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生物学中的计算.docx

1、生物学中的计算生物学中的计算【重点知识联系与剖析】 一、光合作用和呼吸作用中的计算 有关光合作用和呼吸作用的计算,主要是利用光合作用和呼吸作用的反应方程式,根据原料与产物之间的关系进行简单的化学计算,这类题目的难度不大。 如果将光合作用和呼吸作用结合起来设计计算题,题目的难度就大大增加了。正确理解净光合作用、总光合作用和呼吸消耗之间的关系是解题的关键。在关于呼吸作用的计算中,在氧气充足的条件下,完全进行有氧呼吸,在绝对无氧的条件下,只能进行无氧呼吸。设计在这两种极端条件下进行的有关呼吸作用的计算,是比较简单的。但如果在低氧条件下,既进行有氧呼吸又进行无氧呼吸,设计的计算题就复杂多了,解题时必须

2、在呼吸作用释放出的CO2中,根据题意确定有多少是无氧呼吸释放的,有多少是有氧呼吸释放的。如本专题例题1。呼吸作用的底物一般是葡萄糖,以葡萄糖作为底物进行有氧呼吸时,吸收的O2和释放的CO2的量是相等的,但如以其他有机物作为呼吸底物时,吸收的O2和释放的CO2就不一定相等了,在计算时一定要写出正确反应方程式,并且要正确配平后才进行相关的计算。 二、核酸、蛋白质及基因控制蛋白质合成中的计算 1核酸 核酸有两种:DNA和RNA。有关核酸中的计算主要是碱基比例的计算和DNA复制过程中新旧链比例关系的计算。设计题目的理论根据是碱基互补配对原则和DNA的半保留复制。DNA是双螺旋结构,两条链之间的碱基是按

3、照碱基互补配对原则相互配对的,所以计算双链DNA分子中的碱基比例时,必须严格按照碱基互补配对原则进行计算。在双链DNA分子及转录成RNA分子中,各种碱基及其它们之间的比例关系见表。 双链DNA分子及转录成RNA分子中碱基比例的各种关系双链DNA分子DNA分子的a条链DNA分子的b条链如以DNA分子a链为模板转录成的mRNAA=TATATAUG=CGCGCGC=k(k1)=k(k1)=k(k1)=k=1=a(a1)= (a1)= 理解和掌握表中的内容对正确解答碱基比例计算这类题目是必须的。 DNA复制过程中新旧链的比例计算题是根据DNA分子半留复制的特点进行设计的。即一个新的DNA分子中总有一条

4、链是旧的(即亲代DNA分子的),另一条链是新的(即以旧链为模板合成的)。一个DNA分子连续复制n次后,第一代DNA分子的两条链彼此分开后一直保留下去,即在所有的子代DNA分子中,总有两个DNA分子中各含一条第一代DNA分子中的一条链。如果第一代DNA分子用15N标记,则复制n次后,含有15N标记的DNA分子占所有子代DNA分子的比例为。理解了这个算式后,对解这类题目就不难了。 2蛋白质 有关蛋白质中的计算,主要有两个方面:肽链中氨基酸数目、肽链数目和肽链数目之间的关系和氨基酸的平均分子量与蛋白质的分子量之间的关系。详见本专题例题3和4。 3基因控制蛋白质的生物合成 基因控制蛋白质生物合成中的计

5、算主要是根据中心法则和mRNA上3个碱基决定一个氨基酸的原则来设计题目和进行相关的计算。假定蛋白质中有n个氨基酸,则基因中的碱基数目、mRNA中的碱基数目和蛋白质中氨基酸数目之间的关系见表13-2。也可以与蛋白质中的相关计算联系起来命题。基因中的碱基数目mRNA中的碱基数目蛋白质中的氨基酸数目6n3nN 三、遗传概率的计算正确理解基因分离规律的各种比例关系,是正确解答遗传概率计算题的关键。基因的分离规律发生在减数分裂的第一次分裂同源染色体彼此分开时,同源染色体上的等位基因也彼此分开,分别分配到两个子细胞中去的遗传行为。对于基因分离的学习重点要掌握和理解其中的比例关系。下面举一个例子加以说明:豌

