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中国农科院分子生物学考博试题_精品文档.pdf

1、中国农科院中国农科院 2007200720072007 年分子生物学考博试题年分子生物学考博试题1.How to initiate SOS system(15)?2.Illustrate the mechanism of forming of pppGpp and ppGpp?答:1.当细菌发现它们处于很差的生长环境,没有足够的氨基酸来维持蛋白质合成时,它们就会停止大部分活动,这种现象称为应急应答。应急应答产生两种非正常的核酸堆积物,即pppGpp and ppGpp。2.在应急条件下,空载体 tRNA 进入核糖体 A 位,从而引发一个无效反应。位于 A 位和 P 位附近的 relA 基因产生

2、 RelA 这种蛋白应急因子,这种因子作为催化反应酶催化ATP,使其焦磷酸转移到 GDP 或 GTP 上。从而产生 pppGpp and ppGpp。一般情况下,RalA 酶更倾向于以 GTP 为底物,所以 pppGpp 是主要产物。pppGpp 在翻译因子 EF-T u 和 EF-G 的作用下去磷酸化,生成 ppGpp。3.当条件转为正常的时候,有 stpT 基因编码的酶催化作用下,迅速降解 ppGpp,应急应答反应停止。3.Describe the mechanisms of transposition for Tn10 in detail(16,530).T10 的转座属于非复制型转座。

3、转座单元作为实体,直接从一个位点转到另一个位点,并且是保守的。在转座酶的作用下,TN10 释放,同时,靶序列上造成交错断裂,然后转座子与单链末短结合,填补缺口后接完成了转座。4.Try to distinguish methylated and nonmethylated please(21347)?5.What reaction can explain Agrobacterium infection succeeds only on wounded plants(P594,Cha18)?6.Try to explain the properties of the monomeric G-pr

4、otein via example please(such as Ras orRan)(Ras P929,Ran P257(8),EF-TuP164(6),Ran P982)?7.What proteins are given through processing of retroviral genes?(17,555)主要产生三种蛋白:Gap 多聚蛋白质,Pol 多聚蛋白质和 Env 多聚蛋白质。其中,前两种由全长 mRNA 翻译而成,而后者是病毒通过剪接产生一种亚基因组的信使 RNA,然后将其翻译成 Env 产物。gap基因产物组成病毒颗粒的核蛋白核心,pol基因产物的主要功能是核酸合成和

5、重组,而env基因的主要是编码病毒颗粒的外壳蛋白。8.How to initiate each Okazaki fragment?(14,444)DNA 的复制时半不连续的方式合成的。在DNA 的合成是从 N 端-C 端合成的,然而,DNA的双链的方向刚好相反。所以,前导链在复制过程中可以连续复制,而后随链的复制要从 N端-C 端,必须一段一段的复制,这些一段一段的复制片断就叫冈崎片断。9.What is conjugation?(13)Conjugation is a process in which two cells come in contact and exchange geneti

6、c material.Inbacteria,DNA is transferred from a donor to a recipient cell.In protozoa,DNA passes from eachcell to the other.接合是两个细胞相互交流交换遗传物质的一个过程。在细菌的接合是 DNA 从供体菌到受体菌。原生动物中的接合是 DNA 从一个细胞转到另一个细胞。10.How to change(form)the state of lysis and lysogeny for phage(in detail)?(12,395)答:当细菌生长在丰富培养基上时,降解 c 蛋

7、白的宿主蛋白酶是有活性的,于是 PRE 的作用被停止,不能通过 PRE 使基因 c合成阻抑物:另外,此时 Cro 蛋白在 OR3处结合,停止了在 PRM 处开始的溶源维持回路,也不能合成阻抑物。即这时候 Cro 蛋白占据了操纵子,所以,此时噬菌体进入裂解周期。当细菌处于饥饿状态时,降解c蛋白的宿主蛋白酶是没有活性的,于是,c 蛋白通过PRE使基因 c合成阻抑物:另外,Cro 蛋白在 OR1 和 OL1 处结合,这样立即伴随着阻抑物在在 OR2 和 OL2 处的协同结合,从而关闭了 Cro 蛋白的合成并开始了经由 PRM 进行阻抑物的合成。即这个时候阻抑物占据了操纵基因,所以噬菌体进入溶源化。1

8、1.Give the example to describe RNA interference(RNAi and micro RNA etc).(11)答:利用 RNAi 技术研究 p53 基因表达。以质粒为载体,介导体外合成具有与 p53 基因目的区域同源的 DNA 片段,通过脂质体将携带此片段的质粒载体导入肿瘤细胞,利用质粒载体 U6-RNA 启动子不断在体内产生 21-23nt 的 siRNA,在体内,它被组装成无活性的蛋白复合体,即 RNA 诱导的沉默复合体,在 APT 作用下,双链 siRNA 解链成单链 RNA,在它的指导下,核酸酶识别并切割与 siRNA 互补的 P53 基因,使

9、表达量下降或者失去,达到沉默的作用,从而研究其功能。12.Attenuation(衰减作用)can be controlled by what(in details)?(10,360)答:衰减作用可以被翻译所控制。色氨酸操纵子的前导区有一个由 14 个密码子组成的可读框,其中包含编码色氨酸的两个密码子。当存在色氨酸时候,前导序列被翻译,使得衰减子形成法家结构,这个发夹结构引起转录终止。当不存在色氨酸的时候,核糖体停在色氨酸密码子处,衰减子的二级结构阻止了发夹结构的生成,转录得以继续。13.How does glucose inhibit the transcription(by cAMP,CA

