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厦大微生物笔记.docx

1、厦大微生物笔记绪论 1、什么是微生物(Microorganism, microbe) 2、微生物的共性 3、微生物学发展简史 四、微生物学科发展促进了人类进步 五、微生物学及其分科 类 群 : 原核类:细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次氏体、蓝细菌 真核类:真菌(酵母菌、霉菌),原生动物,显微藻类 非细胞类:病毒、类病毒、拟病毒、朊病毒什么是微生物(Microorganism, microbe 1、 ) 个体微小(0.1mm),借助显微镜观察形体; 结构简单:简单多细胞,单细胞或非胞低等:进化地位低。 二、微生物的共性 1、体积小,表面积大2、吸收多、转化快 3、生长旺、繁殖快4、适应性强、

2、易变异 5、分布广、种类多 一定体积的物体,分割成越细小的颗粒, 这些颗粒的总表面积越大,表面积/体积比值越大。 优点:提供巨大的吸收面,排泄面和交换面。 体积小、表面积大是微生物其它四个共性的 基础 2、吸收多、转化快 原因:表面积/体积比值大 例举:乳糖发酵细菌、产朊假丝酵母(Candida utilis) 3、生长旺、繁殖快 原因:吸收多、转化快 例举:大肠杆菌 利弊:有益-工业发酵、理论研究材料培养;有害-病原微生物、霉腐微生物 4、适应性强、易变异 适应强原因:体积小、表面积大;灵活的代谢 调控机制(诱导酶) 极 端 微 生物 (extreme microorganism)易变异原因

3、:结构简单、单倍体、巨大交换面 利弊:有益-育种(青霉素),有害-耐药性 5、分布广、种类多 分布广:土壤、空气、海洋、人体肠道 种类多:(1)微生物的生理代谢类型多 (2)代谢产物种类繁多(3)微生物的种数多 种类多:(1)微生物的生理代谢类型多 微生物特有:分解天然气、石油、纤维素、木质素能力; 多种产能方式:细菌光合作用、嗜盐菌紫膜光合作用、自养细菌的化能合成作用、各种厌氧菌的产能途径 生物固氮作用; 合成次级代谢产物(抗生素、维生素等)能力; 对复杂有机物的生物转化能力(甾体化合物等); 分解氰、酚、多氯联苯等有毒物质的能力 独特的繁殖方式(病毒、类病毒、肮病毒的复制、增殖) 2)代谢

4、产物种类繁多 含氮代谢产物:氨基酸、核苷酸类 糖类厌气性代谢产物:酒精、乳酸、甘油、丙酮丁醇; 糖类好气性代谢产物:柠檬酸、苹果酸、葡萄糖酸; 微生物多糖:黄原胶、右旋糖苷; 微生物酶类:蛋白酶、淀粉酶、酯肪酶、工具酶; -次级代谢产物:抗生素、维生素、激素、生物碱 3)微生物的种类多 目前比较肯定的微生物种数大约10万种, 随着分离、培养方法的改进,研究工 作的深入,新种、新属、新科、新纲陆续被发现。 4)遗传基因多样性 微生物基因组测序 基因组种类多样性。 基因库资源丰富。 5)生态类型的多样性 三、微生物学发展简史 微生物学发展经历五个时期 1、史前期(8000年前-1676年)2、初创

5、期(1676-1861年) 3、奠基期(1861-1897年)4、发展期(1897-1953年5、成熟期(1953-迄今) 学习微物学发展历史的目的: -学习前人严谨治学的科学态度,培养创新意识; -明确科学技术和研究方法的突破在学科发展中的重要作用; -明确学科的发展总是与人类生活、生产实践密切相连的。 四、微生物学科发展促进了人类进步 近代科学中,微生物学是对人类福利贡献最大的一门科学。 1、医疗保健2、食品和医药行业3、微生物学促进农业发展 4、微生物与生态和环境保护的关系5、基础理论研究中的贡献 1、医疗保健 -外科消毒技术的建立 -寻找人畜病原菌 -免疫防治法的应用-化学治疗剂的发明

