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铁细菌.docx

1、铁细菌铁细菌的快速检测试剂瓶的研制1前言铁细菌在含铁的淡水中分布广泛,好气,嗜中性环境。由于它能氧化溶解于水中的氢氧化亚铁,碳酸铁成高铁形式沉积下来,起到浓缩和积累环境中铁的作用,是天然褐铁矿的参与者。另外,由于这类菌能使水中亚铁化合物氧化成红棕色粘性物(Fe2O3xH2O),从而在铁管中形成软泥它也是危害水系统最重要的微生物之一1,2。在工业用水中,如果铁细菌大量滋生,将产生大量覆盖在金属表面上的氢氧化铁鞘层。这不仅降低了热传导效率,而且会造成金属管道的管径缩小或堵塞,降低水流量,使水质变差,同时造成电腐蚀并为硫酸盐还原菌提供极为有利的生长条件。因此铁细菌是循环冷却水中的一种必检菌3。在油田

2、注水开发中,由于其注水的温度和环境均适合铁细菌的生长繁殖。而该菌类的大量生长和繁殖又会造成注水管线、注水设备的腐蚀及堵塞。同时腐蚀产物、菌体及其代谢产物还会堵塞地层、降低地层渗透率、增加注水压力,对油田开发极为不利世界上许多产油国都投入了相当的资金和技术 ,致力于铁细菌的研究。目前,铁细菌的快速检测方法包括:测试瓶绝迹稀释法,镜检法,MPN法,荧光检测法等。其中,测试瓶绝迹稀释法是目前国内外最为常用的测定方法。铁细菌的检测方法通常是采用中石化总公司生产部、发展部编制的冷却水分析和试验方法中的208与GB/T 14643.693。两法大同小异,均是采用试管稀释法,操作繁琐、费时4,5,6。因此,

3、如何快速准确地测定出铁细菌含量,以便适时采取措施,有效地控制其生长和繁殖、避免或减少铁细菌的危害,对油田生产具有非常重要的现实意义。1.1 铁细菌作用的机理铁细菌是一种好气异养菌,在含气量小于0.5 mg/L 的系统中也能生长。铁细菌的生长需要铁。但对铁浓度的要求并不高和苛刻 ,在生长需要铁 ,但对铁浓度的要求并不高和苛刻 ,该菌以有机物为营养源 ,其生长需要有机物 ,偏爱铁与锰的有机化合物. 这类有机物被利用后 ,铁和锰被作为废物排出 ,附着于细菌的丝状体上. 铁细菌是好氧菌 ,在静止水中 ,完全缺铁的深层是很难生长和繁殖的,在流动的水中有一定的溶解氧 ,铁细菌仍能生长。凡是具有以下生理特征

4、的为典型的铁细菌 , 即:能在氧化亚铁成高价化合物中起催化作用;可以利用铁氧化中释放出来的能量满足其生命的需要;能大量分泌氢氧化铁成基定形结构. 铁细菌偏好铁质较多的酸环境 ,以碳酸盐为碳源: 4FeCO3 +O2 +6H2O4Fe(OH)3 +4CO2 +能量7,反应产生能量和高铁维持其能量代谢. 不溶性,Fe(OH)3经菌体排出后,形成大量棕色粘泥.铁细菌在酸性环境中对其发育有利 碱性水中不适宜铁细菌生长,其适宜的pH值为68,所需温度偏低,最适菌生长,其适宜的pH值为68。1.2 铁细菌的快速检测方法1.2.1 测试瓶绝迹稀释法 目前,测定水中铁细菌含量的方法有很多种,其中,测试瓶绝迹稀

5、释法是目前国内外最为常用的测定方法。它被认为是目前测定方法中既简单方便又比较准确可靠的方法8,9。其原理是将欲测定的水样用一次性使用无菌注射器逐级注入到测试瓶中进行接种稀释,放入恒温培养箱中培养。根据细菌瓶阳性反应和稀释的倍数,计算水样中细菌的数目。具体做法是将欲测定的水样用一次性使用无菌注射器逐级注入到测试瓶中进行接种稀释后,将其放入恒温培养箱中,培养温度控制在现场水温的5,铁细菌培养7d后读数。如果铁细菌测试瓶中液体出现棕红色沉淀,即表示有铁细菌。其菌量依据中国石油天然气总公司行业标准SY/T532994计量10,11。1.2.2 培养-镜检法 其基本原理为将经过短期培养的铁细菌进行染色,

