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分子生物学试题 完整版Felisa.docx

1、分子生物学试题 完整版Felisa05级分子生物学真题一、选择题1、激活子的两个功能域,一个是转录激活结构域,另一个是(DNA结合域)2、转录因子包括通用转录因子和(基因特异转录因子)3、G-protein 激活needs ( GTP ) as energy.4、Promoters and (enhancers) are cis-acting elements.5、噬菌体通过(位点专一重组)整合到宿主中6、在细菌中,色氨酸操纵子的前导区转录后,(翻译)就开始7、mRNA的剪切跟(II)类内含子相似8、UCE是(I)类启动子的识别序列9、TATA box binding protein 在下列哪

2、个启动子里面存在(三类都有)10、(5S rRNA)是基因内部启动子转录的11、人体全基因组大小 (3200000000 bp)12、与分枝位点周围序列碱基配对的剪接体 (U2 snRNP)13、tRNA基因是RNA聚合酶(III)启动的 14、在细菌中,色氨酸操纵子的前导区转录后,(翻译)就开始15、乳糖操纵子与阻遏蛋白结合的物质是(异构乳糖)。16、核mRNA的内含子剪接和(II类内含子剪接)的过程相似17、基因在转录时的特点(启动子上无核小体)18、RNA干涉又叫(转录后的基因沉默,PTGS)19、内含子主要存在于(真核生物)20、snRNA在下列哪种反应中起催化酶的作用(mRNA的剪接

3、)二、判断题1、原核生物有三种RNA聚合酶。2、抗终止转录蛋白的机制是使RNA聚合酶忽略终止子。3、RNA聚合酶II结合到启动子上时,其亚基的羧基末端域(CTD)是磷酸化的。4、Operon is a group of contiguous, coordinately controlled genes.5、RNA聚合酶全酶这个概念只应用于原核生物。6、聚腺苷酸尾是在mRNA剪接作用前发生的。7、在转录起始复合复合物中使得open到closed状态(closed转变成open)8、剪接复合体作用的机制:组装、作用、去组装,是一个循环过程三、简答题1、原核生物转录终止的两种方式。2、组蛋白乙酰化对

4、基因转录的影响。3、G蛋白在翻译中的作用有哪些?4、什么是转座?转座子有哪些类型?5、简述增强子的作用机制。04级分子生物学期末题目一、选择题(20题)1、tRNA的5端剪切所需的酶 (RNase P)2、人体全基因组大小 (3,200,000,000 bp)3、(5S rRNA)是基因内部启动子转录的4、线虫反式剪接所占比例 (10%-20%)5、与分枝位点周围序列碱基配对的剪接体 (U2 snRNP)6、Holliday中间体是(同源重组)的模型7、Pribnow box 是原核生物的(启动子)8、TATA box binding protein 在下列哪个启动子里面存在(三类都有)英文9

5、、UCE是(I)类启动子的识别序列10、mRNA的剪切跟(II)类内含子相似11、tRNA基因是RNA聚合酶(III)启动的 英文12、噬菌体通过(位点专一重组)整合到宿主中13、在细菌中,色氨酸操纵子的前导区转录后,(翻译)就开始14、Promoters and (enhancers) are cis-acting elements.15、G-protein needs ( GTP ) as energy. (原句不记得了)16、RNA干涉又叫(转录后的基因沉默,PTGS)17、转录因子包括通用转录因子和(基因特异转录因子) 英文18、激活子的两个功能域,一个是转录激活结构域,另一个是(DN

6、A结合域) 英文19、内含子主要存在于(真核生物)二、是非题(10题)1、RNA干涉是通过gRNA引导。 F2、U5 snRNP是参与两段外显子连接的。 T 英文3、抗终止转录的机制是RNA聚合酶忽略终止子。 T4、原核生物RNA聚合酶有三种。 F 英文5、Operon is a group of contiguous, coordinately controlled genes. T6、枯草杆菌芽孢形成的转录控制通过变化RNA聚合酶的因子达成。T7、enhancers and silencers are position- and orientation- free elements. T8

