生物工程.docx

1、生物工程专业、班级： 姓名： 学号： 成绩： 文献检索与利用课程结课考核报告一、写出下列题录的文献出版类型，并说明识别标志（每题3分，共15分）1、The Future of Thinking : Learning Institutions in a Digital AgeDavidson, Cathy N. Goldberg, David Theo.In John D. And Catherine T. MacArthur Foundation Reports on Digital Media and Learning. In public domain. MIT Press. 2010.I

2、SBN：9780262513746.出版类型：图书识别标志：ISBN：9780262513746 2、Jean-Michel Bourget, Robert Gauvin, Danielle Larouche, Amlie Lavoie, Raymond Labb, Franois A. Auger, Lucie GermainHuman fibroblast-derived ECM as a scaffold for vascular tissue engineeringBiomaterials, Volume 33, Issue 36, December 2012, Pages 92059

3、213http:/dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2012.09.015出版类型：期刊识别标志：Volume 33, Issue 36, December 2012, Pages 92059213 3、蔡旭旺. 副猪嗜血杆菌的分离鉴定及诊断方法与灭活疫苗的研究D.华中农业大学, 2006.出版类型：学位论文识别标志：D 4、郑斌,王新,刘毅,叶紫权. 智能图书定位系统P. 湖南：CN102542237A, 2012-07-04.出版类型：专利文献识别标志：P 5、IEEE standard for medical device communications

4、- transport profile - IrDA based - cable connected14 April 2000出版类型：标准文献识别标志：standard 二、写出下列课题的计算机检索策略式（每题5分，共15分）1、三聚氰胺毒理学研究进展检索式：主题=三聚氰胺*毒理学*研究进展2、卫星跟踪技术在鸟类迁徙研究中的应用检索式：主题=卫星跟踪技术*鸟类迁徙*研究*应用3、莫言小说意象研究检索式：主题=莫言*小说*意向研究三、课题（自拟）检索综合实习（50分） 课题名称：东北野生大豆盐碱胁迫相关转录因子基因筛选、克隆及表达特性分析 一、分析研究课题（如：课题背景、需要解决的问题等） 盐

5、碱、干旱和低温等非生物胁迫是影响植物正常生长发育和作物高产的负面因子。在这些逆境下，植物接受胁迫信号，特定功能基因诱导表达，而后在生理生化水平产生适应性反应。转录因子又称反式作用因子，是指能够与基因启动子区域中顺式作用元件发生特异性相互作用的结合蛋白，该蛋白通过它们之间以及与其它相关蛋白之间的相互作用激活或抑制特定基因的转录，在抗逆基因表达调控中起着重要的作用。野大豆相较于大豆虽有相似的基因组，但在盐碱胁迫中有很多更好的表型。在1Kp计划中，盐碱胁迫六小时的野大豆材料进行高通量测序，采用生物信息学手段和基因组学研究方法分析出测序后有显著差异的盐碱胁迫相关转录因子，得到若干耐盐碱候选基因。通过对

6、候选基因Realtime-PCR验证，确定对植物耐盐碱胁迫起重要作用的新基因。本研究以耐盐碱东北野生大豆为试材，高通量测序并分析筛选出胁迫早期应答转录因子，在候选基因进行Realtime-PCR验证后，对选取转录因子进行全长基因的克隆，通过对选取转录因子进行Realtime-PCR检测，揭示选取基因在不同胁迫处理下的表达特性。为后续基因功能分析以及揭示盐碱胁迫应答分子机制做铺垫，进一步加深对植物抗逆分子机理的认识，对植物盐碱抗胁迫性起重要作用的新基因，为作物抗逆分子育种提供基因资源和奠定理论基础。 二、选取中英文检索词（关键词），可依同义词，广义词，狭义词，相关词等方式列出，请各写3个以上。1

