个数 字并分三群来作编排,外面以【】表示,其数字的型式为【aaaabb-bb-bl,数字b 的部份是固定存在的,也就是说最前面部份最少必须有二

8、码、最多可高达六码。 这里的数字大小可以看出一个化学物质被收录的新旧,原则上,RNs的数字愈大, 表示这化学物质为新的化合物。这里也有一个方法可以用来检查CAS RNs的正确性:1N1+ +4N4+3N? +2N2 +1 Ni R _ Inteeer +10 10其中:N:CAS RNs除了检查号码之外,其它数字山右至左输入。下面为REGISTRY FILE所提供资料之格式:=S 8HL1180-38-0(80 08 0/RN)-D L1 IDE 1以化學物質登錄號來檢索L1 ANSWER 1 RN 80-08-0OF 1 REG1SIRVREGISTRYCOPVR ICHI 1998 ACS

9、CH Benzenamine, .U-sulFonylbis- (9CI) (CA IHOES NfiME), OTHER CA INDEX NAMES:CH Aniline, a,!*1-sulfonyldi- (7CI, 8CT)OTHER NCHES:CH 1,1-Sulfonylbis4-aminohenzeneCN 1358FCN li,U-DapsoneCN 4.M-Dianlnodiphenyl sulFoneCN -Dianinodipheni/l sulphoneCN 4.4-SulFonylbi5anillneCN liy-SulforiylbisbenzainineCN

10、-SulFonpldianilineCN iiSulphonldianilineCN 4-Aninophenyl sulfoneCN Araldite HT 976CN AulosulfonCN AulosulphoneCH Bis(4-aminopheni;l) sulfoneCN Bis(p-aminoprwnyi) sulfoneCH CropsulFonpCN cropsulphoneCH DADPScn DapsonCN DapsoneCH DOSCN DDS (pharnaceutical)CN Di(4-aniinophenpl)sulFoneCN DlCp-arainophen

11、l) sulFoneCN DiaphenplsulfonCN DlaphenlsulFoneCH DiphenasonpCN DiphoneCH DisuloneCN DSSCN Dumitonecn EporalCN F 1358CN Hardener HI 976CN HT 966hCN HT 976CN lletabolite CCN NouophoneCN NSC 6091CN ptp*-Dianinodiphenyl sulfoneCN p,p*-SulfonyldianillneCH p-Aninophenpl sulfoneCN seikacure sCN SulFonaCN C

12、H CN CHFS HFClLCSulFona-llae列出所有的化學命名Sulphadione sumicure s Udolac3D CONCORDC12 H12 N2 02 SCOMSTN Files: AGRICOLA. AIDSLINE, ANABSTR, BEILSTEIN, BIOBUSINESS. BIOSISV CAf GABA, CANCERLH, CAOLD, CAPLUS, CASREACT, CHENCATSt CHEtHNFORMRX, CHEMLIST, CBNB, CIN, CSCHEM, CSNB, DDFU, DRUGU, EMBASE, GMELIH*,

13、HODOCm, HSDBx, IFICDB, IFIPAT, IFIUDB, IPA, MEDLINE, MRCK*f IISDS-OHS, NIOSHTIC, PIRA, PHI, PROMT, RTECS*, SPEC INFO, TOXLIHT, TOXLFT, IJSAH, USPATFULL, UETU(File contains nunericallp searchable property data)Other Sources: DSL, EINECS, TSCA*, WHO(*Enter CHEMLISI File for up-to-date regulatory inFor

14、nation)列出結構式NH22-1861572191REFERENCES IHREFERENCES TOREFERENCE, INFILE CA (1967 TO DATE)NON-SPECIFIC DERIUAT1UES IH FILE CA FILE CAPLUS (1967 TO DATE) 列出所需之資料的 雪相關資料审告知其在CA FILE中之筆數三、利用化学命名来检索资料若有一完整的化合物名称,我们可以利用命名来检索资料,下面有个 例子为寻找有关合成5-CHLOROBENZOTRIAZOLE化合物的专利文献:( 一、進入REGISTRY資料审利用EXPAND指令來 查詢所裾之命名

15、O FILE REGISTRY 利用化學命名來檢索資料R E 5-CHLOROBENZOTRIAZOLE/CN El 1 5-CHLOROBENZOTHIOPHENE-2-CARBOXALDEHYDE/CNE2 1 5-CHLOROBENZOTHIOPHENE.2-METHANOL/CNE3 1 5-CHLOROBENZOTRIAZOLE/CNE4 1 5-CHLOROBENZOXAZOLE/CNE5 1 5-CHLOROBENZOXAZOLE-2-CARBOXALDEHYDE/CNE6 I 5-CHLOROBENZOXAZOL1DONE/CNE7 1 5-CHLOROBENZOXAZOLON

16、E/CNE8 1 5-CHLOROBICYCLO(2.2.1 )HEPT-2-ENE/CNE9 1 5-CHLOROBICYCLO(2.2.1 )HEPT-2-ENE POLYMER/CNE10 1 5-CHLOROBICYCLO(3.2.0)HEPT-2.ENE/CNEll 1 5-CHLOROBIS(L5-CYCLOOCTADIENE)DIIRIDIUM/CNE12 1 5-CHLOROCALICENE/CNL3 ANSWER 1 OF 5 CAPLUS COPYRIGHT 1998 ACSAN 1989:457739 CAPLUSDN 111:57739專利所有權人 )専利號利用此 號碼