6、 -抗生素治疗的兴起-用工程菌生产各种生化药物 2、食品和医药行业 -食品微生物发酵-罐头灭菌和长期保存方法 -厌氧纯种发酵技术-深层液体通气发酵技术 -代谢调控理论在发酵工业中的应用-生物工程的兴起 3、微生物学促进农业发展 -微生物农药-菌肥-植物生长激素-高等真菌-饲料 4、微生物与生态和环境保护的关系 -食物链中主要环节,物质循环,污水处理 5、基础理论研究中的贡献 -以微生物作材料,生物学基础理论研究取得许多重大突破: -分子生物学是在生化、遗传学、微生物学基础上发展起来。 -微生物与基因工程-动、植物细胞应用研究中采用微生物培养/发酵方法。 -微生物学独特实验操作技术。 五、微生物

7、学及其分科 研究主要内容:从不同水平(层次)研究生命活动五大 基本规律。 根本任务:发掘、利用、改善有益微生物,控制、消灭、改造有害微生物。 分科:按研究微生物的基本生活动规律分;按微生物应用领域分等不同分种方式。Chap 1原核生物的形态、构造和功能 1 细 菌(bacteria) 放线菌(actinomycetes) 3 其它原核微生物 1 细 菌(bacteria) 一 细胞的形态构造及其功能 1、细菌的基本形态 :球状、杆状、螺旋状 (1) 形态和染色 自然界中杆状细菌最常见、球菌次之,螺旋状最少; 量度细菌大小的单位是m(微米,10-6m)作单位。 亚细胞构造的量度用nm(纳米,10

8、-9m)作单位。 2、染色 细菌的形态和主要构造的观察:一般都要将菌体细胞染色。原因:菌体微小。含水分多,对光线吸收、反射与水溶液差别不大,借助颜色的反衬作用。 染色方法 : -死菌: 正染色 负染色:荚膜染色法等 - 活菌:用美蓝或TTC(氯化三苯基四氮唑)染色 二)细菌细胞构造与功能 1、细胞壁(cell wall) (1)组成与结构 G+菌和G-菌细胞壁构造比较 A、肽聚糖(Peptidoglycan) 组成和结构特点 水解肽聚糖的酶类:溶菌酶(lysozyme)、自溶酶(autolytic enzyme) B、磷壁酸(Teichoic acid) 存在:成分与结构实型:磷酸多元醇聚合体

9、, 主要有甘油磷酸型和核糖醇磷坒酸两种类型。 结构特点(甘油型为例): 磷壁酸的功能 C、脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS) 存在:G-菌细胞壁特存成分,组成细胞 外壁外壁层的重要成分。分子结构类脂A、核心多糖区,0-特异侧链 LPS的主要功能 D、外壁层中的蛋白质 :基质蛋白、外壁蛋白、脂蛋白。 (2)细菌的某些特性与细胞坒组成,结构的关系 草兰氏染色、抗酸染色、溶菌酶敏感性、青毒素敏感性 3)周质空间(periplasmic space) 即壁膜空间,内含多种蛋白质(酶、结合蛋白、受体蛋白)。 (4)细胞坒的功能 A、固定细胞外形和提高机强度,使其免受渗透压等 外力的损

10、伤; B、为细胞的生长、分布和鞭毛运动所必需; C、阻拦大分子有害物质(某些抗生素和水解酶)进入细胞; D、赋予细菌特定的抗原性以及对抗生素和噬菌体的敏感性。 缺乏细胞壁的微生物 支原体、粘菌、原生动物、某些嗜盐菌、产甲烷细菌(疵壁菌mendosicutes)原生质体、球状体、L-型细菌 2、细胞膜与间体 细胞膜的功能: -控制 细胞内、外的物质的运送、 交换;-维持细胞内正常渗透压的屏障作用; -合成细胞壁各种组分和荚膜等大分子的场所;-进行氧化磷酸化或光合磷酸化的产能基地; -许多酶和电子传递组分的所在部位;-鞭毛的着生点和提供其运动所需的能量等。 3、细胞质(cytoplasn) 聚-羟

11、基丁酸(poly-hydroxybutyrate PHB羧化体(carboxysome) 4、核质体(rcuclear booly) 核区、拟核、核基因组、遗传信息。 (1)鞭毛(flagella) 组成成分:鞭毛蛋白(鞭毛素flagellin)构造: G+ 细菌与G- 细菌鞭 毛构造差别 鞭毛着生方式:一端单毛、一端丛毛、两端(单毛、成束)、周生、侧生 2)菌毛(pilas) 存在G-菌(特别是肠道菌,假单胞菌)表面的一种蛋白质附属物,它由菌毛素(piling)形成中空的丝状体。 种类:一般菌毛和特化菌毛(性菌毛sex pilus, F-Pilus) (3)糖被(glycocalyx): 荚

