pubmed基于临床方法学的文献检索特点.docx

1、pubmed基于临床方法学的文献检索特点循证医学基于临床方法学(methodology-based retrieval)的文献检索特点中国医学科学院 中国协和医科大学 精品课程建设一、传统的基于内容的文献检索方法(content-based retrieval)医学信息最常用的是MEDLINE和EMBASE两大数据库，人们在使用这两个数据库时，通常是根据主题，也就是以内容为基础来进行检索，通过主题检索一般是输入药物、疾病、症状等，再用布尔逻辑算符将各个概念组配进行检索。人们在进行这些检索时，无法区分证据级别，从而检出大量不相关或低质量文献。以内容为基础的检索往往只能满足一般的检索需求(举例来说

2、，要求检索关于AIDS患者体内CD4+细胞数预测患者死亡率的文献，以内容为基础的检索较容易满足这一要求)，但难以解决有针对性的临床需求(如，检索有关CD4+细胞数目较低的AIDS患者开始Zidovudine与其它药物复合使用的高质量文献，此时以内容为基础的检索很难满足这一要求)。而事实上，只要我们掌握了临床试验的研究方法，有效地运用方法学检索词来控制检索策略，就可以走出过去那种泛泛的主题检索或内容检索模式，才能真正为循证医学提供准确、专指度高的临床证据。二、循证医学的基于临床方法学(methodology-based retrieval)的文献检索特点（一）检索过滤器检索过滤器用于滤过无效或不

3、适用信息，只保留有助于解决临床问题的信息。检索过滤器包括内置式检索过滤器和外置式检索过滤器，内置式检索过滤器有较稳定的用户友好检索界面，用户不需掌握复杂的检索策略，就可直接检索到所需的临床研究文献，但用户不能修改过滤器，如美国国立医学图书馆通过PubMed界面提供的“clinical query”检索策略模型。外置式检索过滤器较灵活，但对用户要求较高，用户需要自己制定具体的检索策略，选择相应的检索词作为过滤器。（二）PubMed(http:/pubmed.gov)的“clinical queries”的检索方法美国国立医学图书馆(National Library of Medicine，NLM

4、)通过PubMed的界面提供 “clinical queries”检索,这是专门为临床医生研究设计的内置的临床方法学“过滤器” （Clinical Methodology Filters），这组检索策略模型是由加拿大临床流行病学和生物统计学研究人员Haynes RB等人在1994年提出来的，并进行了查全率和查准率分析。用户通过这一临床方法学检索过滤器，不需掌握复杂的检索策略，即可检索所需的临床研究文献。检索方法是进入PubMed后，点击界面左边辅助检索区中的“Clinical Queries”超链接进入（见图1）。Clinical Queries可以实现两项功能：选择“Clinical Que

5、ries using Research Methodology Filters”，只需在检索框中输入某一疾病名称（如Hepatitis B），然后从“Category”中选择所要检索的临床研究类别，包括治疗（therapy）、诊断(diagnosis)、病因(etiology)和预后(prognosis)四方面，再根据需要选择保证查全率的检索（检出的文献量较多，但有些文献可能不相关）或保证查准率的检索（检出的文献量较少，但相关文献多，不过可能会有一些漏检文献），即从“Emphasis”中选择“sensitivity”(查全率)或“specificity”(查准率)。选择“systematic

6、Reviews”可检索临床研究的系统评价文献，这些文献中包括PubMed所收录的期刊上按Meta分析方法进行研究的系统评价文献，还包括Cochrane 协作网提供的部分系统评价的文摘。图1 PubMed的Clinical Queriesl界面（三）用基于临床方法学（clinical Methodology）的检索策略检索MEDLINE 和EMBASE 我们结合临床治疗、诊断、病因学、预后以及系统评价的关键方法学特点和关键评价指标来理解clinical queries中提供的检索策略，同时也是为推荐将这28组策略作为基本检索模板应用于MEDLINE的其它检索界面或EMBASE等其它数据库。下文均

7、以hepatitis 为例作为内容主题词，其后组配的方法学策略是相对稳定的。1 有关治疗方案的检索模式(1) 检索MEDLINE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略 (hepatitis ) AND (randomized controlled trial PTYP OR drug therapy SH OR therapeutic use SH:NOEXP OR random* WORD)保证较高查准率(specificity)的检索策略(hepatitis) AND (double WORD AND blind* WORD) OR placebo WORD)查全与查准均

8、衡时的检索策略hepatitis and randomized controlled trialPTYP(2) 检索EMBASE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略Shepatitis! And (randomized controlled trial or drug therapy or random?)保证较高查准率(specificity)的检索策略 S hepatitis! And (double(w)blind? Or placebo?) 查全与查准均衡时的检索策略Shepatitis! And controlled study!2 有关诊断方案的检索模式(1)