6、并依据其在生物显微镜下的特定形状、形态即可进行快速测定。铁细菌呈螺旋杆状、球状或杆状到椭圆状。待测水样中的铁细菌在测试瓶中经短期培养后,铁细菌的数量会大大增加。这时即可取出测试瓶中的培养液进行简单的染色镜检观察,而勿需等待培养液出现棕红色沉淀,从而可达到快速准确测定铁细菌量的目的。根据上述培养镜检法的基本原理,在大量试验研究工作的基础上,选择了草酸铵结晶紫作为铁细菌的染色剂,培养温度控制在现场水温5内,测定铁细菌所需时间仅为1天12,13。1.2.3 荧光原位杂交法 荧光原位杂交技术( fluorescencein situhybridization,FISH)的原理是根据已知微生物不同分类级

7、别上种群特异的DNA或RNA分子序列,利用荧光标记的特异寡核普酸片段作为探针,依据碱基互补原理,与待测微生物基因组中DNA或RNA分子杂交,在一定激发波长的荧光显微镜下观察,对待测微生物种群进行定性、相对定量分析。荧光原位杂交技术作为一种在医学方面已经较为成熟的技术已经越来越多的应用到了环境微生物学当中。荧光原位杂交技术不依赖于对铁细菌微生物进行培养,而直接以铁细菌rRNA中高度保守、具有物种特异性的片断序列作为鉴别的标志14。设计和选择特异性探针以及荧光标记物质,通过探针与目标铁细菌的rRNA特异性片断进行杂交反应使目标铁细菌特异性地带有荧光标记。利用显微观察和计数技术,快速、直观、准确地检

8、测目标铁细菌在水样中的存在、数量和分布.利用多种特异性探针来解析环境样品中铁细菌的群落结构和生物多样性。了解环境中优势铁细菌的种类、数量和分布,从而可以根据对优势铁细菌的种群的作用来促进、抑制和调控环境中其他微生物群落,达到指导生产的目的15。目前,清华大学吴晓磊、屈睿、晏芸几人发明了涉及铁氧化细菌(Iron bacteria, IB)检测的组合基因探针及其检测方法。该组合基因探针由IB中的个基因序列的两种或两种以上组合而成,该检测方法为取水样品,用异多醛溶液固定该水样品中的微生物细胞;滴入载玻片中,进行干燥、脱水后加入所述的组合基因探针溶液,再加入Nacl和甲酰胺的杂交溶液;杂交后,用磷酸盐

9、缓冲溶液清洗该载玻片上的探针溶液,再用蒸馏水清洗该载玻片上水样品,后干燥;用荧光显微镜观察该载玻片上微生物样品,对其中带有荧光的IB细胞进行计数。本发明能够对油田回注水中IB快速、全面、精确、便捷地检测,可以实现对采油过程及时、准确的调控。1.2.4 MPN法 1915年,McCrady首次发表了用MPN法(最大可能数法)来估算细菌浓度的方法,这是一种应用概率理论来估算细菌浓度的方法16。目前,我国仍普遍将MPN法用于大肠菌群,大肠杆菌等微生物的检测,该法对实验室的微生物检测及食品工业和环境微生物的控制都有着重要的指导作用。我们也常用MPN法对工业循环水,原水、生活用水及粘泥中铁细菌铁细菌的测

10、定。首先用生理盐水将检样进行10的系列稀释,选择3个连续稀释度,每个稀释度各接种到3支装有柠檬酸铁铵固体培养基的试管中。根据初次培养结果,将阳性管在铁细菌的柠檬酸铁铵的固体培养基上选择性平板分离,选择培养基上的铁细菌菌群典型菌落(黄色或红色菌落)进行确证试验,由阳性管数查MPN检索表,得到MPN值17。1.3 铁细菌的处理本文前面已经介绍了铁细菌快速检测方法(测试瓶绝迹稀释法、镜检法、荧光原位杂交法、MPN法),在生产实践中,我们应该根据实际情况从中选择一种最适合的方法来快速检测铁细菌从而对其采取相应的措施。控制铁细菌生长最常用的方法是投加杀菌剂。细菌的生命力极强,长时间使用任何一种杀菌剂都会

