中国生物医学文献数据库CBMWeb版的使用.docx

1、中国生物医学文献数据库CBMWeb版的使用第1章 中国生物医学文献数据库（CBM）Web版的使用11 数据库简介111 收录范围中国生物医学文献数据库(CBMDisc)是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的生物医学文献数据库。该数据库收录了1978年以来1,600多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录，总计340余万条记录，年增长量约40万条。学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、口腔医学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。112 标引和分类中国生物医学文献数据库的全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版医学主题词表(即MeSH词表)，和中国中医研究院图书情报研究所新版中

2、医药学主题词表进行了主题标引，并根据中国图书资料分类法进行了分类标引。113 数据库结构中国生物医学文献数据库的记录包括以下30多个可检索数据项(字段)，下面列出的是各数据项的英文、中文检索标识符，以及注释。 AA 著者文摘 AB 文摘 AD 地址 (第一著者地址) AD1 国省市名 (第一著者省市名) AF 原文出处 (译文原文出处) AU 著者 CA 索取号 (医信所会议、汇编内部编码) CN 国内代码 (国内期刊代码) CL 分类号 CT 特征词 FS 资助类别 ID 资助编号 IS ISSN (国际标准连续出版物号) JC 内部代码 (医信所期刊内部代码) LA 语种 (缺省值为中文)

3、 MA 会议地点 MH 主题词 (MMH) (主要概念主题词) NI 团体著者 PA 分册 PG 页码 IP 期 PP 出版地 (期刊出版地) PS 人名主题 PY 出版年 PT 文献类型 RF 参文数 (参考文献数) (SO) 出处 (复合字段：TA,PY,VI,IP,PG) SU 增刊 TA 期刊名称 TI 中文题目 TT 英文题目 TW 关键词 VI 卷 UI 流水号114 数据库的进入 在图书馆主页中选择中文文摘数据库，点击中国生物医学文献数据库旁边的“开始检索”链接，进入CBM数据库的登录界面，用户名和密码均输入“guest”（见图1-1），点击确认按钮，进入检索系统。图1-1 进入

4、检索系统后的初始界面是基本检索界面（见图1-2）。图1-212 数据库使用方法在检索形式上，CBM有基本检索、主题检索、分类检索、期刊检索、作者检索以及索引检索六种类型，此外还可以进行限定检索、定题检索和通过检索史进行复合检索等。121 基本检索进入检索系统后，缺省的检索界面就是基本检索，在其它检索界面时也可以直接点击页面上端的“基本检索”链接进入该检索界面。在此检索界面中可进行以下几种检索操作。1211 默认字段检索（缺省）直接在检索词输入框中键入检索词，然后点击右侧的检索按钮，系统将在中文题目、文摘、主题词、特征词、关键词、期刊字段内进行查找。1212 全部字段检索单击字段选择框（见图1-

5、3）选择“all全部”，在检索词输入框中键入检索词，然后点击右侧的检索按钮，系统将在数据库的所有字段内进行查找。1213 指定字段检索单击字段选择框选择相应的字段（如题目、作者、地址等，除“缺省”和“全部”外，有14个字段可以选择），在检索词输入框中键入检索词，然后点击右侧的检索按钮，系统将在指定的字段内进行查找。也可以不选择字段，直接在检索词前后加标识符进行检索（特别是有些字段未在字段选择框中出现），主要有以下几种：（1）字段标识符在前,用“=”，表达式为“字段=检索词”，表示精确查找。下述字段可做精确查找:AD, AU, CL, CN, CT, IP, IS, JC, MA, MH, MM

6、H, PP, PS, TA, TI, TW, VI。如: AU=张军（2）字段标识符在后,用“in”，表达式为“检索词in字段”，表示对所指定字段的任意片段进行查找。所有字段均可进行非精确查找。如：张军 in AU（同学们可对比上述两种查找方式得到的结果，体会其区别）。（3）检索词中如有不可检索的字符(多为特殊字符或标点)应用双引号(“”)标识。例: MH=“基因,p53”，“1004-616X” in ISSN等。*注意：检索时输入的各种符号必须在英文状态下输入。（4）出版年的查找只能是精确查找或范围查找，包括以下几种：= (等于) PY=1992 (小于) PY (大于) PY1992或出