7、、RNA聚合酶II结合到启动子上时,其亚基的羧基末端域(CTD)是磷酸化的。F9、细胞质中的poly(A)往往比细胞核中的poly(A)短。T三、问答题(5题)1、比较原核生物和真核生物翻译起始的异同2、启动子在基因内的基因如何进行转录3、组蛋白乙酰化对基因转录的影响、4、什么是选择性剪接及其生物学意义是什么5、RNA编辑的机制03级试题一选择题1 Holliday中间体是(同源重组)的模型 2 Pribnow box是原核生物的(启动子的共同序列)3原核生物RNA聚合酶在转录延伸时不需要的因子(rou因子)4 TBP结合蛋白在下列哪个启动子里面存在(三类都是)5 UCE是(I)类启动子识别的

8、序列6乳糖操纵子与阻遏蛋白结合的物质是异乳糖。阻遏物与操纵区结合。7 二 判断题1 gRNA是引导RNA干涉的,用于RNA编辑。(F)2 基因在转录时,其启动子上不具有核小体。(T)转录因子与组蛋白竞争,转录因子与启动子结合是启动转录;组蛋白与启动子结合是关闭转录。8原核生物RNA聚合酶有三种(英文)(F)只有一种RNA聚合酶,真核才有三种。9抗终止转录的机制是RNA聚合酶忽略终止子(T)抗终止蛋白与mRNA或DNA上特异位点结合,再改变RNA聚合酶使其忽略终止子。10乳糖操纵子不仅需要正调空也需要负调。(T)阻遏物起负调控,CAP-cAMP起正调控。11基因在转录时,核小体不在启动子区。(T

9、)三 问答题1 原核生物和真核生物在翻译起始的异同答:相同点:都需要tRNA识别氨基酸并装载;都需要核糖体大小亚基解离;都需要起始因子;不同点:1起始tRNA携带的氨基酸不同,原核是甲酰甲硫氨酸,而真核是甲硫氨酸;2原核中甲酰甲硫氨酸识别的起始密码子有三种AUG/GUG/UUG,而甲硫氨酸只识别AUG; 3原核中不需要通过扫描寻找起始密码子,而真核中需要扫描寻找起始密码子;4原核中需要SD序列帮助mRNA与小亚基结合,而真核没有SD序列,需要5端帽子引导两者结合;5原核中起始因子比较简单,种类少,而真核中起始因子要复杂的多,种类也多;6原核中起始的控制是通过mRNA二级结构影响起始和反馈控制,

10、而真核中通过起始因子磷酸化来控制。2 核mRNA 的转录后加工有哪些?答:核mRNA前体的剪接(选择性剪接和自剪接);5端加帽和3端聚腺苷酸化;反式剪接;mRNA编辑3什么是转座?转座子有哪些主要类型?答:转座因子(transposable element,TE)是细胞中能改变自身座位的一段DNA 序列,可从复制子的一个座位跳跃到另一个座位,也可从同一个细胞的一个复制子跳跃到另一个复制子,DNA片断的这种运动称为转座。1) 复制性转座(replicative transposition) 转座过程有DNA复制,结果一个转座子留在原位,另一个插入到新的位点2) 保守性转座(conservativ

11、e transposition)转座子离开原位置,插入到新的位点;这种转座又称非复制性转座(nonreplicative transposition )3) 反转录转座子(retrotransposons)以RNA作为中介进行复制(转座),与反转录病毒(retroviruses)的复制相似,含有编码反转录酶的基因,能进行反转录;酵母中的Ty(transposon yeast)、果蝇中的copia等反转录转座子的两端有LTRs(long terminal repeats)13 什么是选择性剪接?具有什么生物学意义?答:选择性剪接:一个基因转录出来的RNA前体,通过不同的剪接方式(选择不同的外显子

12、)而形成不同的成熟mRNA,产生不同的蛋白质意义:通过选择性剪接,可对基因的表达起一定的调控作用选择性剪接常用于在不同的组织或发育时期产生组织特异或调控发育的蛋白质;选择性剪接还可有重要的生物学效应,如在果蝇的性决定体系中起重要的作用14 请你谈谈对第二遗传密码概念的认识?答:1) 氨酰tRNA合成酶的专一性很高,共有20种,每一种只用于单一种氨基酸与相应tRNA的结合,tRNA上的某些结构特征能使它在氨酰tRNA合成酶的催化下,与特定的氨基酸结合;这些结构特征就是“第二遗传密码”(the second genetic code)2) “第二遗传密码”常在tRNA的受体茎(acceptor s