10、P)?(10,11,344)答:细菌对各种潜在的碳源具有潜在的偏好,当葡萄糖作为一种可以用的能量来源时相对其他糖类,它被优先利用。当大肠杆菌培养基中发现葡萄糖和乳糖的时候,葡萄糖优先进入细胞,使单糖磷酸转移酶系统(PTS)中的蛋白质AGlc 脱磷酸化,然后它结合乳糖通透酶,乳糖不能进入细胞,于是阻抑物关闭操纵子。蛋白质AGlc 脱磷酸化导致腺甘酸环化酶活性降低,于是控制大肠杆菌操纵子的激活剂 CAP 蛋白失去作用,不能激活转录。从而抑制了转录。14.Toillustrate cascade(因子).(9)答:因子和核心酶共同组成全酶,在转录的时候起催化作用。转录开始的时候因子和核心酶共同作用,

11、识别并催化转录,转录进行 8-9 个碱基的时候,因子脱离全酶。因子有多种类型:70,普通通用因子;S,张力28F,鞭毛基因的表达;32,热激基因的转录;E,热激;54,氮的利用15.How doesPfactor work?(9)答:P 因子是 大肠杆菌的一种基本蛋白质,只在终止阶段发挥作用,由6 个相同亚基组成。亚基具有一个 RNA 结合域和 ATP 水解域。它作为 RNA 聚合酶的辅助因子行使其功能。P 因子最初结合到 RNA 终止子上游一个伸展的单链区,然后发挥它的 ATP 酶活性以提供在RNA 上滑动的能量,沿 RNA 伸展的方向滑动直到 RNA-DNA 杂合的终止子区域,然后发挥解螺

12、旋的作用,使双链体结构解开。16.Describe the components of the translocon and their functions.(8)答:Atranslocon is a discrete structure in a membrane that forms a channel through which(hydrophilic)proteins may pass.易位子是镶嵌在内质网等膜性结构内的一种水溶性跨膜通道。它帮助跨膜蛋白通过脂质双层膜结构。它主要成分是 Sec61 复合体,它包括三种跨膜蛋白。17.Give the example to describ

13、e suppressor tRNAs compete with wild-type tRNAs that have thesame anticodon to read the corresponding codon(s).(7,206)答:野生型翻译的时候,蛋白质的翻译终止于 UAG 终止密码子,然而,琥珀抑制子 tRNA能够与释放因子竞争性的识别终止子 UAG 密码子,使蛋白质的合成通过终止子继续阅读。18.Describe Eukaryotic initiation.(6)1.40s 小亚基结合到 mRNA 的 5帽子结构eIF-2 Met-tRNAiGTP 形成三元复合体,与游离的小亚基

14、结合形成 43s 复合体,与mRNA 的 5帽子结构结合。2.40s 小亚基在 mRNA 上移动,找到起始密码子eIF1 和 eIF1A 辅助 43s 起使复合体扫描 mRNA 直到 AUG 起始密码子,然后 eIF2 和 eIF3释放。3.40s 小亚基与 60s 大亚基结合eIF5B 的作用下,介导 60s 亚基与复合体结合形成可以延伸的核糖体。19.How to separate satellite DNA?对 DNA 进行密度梯度离心,即因子中大部分 DNA 形成连续的片断群,这一片断群形成一个较宽的峰,以基因组平均 GC 含量相对应的浮力密度位置为中心,称为主带;在不同密度值处看到另

15、外一个或多个较小的峰,就是卫星 DNA。另外,利用复性杂交的方法,也可以分离出来。20.Which test displays Mendelian segregation at the level of DNA marker fragments.(2)1.RFLPRestriction Fragment Length Polymorphism-限制性片段长度多态性,是指用某种限制性内切酶切割来自不同个体的基因组 DNA 或某个基因,会得到不同长度的 DNA 片段,表明在这种被切割的来自不同个体的 DNA 分子上内切酶的识别序列有差异。2.AFLPAmplified Fragment Lengt

16、h Polymorphism-扩增片段长度多态性,相对与 RFLP而言,在 AFLP 分析中显示多态性的 DNA 片段不是由于限制性内切酶酶切基因组 DNA 而产生,而是通过 DNA 多聚酶链式反应扩增基因组 DNA 模板而产生的。由于不同物种或品种的基因组 DNA 序列差异很大,在复制特定的 DNA 序列时所需要的引物核苷酸序列也不同,同一引物可能使某一品种的 DNA 片段得以复制,而在另一品种中可能无法诱导。如此将引物所诱导复制的特定 DNA 片段采用 PCR 技术扩增,再进行电泳分离,就可以区分出不同物种或品种之间的多态性。3.RAPDRandomAmplified Polymorphism DNA-RAPD 随机扩增多态性 DNA。实际上 RAPD 是一种特殊形式的 AFLP,区别在于扩增多态性 DNA 所用的引物是随机的,而不是专一的。RAPD 所用的一系列引物序列各不相同,但对于任一一对特定引物,它同基因组DNA 序列的结合又是特定的。用一组引物(20-40 个)在基因组全序列上扫描可以获得基因组多态性丰富的信息。如果引物长度为 10 个碱基,排列方式有 44.STMS(S

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