12、膜(capsule)、微荚膜(microcapsule)、粘液层(slime layer)、菌胶团(zoogloea)。 糖被生理功能 保护作用、贮藏养料、堆积代谢废物菌体附着、信息识别作用、屏障和交换系统 (4)芽孢(endospore spore) 定义:产生芽孢的细菌种类 芽孢耐热机制(渗透调节皮层膨胀学说)研究细菌芽孢的意义: (5)伴孢晶体(parasporal crystal) (三)、细菌的繁殖 1、裂殖(fission)2、芽殖(budding) 一、细菌群体培养特征 1、固体琼脂平板上菌落形态:菌落(colony)及特征描述、菌苔(lawn) 2、液体培养基中培养特征:混浊、

13、菌膜、或絮状沉淀。3、半固体培养基培养特征 2 放线菌(actinomycetes) 一、概述 定义:分布:放线菌与人类的关系: 放线菌重要类群:链霉菌属(Streptomyces)弗兰克氏菌属(Frankia)小单孢菌属(Micromonospora) 二、放线菌的形态构造(以链霉菌为例) 一般形态与构造 2、 放线菌的繁殖 3、 横割分裂,4、 两种途径:细胞内陷、壁膜同5、 时内陷。 三、放线菌的培养特征 固体培养基平板培养液体培养基振荡培养 3 其它原核微生物 一、蓝细菌(cyanobacteria)蓝藻或蓝绿藻 定义:形态:细胞结构特点:繁殖: 蓝细菌转基因研究进展: 二、支原体、立

14、克次氏体、衣原体 1、支原体(Mycoplasma) 1)特征: 个体微小缺乏细胞壁可在人工培养基上生长 二等分裂繁殖对抗生素(四环素)敏感性 2)种类:胸膜肺炎支原体,类支原体 2、立克次氏体(Rickettsia) (1)定义:(2)种类:立克次氏体,类 立克次氏体(Rickettsia-like organisms, RLO)。 (2)特征 结构繁殖对热、四环素等抗生素敏感培养 (3)与人类关系: 3、衣原体(chlamydia) 是一类在真核细胞内营专性能量寄生、有独特生活周期(原体、始体)、小型G-原核微生物。 营专性能量寄生:独特生活周期:小型G-原核微生物 培养传播感染范围支原体

15、、立克次氏体、衣原体三者主要区别Chap 3 真核微生物形态构造 1 . 真核微生物概述 真核生物、真核微生物 一、真核生物与原核生物的比较:P40.表2-1 二、真核微生物的主要类群 菌物界(Mycetalia)真核微生物的主要类群真菌(Fungi)的特点 三、真核微生物的细胞构造 (一)、细胞壁 1、真菌的细胞壁 构造:微纤维(单糖的聚合物)、基质(甘露聚糖、葡萄糖、蛋 白质、脂类)。 不同分类地位真菌的细胞壁多糖 2、藻类的细胞壁 结构骨架(纤维素)、间质多糖(杂多糖)。 二)鞭毛与纤毛 真核微生物的“9+2”型鞭毛 存在:鞭毛(鞭毛钢的原生动物、藻类、低等水生真 菌的游动孢子或配子),

16、纤毛(纤毛纲的原生 动物:草履虫属)。 三)细胞质膜 (四)细胞核 构造:核被膜、核仁、核基质。不同真菌的核染色体数目差别很大。 (五)细胞质和细胞器 1、细胞基质、细胞骨架、内质网、核糖体、高尔基体、溶酶体、微体、线粒体、叶绿体液泡。 2、膜边体(Iomasome)、几丁质酶体(Chitosome)、氢化酶体(Hydrogenosome)。 1 酵母菌(yeast) 定义 一、分布以及与人类关系 1、分布2、与人类关系 单细胞蛋白(Single-cell protein,SCP) 二、酵母菌细胞形态特征 细胞大而结构分化;细胞单个分散或呈假菌丝;细胞多形态。 三、酵母菌细胞构造 1、细胞壁(