6、豆的高茎对矮茎是显性,现将纯合的高茎豌豆和矮茎豌豆杂交,得F1全是高茎;F1的高茎豌豆自变得F2。其遗传过程如图8-1所示。其中F2的基因型和表现型的比例必须熟记,并且要理解在F2的高茎豌豆中的纯合体 DD占13和杂合体 Dd占 23的比例关系。这个比例关系在解遗传题时是非常重要的。F2中的高茎豌豆自交后代和随机亲配后代的基因型和表现型的比例是不一样的。自交的概念是指基因型相同的个体之间相交,杂交一般是指基因型不同的个体之间相交。如果F2的高茎豌豆自交,后代表现型和基因型的比例计算方法见表。F2高茎中的基因型DD(1/3)Dd(2/3)自交后代的基因型及比例DDDD(1/4)Dd(2/4)Dd

7、(1/4)各自自交后代的表现型及比例高茎高茎高茎矮茎在F3代中的例1/31/42/32/42/31/42/3归类后F3代中的基因型的比例DD:1/2Dd:1/3Dd:1/6归类后F3代中的表现型的比例高茎:5/6矮茎:1/6表中的表现型和基因型的比例关系在解有关人类遗传病系谱的遗传题中得到广泛的应用,详见例题解析。如果F2代的高茎豌豆之间随机交配,就会有4种交配方式如图82。计算随机交配后代的基因型和表现型及其比例的常规方法如表8-2。交配方式基因型表现型DD(1/3)DD(1/3)DD(1/9)高茎(1/9)DD(1/3)Dd(2/3)DD(1/9)、Dd(1/9)高茎(2/9)Dd(2/3

8、)DD(1/3)DD(1/9)、Dd(1/9)高茎(2/9)Dd(2/3)Dd(2/3)DD(1/9)、Dd(2/9)、dd(1/9)高茎(3/9)、矮茎(1/9)后代基因型和表现型合计DD(4/9)、Dd(4/9)、dd(1/9)高茎(8/9)、矮茎(1/9) 随机交配用上述方法计算比较烦,如果用基因频率的方法计算就简单多了。在F1的高茎豌豆中,基因型DD占13,Dd占23,所以在群体中产生的雌配子有两种D和d,其中D配子的比例为23,d配子的比例为13;雄配子中D基因的配子比例为2/3,d基因的配子比例为1/3。雌雄配子结合是随机的,可以用一个简单的二项式表示即可,即(D+d)(D+d),

9、展开后三种基因型所占比例为:DD=8/9,Dd=4/9,dd=1/9;表现型的比例为:高茎(Dd.Dd)为,矮茎(dd)为1/9。所以自交和随机交配是两个不同的概念。在自然界中的某一生物群体中,种群中每个个体所含有的基因只是种群基因库中的一个组成部分。不同基因在种群基因库所占的比例是不同的。某种基因在某个种群中出现的比例,叫做基因频率。基因频率可通过抽样调节的方法获得。如从某个处于遗传平衡状态的种群中随机抽出100个个体,测知基因型AA、Aa和aa的个体分别为49,42和9个。就一对等位基因来说,每个个体可以看作含有2个基因。那这100个个体共有200个基因,其中A基因有249+42=140个

10、,a基因有29+4260个。按基因频率的计算方法,可确定在这个种群中,A基因的基因频率为70,a基因的频率为30。如完全随机交配,3种基因型的频率和基因频率不发生变化。在自然界中,一个完全处于遗传平衡状态的种群几乎是不存在的。因为遗传平衡必须符合下列条件:没有基因突变;没有选择压力(生态条件适宜,空间和食物不受限制);种群要足够大;完全随机交配等。这些条件是非常苛刻的,即使在实验条件下也无法满足。当选择对基因发生作用时,基因频率就开始发生变化,从而导致生物的进化。如在上述例子中,假如aa的个体生存能力相对较差,只有约45的个体能够较好地生存并繁殖后代,则参与繁殖的基因频率已发生变化。即在100

