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分子生物学名词解释等.docx

1、分子生物学名词解释等名词解释1、广义分子生物学:在分子水平上研究生命本质科学,其研究对象是生物大分子结构和功能。22、狭义分子生物学:即核酸(基因)分子生物学,研究基因结构和功能、复制、转录、翻译、表达调控、重组、修复等过程,以及其中涉及到与过程相关蛋白质和酶结构与功能3、基因:遗传信息基本单位。编码蛋白质或RNA等具有特定功能产物遗传信息基本单位,是染色体或基因组一段DNA序列(对以RNA作为遗传信息载体RNA病毒而言则是RNA序列)。4、基因:基因是含有特定遗传信息一段核苷酸序列,包含产生一条多肽链或功能RNA所必需全部核苷酸序列。5、功能基因组学:是依附于对DNA序列了解,应用基因组学知

2、识和工具去了解影响发育和整个生物体特定序列表达谱。6、蛋白质组学:是以蛋白质组为研究对象,研究细胞内所有蛋白质及其动态变化规律科学。7、生物信息学:对DNA和蛋白质序列资料中各种类型信息进行识别、存储、分析、模拟和转输8、蛋白质组:指是由一个基因组表达全部蛋白质9、功能蛋白质组学:是指研究在特定时间、特定环境和实验条件下细胞内表达全部蛋白质。10、单细胞蛋白:也叫微生物蛋白,它是用许多工农业废料及石油废料人工培养微生物菌体。因而,单细胞蛋白不是一种纯蛋白质,而是由蛋白质、脂肪、碳水化合物、核酸及不是蛋白质含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成细胞质团。11、基因组:指生物体或细胞一套完整单

3、倍体遗传物质总和。12、C值:指生物单倍体基因组全部DNA含量,单位以pg或Mb表示。13、C值矛盾:C值和生物结构或组成复杂性不一致现象。14、重叠基因:共有同一段DNA序列两个或多个基因。15、基因重叠:同一段核酸序列参与了不同基因编码现象。16、单拷贝序列:单拷贝顺序在单倍体基因组中只出现一次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序中储存了巨大遗传信息,编码各种不同功能蛋白质。17、低度重复序列:低度重复序列是指在基因组中含有210个拷贝序列18、中度重复序列:中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万(105)次重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序,但慢于高度重复顺序。19、高度重复序列:基因

4、组中有数千个到几百万个拷贝DNA序列。这些重复序列长度为6200碱基对。20、基因家族:真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关一组基因,可能由某一共同祖先基因经重复和突变产生。21、基因簇:基因家族各成员紧密成簇排列成大段串联重复单位,定位于染色体特殊区域。22、超基因家族:由基因家族和单基因组成大基因家族,各成员序列同源性低,但编码产物功能相似。如免疫球蛋白家族。23、假基因:一种类似于基因序列,其核苷酸序列同其相应正常功能基因基本相同、但却不能合成功能蛋白失活基因。24、复制:是指以原来DNA(母链)为模板合成新DNA(子链)过程。或生物体以DNA/RNA为模板合成DNA/RNA过程

5、。25、半保留复制:DNA复制过程中,新合成子代DNA分子中,一条链是新合成,另外一条链来自亲代,这种复制方式称为半保留复制。26、复制子:基因组上能够独立进行复制单位,包括复制起点和复制终点。所有原核生物染色体、噬菌体仅有一个复制子;真核生物染色体有多个复制子27、复制起始点:DNA分子上起始复制并控制复制起始频率特定位置28、复制终点:终止复制位点。29、复制叉:又称生长点,复制开始时,起始点处DNA双螺旋要解链,松开两股链和未松开双螺旋形状象一把叉子,称为复制叉,是复制有关酶和蛋白质组装成新复合物和新链合成部位。30、引物:是人工合成与模板DNA互补寡核苷酸序列31、简并引物:是指代表编

6、码单个氨基酸所有不同碱基可能性不同序列混合物。32、相向复制:从两个起点开始两条链复制,形成两个复制叉,各以一条链为模板单一方向复制出一条新链。33、单向复制:复制从一个起始点开始,只有一个复制叉,以同一方向生长出两条链。34、双向复制:从一个起始点开始,沿着两个相反方向形成两个复制叉,一方向移动,两条DNA链都被作为模板,各生长出两条新链,形成一个复制泡,用电子显微镜可以观察到复制泡存在。这是原核生物和真核生物DNA复制最主要形式35、D环复制:又称取代环复制,是线粒体DNA复制形式。复制中呈字母D形状而得名。36、DNA半不连续复制:DNA在复制过程中,一条链合成是连续,而另一条链合成是不