11、使细菌产生抗药性,引起杀菌剂的杀菌效率下降、药量增加等问题。因此,杀菌剂首要的性能是应具有良好的杀生性能。此外,良好的杀菌剂还应有以下特征:广谱性、剥离黏泥和藻层的能力、不污染环境、抗氧化性、与其他水质稳定剂的相容性和较宽的pH适应范围。按药剂杀生机制,杀菌剂可分为两类:即氧化性杀菌剂(如Cl2、ClO2、漂粉精、过氧化物等)和非氧化性杀菌剂(如季铵盐等) 18,19,20。杀菌剂的作用机理主要有以下四类:阻碍菌体的呼吸作用;抑制蛋白质合成;破坏细胞壁;阻碍核酸的合成。杀菌剂种类很多。杀菌机理也各不相同,但凡具备以上条件之一者,均能使细菌被抑制或致死。目前,国内油田回注水杀菌处理方法主要有投加

12、次氯酸钠、二氧化氯、氯气、以及电磁杀菌、紫外线杀菌等。国内还有利用各类杀生剂及活性酶之间的协同作用复配而成非氧化性杀生剂,如有机硫类化合物活性酶与季铵盐等复配,用于工业循环冷却水的杀菌灭藻,粘泥剥离等均有显著的效果,是新一代的非氧化性的杀生剂。这些不同的杀菌工艺与技术应用于不同的杀菌领域,都有一定的适应性、针对性和局限性21,22。尽管国内一些主要的研究油田注水杀菌剂的机构对新型杀菌剂进行了进一步的研究与开发,但面对油田水复杂的处理环境,这方面的研究还没有大的突破。因此,面对油田注水规模的扩大,对于杀菌剂今后的发展,应有更多的高等院校和科研院所联合参与,在对铁细菌的快速检测方法进一步探索的基础

13、上,加强基础理论的研究,从而提出更新更适用的杀菌抑菌措施,这对于油田生产、工业生产以及人类日常生活都具有重要的现实意义23。1.4 研究内容及展望以上分别简单的介绍四种快速检测铁细菌的方法中,测试瓶绝迹稀释法由于其测定铁细菌需要七天,所需时间太长,在实际油田生产中往往不可取。培养-镜检法由于在操作过程需要用到生物显微镜等各种特殊的生物器材也往往不实际。荧光原位杂交技术常常因为其在样品处理以及杂交过程中的多种影响因素譬如探针难以制备,操作繁琐和复杂,费用高等都制约了其前进的脚步。而MPN法是一种采用数学理论推算,用置信区间描述菌落浓度的一种间接计数法。虽然实验结果以MPN值表示,但是MPN值并不

14、能表示实际菌落数,而实际菌落数落在置信区间内的任何一点;MPN法也是一种常见的间接计数法,其存在有一定的局限性,且该法操作极为繁琐、费时,包括清洁玻璃器皿、培养基的配制与灭菌、分装等一系列复杂过程,且要求无菌操作13。因此,本实验研究目在于研制出一种新型针对水质中铁细菌的检测装置。它是一种带有营养成分的测试瓶,包括玻璃瓶、橡胶瓶盖等,其特征是内部提供充氧的液体环境。该测试瓶是通过本实验室重复试验优化得到铁细菌的最适培养基,然后通过该培养基对铁细菌的培养一定时间而呈现浑浊或沉淀现象的铁细菌水质测试瓶。(语言不通)该测试瓶的主要特点为:1、经过重复试验得到优化的铁细菌培养基,促使铁细菌迅速生长。2

15、、缩短检测周期,正常操作下,可在一周内出结果。3、采用三瓶重复法,得到的结果精确。4、操作简单,易于推广。与以上四种方法相比,用该测试瓶检测铁细菌,具有成本投入少,检测周期短,较精确的检测灵敏度等优点,能更好的适用于油田生产和工业生产。2 材料与方法2.1 样品试剂及实验仪器 硫酸铵 硝酸钠 MgSO47H2O CaCl22H2O K2HPO4 柠檬酸铁铵 250mL三角瓶空的医药检测瓶起子1mL移液枪 1mL移液枪头 超净台恒温箱2.2 水样实验所需水样由老师提供,来自于江汉油田现场采集。2.3 方法2.3.1 铁细菌的培养基的配置(每段开头,空两格即可,后面的格式自己修改下,标题注意对齐)