13、tem)上,但在其他区域的也有不少3) “第二遗传密码”较复杂,且是非简并的,但专一性同样很强4) 之所以叫“第二”是因为“第一”遗传密码是mRNA上的编码氨基酸的密码子。01级大题1、简述基因组学的几个分支答:把基因组作为研究对象的学科(1)结构基因组学(structural genomics)基因组结构(genome structure)定位基因(gene mapping)测定基因组全序列(whole-genome sequencing)(2)功能基因组学(functional genomics)大规模、高通量分析基因组中基因表达的技术基因功能的分析(3)进化基因组学(evolutiona

14、ry genomics)在整体水平上研究基因和基因组的结构、功能的起源与进化比较基因组学(comparative genomics) 进化基因组学的初始阶段通过比较,发现基因组中蛋白质和功能RNA基因的密度与生物的复杂程度有一定的负相关2、与类核基因组相比,核基因组在结构上有什么特点?答:真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达8万);真核生物基因组存在C值佯谬现象(基因组中基因数目与基因组大小无关);多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)3、简述增强子的作用机制答:增强子 能增强

15、转录的元件,但又不是启动子的一部分(无位置、方向的限制) 增强子常在启动子的上游,但也可以在基因内部(如内含子中)增强子的远距离作用 激活子是使增强子能远距离作用的原因 4种可能性(第三、四种可能性较符合实际情况) Coiling (change in topology) Sliding Looping Facilitated tracking (looping and tracking)远距离增强子元件的成环作用机制。4、tRNA的转录后加工有哪些?答:tRNA的加工 在真核生物中, tRNA前体含单个tRNA分子,两端有额外的序列,其加工是要除去这些额外的序列 在原核生物中, tRNA前体

16、含1至多个tRNA分子,或与rRNA前体混在一起,故其加工首先要把含单个tRNA分子的片段切割出来(由RNase III负责),然后再除去5及3 端额外的序列 核tRNA内含子:内含子较小(10 bp左右),且只有1个,一般在相应于反密码子的碱基附近(与反密码子的 3端隔1个核苷酸)tRNA剪接(tRNA splicing)分2步进行,需要tRNA内切酶及RNA连接酶的参与 Step 1:由剪接内切酶把内含子切除 Step 2:由RNA连接酶把两个外显子连接起来5、什么是RNA编辑?RNA与中心法则的关系?答:基因转录产生的mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置换,基因转录物的序列不与基因

17、编码序列互补,使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成,不同于基因序列中的编码信息,这种现象称为RNA编辑。简单来说就是指mRNA加U或减U.编辑的机制 在转录后进行,沿3 5方向进行,由gRNA(guide RNA,向导RNA)指导进行 一些gRNA由大环的某些区域编码,另一些gRNA由小环编码 大部分gRNA 80 ntRNA与中心法则的关系:遗传信息从DNA传递给信息RNA的转录;在逆转录酶的作用下,以RNA为模板合成DNA;以RNA为模板合成蛋白质,体现生物性状;以RNA为模板复制RNA(如某些只有RNA的病毒)01级分子生物学期末考试题目 第一题是选真核生物启动子还包括什么,选的是上游元件真核

18、生物启动子:I类启动子:核心元件(core element),转录必不可少 上游控制元件(upstream control element, UCE),高效转录所需 核心元件与上游控制元件之间的距离很重要II类启动子:前三类是核心启动子(core promoter)的元件 TATA区(TATA box) 起始子(initiator) 下游元件(downstream element) 上游元件(upstream element)III类启动子:内位于基因部位于基因外部,类似RNA聚合酶II识别的启动子(含TATA box) 最后一题就是那个真核生物线粒体的大小:选160kb还有:问tbp在那类酶