7、连续,这样复制过程称为半不连续合成。37、冈崎片段:DNA复制时,以53方向母链作为模板,子链沿53最初合成长短不一、不连续核苷酸小片段,最后连接成为完整子链,这些小片段称之为岗崎片段。38、前导链:以35方向DNA链为模板链,子代DNA以53方向连续合成,称为前导链。39、后随链:以53方向DNA链为模板链,子代DNA以53方向不连续合成,形成许多不连续冈崎片段,最后连接成一条完整DNA链,称为后随链,又称后滞链。40、引物酶:又称引发酶,合成起始引物,引物长度为10-60个核苷酸,E.coli中是DnaG蛋白。41、RNA聚合酶:以一条DNA链或RNA链为模板催化由核苷-5-三磷酸合成RN

8、A酶。促进DnaA活性,促进复制起始。42、端粒:真核生物线性染色体DNA两端是一种特殊结构称为端粒功能:稳定染色体末端结构,防止染色体末端融合、重组、降解;补偿5末端在切除RNA引物后留下空缺43、DNA损伤:生物体生命过程中DNA双螺旋结构发生任何改变都称之为DNA损伤。44、DNA修复:是细胞对DNA受损伤后一种反应。主要包括:直接修复、切除修复、错配修复、重组修复、易错修复和SOS应急反应45、光修复:光裂合酶能特异地和嘧啶二聚体结合,在可见光下催化光化合反应,使环丁烷环回复到两个独立嘧啶,这一过程叫光复活作用。46、应急反应(SOS反应):许多能造成DNA损伤或抑制DNA复制过程能引

9、起一系列复杂诱导效应,这种效应称为应急反应(SOS反应)47、同义突变:指突变改变了密码子组成,但由于密码子简并性没有改变所编码氨基酸序列突变48、错义突变:指基因突变改变了所编码氨基酸序列,不同程度地影响蛋白质和酶活性。49、无义突变:指基因改变使代表某种氨基酸密码子变为终止密码子,导致肽链合成过早终止。50、致死突变:有些错义突变和无义突变严重影响到蛋白质活性甚至完全无活性,从而影响了表现型。51、渗漏突变:有些错义产物仍然有部分活性,使表现型介于完全突变型和野生型之间中间类型。52、中性突变:有些错义突变不影响或基本上不影响蛋白质活性,不表现出明显性状变化。53、电泳:带电颗粒在电场作用

10、下,向着与其电性相反电极移动,称为电泳。54、迁移率:是指带电颗粒在单位电场下泳动速度。影响迁移率内在因素:(1)样品所带静电荷多少(2)样品颗粒大小(3)样品分子空间构象影响迁移率外界因素:电场强度、电泳缓冲液离子强度、电泳缓冲液pH值、支持物及其浓度影响、插入染料影响、温度影响、电渗55、DNA重组:又称遗传重组,指DNA分子内或分子间发生遗传信息重新组合,重组产物叫重组DNA56、同源重组:又称一般性重组,指发生在两条同源DNA分子之间,通过配对、链断裂和再连接,而产生片段交换过程。重组产物称为重组体57、Holliday中间体:同源重组中,两条同源DNA分子经过配对、断裂和再连接,形成

11、连接分子,称为Holliday中间体58、Chi位点:它是刺激重组位点。这一位点是由8个碱基组成非对称序列59、特异位点重组:指发生在一个特定短DNA序列内,由特异酶和辅助因子识别和作用重组。60、单链同化:单链DNA与同源双链DNA分子发生链交换,从而使重组过程中DNA配对、Holliday中间体形成、分支移动等步骤得以实现过程。61、转座子:基因组上中可以移动DNA片段。转座子由基因组一个位置转移到另一个位置过程叫转座62、反转座子:又称反转录转座子或反转录子,是一类在转座过程中需要以RNA为中间体,经过反转录过程再分散到基因组中转座子。生物学意义:对基因表达影响;反转座子介导基因重排;反