16、按照优化后的铁细菌检验用的培养基(柠檬酸铁铵培养基)配方:(NH4)2SO4 0.5g、NaNO3 0.5g、K2HPO4 0.5g、CaCl22H2O 0.2g、MgSO47H2O 0.5g、柠檬酸铁铵10g、DH2O 1000 ml,最后调PH(pH)为自然,高压蒸汽灭菌30 min,冷却待用。2.3.2 铁细菌的检测 步骤一:在无菌的条件下,将已灭过菌的铁细菌液体培养基分别分装9 ml于16支测试瓶中(该测试瓶事先均已灭菌)。步骤二:铁细菌测定推荐采用三瓶重复法,即一个稀释度作三瓶重复。将以上装有液体培养基的测试瓶排成一组,按每3支测试瓶为一组依次编上序号,记为IB1.1、IB1.2、I

17、B1.3、IB2.1、IB2.2总共五组,剩余的一支测试瓶做空白对照。用移液枪分别取采来的水样1.0mL注入3支1号测试瓶内,充分震荡。步骤三:用另一支无菌注射器分别从1号测试瓶取1.0 mL水样注入到2号瓶内,充分震荡。再更换一支无菌注射器从2号瓶内取1.0 mL水样注入到3号瓶内,充分震荡。依次类推,一般稀释到最后一瓶为止(移液枪头经过高压蒸汽消毒,以保证无菌操作,每稀释一次就要换一次枪头)。一般根据细菌含量决定稀释的倍数,一直稀释到最后一级稀释度即无菌生长为止,做五个连续的稀释度。步骤四:最后将所有测试瓶放入恒温箱中恒温(350.5)培养,每天观察现象。3 结果与分析从油田注水样品中检出

18、的铁细菌,即以氧化还原态获取能量,而且以氧化铁的形式沉淀于细菌的粒质分泌物之上或之内。该细菌能所利用的铁来自管道本身,或者来自管道中的水。沉淀的氢氧化铁在设备中形成大量的红褐色的沉淀物,造成系统内的生物污垢和管道的堵塞。在本实验中,铁细菌根据测试瓶中是否长铁细菌,如有:试管内棕色消失,而且形成深褐色或黑色沉淀,这表明铁细菌的存在。实验中所有测试瓶是从2010年3月24日开始被放入恒温箱中培养,其具体变化情况如下表1表1 铁细菌的检测测试瓶号现象3.253.263.273.284.24.4IB1.1、IB1.2、IB1.3所有测试瓶均无明显变化1号测试瓶内颜色均有变浅现象,但都不显著。颜色继续在

19、变浅,瓶中有少量细沙状沉淀出现瓶内颜色逐渐在变清,红褐色沉淀变多瓶内棕色消失,瓶底有深褐色的沉淀IB2.1、IB2.2、IB2.3都无明显变化颜色变浅,但不显著颜色变化仍不显著有少量细沙状沉淀出现IB3.1、IB3.2、IB3.3IB4.1、IB4.2、IB4.3无明显变化无明显变化无明显变化IB5.1、IB5.2、IB5.33.1 铁细菌的检测结果 由于在本实验中铁细菌快速检测试剂瓶的前几天变化都不显著,其微小变化只能通过视眼可见,用相机拍摄的效果并不理想,因此只用数码相机记录了4.4日的结果既铁细菌培养检测的最后一天的结果。 图1 1号铁细菌测试瓶的比较 如图1可知,做空白对照的铁细菌测试

20、瓶内显示的就是原优化过的铁细菌的柠檬酸铁铵培养基的颜色,而铁细菌1号测试瓶内都有明显变化,都由深棕色变为浅棕色,测试瓶底部都有一层红褐色的沉淀,特别是IB1.1号测试瓶内变化最为明显,深棕色几乎退去。由上实验结果可知稀释度为10-1的油田水样里存在铁细菌,继而也说明了在江汉油田采集的油田注水水样里存在铁细菌。图2 2号铁细菌测试瓶的比较 由图2可知,2号铁细菌测试瓶内颜色及沉淀现象都不显著,但IB2.3号测试瓶颜色变化相对于IB2.1 、IB2.2两测试瓶显著。该现象说明了,在一定的时间内,铁细菌快速检测瓶很难检测出该稀释度为10-2的油田水样中的铁细菌。图3 3号铁细菌测试瓶的比较由图3可知