11、个个体中,基因型aa的个体只有约4个个体能够参与繁殖后代,即在100个个体中实际参与繁殖后代个体数只有95个,49个AA42个Aa和4个aa。那么参与繁殖后代的基因频率为:A基因频率为(249+42)/190=7368%。a基因频率为:(24+42)/1902632。假定交配仍然是随机的,其后代基因型的频率为:AA为5429,Aa为3879,aa为692。由此可见后代基因型的频率已发生变化,aa基因型的频率在下降。如果这种定向选择一直保持下去,基因型a的个体将逐渐被淘汰,在该种群的基因库中aa基因的基因频率将逐渐减少。生物也就发生了定向的进化。 四、细胞分裂中的计算 有丝分裂和减数分裂过程中,

12、各时期染色体数量变化和DNA含量的变化规律是设计细胞分裂中相关计算题的基础,理解和掌握其变化规律是正确解答这类计算题的关键。表13-3是有丝分裂过程中各时期染色体数目和DNA含量的数量关系。表13-4是减数分裂过程中各时期染色体数目和DNA含量的变化关系。表 13-3有丝分裂时期间期分裂期子细胞前期中期后期末期染色体数目2N2N2N4N4N2N同源染色体对数NNN2N2NN染色单体数0或4N4N4N000DNA含量2a4a4a4a4a4a2a表 13-4减数分裂时期间期第一次分裂第二次分裂生殖细胞前期中期后期前期中期后期染色体数目2N2N2N2NNN2NN同源染色体对数NNNN0000染色单体

13、数0或4N4N4N4N2N2N00四分体数目0NN00000DNA含量2a4a4a4a4a2a2a2aa 五、生态学中有关食物链、物质循环和能量流动中的计算设计生态学中计算题的理论基础是能量沿食物传递的效率,即1020的平均传递效率是相关计算题运用的基本数据。对1020%的平均传递效率的正确理解,是一个营养级中的能量只有1020的能量被下一个营养级所同化,其余的8090的能量流向包括两个部分:该营养级生物本身的呼吸消耗和该营养级生物的排泄物、残落物和死亡后的尸体被分解者利用。在设计这种类型的题目还可以与光合作用和呼吸作用中的相关计算结合起来综合命题。如本专题的例题8和例题9。【经典例题解析】例

14、题1 图13-1表示某种植物的非绿色器官在不同氧浓度下O2吸收量和CO2释放量的变化。请据图回答:图13-1(1)外界氧浓度在10以下时,该器官的呼吸作用方式是_。(2)该器官的CO2释放与O2的吸收两条曲线在P点相交后则重合为一条线,此时该器官的呼吸作用方式是_,进行此种呼吸方式所用的底物是_。(3)当外氧浓度为45时,该器官CO2释放量的相对值为06,而O2吸收量的相对值为04。此时,无氧呼吸消耗葡萄糖的相对值约相当于有氧呼吸的_倍,释放的能量约相当于有氧呼吸的_倍,转移到ATP的能量约相当于有氧呼吸的_倍。 解析 根据图13-1所示曲线,在氧浓度大于10时,O2的吸收量与CO2的释放量相