7、版年1992=(小于或等于) PY= (大于或等于) PY=1992或出版年=1992 (指定范围) PY=1990-19921214 精确检索在检索词输入框后有“精确检索”的选项，选择后就要求检索词与检索字符串完全相等，如检索作者张军，仅检索出作者为张军的文献，而不会将作者名中含有张军片段（如张军山、张军文等）的文献检出。也可用表达式为“字段=检索词”代替。精确检索仅限于作者、关键词、刊名、出版年、期、分类号、主题词、特征词等字段。1215 二次检索在已经开始一次以上的检索后，基本检索界面中会出现“二次检索”选择框，输入新的检索词，选中“二次检索”前面的复选框，点击“检索”按钮即可在上一次检

8、索结果的范围内进行新的检索词。1216 检索示例如检索：第三军医大学发表的国家自然科学基金项目的论文。首先在检索入口处的下拉菜单中选择“地址”，在检索词输入框中输入“第三军医大学”，见图1-4。图1-4点击“检索”按钮，出现检索结果显示页面，缺省设置每页显示检索结果20篇，在检索结果的上端显示“共检出*篇”。再次选择检索入口“基金”，在检索词输入框中输入“国家自然科学基金”，选中“二次检索”前的复选框（见图1-5），然后点击“检索”按钮，即可得出“第三军医大学发表的国家自然科学基金项目的论文”的检索结果。图1-5122 主题检索点击页面上端的“主题词”链接，进入主题词检索界面（图1-6）。*自

9、由词、关键词、主题词三者的联系与区别自由词：是指出现在数据库中任意字段中的字或词，可以是文献中无关紧要的一个内容，也可以是文献中的重要组成部分。关键词：是指能够反映一篇文献主要内容的字或词，未经过严格规范，一般由作者或期刊编辑提供，对于不同文献中同一事物可能会有不同的关键词表达。主题词：也是能够反映一篇文献主要内容的字或词，但经过严格规范，根据美国国立医学图书馆的医学主题词表(即MeSH词表)，以及中国中医研究院图书情报研究所新版中医药学主题词表进行了主题标引，对同义词、近义词进行了统一，不同文献中的同一事物使用相同的主题词标引。并且可以通过设置是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词，使检索结

10、果更符合检索需求。图1-61221 选择主题词形式在检索入口处的下拉菜单中，可选择使用中文主题词或英文主题词进行检索。若检索英文主题词，只需用鼠标选中“英文主题词”即可。（缺省状态为中文主题词）1222 输入主题词在主题词输入框键入一个字或词，如“脑”，点击查找按钮，系统显示含有该词或字的片段的所有款目词、主题词列表以及每个主题词相对应的文献数量（图1-7）。在页面上端显示出查找到的相关主题词的数量。若没有任何款目词或主题词包含该字或词，则显示检出0个主题词。有时显示出的第一个主题词（或第一页）并不是我们需要的，就需要向下查找或翻页。 检索英文主题词时，选择“英文主题词”检索入口，在输入框键入

11、英文检索词，点击“查找”按钮，系统显示含有该检索词的英文主题词轮排表。英文主题词轮排表包括英文主题词和款目词 ( 同义词 ) 及主题词的中译名。词条中带有“见”字时，前面的词为英文款目词（同义词），后面为该同义词所对应的英文主题词的中译名。词条中没有“见”时，前面的词为英文主题词，后面为主题词中译名。如查找“brain”（图1-8）图1-7图1-81223 主题词检索的相关选项找到需要的主题词后点击该主题词即可进入下一界面（图1-9），在此，可以对主题词选择是否“加权检索”、“扩展检索”、以及副主题词和副主题词扩展检索，此外还可以浏览主题词注释信息和树形结构表。图1-9加权检索表示仅对主要概念