7、中文关键词：野生大豆，盐碱胁迫，转录因子，基因2英文关键词：wild soybean，saline-alkali stress，transcription factor，gene 三、选择检索工具，构造检索式，筛选所需检索结果1、中文期刊论文检索选取的数据库名称：中国学术期刊网络出版总库检索方式：专业检索检索限定条件：时间： 到 ；来源期刊： ；期刊范围： ；其他限制条件 检索式一：KY=野生大豆 and KY=盐碱胁迫其检出的文章篇数： 6 篇检索式二：KY=野生大豆 and KY=转录因子其检出的文章篇数： 4 篇 参考文献（至少5篇，请按照作者、文章题名、来源刊、年卷期、页码的顺序进行编

8、写）1朱丹,柏锡,朱延明,才华,李勇,纪巍,陈超,安琳,朱毅. 野生大豆盐碱胁迫相关GsTIFY11b的克隆与功能分析J. 遗传,2012,34(2):230-240.2王臻昱,才华,柏锡,纪巍,李勇,魏正巍,朱延明. 野生大豆GsGST19基因的克隆及其转基因苜蓿的耐盐碱性分析J. 作物学报,2012,38(6):971-980.3罗晓,曹蕾,王明超,胡梦然,柏锡,纪巍,才华,朱延明. 野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析J. 东北农业大学学报,2012,43(4):20-27.4肖鑫辉,李向华,刘洋,张应,王克晶. 高盐碱胁迫下野生大豆(Glycine soja)体内离子积

9、累的差异J. 作物学报,2011,37(7):1289-1301.5肖鑫辉,李向华,王克晶. 渤海湾津唐沿海野生大豆(Glycine soja)种群高盐碱胁迫反应J. 植物遗传资源学报,2010,11(3):290-298. 2、中文学位论文检索选取的数据库名称：中国优秀硕士学位论文全文数据库检索方式：专业检索检索限定条件：学位年度从 年到 年；学位单位 ；论文级别 ；作者 ；作者单位 ；其他限制条件 检索式一：TI=野生大豆 and TI=基因其检出的文章篇数： 8 篇检索式二：KY=野生大豆 and KY=转录因子其检出的文章篇数： 3 篇 参考文献（至少5篇，请按照作者、论文题名、学位授

10、予单位、学位年度的顺序进行编写）1张丽敏. 野生大豆基因在拟南芥中高通量表达技术研究D.东北农业大学,2010.2杨靓. 野生大豆渗透胁迫早期应答基因GsPK、GsLRPK的筛选及克隆D.东北农业大学,2009.3李莹. 耐盐野生大豆DREB类转录因子基因的克隆与分析D.东北农业大学,2008.4张春宝. 野生大豆耐盐相关基因的克隆与序列分析D.东北农业大学,2008.5白晶. 野生大豆（Glycine soja）C2H2型锌指蛋白基因的克隆及功能分析D.哈尔滨师范大学,2011.6 孙薇. 河南和山西野生大豆耐盐鉴定及耐盐相关基因分析D.中国农业科学院,2007. 3、外文期刊论文检索选取的

11、数据库名称：EBSCO全文资源库检索方式：高级检索检索限定条件：时间： 年到 年；来源期刊： ；卷 期 页码 ；学科类别： ；其他限制条件 检索式一：wild soybean AND transcription factor其检出的文章篇数： 12 篇检索式二：wild soybean AND gene其检出的文章篇数： 87 篇 参考文献（至少3篇，请按照作者、文章题名、来源刊、年卷期、页码的顺序进行编写）1 Ming Chen,Zhaoshi Xu,Lianqin Xia,Liancheng Li,Xianguo Cheng,Jianhui Dong,Qiaoyan Wang,Youzhi

12、 Ma. Cold-induced modulation and functional analyses of the DRE-binding transcription factor gene, GmDREB3, in soybean(Glycine max L.). Journal of Experimental Botany,Jan2009, Vol. 60 Issue 1, p121-135.2Kejing Wang,Xianghua Li. Genetic characterization and gene flow in different geographical-distanc