12、转座子在进化中作用63、转录:生物体以DNA为模板合成RNA过程。64、反转录:生物体以RNA为模板合成DNA过程。65、剪接:真核生物RNA前体去除内含子,连接外显子过程。66、剪接体:在mRNA前体内含子剪接过程中,由多个核内小分子核糖核酸(snRNA)和蛋白质组装形成催化剪接反应复合体。67、模板链:“链”、“反义链”,指用于转录DNA单链,是合成RNA模板68、编码链:“链”、“有义链”、“非模板链”,指模板链对应DNA链,碱基序列与mRNA一致(DNA:T,RNA:U)69、编码序列:编码序列从AUG开始以三核苷酸单位阅读直到出现终止密码UGA,UAA或UAG之一。70、RNA编辑:

13、是指转录后RNA在编码区发生碱基插入、丢失或替换等现象。编辑生物学意义:(1)改变和补充遗传信息;(2)增加基因产物多样性,是基因调控一种方式,有利于进化;(3)可能与学习和记忆有关71、反式作用因子:通过扩散到与其编码基因不在同一个DNA分子上靶位置,识别、结合而调节基因表达分子。如转录因子、RNA聚合酶72、顺式作用元件:通常只在原位影响与其处于同一个DNA分子上、物理上紧密相连、被表达基因序列。通常不编码蛋白,多位于基因旁侧或内含子中。如启动子、终止子、增强子、操纵基因、MAR73、启动子:位于转录起始点附近,且为转录起始所必需,可被RNA聚合酶特异性识别、结合,并起始转录一段保守DNA

14、序列,其本身不被转录。74、-10序列(Pribnow框):几乎所有原核基因启动子中,在转录起始位点上游-10bp位点区域都有一个典型6bp区域,共有序列为TATAAT(T80A95T45A60A50T96)序列,称为-10序列或Pribnow框。75、-35序列(Sextama框):转录起始位点上游约35bp处有一段6bp区域,共同序列为TTGACA(T82T84G78A65C54A45),称为-35序列(Sextama框)76、操纵子:是原核生物在分子水平上基因表达调控单位,由调节基因、启动子、操纵基因和结构基因等序列组成。77、增强子:指能使基因转录频率明显增加DNA远端调控序列78、强

15、终止子:无需其他蛋白质因子帮助,而是依靠转录产物形成特殊二级结构就可以终止转录,这种终止子被称为内部终止子。79、弱终止子:需要在一种蛋白质因子帮助才能终止,所以又称为依赖性终止子。80、结构基因:编码参与细胞结构或代谢活动结构蛋白、酶基因。81、操纵基因:指操纵子中常与启动子相邻或重叠序列,被有活性调节蛋白结合后,影响启动子启动下游结构基因转录,是一类顺式作用元件。82、调节基因:编码控制其它基因表达蛋白质或RNA基因。83、调节蛋白:是调节基因产物,有活性调节蛋白可与操作基因结合,控制下游结构基因转录。84、效应物:调节蛋白需要有一个小分子物质结合并改变其活性,共同调节结构基因转录,这个小

16、分子物质称为效应物(effector)85、CAP:(降解物活化蛋白)或CRP(环腺苷酸受体蛋白)是分子量为22.5kd二聚体86、顺反子:遗传学将编码一个蛋白质或多肽遗传单位称为顺反子(cistron)。87、多顺反子:原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成mRNA可编码几种功能相关蛋白质,为多顺反子(polycistron)。88、单顺反子:真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(singlecistron)。89、遗传密码:DNA(或mRNA)中核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间对应关系称为遗传密码。特点:连续性、简并性、通用性、变异性、方向性、变偶性90、密码子:mRN

17、A上每3个相邻核苷酸编码蛋白质多肽链中一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子或三联体密码。91、同义密码子:同一种氨基酸具有两个或更多密码子现象称为密码子简并性。对应于同一种氨基酸不同密码子称为同义密码子。92、开放阅读框架:从mRNA5 端起始密码子AUG到3 端终止密码子之间核苷酸序列,按照三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(openreadingframe,ORF)。93、RNA再编码:mRNA以不同方式翻译,改变原来编码信息,称为RNA再编码94、氨基酸活化:是指氨基酸与tRNA相连,形成氨酰-tRNA过程。氨基酸活化在细胞质中进行。反应由氨酰-tRNA合成酶(