12、主题词（即在一篇文献中相对比较重要，能够反映文章论述的主要内容的主题词，在记录中主要概念主题词前加星号* 表示）检索。非加权检索表示对主要概念主题词（加星号主题词）和非主要概念主题词（未加星号主题词）均进行检索。若进行加权检索，对“加权检索”选择框进行标记即可。扩展检索指对当前主题词及其所有下位主题词（参见树形结构表）进行检索，非扩展检索则仅限于当前主题词的检索。默认状态为扩展检索，若不进行展检索请选择“不扩展”选项。副主题词用于对主题词的某一特定方面加以限制，强调主题词概念的某些专指方面。如要检索有关论药物对肝脏的影响的文献，可以查找主题词“肝”，然后选择副主题词“药物作用”进行检索。一些副

13、主题词之间也存在上下位关系，如副主题词“副作用”的下位词包括“中毒”和“毒性”，选择“扩展副主题词”，指对该副主题词及其下位副主题词进行检索，非扩展检索则仅限于当前副主题词“副作用”。*主题词与副主题词的组配规则：副主题词一共有94个，表明同一主题的不同方面。主题词与副主题词的组配有严格的规定，不是所有的副主题词均能与每个主题词进行组配，“可组配副主题词”列出了当前主题词可以组配的所有副主题词，每个副主题词前面都有一个复选框，可以同时选择多个副主题词。点击某个副主题词可弹出该副主题词的注释窗口，有助于正确使用副主题词。主题词注释包括该主题词的中文名称、英文名称、款目词、树状结构号、相关词、可组

14、配的副主题词、药理作用主题词、检索回溯注释、标引注释、历史注释、范畴注释等内容（图1-10）。阅读主题词的注释信息，可以对检索起到一定的帮助作用。树形结构表位于屏幕的下方，主要说明了主题词之间的相互关系，由上位概念词到下位词一层层打开，形似倒置树枝的形状（图1-11）。在结构表中可以选择合适的上位词或下位词进行检索。图1-10图1-11123 分类检索点击页面上端的“分类检索”链接，进入分类检索页面（图1-12）。CBM分类标引的依据是中国图书馆分类法医学专业分类表，因此，分类检索是依据分类表，通过分类号和分类名进行检索。检索步骤如下：（1）在检索入口处可直接选择“类名”或“分类号”，在已知要

15、检索的正确的类名或分类号的情况下，可直接在检索词输入框中输入相应的类名或分类号，点击查找按钮，若查找的是类名，则显示所有含有检索词的类名及对应的分类号的列表（图1-13）；若查找的是分类号，则显示以此分类号开始的分类表，可以前后翻页查看其它的分类情况（图1-14）。直接点击要查找的分类号或分类词，进入选择复分号页面（到第3步）。（2）在缺省的分类检索界面，可以直接用鼠标选择需要查找的分类类目，通过类目前的“+”可以打开下一级类目。找到需要的类名后直接点击即可。如：查找“淋巴系结核”，首先找到“R52 内科学”，点击前面的“+”打开下一级类目，找到“R52 结核病”，再向下找到“R522 淋巴系

16、结核”，直接点击“淋巴系结核”，进入选择复分号页面。（3）在选择复分号页面中可进行“扩展”检索和选择复分号（图1-15）。分类检索中的扩展检索与主题检索中的扩展概念类似，选中“扩展检索”表示对该类目及其下位类同时进行查找，不选中“扩展检索”则表示仅对该类目检索。选择复分号用于对分类号某一特定方面加以限制，强调某些专指方面。如：复分号“022”表明主类号的“病理学”方面。类号及其类名下列出了可与当前主类号组配的全部复分号：选择“全部复分”表示检索与当前主类号组配及不组配复分号的所有文献；选择“无复分”表示检索与当前主类号不组配复分号的文献；选择某一复分号表示仅检索当前主类号组配所选复分号的文献。

