1、黄化突变体文献综述分析植物叶色突变体的研究进展 植物叶色的表现受叶绿体中各种色素的综合影响 , 正常情况下 ,由于叶绿素在植物色素总 量中占优势而表现为绿色 .叶色突变体是植物中突变率较高且易于鉴定的突变性状 ,往往直接或间接影响叶绿素的合成与降解 ,导致植株的叶片颜色较正常的绿色发生变化 .目前几乎所有 的高等植物中都发现了叶色突变体 .(陈艳丽 )在本世纪三十年代就有关于叶绿素突变体的报 道 ,但叶色变异通常伴随着植株矮小 ,并影响植株的光合作用造成减产 ,甚至在生长过程中出 现死亡现象 ,因此叶色突变体常被认为是无意义的突变 .直到 1949 年 ,Granick 对失绿的小球藻 突变体
2、的研究并通过此突变解释了叶绿素合成过程 1 ,人们才认识到叶色突变体对理论研究具有重要的作用。 并且最近几年, 叶色突变体的研究越来越深入,也受到广泛的关注,已 经被用于基础研究和生产实践,也取得了一定的成果。 2叶色突变体的来源除自然突变可产生叶色突变体外,利用人工诱变,插入突变和基因沉默等均可得到叶色 突变,其中人工诱变和插入突变的突变频率较高。自然突变就是在自然条件不经过人工处理情况下发生的突变,比如自然辐射,环境污染 等。但是自然突变的频率极低,一般不超过 1%(郭龙彪, 2006),因此可供直接利用的突变很少。 我国著名水稻良种矮脚南特就是在高杆品种南特号稻田里发现的自然突变, 水稻
3、的 叶色突变体 chl1 和 chl9 ( zhang et al .2006 ),棉花中的芽黄突变体(蒋博 2012),荠菜型油 菜黄化突变体都是自发突变体。人工诱变 人工诱变导致植物基因产生突变,是选育新品种、创造新种质的有效途径。根据产生诱 变的来源, 人工诱变分为物理、 化学诱变及基因工程引起的突变, 物理和化学诱变是主要的 诱变方法。诱发植物发生突变的因素有诱变剂,物理诱变是通过各种射线(紫外线、 X 射线、丫射 线、 p 射线、中子等)来处理植物某个器官(如种子、子房、愈伤组织等) ,诱发植物发生 基因突变。种子是最常用的处理材料,其对环境适应能力很强,可以在极度干燥、低温、高 温
4、、真空等条件下进行处理,并且操作方便,便于运输和储藏。 1934 年日本首次利用 X 射 线处理水稻种子,成功得到水稻早熟突变体(阳惠琴, 1995)我国于 1987 年开始航天搭载育种利用空间环境(微重力、高真空、微磁场等)进行诱变,通过地面选育得到有益变异创 造出新种质、培育出新品种,已经成功在水稻种选出紫色、红色、茶色等叶色突变体(萨如 拉, 2009)。化学诱变是通过烷化剂、 叠氮化钠、 碱基类似物等对植物进行诱变, 其中烷化剂是诱变效率 最高和最常用的化学诱变剂。常用的烷化剂又包括甲基黄酸乙酯( EMS )、磺酸二乙酯、乙 烯亚铵和亚硝基乙基脲。 EMS 诱变得到的突变体大多数为点突
5、变,诱变机理: EMS 带有 1 个或多个活性烷基, 该基团能够转移到其他电子密度高的分子上去, 使碱基许多位置上增加 了烷基 ,可以改变氢键的能力 ,从而 DNA 在复制时导致碱基配对错误而引起突变。 EMS 将鸟 嘌呤的 O6 位置烷基化,在 DNA 复制过程中由于烷基化的鸟嘌呤与正常的胸腺嘧啶配对, 使得碱基发生替换(赵用亮, 1996)。 EMS 诱发的另外一个鸟嘌呤位点是 N7 位点,该位点 是最易起反应的位点几乎可以与所有烷化剂起烷化作用,鸟嘌呤 N7 位点烷基化后,使核苷 键发生水解导致断裂,鸟嘌呤从 DNA 链上脱落,造成 DNA 链碱基缺缺失,在复制的时候 游离的碱基可能发生