9、检索MEDLINE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略(hepatitis b) AND (sensitivity and specificity MESH OR sensitivity WORD OR (diagnosis SH OR diagnostic use SH OR specificity WORD)保证较高查准率(specificity)的检索策略(hepatitis b) AND (sensitivity and specificity MESH OR (predictive WORD AND value* WORD)查全与查准均衡时的检索策略hepatit

10、is and sensitivity(2)检索EMBASE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略 S hepatitis and diagnostic accuracy or sensitivity or specificity or diagnosis/de保证较高查准率(specificity)的检索策略Shepatitis and diagnostic accuracy or predictive(w)value?查全与查准均衡时的检索策略Shepatitis and sensitivity3 有关病因的检索模式(1) 检索MEDLINE数据库保证较高的查全率(sens

11、itivity)检索策略hepatitis AND (cohort studies MESH OR risk MESH OR (odds WORD AND ratio* WORD) OR (relative WORD AND risk WORD) OR (case control* WORD OR case-control studies MESH)保证较高查准率(specificity)的检索策略hepatitis AND (case-control studies MH:NOEXP OR cohort studies MH:NOEXP)查全与查准均衡时的检索策略hepatitis and

12、risktw(2)检索EMBASE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略 Shepatitis and cohort analysis or risk! Or odds(w)ratio? Or relative(w)risk or case(w) control?保证较高查准率(specificity)的检索策略 Shepatitis and case control study or cohort 查全与查准均衡时的检索策略Shepatitis and risk4 有关预后的检索模式(1) 检索MEDLINE数据库保证较高的查全率(sensitivity)检索策略hepat

13、itis AND (incidence MESH OR mortality MESH OR follow-up studies MESH OR mortality SH OR prognos* WORD OR predict* WORD OR course WORD)保证较高查准率(specificity)的检索策略hepatitisAND (prognosis MH:NOEXP OR survival analysis MH:NOEXP)查全与查准均衡时的检索策略hepatitis and prognosis(2)检索EMBASE数据库保证较高查全率的(sensitivity)检索策略She

14、patitis AND (incidence! OR mortality! OR prognos? ORcourse)保证较高查准率(specificity)的检索策略Shepatitis AND (prognosis OR survival! )查全与查准均衡时的检索策略Shepatitis AND prognosis5 有关系统评价和指南的检索模式(1) 检索MEDLINE数据库系统评价的检索策略hepatitis and (meta-analysisPTYP OR meta-analysismh)指南的检索策略hepatitis AND (GuidelinesMH OR consensu

15、s development conferencesMH) OR GuidelinePTYP OR consensus development conferencesPTYP)(2) 检索EMBASE数据库系统评价的检索策略hepatitis and meta-analysis指南的检索策略hepatitis and practice guideline! （四）用基于临床方法学（clinical Methodology）的检索策略检索中文生物医学文献数据库（CBMdisc）近年来，循证医学已成为国际临床医学界倡导的学科发展趋势,我国正逐步引入循证医学的思想、理念以及研究和实践方法。循证实践的一

16、个重要前提是要有充分的临床研究证据，尽管外文临床研究证据日益丰富，且可以通过许多便捷的检索途径获取，但由于人种因素、经济因素、地域因素等多种因素的影响，不是所有的外文证据都可直接用于中国人群，因而如何查找和获取适合于中国人群的国内临床研究证据成为国内循证实践面临的一个新问题。中国生物医学文献数据库 (CBMdisc)是目前国内临床界常用的一个综合型的生物医学文献数据库, 虽然CBMdisc 收录了自1978年至2003年以来1000多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录, 总计2,570,528条记录，但其中只有少量的文章可以作为直接指导临床实践的证据,那么，临床医生如何能省时省力

17、地检索和利用这些文章呢？由于CBMdisc数据库在其建立之初，循证医学的理念还没有引入我国，因而迄今为止，标引人员还没有对该库所收录的数据进行循证医学临床方法学的专门标引，即使是CBMdisc的主要参考模板MEDLINE 在建立之时也未考虑到对这些临床研究进行专门的标引，这就会影响循证信息的查全和全准，再加上临床终端用户在利用CBMdisc寻找临床问题的答案时，对检索方法的不正确使用，就进一步造成极低的查全率和查准率。为此,我们结合循证医学临床研究方法学和CBMdisc数据库的特点，收集了临床方法学检索词，研究开发制定了针对临床治疗、诊断、病因、预后四个方面的检索策略，利用这些检索策略检索临床研究证据将会获得较好的查全率与查准率。表2收集的检索词列表表3适用于CBMdisc的最佳循证医学文献检索策略列表