17、（4）选择好“扩展”及“复分号”后，点击“分类检索”按钮开始检索。*不是所有类号都有复分组配，仅以下类号可进行复分组配： R25/278中医各科及中医急症学、R5/8临床各科疾病与“临床医学复分表”进行复分组配； R282.71/.77 各种药材与“各类药材专类复分表”进行复分组配。图1-12图1-13图1-14图1-15124 期刊检索点击页面上端的“期刊检索”链接，进入期刊检索页面（图1-16）。图1-16在检索入口后可以选择“刊名”、“出版单位”、“出版地”或“期刊主题词”，然后输入相应的检索词，点击“查找”按钮开始查找。查找结果显示含有该检索词的期刊列表（图1-17），从中选择合适的期

18、刊名，点击后显示期刊信息及检索设置页面（图1-18）。图1-17图1-18在图1-18所示的页面中，可以设置期刊的出版年、期（如不设置则默认为数据库收录的所有年和期）；也可以由“期刊刊名”检索改为“期刊代码”（医科院信息所为每种期刊分配了内部编码，期刊更名时内部编码不变。）检索，即可检索出指定期刊及其更名期刊。设置好后，点击“期刊检索”按钮开始检索。期刊的查找也可以直接通过期刊检索初始页面（图1-16）中的“期刊导航”，逐级浏览，找到要查找的期刊，浏览该刊的基本信息并进行检索。125 作者检索点击页面上端的“作者检索”链接，进入作者检索页面（图1-19）。图1-19在检索输入框键入完整作者名或

19、作者名片段，点“查找”按钮，系统显示包含检索词的作者列表（图1-20）。找到要检索的作者名，点击该作者名的链接，即可检索出本数据库中收录的该作者的所有文献。如要检索该作者作为第一作者发表的文献，点击该作者所对应的第一作者图标 即可。*在“作者检索”页面中，所检索的作者都是精确检索，而不是在“基本检索”页面中选择作者字段检索需要选择“精确检索”的选框。图1-20126 索引检索点击页面上端的“索引检索”链接，进入索引检索页面（图1-21）。图1-21索引词是指包括在数据库中所有默认字段（即：题目、文摘、关键词、主题词、刊名等字段）中的单个字和部分词组。“索引检索”主要可为用户选择检索词提供线索和

20、帮助。检索时，在输入框键入检索词，点“查找”按钮，出现索引词列表（图1-22）。图1-22索引词列表包括索引词、命中文献数、出现数。命中文献数指文献篇数，出现数指该索引词的词频数。从索引词列表中选中合适的索引词，点击后即可开始检索。*索引词列表中显示的命中文献数为所有字段的检出结果数，而索引词的检索在缺省字段中进行，故某索引词的检出文献数与索引词列表中显示的命中文献数有时不一致。127 限定检索在“基本检索”页面中，点击检索词输入框下端的“限定检索”链接，进入限定检索页面（图1-23）。图1-23限定检索内容划分为若干组，各组分别为：年代范围（默认为所有年代）；带摘要（选中“带摘要”，表示题录

21、中带有中文摘要）；核心期刊（默认为全部期刊,选定“核心期刊”则限定在核心期刊内进行检索）；文献类型（包括综述、讲座、译文、病例报告，默认为不限定文献类型）；年龄组（包括婴儿,新生、婴儿、儿童,学龄前、儿童、青少年、成年人、中年人、老年人、老年人, 80岁以上）；性别（包括男(雄)性、女(雌)性）；人类或动物（包括人类、动物）；其他（包括妊娠、体外研究）。每组内的关系为“OR”，组间关系为“AND”。限定检索可以在检索前限定(“先限定”)，或者对已有检索式做限定(“后限定”)。取消限定检索前，限定设置始终有效。*建议限定检索放在检索课题的最后一个检索式进行。检索1994年以前文献，最好不限定特征