21、,3号铁细菌测试瓶内颜色及沉淀现象也都不显著,其情况与2号测试瓶基本上一样。图4 4号铁细菌测试瓶的比较图5 5号铁细菌测试瓶的比较 由图3、图4、图5我们可以看出,随着油田水样的稀释度的逐渐增大,该铁细菌测试瓶的变化现象越来越不明显,可以说基本上没什么变化。但是,1号测试瓶组的第三组测试瓶中,虽然随着稀释度的逐渐增加,细菌测试瓶内的变化现象也不明显,但是该组所有测试瓶内都有较为明显的颜色变化。 图6 铁细菌测试瓶的稀释梯度对比 由图6可知,该组测试瓶在分别接种五个稀释度的油田水样后,只有IB1.1号测试瓶内现象最明显,红棕色消失,有红褐色沉淀生成。随着稀释倍数的增加,测试瓶内基本上没什么变化

22、。以上测试瓶中除了做空白对照的测试瓶以外,其他测试瓶内均有沉淀生成,只是通过照片不能看出来,只能通过肉眼可见。3.2 讨论综合上述实验结果,用本实验室研制出的铁细菌快速检测试剂瓶需要11天才能将油田注水中的铁细菌给检测出来,而没有达到预期的需在一周内将其检测出来,实验结果并不理想。本实验结果不理想的可能原因有:1. 本实验室里的水样是一年以前从江汉油田现场采集的水样,并非本实验所要求的新鲜水样。新鲜的水样能保证里面可能存在的铁细菌具有旺盛的代谢能力,能快速的利用将亚铁催化氧化成三价铁化合物所释放的能量,也即在宏观上表现为铁细菌测试瓶内出现红棕色消失和红褐色沉淀出现的现象,从而将铁细菌快速的检测

23、出来。2. 该水样的油分和浊度可能会对实验结果造成一定的影响。从江汉油田现场采集的水样,为了满足本实验研制出的测试瓶在检测铁细菌的过程中具有操作简便和成本投入少等特点,在进行接种之前并没有经过离心等措施来去掉水样表面油污以及岩屑等沉淀。3.影响铁细菌生长和繁殖的因素有很多,其中影响比较大的有温度等。众所周知,反应速度与微生物的活性有关,而温度可以改变微生物的活性。PDFranzmann24,25等人认为铁细菌的活性与温度有着极为密切的联系, 通过使用Ratkowsky方程可以估算出保持微生物活性的几个主要温度(TMIN, TOPT以及TMAX),该结果与以前文献报道的类似,但是更精确,他们认为

24、铁细菌的最适生长温度为3050之间。一般铁细菌生长所需温度偏低,在参考其他文献的基础上发现大多数都是采用(300.5)来培养并检测铁细菌,而在本实验中采用的是(350.5),因此实验中铁细菌的培养温度可能过高。4. 铁细菌是一种好氧好气的微生物,其在氧化水中亚铁成为氢氧化高铁时,发生:Fe2+ (x +2)H2O + O2Fe2O3xH2O +4H +能量。由此可见,氧气对铁细菌生长的重要性,而在本实验中,在总体积只有15mL的测试瓶里却装有9mL的铁细菌液体培养基,铁细菌在封闭的测试瓶里面可能会因为氧气不足而放慢了其反应的进程。用测试瓶绝迹稀释法测定出铁细菌需要7天,培养-镜检法只需要1天,

25、荧光原位杂交法与MPN法只是在前期准备工作所需时间较长,其检测出铁细菌的时间也远比本实验室所需要的时间短。但是,该快速检测试剂瓶的成本投入少,操作简单,有较高的灵敏度等优点还是无法忽略的,因此应重新从整体把握该实验,在铁细菌的生理生化基础上仔细分析该实验,从而进一步改进该实验,使实验结果向预期的方向靠近。4总 结 在油田生产中,注水作为保持地层压力和提高采油率的有效手段,被国内外广泛采用然而注水会引起油层原有的平衡被破坏,导致各种油层伤害问题接踵而至油层结垢就是注水过程中油层伤害的常见类型注水一般是先将污水处理后,再将注入水与处理过的浅层清水混合,然后注入地层清水和污水的性质差异较大,如果先分别处理再混合注入,就会形成严重的“结垢一腐蚀,腐蚀一结垢”互为因果的恶性循环,导致水处理设备、管网、井筒出现结垢和腐蚀以及地层堵塞日趋严重1985年美国油井因微生物腐蚀所造成的经济损失达160170亿美元,而铁细菌也就是造成这微生物腐蚀的主要因素之一。在工业生产中,工业循环冷却水具有温度适宜(3040)、营养物质与溶解氧含量高等特点,极易导致微生物特别是铁细菌在冷却水系统中大量繁殖,造成输水水质恶化,形成生物粘泥,造成传热效率下降,管道腐蚀,输

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