18、又称氨基酸活化酶)催化。意义:(1)使氨基酸本身被活化,利于下一步形成肽键反应。(2)tRNA可携带氨基酸到mRNA指定部位,使氨基酸进入到肽链合适位置95、安慰诱导物:又称义务诱导物:能高效诱导酶合成,但不是酶作用底物,与酶底物结构类似分子96、应急反应:当细菌能源十分缺乏时,几乎所有生化反应都停止,为生存,细菌体内可立即产生一种应急应答反应,关闭许多基因表达。97、反式作用因子:通过扩散到与其编码基因不在同一个DNA分子上靶位置,识别、结合而调节基因表达分子。如转录因子、RNA聚合酶98、顺式作用元件:通常只在原位影响与其处于同一个DNA分子上、物理上紧密相连、被表达基因序列。通常不编码蛋

19、白,多位于基因旁侧或内含子中。如启动子、终止子、增强子、操纵基因、MAR99、转录后加工:是指将各种前体RNA分子加工成成熟RNA过程。100、信号序列:所有靶向输送蛋白质结构中存在分选信号,主要为N末端特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞适当靶部位,这一序列称为信号序列。101、分子伴侣:分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链非天然构象,促进各功能域和整体蛋白质正确折叠。102、应急反应(strigentresponse):当细菌能源十分缺乏时,几乎所有生化反应都停止,为生存,细菌体内可立即产生一种应急应答反应,关闭许多基因表达。103、管家基因:在生物体几乎所有细胞中始终表达基因,表达

20、产物大致以恒定水平始终存在于细胞内,是维持细胞最低限度功能所不可缺少基因,是细胞生存所必须。这类基因表达称为组成型表达104、奢侈基因:只在特定细胞类型或细胞生长发育特定时间表达基因。这类基因表达称为可调节表达105、核基质结合区:30nm染色质纤维以特定DNA序列结合在核基质上,这些特定DNA序列称为MAR,它使纤维状染色质DNA形成数以万计环状结构域。106、绝缘子:是一类特殊顺式作用元件,阻止激活或阻遏作用在染色质上传递,使染色质活性限定于结构域内107、座位控制区(LCR):是一种远距离顺式元件,为相连接基因提供了一个可以活化染色体环境,可能是DNaseI超敏感位点和许多转录因子结合位

21、点,可促进基因转录108、CpG岛:真核生物基因组中,常见富含CpG区域,称为CpG岛,常位于转录调控区及其附近,其甲基化程度直接影响转录活性。109、DNA甲基化:真核生物DNA双螺旋中,胞嘧啶核苷嘧啶环5位甲基化,并与其上鸟嘌呤形成mCpG,是DNA甲基化唯一形式110、高速泳动蛋白(HMG):活性染色质中含有两种高度丰富小分子非组蛋白,这些蛋白具有异常高电荷,在凝胶电泳中移动快,所以称为高速泳动蛋白(HMG)111、小卫星DNA序列:又称可变数目串联重复,重复单位6-40bp,每个拷贝长度0.1-20Kb(6-100次),分为位于邻近染色体端粒区域(端粒家族),以及分散在基因组多个位置上

22、(高变家族),一般没有转录活性。112、增强子:指能使基因转录频率明显增加DNA远端调控序列。2、病毒基因组结构特点答:a与细菌相比,病毒基因组很小,大小相差较大。b病毒基因组由DNA组成,也可以由RNA组成,每种病毒颗粒中只含有一种核酸,核酸结构可以是单链或双链、环状或线状。c有重叠基因。d大部分是用来编码蛋白质,基因间间隔序列较短。e功能上相关基因集中成簇,在基因组特定部位,形成一个功能单位或转录单元,转录产物为多顺反子,之后经过简单加工。f噬菌体基因是连续;而真核细胞病毒基因是不连续,具有内含子。3、细菌染色体基因组结构一般特点答:细菌染色体基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成,染色

23、体相对聚集在一起,形成一个较为致密区域,称为类核。只有一个复制起点,数个相关结构基因串联在一起,受同一调控区调节,合成多顺反子mRNA。具有操纵子结构。编码蛋白质基因都是单拷贝,但rRNA基因是多拷贝。和病毒基因组相似,非编码DNA部份所占比例比真核细胞基因组少得多。基因组DNA中具有多种调控区如复制起始区、复制终止区、转录启动区和终止区等,还有重复序列,比病毒基因组复杂。具可移动DNA序列4、真核生物基因组特点答:真核生物基因组比较庞大,具有多个复制起始点。一个基因组包括多条线状染色体,每条染色体DNA上有多个复制起始点。真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色质复杂高级结构,储存于细胞核内