13、e neighbouring natural populations of wild soybean ( Glycine soja Sieb. & Zucc.) and implications for protection from GMsoybeans.Euphytica,Aug2012, Vol. 186 Issue 3,p817-830.3 Ishibashi Nobuchika,Setoguchi Hiroaki. Polymorphism of DNA sequences of cryptochrome genes is not associated with the photop

14、eriodic flowering of wild soybean along a latitudinal cline.Journal of Plant Research, Jul2012, Vol. 125 Issue 4, p483-488.4、外文优先出版论文检索选取的数据库名称：ScienceDirect检索方式：高级检索检索限定条件：时间： 2013 年；学科类别： Agricultural and Biological Sciences ；其他条件 检索式一：wild soybean AND transcription factor其检出的文章篇数： 5 篇检索式二：wild so

15、ybean AND gene其检出的文章篇数： 43 篇 参考文献（至少3篇，请按照作者、文章题名、来源刊、DOI的顺序进行编写）1 Leila Riahi,Nejia Zoghlami,Alexis Dereeper,Valerie Laucou,Ahmed Mliki,Patrice This.Single nucleotide polymorphism and haplotype diversity of the gene NAC4 in grapevine. Industrial Crops and Products, 10.1016/j.indcrop.2012.08.021.2 J

16、ehan akht,Asghari Bano,Mohammad Shafi, Peter Dominy.Effect of abscisic acid applications on cold tolerance in chickpea (Cicer arietinum L.) European Journal of Agronomy, 10.1016/j.eja.2012.07.006. 3 Vctor Pecina-Quinteroa, Jos Luis Anaya-Lpeza, Carlos Alberto Nez-Colna, Alfredo Zamarripa-Colmenerob,

17、No Montes-Garcac, Jos Luis Sols-Bonillab, Mara Roco Aguilar-Rangela. Assessing the genetic diversity of castor bean from Chiapas, Mxico using SSR and AFLP markers. Industrial Crops and Products, 10.1016/j.indcrop.2012.04.033. 5、网络免费信息检索选取的网络检索工具：Google学术检索方式：高级检索检索步骤：野生大豆AND盐碱胁迫AND转录因子AND基因检索结果： 339

18、 篇 参考文献（至少5篇，请按照作者、文章题名、来源刊、年卷期、页码的顺序进行编写）1张兰,王晓萍,毕影东,张春义,范云六,王磊. 转录因子GmWRKY57B 的基因克隆及功能分析J.科学通报, 2008 ,53（21）: 2604-2611. PDF2王志春,梁正伟.植物耐盐研究概况与展望J.生态环境, 2003, 12 （1）: 106-109. 3陈金焕,夏新莉,尹伟伦.植物DREB 转录因子及其转基因研究进展J. 分子植物育种, 2007,(6s) : 29-35.4 高世庆,徐惠君,程宪国,陈明,徐兆师,李连城.转大豆GmDREB 基因增强小麦的耐旱及耐盐性J.科学通报, 2005,

19、50,（23）: 2617-2615. PDF5 才华,朱延明,李勇,柏锡,纪巍,王冬冬,孙晓丽.野生大豆转录因子GsNAC20 基因的分离及胁迫耐性分析J.作物学报, 2011,37（8）: 1351-1359. 四、对本课题的简要分析通过对中文资源和外文资源的搜索结果得知，植物各种诱导型基因的表达主要受特定转录因子在转录水平上的调控。自从1987年Paz-Ares首次报道玉米转录因子基因的克隆以来，相继从高等植物中分离出的调控干旱、高盐、低温、激素、病原反应及生长发育等相关基因表达的转录因子已达数百种。转录因子一般包括DNA结合域、转录调控区域、寡聚化位点、核定位信号等。 植物对非生物胁迫

20、的分子应答途径。植物感受胁迫刺激后，通过 ABA 依赖或 ABA 非依赖途径传导胁迫信号，合成转录因子，继而各转录因子与抗逆功能基因上游启动子中的顺式作用元件结合，促进抗逆功能基因的表达，植物表现出抗逆性。植物非生物胁迫功能基因的表达受启动子中顺式作用元件及转录因子的调控，了解植物非生物胁迫诱导启动子顺式作用元件及转录因子研究现状，有助于揭示胁迫应答基因的表达调控机制。本究最终目标如下：1.对东北野生大豆盐碱胁迫六小时材料进行高通量测序，分析并筛选出若干与盐碱胁迫相关的转录因子基因；2.Realtime-PCR对筛选显著差异的转录因子基因进行验证，确定新的与盐碱胁迫相关的转录因子基因；3.对选