17、可凋閱所肅 之専利文獻Hayashi. Hiroyasu: Maekawa Tsukas;Olsuka Chemical Co. Ltd. JapanJpn. Kokai Tokkyo Koho. 6 pp.CODEN: JKXXAFPI JP 01019073 A2 HeiseiAl JP 87-175406DT PatentLA Japanese專利文獻摘要AB Benzotriazole I(R = H; Rl R4 二 H halo, stable group in reaction solvents) (II free of byproduct amines as colored m

18、atters. useful as anticorrosives and stabilizers for polymers (no data) are prepd. in high yields by treatment of 1-hydroxybenzotriazoles I D SCAN V L! 3 ANSWERS REGISTRY COPYRIGHT 1998 ACSIN Thiophene. 2.5-dibromo-3.4-dinilro-(6CL 7CL 9CI) MF Br2 N2 04 S初Cl COMHOW MANY MORE ANSWERS DO YOU WISH TO S

19、CAN? (1):1LI 3 ANSWERS REGISTRY COPYRIGHT 1998 ACSIN Thiophene. 2.4-libromo-3.5-dinilro- (7CI)MF *C4 Br2 N2 04 S帶林不是所耍査砌旳化合物 一HOW MANY MORE ANSWERS DO YOU WISH TO SCAN? (1):1LI 3 ANSWERS REGISTRY COPYRIGHT 1998 ACSIN Thiophene. 3.4-dibromo-2.5-dinilro- S LI AND 2.5-DIBROMO 357803 2.5109536 DIBROMO27

20、24 2.5-DIBROMO(2.5(W)DIBROMO)L21 LI AND 2.5-DIBROMO= D L2 IDEL2 ANSWER 1 OF 1 REGISTRY COPYRIGHT 1998 ACSRN 52431-30-8 REGISTRYCN *Thiophene. 2.5iibromo-3.4-dinitn)-(6CL 7CL 9CI)* (CAINDEX NAME)OTHER NAMES: 檢索出所需之化合物CN *#2.5-Dibromo-3.4-dinitrothiophene:*5FS 3D CONCORDMF *=C4 Br2 N2 04 S*CI COMLC ST

21、N Hies: BE1LSTEIN鹫 CA. CAOLD. CAPLUS. CHEMCATS. CHEMINFORMRX.CSCHEM. IFICDB. IFIPAT. IF1UDB. SPECINFO. TOXLIT. USPATFULL (*Filc contains numerically searchable property data12 REFERENCES IN FILE CA (1967 TO DATE)12 REFERENCES IN FILE CAPLUS (1967 TO DATE)3 REFERENCES IN FILE CAOLD (PRIOR TO 1967)五、利

22、用化学结构式来检索资料STN线上检索系统的软件一STN Express有强大的化学结构绘图功能,它可 以在离线的状况下,先画化学结构式进而再上线来检索资料,其中的结构式可 以有多样的变化来选择,下面将有讨论。它可以快速同时很准确的找出所要查 询的化合物资料,这最适合用在查询新化合物的合成资料,若再配合Markush 结构式的检索,则对新化合物合成的专利资料会有非常完整的收集,这是STN 线上检索系统非常强大的功能,但所需的检索费用也比较昂贵,这也是检索资 料所要考虑的因素。下图为STN Express软件的界面:| |Fri 1998/11/06 3:05:18STN Express画化学结构

23、式的软件有四种不同型式的检索选择,同时其费用 如下表所示:检索指令型态检索出的结果范围检索费用(美元)EXACT与所绘的结构完全符合,同时还 包括其同位素、立体异构物、单 体聚合物、自由基和带电化合 物。FAMILY倉EXACT以外,另包含了其盐 类、混合物和其共聚物的化合物SSS除了含EXACT和FAMILY以 外,还包含了所有其它不同官能 基之取代及延伸相关的结构式。山上表可得知,以化合物的结构式来检索资料的费用是比较昂贵,但它也 有它独特的地方,除了特定的(EXACT)结构式的检索外,它还可以配合下面其 它比较特殊的功能做进一步的检索:1.可变异的官能(Variables):选用此吱功能

24、键,可以以唯一的符号检索包 含同类或同族的取代基;其中X表示所有卤素原子、A表示除了氢以外的所有 原子、Q表示除了氢和碳以外的所有原子、M表示所有金属原子等、Cb表示 碳环状化合物、Hy表示异碳环状化合物、Ak表示直键碳化合物等。2不定官能ffi(G-group):可以在同一位置上定义多种不同的取代基的检索,所以只要画一次结构即可检索同一主体上有不同的取代基。3.不定位的取代(Variable Point of Attachment):对于环状化合物而言,若化合物 可能同时有邻-、间-或对-位的取代时,则STN Express软件可在同一结构上找 出不同位置的取代的化合物。4.重复取代基的定义(Defining a Repeating Group): STN Express软件可定义有相 同结构的某一原子或一群原子同时排列在一齐时,可利用其定义功能来检索, 其中重复的取代基的数H可从0-20单位皆可。下面的例子为套用以上四点的定义所画出的结构式:当然STN Express画化学结构式的软件,除了以上介绍的功能外,还有 许多其它强大的画图功能,在此不易一一列举出来。同时它不但可做单一化合 物的结构检索外,它还可以做高分子化合物的检索,另外也可以以结构式做化 学反应的检索,若以后有机会将再为大家来介绍。

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