24、。真核细胞被核膜分隔成细胞核和细胞质,在基因表达中,转录和翻译在时间和空间上被分隔,不偶联。真核生物基因组存在着许多重复序列,重复序列单位长度不一,重复程度各异。真核生物蛋白质基因一般以少拷贝形式存在,转录产物为单顺反子。存在着可移动DNA序列。大多数真核生物基因含内含子,为断裂基因。5、滚环复制特点:(1)共价延伸;(2)模板链和新合成链分开;(3)不需RNA引物,在正链3OH上延(4)只有一个复制叉;(5)形成多联体;12、DNA复制过程1、复制起始 DNA解旋、解链,形成复制叉:拓扑异构酶、解旋酶及单链DNA结合蛋白 RNA引物合成:依赖于单链模版,由引物酶催化合成一小段RNA引物 特点

25、:原核环形DNA通常只有一个起点,双向复制;真核线性DNA通常多个起始点,形成多个复制叉2、复制延长 a子链延长:引物合成后,由polII催化,在引物3-OH末端逐一添加与模板链对应互补脱氧核苷三磷酸 b半不连续合成:A.领头链:键延长方向与解链方向相同,为连续合成B.随从链:键延长方向与解链方向相反,为不连续合成,产生冈崎片段3、复制终止 水解引物及填补空隙:冈崎片段合成后,由PolI水解去除RNA引物,并填补留下空隙 连接酶连接冈崎片段形成完整双链DNA分子:空隙填补后,DNA片段与片段之间一个缺口由DNA连接酶催化连接,从而产生完整双链DNA分子21、帽子结构功能(1)对翻译起识别作用-

26、为核糖体识别RNA提供信号,Cap0全部都是识别重要信号,Cap1,2甲基化能增进识别(2)增加mRNA稳定性,使5端免遭外切核酸酶攻击(3)有助于mRNA越过核膜,进入胞质22、poly(A)功能(1)可能与核质转运有关(2)增强mRNA稳定性(3)增强可翻译能力24、翻译(蛋白质生物合成):以氨基酸为原料以mRNA为模板以tRNA为运载工具以核糖体为合成场所起始、延长、终止各阶段蛋白因子参与合成后加工成为有活性蛋白质27、肽链合成延长包括以下三步:进位:新氨酰tRNA识别核糖体内mRNA,进入A位转肽:P位氨基酸转到A位新氨基酸末端,形成肽键移位:核糖体向3端移动1个密码子长度肽链延长是以

27、上3步在核糖体上连续性循环式进行,每次循环增加一个氨基酸,又称为核糖体循环(ribosomalcycle)。31、基因工程操作流程1、分:分离目基因2、切:对目基因和载体适当切割3、接:目基因与载体连接4、转:重组DNA转入受体细胞5、筛:筛选出含有重组体受体细胞6、表:目基因在受体细胞中表达,受体细胞成长为基因改造生物32、PCR技术原理聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction,PCR)原理类似于DNA变性和复制过程,即在高温(9395)下,待扩增靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(3765)情况下,两条人工合成寡核苷酸引物与互补单链DNA模板结合,

28、形成部分双链;在Taq酶最适温度(72)下,以引物3端为合成起点,以单核苷酸为原料,沿模板以53方向延伸,合成DNA新链。这样,每一双链DNA模板,经过一次解链、退火、延伸三个步骤热循环后就成了两条双链DNA分子。如此反复进行,每一次循环所产生DNA均能成为下一次循环模板,每一次循环都使两条人工合成引物间DNA特异区拷贝数扩增一倍,PCR产物得以2n批数形式迅速扩增,经过2530个循环后,理论上可使基因扩增109倍以上,实际上一般可达106107倍。1.变性:在加热或碱性条件下可使DNA双螺旋氢键断裂,形成单链DNA,称之为变性。2.退火:是模板与引物复性。引物是与模板某区序列互补一小段DNA片段。3.延伸:从结合在特定DNA模板上引物为出发点,将四种脱氧核苷酸以碱基配对形式按53方向沿着模板顺序合成新DNA链。

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