15、等,说明该非绿色组织此时进行的是有氧呼吸,呼吸底物主要是葡萄糖。在氧浓度小于10时,CO2的释放量大于氧气的吸收量,说明有一部分CO2是通过无氧呼吸释放出来的,所以在氧浓度小于10时就是无氧呼吸和有氧呼吸并存。第(3)小题的计算方法是:在外界氧浓度为45时,O2的吸收量相对值为0.4,则通过有氧呼吸释放的CO2的相对值也应为0.4,有氧呼吸分解1mol葡萄糖释放6molCO2,所以通过有氧呼吸消耗葡萄糖的相对值应为0.46。无氧呼吸释放的CO2的相对值为0.6-0.40.2,按题意该非绿色组织无氧呼吸产物是酒精和CO2,分解1mol葡萄糖释放2molCO2,所以通过无氧呼吸消耗的葡萄糖的相对值

16、为0.22。由此可知,无氧呼吸消耗的葡萄糖约相当于有氧呼吸的倍数是:(022)(0.46)15。释放的能量无氧呼吸约相当于有氧呼吸的倍数是:(022)19665(046)287001027。无氧呼吸转移到ATP中的能量约相当于有氧呼吸的倍数是:(022)6108(046)1255=0073。答案 (1)有氧呼吸和无氧呼吸 (2)有氧呼吸 葡萄糖 (3)15 01 007例题2 有一位科学家做了这样一个实验,将10g叶肉细胞中的叶绿体和线粒体分离开来,在离体条件下分别测定其光合作用中CO2的吸收量和呼吸作用中CO2的释放量,图13-2A曲线表示:分别在15和30条件下,测定叶绿体在不同光照和不同

17、温度条件下每小时CO2的吸收量;图13-2B曲线表示:在不同温度条件下测得的线粒体呼吸作用每小时CO2的释放量。请仔细分析后回答下列问题:图13-2(1)在温度为30,光照为8000勒克斯的条件下,离体叶绿体的光合作用强度为_gh/10g;在温度为15,光照为8000勒克斯时,离体叶绿体的光合作用强度为_g/h/10g。在光照强度相同,温度不同的的条件下,光合作用强度不同,是因为受光合作用的_过程的限制。(2)离体线粒体在温度为 15和30时的呼吸作用强度分别为_gh/10g和_gh/10g。(3)假定离体叶绿体和线粒体与在叶肉细胞内的生理活性基本一致,在30条件下的叶肉细胞内既不吸收CO2也

18、不释放CO2的光照强度为_勒克斯,此时光合作用正好补偿呼吸作用的消耗,呼吸作用所释放出的CO2正好用于_。(4)假定离体叶绿体和线粒体与在叶肉细胞内的生理活性基本一致,在温度为30,光照强度为8000勒克斯时,光照10h,然后转入无光条件下,温度也为30时,10克叶肉组织一昼夜能积累葡萄糖_g。如果黑暗条件下的温度平均为15,则10克叶肉组织积累葡萄糖_g。(5)根据第(4)小题计算的结果,解释种在新疆吐鲁番的哈密瓜比种在江苏的品质要好的原因是_。解析 解这一类题目首先要读懂曲线,按题目的条件,由于上述数据是在叶绿体和线粒体离休的条件下测得的,光合作用和呼吸作用都是在独立的条件下进行。这与对整

19、体叶片或植株的测量不同,对整体植株测得的吸收CO2或释放出O2的数据反应的是净光合作用速率,而真正的(或总的)光合作用速率还应该加上这段时间中的呼吸消耗。本题目所设条件叶绿体与线粒体已分离,在测定叶绿体的光合作用时不存在呼吸作用的影响。所以光合作用和呼吸作用速率(或强度)只要直接读取曲线中的有关数据就可以了。第(3)小题所设条件是叶肉细胞,内有叶绿体和线粒体,在光下既进行光合作用又进行呼吸作用,光合作用释放的O2有一部分被呼吸作用消耗掉,呼吸作用释放的CO2被光合作用吸收掉。当光合作用吸收的CO2与呼吸作用释放的CO2量相等时的光照强度称为光补偿点。在图B曲线中查出在30时每小时产生CO2量为