17、cell wall 组成与结构 甘露聚糖(mannan)(外层);蛋白质(protein)(中层);葡聚糖(glucan)(内层类脂,几丁质 酵母原生质体的制备: EDTA-巯基乙醇 蜗牛消化酶 酵母菌细胞原生质体 (预处理) 2、细胞膜(cell membrane) 酵母细胞膜的成分和构造膜构造与功能、控制胞内外物质交换的主要屏障。 3、细胞核(cell nuclei) 形态结构:定形(真核)、核膜(双层单位膜)、核孔、染色体 细胞核的观察:核(相差显微镜)、核膜(电镜)、染色体(姬姆萨染色/ 碱性品红染色) 4、酵母菌其他细胞构造 线粒体、液泡、2m质粒 四、酵母菌繁殖和生活史 1、繁殖方

18、法 无性繁殖 芽殖(budding):名属常见方式、芽痕(bud scar)、蒂痕(brith scar). 繁殖(fission):裂殖酵母属(schizosaccharomyces) 产无性孢子:节孢子:地霉属(Geotrichum)掷孢子:掷孢酵母属(sporobolomyces)厚垣孢子:白段丝酵母属(Candida albicans) 有性繁殖:子 囊( ascus)、孢子(ascospore) 2、生活史(Life cycle) 定义酵母菌三种类型生活史 a.营养体以单倍体或二倍体形式存在 b.营养体只能以单倍体形式存在 c.营养体只能以二倍体形式存在 五、酵母菌的培养特征 固体琼

19、脂培养基上菌落特征 液体培养基中培养特征 3、丝状真菌 定义:真菌(fungi)、霉菌(mould) 分布、种类、与人类关系 一、1、营养体的基本单位-菌丝(hyphoe) 菌丝直径大小,隔膜 2、真菌细胞壁成分及物理形态 菌丝分化及其细胞壁的成分 物理形态及成分 壁的网状骨架成分:微纤维(microfibril)纤维素、几丁质 无定形基质成分:葡聚糖、蛋白质、脱乙酰几丁质、甘露聚糖、少量脂类无机盐等。 3、菌丝体(mycelium) 定义、类型(营养菌丝体、气生菌丝体) 4、营养菌丝体的特化形态 假根(rhizoid)、吸器(haustorium)、附着胞、附着枝、菌核(selerotium

20、)、菌索、匍匐菌丝(stolon)、菌环(ring),菌网(net)。 5、气生菌丝体的特化形态 (1)结构简单的子实体:分生孢子头;孢子嚢(根霉、毛霉)均产无性孢子(分生孢子、孢囊孢子);担子(担子菌),产有性孢子(担孢子)。 2)结构复杂的子实体:产无性孢子 分生孢子器、分生孢子座、分生孢子盘 子囊果(ascocarp)三种类型,产有性孢子:闭囊壳、子囊壳、子囊盘 曲霉营养菌丝横;隔示木霉细胞壁及横隔;曲霉顶囊及其分生孢子;横轴腐霉(一种水生真菌)横轴腐霉 (示孢子头与菌丝原生质的自发荧光) 二、真菌的孢子 类型和特点 真菌孢子与细菌芽孢的比 较 真菌可通过菌丝碎片繁殖,但主要靠形成有性或

21、无性孢子繁殖 孢子类型、形态特征是真菌分类、鉴定重要形态学依据 三、霉菌的培养特征 固体琼脂培养基上菌落特征 液体培养特征 chap 3 非细胞型生物 1 病毒(Virus) .2 亚病毒 chap 4 非细胞型生物 非细胞型生物种类:病类、亚病毒(类病毒、拟病毒、朊病毒) 非细胞型生物与细胞型生物的主要区别。 1病毒(Virus) 定义:分布及种类 一、病毒的形态与大小 形态:杆状、蝌蚪状、球状、砖块状、丝状等。 大小:极其微小、一般都可通细菌滤器、电镜观察 二、病毒粒子(virion) 定义:成熟、结构完整、单个病毒。 病毒粒子结构与组成 病毒粒子 核衣壳(基本构造)核心:由DNA或RNA

22、构成 衣壳:由许多衣壳粒蛋白构成 包膜(非基本构造):由类脂或脂蛋白构成 病毒粒子对称体制:螺旋对称(TMV)、二十面体对称(腺病毒)、复合对称(T偶数噬菌体)。 病毒核酸 类型:ds DNA/SS DNA, ds RNA/SS RNA; 链状/环状,闭环/缺口环 基因组:单组分/双组分/三组分/多组分(RNA病毒特有) 三、病毒的群体形态 1、包涵体(inclusion body)定义与实践应用 2、噬菌斑(plaque)定义与实践应用 3、空斑和病斑:定义4、枯斑:定义 四、噬菌体(bacteriophage, phage) 1、噬菌体的模式结构2、噬菌体的繁殖 吸附(感染复数,m.o.i