6、错配,以致发生碱基颠换即 G:C A:T,G:CC:G,G:CT:A ;另外烷基化的鸟嘌呤易离子化,使稳定的酮式变为不稳定的烯醇式,不与胞嘧啶配对而 与胸腺嘧啶配对,从而发生 G:CA:T 转换。除此之外, EMS 还可能使两个鸟嘌呤 N7位点形成共价键,使得 DNA 双链交联而造成变异甚至死亡。这些 DNA 结构上的变化都可 能促使不表达的基因或区段被激活,而表现出被掩盖的性状。另外胸腺嘧啶 O4 位点也易发生烷基化,其次是鸟嘌呤 N3,腺嘌呤N2,腺嘌呤N7和胞嘧啶N3位点,此四个位点发生 烷基化后引起碱基置换突变只占烷化作用突变的 10%。1.1.2 叶色突变体的分类由于叶色突变体通常在
7、苗期出现叶色变异 ,因此 ,其分类常常根据苗期的叶色 表型进行。目前分类方法较多,如Gustaftsson把叶色突变体分为五种类型:白化、 黃化、浅绿、条纹、斑点。而 Awan 等将其分成八种类型:白化 ,黄化,浅绿,白翠, 绿白,黄绿,绿黄和条纹。二者的分类中,白化、黄化、浅绿类型相同,Awan将条纹 和斑点两种类型按表型的差异又分成了不同的类型 16。 walles 将叶色突变体分 成 3 类:1、单色突变 ,指叶片仅表现出浅绿、黄、白三种颜色中的一种 ;2、杂色突 变,指叶片存在多种颜色 ,如白黄、白绿、斑等 ;3、阶段性失绿 ,指在植株发育的某 个阶段,叶色发生突变 ,然后再恢复到正常
8、颜色。 然而,简单地以苗期表型为依据来 进行分类具有一定的局限性。植物的表型性状与基因型并非一一对应的关系 ,一种表型性状可能受多个基因同时突变的共同影响 ,即使是同一个基因发生突变 ,损 伤的程度不同基因功能也会表现出不同的表型性状。 比如,au和yg 一 2是番茄的黄叶突变体 ,其表现型非常相似 ,而研究表明 an 突变体的黄叶性状是由编码血红 素加氧酶的基因发生突变引起的,yg 2突变体中编码光敏色素生成团合酶基因 发生了突变 17 。另外 ,还有一些叶色突变性状在苗期时无法识别 ,如常绿 (staygree n突变体是常见的苗期后才表达的叶色变异 18,此突变性状也存在于拟 南芥、菊花
9、等很多物种中 ,其最明显的特征是生育末期叶片保持绿色甚至出现完 全不黄化现象。植物表型的表达不仅受基因的控制 ,也受环境因素的影响。因此 , 在对叶色突变体进行分类时 ,应根据不同的表型性状选择并结合多种分类方法对 其进行科学的分类。1.1.3 叶色突变体的遗传研究叶色突变体的来源广泛 ,种类繁多 ,种类不同其遗传规律差别也较大。 叶色变异 性状可能受细胞核遗传 ,也可能受细胞质遗传 ;可能由单基因控制 ,也可能由多基 因控制 ;可能是质量性状 ,也可能是数量性状。 为了确定叶色突变的遗传方式 ,在构 建 F1 群体时必须进行正反杂交 ,并且需要进行测交试验。 如果是细胞质遗传 ,正反 杂交的
10、子代叶色表型不同 ,总是和母本保持一致且不发生性状分离 ;如果是细胞核 遗传,正反交的子代叶色相同,在F2和BC1群体中发生叶色分离,并具有一定的性 状分离比例 ,根据分离比便可知叶色变异是受单基因控制还是多对基因控制。甘 蓝型油菜黄化突变体的基因定位3.1细胞核遗传对多种突变体的研究表明 ,叶色突变多是由单隐性核基因控制的 13、 19、 20、 21。胡远辉等对甘蓝型油菜叶色突变体 Cr3529进行了研究,认为此突变性状受细 胞核内1对隐性基因控制22。刘海衡等对芥菜型(召rassicajuneea五.)油菜黄化 突变体五“s少进行了研究,该黄化性状受2对隐性核基因控制23。何瑞锋等(20