20、15g,在图B中查出在30时的每小时吸收CO215g时的光照强度为1500勒克斯。第(4)小题,先算出10g叶内组织在30、8000勒克斯光照条件下光合作用10h总共吸收 CO2的量为810=80g,在此期间10g叶肉组织的呼吸作用消耗为1.5g10=15g,由此计算出在此条件下10h的净光合作用为80g-15g65g。一昼夜余下的14h是在无光条件下,此时只进行呼吸作用而不进行光合作用,在30t条件下14h的呼吸作用消耗为 15g14=21g。所以一昼夜积累有机物=30(g) ;在15条件下14h的呼吸作用消耗为0.75g14=115g,一昼夜积累有机物为=36.5(g)。第5 小题主要是考

21、虑光照和温度对光合作用和呼吸作用的影响。答案 (1)8 4 暗反应 (2)075 15 (3)1500 光合作用 (4)30 365(5)吐鲁番地区属于高纬度地区,日照时间比江苏长,光合作用时间长;吐鲁番地区属于沙漠性气候,日夜温差大,有利有机物质的积累。例题3 称取某多肽415g,在小肠液的作用下完全水解得到氨基酸505g。经分析知道组成此多肽的氨基酸平均相对分子质量为100,此多肽由甘氨酸、丙氨酸、半胱氨酸3种氨基酸组成,每摩尔此多肽含有S元素51mol。3种氨基酸的分子结构式如下:(1)小肠液为多肽的水解提供的物质是_。(2)组成一分子的此多肽需氨基酸个数为_。(3)此多肽分子中3种氨基

22、酸的数量比为_。(4)控制此多肽合成的基因片段至少有脱氧核苷酸个数为_。(5)此多肽415g,用硫酸把它分解成氨盐后,加过量的碱中和,能够蒸出氨_。(6)60g甘氨酸和500mL2molL-1的氢氧化钠充分反应,能够生成甘氨酸的钠盐为_。 解析 第(2)小题由题意可知,415g此多肽完全水解需要水505g-415g=90g,即形成415g此种多肽需要脱去90g水。415g此多肽形成时,需要氨基酸505100505(mol),脱水90185(mol),所以在形成此多肽时需要的氨基酸摩尔数与合成时脱去的水分子摩尔数之比为:5055=1.01。设该肽链上的氨基酸残基数目为n,则该肽链上的氨基酸残基数

23、目与在形成该肽链时脱去的水分子数之比:n(n-1)。得n(n-1)=101,解此方程得n=101。所以此多肽为101肽。第(3)小题由题意知每一分子此多肽含半胱氨酸51个,设一分子此多肽中甘氨酸x个,则一分子此多肽含丙氨酸(50-x)。依据多肽的分子量列出方程:10110051121+79(50-x)+75x,解此方程得x5。所以甘氨酸:丙氨酸:半胱氨酸=54551。第(4)小题中由mRNA翻译成蛋白质时,是3个碱基决定一个氨基酸,基因转录成mRNA时是以其中的一条链为模板转录的,而基因中有两条链,所以指导合成多肽的基因中的脱氧核苦酸数为多肽中的氨基酸总数乘6。第(5)小题由于此多肽中的3种氨

24、基酸中均只有一个氨基,415g此多肽中合氨基酸的摩尔数为505,所以含 N总量为505mol。由于碱过量,N全部转化为NH3,所以产氨量为:505mol1786g。第(6)小题中,由甘氨酸和NaOH的反应式:NH2CH2COOH+NaOHNH2CH2COONa+H2O,可知碱过量。能够生成的甘氨酸的钠盐为:976075=776(g)。答案 (1)肽酶 (2)101肽 (3)甘氨酸:丙氨酸:半胱氨酸=54551 (4)606(5)约86g (6)776g 例题4 已知某蛋白质分子由2条多肽链组成,在合成该蛋白质的过程中生成了3010-21g的水。问指导合成该蛋白质的基因中至少有碱基多少个(写出计