22、词。128 检索史点击检索词输入框下端的“检索史”链接，进入检索史页面（图1-24）。图1-24“检索史”界面用来显示前面进行过的检索式，显示时按时间顺序，从上到下依次显示，最后完成的检索式总在最上面。每页最多可以显示100条检索式。检索式的上方和下方都有“AND”、“OR”、“NOT”和“清除检索史”四个按钮，通过它们可以将一个或多个检索式组成更恰当的检索策略，或清除不需要的检索式。 逻辑组配符之一，只有选中两个以上的检索式时才能使用。如选中两个以上检索式A 和 B，然后点“AND”按钮。检出的记录中既含有检索词 A，也含有检索词B，也可在检索输入框中直接输入检索式A and B。（结果为下

23、图中的阴影部分）A and B 逻辑组配符之一。平时显示为灰色，只有选中两个以上的检索式时才能使用。如选中两个以上检索式A 和 B，然后点“OR”按钮。检出记录中含有检索词 A 或检索词 B。也可在检索输入框中直接输入检索式A or B。（结果为下图中的阴影部分）ABBA A or B 逻辑组配符之一。平时显示为灰色，只有选中一个以上的检索式时才能使用。如选择要去除检索词B的检索式，点“选中”按钮，再点“NOT”按钮，得到的就是数据库中除去B的全部记录C。如果检索A记录中去除B记录，则直接用A and C即可。也可在检索输入框中直接输入检索式A and not B。（结果为下图中的阴影部分）A

24、B A and not B 可选择性删除指定的检索式或全部检索式。要删除某个检索式，只需选中其前方的复选框，然后点“清除检索史”按钮即可；若不选择检索式，则系统默认删除全部检索式。在选定检索式并点击相应的逻辑组配按钮AND、OR或NOT之后，系统将首先将完成后的检索式放在检索词输入框中，点击“检索”按钮后开始检索，如不满意可以点击“清除”按钮清除输入框中的检索式。*可以直接在检索词输入框中输入检索式，如：#1 and #2、#1 and not #2等。注意：“#”符号要在英文状态下输入。各组配符之间有一定的优先顺序：AND NOT AND OR，如希望优先级较低的组配符优先进行运算，需要在该

25、算式两端加上括号“（）”。*CBM中设置了超时退出，即超过一定时间未对数据库进行任何操作，则系统自动退出，再次进行操作时要求重新输入“用户名”和“密码”。超时退出系统后，检索历史仍然保留，您可继续检索。如选择“退出系统”（页面左侧），则检索历史清除。129 定题检索点击检索词输入框下端的“定题检索”链接，进入定题检索用户登陆页面（图1-25）。图1-25“定题检索”是对预先制定好的检索策略（检索史）进行保存，在下次使用数据库时可以直接调用保存过的检索策略，主要用于定期跟踪某一课题的最新文献。初次使用“定题检索”，首先要进行注册，点击“新注册”链接，进入定题检索用户注册页面（图1-26）。图1-

26、26只要你输入的用户名未被他人使用过，在验证密码正确的情况下，点击“注册”按钮即可开始使用。已注册用户在用户登陆界面中输入正确的用户名和口令后即可进入检索策略存储和调用界面（图1-27）。图1-271291 检索策略存储在“检索策略存储”中，可以保存本次的检索策略（即当前在“检索史”页面中显示的全部检索式）。为了日后能够清晰、准确地了解当时的检索思路，我们可以根据需要在“检索史”页面中重新整理、组织一个满意的检索策略。存储检索策略之前，首先要为将要保存的检索策略命名一个“名字”，检索策略名要直观、好记，不与其他检索策略文件名搞混，而且以后也可以根据文件名就知道所查找的内容。在“检索策略名称”后