19、含有,选择三个都有 问mRNA的剪切跟哪类内含子像,选第二类 问噬菌体通过什么转座整合到宿主中,选择位点专一重组;需要整合酶、宿主蛋白IHF. 问乳糖操纵子的真正诱导物是什么,选择异构乳糖 问色氨酸操纵子的弱化作用通过前导序列的什么进行的,选择翻译 第二遗传密码是什么 ,选氨酰tRNA上面的 UCE在哪类启动子中有,选择第一类; 判断:RNA编辑是通过dsRNA引导 错 RNA干涉是通过gRNA引导 错 反式剪接在所有生物中都有 错选择和判断的补充:1. 动物线粒体的基因大小 十几kb2. 一个基因是否可以由多个启动子 可以吧3. 锌指4. split gene5. TBP在哪类转录酶中含有6

20、. 乳糖操纵子真正的诱导物7. 色氨酸操纵子的弱化作用是通过前导序列的( )进行操控的8. 原核生物全酶不需要哪个因子9. 真核生物的转录因子包括通用转录因子和(基因特性性转录因子)第二遗传密码;上游元件;上游控制元件;帽子的功能;位点专一重组;反式剪接;G蛋白;帽子的功能: a) 保护mRNA:一般的RNase不能切割含有3个磷酸基的帽子b) 提高翻译能力(效率):通过与帽子结合蛋白结合,mRNA能更好地进入核糖体c) 有利于mRNA在细胞内的运输(运出细胞核):若没有帽子,则mRNA基本上留在细胞核d) 使mRNA前体的能正确剪接:第一个内含子的剪接所需00级大题真核与原核基因组的比较真核

21、mRNA转录后的加工有哪些?真核与原核转录起始的比较对基因组的认识1、原核基因组和真核基因组在非编码序列方面的区别答:类核基因组 环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的DNA序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列 “streamlined”核基因组 多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)3、真核mRNA5帽子和3pol(A)的功能帽子功能: 保护mRNA:一般的RNase不能切割含有3个磷酸基的帽子 提高翻译能力(效率):通过与帽子结合蛋白结合,mRNA能更好地进入核糖体 有利于mRNA在细胞内的运输(运出细胞核)

22、:若没有帽子,则mRNA基本上留在细胞核 使mRNA前体的能正确剪接:第一个内含子的剪接所需聚腺苷酸化功能: 保护mRNA:延长其寿命(半衰期) 提高mRNA的翻译能力:能与poly(A)结合蛋白 poly(A) binding protein I 结合,促进翻译,促进mRNA与核糖体结合5、什么是选择性剪接及其生物学意义答:选择性剪接:一个基因转录出来的RNA前体,通过不同的剪接方式(选择不同的外显子)而形成不同的成熟mRNA,产生不同的蛋白质意义:通过选择性剪接,可对基因的表达起一定的调控作用,因此选择性剪接常用于在不同的组织或发育时期产生组织特异或调控发育的蛋白质;选择性剪接还可有重要的

23、生物学效应,如在果蝇的性决定体系中起重要的作用6.真核生物与原核生物翻译的异同答:起始的异同:相同点:都需要tRNA识别氨基酸并装载;都需要核糖体大小亚基解离;都需要起始因子;不同点:起始tRNA携带的氨基酸不同,原核是甲酰甲硫氨酸,而真核是甲硫氨酸;原核中甲酰甲硫氨酸识别的起始密码子有三种AUG/GUG/UUG,而甲硫氨酸只识别AUG;原核中需要SD序列帮助mRNA与小亚基结合,而真核没有SD序列,需要5端帽子引导两者结合;原核中不需要通过扫描寻找起始密码子,而真核中需要扫描寻找起始密码子;原核中起始因子比较简单,种类少,而真核中起始因子要复杂的多,种类也多;原核中起始的控制是通过mRNA二

24、级结构影响起始和反馈控制,而真核中通过起始因子磷酸化来控制。延伸过程:两者相似,都包括进位、转肽、移位,都需要延伸因子和GTP,只是延伸因子不同;终止过程也相似:都需要释放因子,2.基因组学的最新研究进展3.简述并举例生物信息学的研究方法答:生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头,找到基因组序列中代表蛋白质和RNA基因的编码区;同时,阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言规律;在此基础上,归纳、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据,从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。生物信息学还利用基因组中编码区的信息进行蛋白质空间结构的模