21、取转录因子进行全长基因的克隆及其在不同胁迫处理下的表达特性分析。为后续基因功能分析做基础。 专业、班级： 姓名： 学号： 成绩： 文献检索与利用课程结课考核报告一、写出下列题录的文献出版类型，并说明识别标志（每题3分，共15分）1、The Future of Thinking : Learning Institutions in a Digital AgeDavidson, Cathy N. Goldberg, David Theo.In John D. And Catherine T. MacArthur Foundation Reports on Digital Media and Lea

22、rning. In public domain. MIT Press. 2010.ISBN：9780262513746.出版类型：图书识别标志：ISBN：9780262513746 2、Jean-Michel Bourget, Robert Gauvin, Danielle Larouche, Amlie Lavoie, Raymond Labb, Franois A. Auger, Lucie GermainHuman fibroblast-derived ECM as a scaffold for vascular tissue engineeringBiomaterials, Volum

23、e 33, Issue 36, December 2012, Pages 92059213http:/dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2012.09.015出版类型：期刊识别标志：Volume 33, Issue 36, December 2012, Pages 92059213 3、蔡旭旺. 副猪嗜血杆菌的分离鉴定及诊断方法与灭活疫苗的研究D.华中农业大学, 2006.出版类型：学位论文识别标志：D 4、郑斌,王新,刘毅,叶紫权. 智能图书定位系统P. 湖南：CN102542237A, 2012-07-04.出版类型：专利文献识别标志：P 5、IEEE s

24、tandard for medical device communications - transport profile - IrDA based - cable connected14 April 2000出版类型：标准文献识别标志：standard 二、写出下列课题的计算机检索策略式（每题5分，共15分）1、三聚氰胺毒理学研究进展检索式：主题=三聚氰胺*毒理学*研究进展2、卫星跟踪技术在鸟类迁徙研究中的应用检索式：主题=卫星跟踪技术*鸟类迁徙*研究*应用3、莫言小说意象研究检索式：主题=莫言*小说*意向研究三、课题（自拟）检索综合实习（50分） 课题名称：东北野生大豆盐碱胁迫相关转录因子

25、基因筛选、克隆及表达特性分析 一、分析研究课题（如：课题背景、需要解决的问题等） 盐碱、干旱和低温等非生物胁迫是影响植物正常生长发育和作物高产的负面因子。在这些逆境下，植物接受胁迫信号，特定功能基因诱导表达，而后在生理生化水平产生适应性反应。转录因子又称反式作用因子，是指能够与基因启动子区域中顺式作用元件发生特异性相互作用的结合蛋白，该蛋白通过它们之间以及与其它相关蛋白之间的相互作用激活或抑制特定基因的转录，在抗逆基因表达调控中起着重要的作用。野大豆相较于大豆虽有相似的基因组，但在盐碱胁迫中有很多更好的表型。在1Kp计划中，盐碱胁迫六小时的野大豆材料进行高通量测序，采用生物信息学手段和基因组学

26、研究方法分析出测序后有显著差异的盐碱胁迫相关转录因子，得到若干耐盐碱候选基因。通过对候选基因Realtime-PCR验证，确定对植物耐盐碱胁迫起重要作用的新基因。本研究以耐盐碱东北野生大豆为试材，高通量测序并分析筛选出胁迫早期应答转录因子，在候选基因进行Realtime-PCR验证后，对选取转录因子进行全长基因的克隆，通过对选取转录因子进行Realtime-PCR检测，揭示选取基因在不同胁迫处理下的表达特性。为后续基因功能分析以及揭示盐碱胁迫应答分子机制做铺垫，进一步加深对植物抗逆分子机理的认识，对植物盐碱抗胁迫性起重要作用的新基因，为作物抗逆分子育种提供基因资源和奠定理论基础。 二、选取中英