23、)侵入,增殖,装配(成熟)、释放(裂解)、增殖、装配 增殖、装配: 3、噬菌体侵染的结局 烈性噬菌体(Virulent phage):一步生长曲线(One-step growth curve) 温和噬菌体(temperate phage):定义、特点、存在形成(游离点、整合态和营养态) 溶源菌(hysogen):定义、特性、检查方法。 五、真核生物的病毒 1、植物病毒 种类、形态、核酸(SSRNA)。 增殖过程与T偶数噬菌体不同点:吸附(被 动)、扩散(胞饮或包膜融入细胞膜或特异性受体转移)、衣壳(侵入后)。 2、人类和脊椎动物病毒 种类、引起疾病 增殖过程与T偶数噬菌体不同点:吸附(被 动)

24、、扩散(胞饮或包膜融入细胞膜或特异性受体转移)、脱衣壳(侵入后)。 人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV 3、昆虫病毒 病毒多角体(polyhedron)昆虫病毒种类 .2亚病毒 亚病毒是一类与传统的病毒有显著区别的分子生物,仅含有侵染性 RNA/侵染性蛋白质一种成分。 1、类病毒:是至今所知道的最小的、只含有侵染性RNA一种成分,专性细胞内寄生的分子生物。 2、拟病毒:类病毒、植物病毒粒子中的病毒、侵染性 RNA 分子,复制需要辅助病毒。 3、朊病毒:侵染动物细胞、胞内复制、 小分子无免疫性疏水Pro。病例:羊搔痒病、疯牛病、Kuru病,中心法则

25、的挑战。 3 病毒与实践 一、噬菌体与发酵工业危害与预防措施,噬菌体污染出现的现象与杂菌不同。 二、人类和脊椎动物病毒的防治预防(侵染预防、感受预防),治疗(被动免疫、干扰素、抗生素等) 三、植物病毒病的防治指导思想(防重于治、综合防治),主要措施。 四、昆虫病毒用于生物防治主要优点和缺点,病毒多角体的实际意义。 五、病毒在基因工程中的应用克隆载体(charon)、科斯质粒; SV40(Simian Virus 40,即猴病毒40)。Chap 4 微生物的营养与物质运输 1 微生物的营养与培养基 2 营养物质进入细胞的方式 概述 营养(nutrition):生理功能、能量和物质、生长和繁殖。

26、营养物(nutrient):营养功能,提供结构物质,能量、代谢调节物质和 生理环境。 1 微生物的营养与培养基 一、微生物的营养要素与营养类型 六种营养要素:碳源、氮源、能源、生长因子、无机盐和水。 1、碳源(Carbon source) 定义:碳元素(碳架)、营养源。 碳源谱:碳源范围-有机碳源、无机碳源。 依据利用碳源情况,微生物营养类型有: -自养型(autotroph):CO2(唯一碳源)。不依赖有机营养物。 -异养型(heterotroph):至少需要一种大量有机物、正常营养。 -混合型(mixotroph):碳同化混合类型。 异养微生物的适宜碳源:糖类、醇类、有机酸类、脂类。 2、

27、能源(energy source) 定义:提供最初能量来源的营养物或辐射能。异养微生物的能源就是其碳源。 以能源分类,微生物的营养型有: -光能营养型(phototrohp)直接利用太阳光辐射能。 -化能营养型(chemotroph):从脂合物化学反应中获得能量,又分无机营养型有机营养型。 微生物的营养类型 3、氮源(nifrogen source) 定义:氮元素、营养源氮源谱: 氨基酸自养型与氨基酸异养型 微生物利用各种氮源的特点:N2(固N)蛋白质及水解物。 4、生长因子(growth factor) 定义:正常代谢必需,不能自身合成,有机化合物,需要量少。 微生物与生长因子的关系: 5、无机盐 定义:C、N以外的各种重要元素,大量元素、微量元素及配制细菌培养基时对无机盐的选择。 无机元素的来源和功能 6、水:营养要素之一,在微生物生命活动过程的重要作用。 二、微生物的培养基 培养基(medium):人工配制,适合微生物生长繁殖或产生代谢产物、混合养料,具备六大营养要素, 比例合适,配制后立即灭菌。 (一)

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