25、拟和蛋白质功能的预测,并将此类信息与生物体和生命过程的生理生化信息相结合,阐明其分子机理,最终进行蛋白质、核酸的分子设计、药物设计和个体化的医疗保健设计。首先,它需要一定的计算能力,包括相应的软、硬设备。要有各种数据库或者能与国际、国内的数据库系统进行有效的交流。要有发达、稳定的互联网络系统;同时,生物信息学需要强有力的创新算法和软件。没有算法创新,生物信息学就无法获得持续的发展。最后,它要与实验科学,特别是与自动化的大规模高通量的生物学研究方法与平台技术建立广泛、紧密的联系。这些技术,既是产生生物信息数据的主要方法,又是验证生物信息学研究结果的关键手段。4.RNAi的原理和应用答:原理:RN

26、A干扰( RNA interference, RNAi)是指双链RNA诱导同源mRNA 降解导致基因表达抑制的现象,又称基因沉默,是一种转录后基因沉默(post- transcriptional gene silencing, PTGS)现象,是生物体在进化过程中抵御病毒感染及防御重复序列和突变引起基因组不稳定的保护机制。RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。 其机制分两步:长双链被细胞源性的双链特异的核酸酶切成个碱基对的短双链,称为小干扰

27、性 小干扰性与细胞源性的某些酶和蛋白质形成复合体,称为诱导的沉默复合体,该复合体可识别与小干扰性有同源序列的,并在特异的位点将该切断。它的应用:1.RNAi在探索基因功能中的应用:由于RNAi技术可以利用siRNA或siRNA表达载体快速、经济、简便的以序列特异方式剔除目的基因表达,所以现在已经成为探索基因功能的重要研究手段。同时siRNA表达文库构建方法的建立,使得利用RNAi技术进行高通量筛选成为可能,对阐明信号转导通路、发现新的药物作用靶点有重要意义。2.RNAi在基因治疗领域中的应用:RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RN

28、Ai技术对HIV-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现,选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位点,可对部分有明确基因突变的恶性肿瘤细胞如含有BCL/ABL或AML1/MTG8融合基因的白血病细胞产生凋亡诱导作用。此外尚可通过使用肿瘤特异性启动子如hTERT启动子、survivin启动子或组织特异性启动子如酪氨酸酶启动子、骨钙素启动子引导针对某些癌基因或抗凋亡分子的siRNA或shRNA表达,从而达到特异性杀伤肿瘤细胞的目的。研究生的题 简述帽子结构和POLYA的功能 帽子的功能 保护mRNA:

29、一般的RNase不能切割含有3个磷酸基的帽子 提高翻译能力(效率):通过与帽子结合蛋白结合,mRNA能更好地进入核糖体 有利于mRNA在细胞内的运输(运出细胞核):若没有帽子,则mRNA基本上留在细胞核 使mRNA前体的能正确剪接:第一个内含子的剪接所需 poly(A)的功能 保护mRNA:延长其寿命(半衰期) 提高mRNA的翻译能力:能与poly(A)结合蛋白 poly(A) binding protein I 结合,促进翻译,促进mRNA与核糖体结合 近20年来,RNA研究领域有哪些重大进展=03=1。真核基因组与原核基因的特点,两者基因表达调控的异同?2。简述生物信息学的研究方法及内容?

30、3。简述对蛋白质组的认识?4。rna近30年的研究进展和大事?5。RNAi的认识?6。mRNA有帽子结构和polyA结果而rRNA和tRNA没有,why?(03级)06年1月7日期末考回忆:1. 乳糖操纵子诱导物:别构乳糖2. 哪一种rna含有较多内含子:MRNA3. mRNA的剪切跟哪类内含子像 第二类4. 噬菌体通过什么转座整合到宿主中, 位点专一重组5. ECU在哪类启动子中有, 第一类6. 真核生物的转录因子包括通用转录因子和(基因特异转录因子(激活子)7. 断裂基因是什么8. Holliday是哪个过程的中间物:同源重组9. 原核生物全酶不需要哪个因子10. 启动子和“增强子”是顺式转录因子11. G蛋白由gtp激活12. TATA盒存在于哪几类启动子13.Pribnow box是原核生物的(启动子)14. 原核生物RNA聚合酶在转录延伸时不需要的因子15. TBP结合蛋白在下列哪个启动子里面存在16. 乳糖操纵子与阻遏蛋白结合的物质是异乳糖。转录因子有两类通用转录因子(general transcription factors)基因特异转录因子(gene-specific trans

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