25、算过程)? 解析 先求水的物质的量 求出水的分子个数,设为n,则10-216.0231023=100个;求出该蛋白质中氨基酸的数目,设为y,则y=1002=102个; 求基因中的碱基数目,设为x,x=10232=612个答案 612个。计算过程见解析。 例题5 某DNA分子片段中,胞嘧啶有240个,占全部碱基的30,问在这片段中,腺瞟吟有( ) A.240 B.48 C.800 D.160 解析 题中所给条件是胞嘧啶240个,占全部碱基的30,而要求求的是腺嘌呤的数量,所以首先要求出这个DNA分子中的碱基总数。碱基总数=24030=800个。DNA分子是双链的是,根据碱基互补配对原则,A=T,

26、G=C,由此可知G+C=240+240=480个,则A+T=800-(C+C)800-480=320,因AT,所以A=160。正确解答这道题的关键是要正确运用碱基互补配对原则。答案 D 例题6 假设有一段mRNA上有60个碱基,其中A有15个,G有25个,那么转录该mRNA的DNA分子区段中,C和T的个数共有( ) A15个 B25个 C40个 D60个 解析 mRNA上有60个碱基,则转录成该mRNA的DNA中应有120个碱基。DNA是双螺旋结构,分子中有两条链。按照碱基互补配对原则,AT,G=C,则在双链 DNA分子中,A+C= C+T。所以C+T=60。这道题有一个陷附,即mRNA的60

27、个碱基中,有15个A,25个G,如果把注意力集中在这两个数据上,将无法得到一个确定的答案。答案 D 例题7 假如一个DNA分子含有1000个碱基对,将这个DNA分子放在用32P标记的脱氧核苷酸的培养液中让其复制一次,则新形成的DNA分子的分子量比原来增加了( ) A1000 B2000 C500 D无法确定 解析 在自然界中,磷元素主要是以31P状态存在,31P的原子核中有15个质子和16个中子,原子质量是31,按题意亲代DNA分子中的P是31P。32P的原子核中有15个质子和17个中子,原子质量是32,32P的原子质量比31P大1。DNA复制是半保留复制,亲代DNA分子放在含有32P的培养基

28、中培养,复制一次,子代DNA分子中一条链上含31P,另一条链中含32P。由于亲代DNA分子有1000个碱基对,单链为1000个碱基,分别以这两条单链为模板合成的子代DNA分子中,每条单链也是1000个碱。脱氧核甘酸是由一分子磷酸,一分子脱氧核糖和一分子含氮碱基组成。所以子代DNA分子中一条链上有1000个31P,另一条链上有100032P;亲代DNA分子中两条链是均是31P,所以子代DNA分子的分子量比亲代DNA分子增加了1000。答案 A 例题8 某生态系统森林现存量为35kgm2,纯生产量是 5460kJm2a,呼吸量占总生产量的45,问总生产量是多少kJm2a。( ) A.191100

29、B.5495 C.9927 D.19110 E.12211 解析 本题考查的是生态系统的纯生产量、总生产量和呼吸量之间的关系。总生产量=纯生产量+呼吸量,年总生产量与生物的现存量之间没有联系。设总生产量为X,则X5460kJ/ma+X45。解得X9927kJm2a。答案 C 例题9 在“棉花棉芽食蚜蝇瓢虫麻雀鹰”这条食物链中,如果一只食蚜蝇要有5m2生活范围才能满足自身的能量需求,则一只鹰的生活范围至少是( ) A.5103m2 B.5104m2 C.53m2 D.54m2 解析 按题意分析获取能量的多少与生活范围成正比,生活范围越大,获取的能量就越多。一只鹰的生活范围至少需要多少,就按能量传递效率最高值来计要。按题中提供的食物链来看,食蚜蝇处在第三营养级,鹰处在第六营养级,它们相差3个营养级,所以一只鹰的生活范围至少是5m2202020=54m2。答案 D例题10 SO2是引起大气污染的主要有害气体之一

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