27、的输入框中输入名称后，点击“存储检索策略”按钮，即把这个检索策略存储下来，同时系统记录下此次检索的时间。1292 检索策略调用登录定题检索后，先前已经保存的检索策略名称会显示在页面下方，根据需要选择对应的检索策略前的复选框，可以进行“重新检索”、“最新文献检索”和“删除检索策略”的操作。“重新检索”是使用该检索策略对数据库中的所有文献再次进行检索，是定题检索的一个附加功能。可以选择要选择的检索策略前的复选框，点击“重新检索”按钮开始检索；也可以直接点击该检索策略名称，系统将自动开始检索。“最新文献检索”是对末次检索后至今数据库中新添加的文献进行检索，以追踪获取该课题的最新文献。检索后记录下了更

28、新日期。选择要选择的检索策略前的复选框，点击“最新文献检索”按钮开始检索。“删除检索策略”是将不再需要的检索策略文件删除，使我们的定题检索页面更加简洁。选择要删除的检索策略前的复选框，点击“删除检索策略”按钮即可删除。13 检索结果的处理131 结果显示（1）在检索完成后，系统直接显示检索出的文献，缺省情况下，仅显示文献的题录信息（图1-28）。图1-28（2）在图1-28的界面中，可根据需要在“显示”按钮后的下拉菜单中选择“题录格式”、“文摘各式”或“详细格式”，选择好后，点击“显示”按钮就可以显示相应的格式。“文摘格式”比“题录格式”多了文摘、主题词、关键词及特征词。（3）缺省状态下，每页

29、显示20条检索结果，可以通过显示条数后的下拉菜单选择每页显示的文献条数。有5、10、20、50、100五种选项。（4）可以改变结果的排序方式。点击 “排序格式”下拉菜单，可根据需要选择作者、年代、期刊三种排序方式（*显示的文献记录不超过10000条）。不指定排序格式时，记录按数据入库时间显示。（5）在浏览检索记录的同时，可以对需要的记录进行标记，标记时直接点击相应记录前复选框；标注完题录后，点“显示”按钮，即可显示被标记的题录；如果要去除标注，用鼠标点被标记题录前的复选框即可，在显示标注记录的情况下，也可用此方法显示全部记录。132 链接检索 CBM数据库中对记录中的作者、期刊、关键词、特征词

30、、主题词、副主题词做了超链接，在察看检索结果的过程中，如果对其中某篇文章中的作者、关键词、主题词等感兴趣，可以直接点击该词，系统将直接开始检索并显示结果。同时，数据库还提供了相关文献字段，点“主题相关”，系统将按照内置算法检出与该篇主题内容相关的文献。133 结果输出（1）在“文本显示”状态下点击“输出”按钮，将以文本格式显示检索结果，如果标注了记录，将只显示标注过的记录。（2）在下拉菜单中选择“文件保存”，点击“输出”按钮，将提示以文本的形式保存检索的结果，在选择文件路径和名称后保存。如果标注了记录，将只保存标注过的记录。（3）显示格式、及排序设置对结果的输出同样有效。（4）保存题录不超过5

31、00条。14 检索举例1查找有关消化性溃疡的药物治疗方面的综述文献分析：“消化性溃疡”作为一种疾病，可利用主题词进行查找，“药物治疗”与副主题词“药物疗法”对应，“综述”是文献的一种类型，可利用“限定检索”来实现。（1）在主题检索界面中查找“消化性溃疡”，找到后，选择扩展全部树，并选择副主题词“药物疗法”，点击“主题检索”按钮。（2）点击“限定检索”，进入限定检索页面，选择文献类型“综述”，点击确认按钮。（3）点击检索输入框旁的检索按钮（此时检索框中应该有“主题词=“消化性溃疡/DT/全部树”字样），即可得到检索结果，此时“显示”按钮上方出现红色的“限定：综述”字样。提示：可以用基本检索界面查找，比较检索结果的异同，并说明原因。2. 2检索我校吴玉章教授2000年以来发表的有关T淋巴细胞的文献分析：我校在此指的是“第三军医