27、文检索词（关键词），可依同义词，广义词，狭义词，相关词等方式列出，请各写3个以上。1中文关键词：野生大豆，盐碱胁迫，转录因子，基因2英文关键词：wild soybean，saline-alkali stress，transcription factor，gene 三、选择检索工具，构造检索式，筛选所需检索结果1、中文期刊论文检索选取的数据库名称：中国学术期刊网络出版总库检索方式：专业检索检索限定条件：时间： 到 ；来源期刊： ；期刊范围： ；其他限制条件 检索式一：KY=野生大豆 and KY=盐碱胁迫其检出的文章篇数： 6 篇检索式二：KY=野生大豆 and KY=转录因子其检出的文章篇数：

28、 4 篇 参考文献（至少5篇，请按照作者、文章题名、来源刊、年卷期、页码的顺序进行编写）1朱丹,柏锡,朱延明,才华,李勇,纪巍,陈超,安琳,朱毅. 野生大豆盐碱胁迫相关GsTIFY11b的克隆与功能分析J. 遗传,2012,34(2):230-240.2王臻昱,才华,柏锡,纪巍,李勇,魏正巍,朱延明. 野生大豆GsGST19基因的克隆及其转基因苜蓿的耐盐碱性分析J. 作物学报,2012,38(6):971-980.3罗晓,曹蕾,王明超,胡梦然,柏锡,纪巍,才华,朱延明. 野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析J. 东北农业大学学报,2012,43(4):20-27.4肖鑫辉,李向

29、华,刘洋,张应,王克晶. 高盐碱胁迫下野生大豆(Glycine soja)体内离子积累的差异J. 作物学报,2011,37(7):1289-1301.5肖鑫辉,李向华,王克晶. 渤海湾津唐沿海野生大豆(Glycine soja)种群高盐碱胁迫反应J. 植物遗传资源学报,2010,11(3):290-298. 2、中文学位论文检索选取的数据库名称：中国优秀硕士学位论文全文数据库检索方式：专业检索检索限定条件：学位年度从 年到 年；学位单位 ；论文级别 ；作者 ；作者单位 ；其他限制条件 检索式一：TI=野生大豆 and TI=基因其检出的文章篇数： 8 篇检索式二：KY=野生大豆 and KY=

30、转录因子其检出的文章篇数： 3 篇 参考文献（至少5篇，请按照作者、论文题名、学位授予单位、学位年度的顺序进行编写）1张丽敏. 野生大豆基因在拟南芥中高通量表达技术研究D.东北农业大学,2010.2杨靓. 野生大豆渗透胁迫早期应答基因GsPK、GsLRPK的筛选及克隆D.东北农业大学,2009.3李莹. 耐盐野生大豆DREB类转录因子基因的克隆与分析D.东北农业大学,2008.4张春宝. 野生大豆耐盐相关基因的克隆与序列分析D.东北农业大学,2008.5白晶. 野生大豆（Glycine soja）C2H2型锌指蛋白基因的克隆及功能分析D.哈尔滨师范大学,2011.6 孙薇. 河南和山西野生大豆

31、耐盐鉴定及耐盐相关基因分析D.中国农业科学院,2007. 3、外文期刊论文检索选取的数据库名称：EBSCO全文资源库检索方式：高级检索检索限定条件：时间： 年到 年；来源期刊： ；卷 期 页码 ；学科类别： ；其他限制条件 检索式一：wild soybean AND transcription factor其检出的文章篇数： 12 篇检索式二：wild soybean AND gene其检出的文章篇数： 87 篇 参考文献（至少3篇，请按照作者、文章题名、来源刊、年卷期、页码的顺序进行编写）1 Ming Chen,Zhaoshi Xu,Lianqin Xia,Liancheng Li,Xianguo Cheng,Jianhui Dong,Qiaoyan Wang