11、00) 研究“斑马叶”叶色突变体 ,发现由于核基因改变其叶片间断失绿 24。吴殿星等 对水稻转绿型白化突变系 W25 进行研究 ,表明 W25 不育系的的叶色表型由单隐 性核基因控制。 25 3.2细胞质遗传细胞质遗传的叶色突变体与细胞核遗传的相比 ,数量比较少 ,且后代性状遗传 以母性遗传方式进行。细胞质控制的叶色突变体最早在大豆中出现 ,刘友杰利用激光诱变处理早稻品种 ,获得了褪绿突变体 ,遗传分析表明该褪绿性状是由细胞质 基因突变引起的 26 。此外 ,受细胞质遗传的叶色突变体仅在拟南芥 27 、小麦28(王保莉等,1996)、烟草15、29(Mondeetal.,2000;Barake
12、tal.,2001等植物中有 报道。1.1.3.3外部环境对叶色突变体的影响外部环境如温度、 光照,水分等对叶色突变体都有影响 ,其中温度的影响最大。 陈佳颖等(2010)利用60c。丫射线辐照处理粳稻品种嘉花1号的种子,得到了 1个 低温敏感叶色突变体InrZI,在较低温度(V25OC )条件下,该突变体幼苗叶色呈黄 色;随着温度逐渐升高 ,叶色由黄色转化为绿色 ,出现转化现象的临界温度约为 27,5C。 301.1.4 叶色突变体的分子机制 叶绿素合成机制的稳定受突变基因直接或间接的影响 ,任何妨碍叶绿素素代 谢稳定性的因素都会引起叶色变异 ,其分子机制非常复杂。1.1.4.1叶绿素生物合
13、成途径中的基因突变叶绿素合成分为厌氧条件和有氧条件下的反应。 的生物合成以谷氨酸与a 一酮戊二酸为原料 ,然后合成厌氧条件下 ,高等植物叶绿素 ALA 。 2 分子 ALA 成 1 分子胆色素原 ,其具有毗咯环。 4 分子胆色素原经脱氨基缩合形成脱水缩合形成 1 分子尿琳原 11,尿叶琳原 111 的 4 个乙酸侧链脱梭形成具有 4 个甲基的粪叶琳 原m。在有氧条件下,粪叶琳原m再脱梭、脱氢、氧化形成原叶琳双,原叶琳IX 是形成叶绿素和亚铁血红素的分水岭。如果与铁结合 ,就生成亚铁血红素 ;与镁结合,则形成Mg-原叶琳仄。Mg 原叶琳IX的一个梭基被甲基酷化,在原叶琳IX 上形成第五个环,接着
14、B环上的一 CH=CHZ侧链还原为一 CHZ 一 CH3,即形成原 叶绿酸酷。原叶绿酸酷经光还原变为叶绿酸酷 a,然后与叶醇结合形成叶绿素 a,叶绿素b是由叶绿素a转化而成的。叶绿素合成的过程涉及多个酶的参与。DVR 基因最先被鉴别后 ,参与高等植物叶绿素合成的所有基因逐一被鉴定 ,拟南芥中从谷氨酞一 tRNA 到叶绿素 b 的合成过程中 ,共有编码 15 种叶绿素合成酶的 27个 基因参与困31agatactal.,2005叶绿素合成过程中的任何一种酶的合成发生突变 均可影响叶绿素的合成进程 ,进而改变叶绿体中各种色素的含量 ,引起植株叶色变 异。1.1.4.2血红素代谢途径中的基因突变叶绿
15、素合成速率受细胞内血红素含量影响。当血红素的消耗大于合成时 ,血红素减少就会促进 ALA 的合成 ,ALA 含量增加促使叶绿素的合成。当血红素的 合成大于消耗时 ,其浓度升高从而抑制 ALA 的形成 ,ALA 含量减少便抑制叶绿素 的合成。血红素经一系列的反应最终形成光敏色素生色团 ,若此途径任何反应受 阻,细胞内血红素含量上升 ,血红素的积累反馈抑制叶绿素合成 ,突变体由于缺乏 叶绿素使得叶色产生变异 17。叶绿素合成过程中血红素反馈抑制是关键的调控 步骤。最直接的证据是,在番茄aurea和yenow green一 2突变体中,编码血红素 氧化酶(hemeoxygenase和光敏色素生色团合
16、酶的(PFBs” thase基因突变,使细胞 内积累过量的血红素 ,其反馈抑制叶绿素前体氨基酮戊酸的合成 ,致使突变体表现 为叶色黄化 17。1.1.4.3编码其他叶绿体蛋白的基因突变叶绿体的结构基础是蛋白质 ,约占口卜绿体干重的 30一 40%。它亦是叶绿体 功能的基础 ,几乎参与叶绿体全部的生命活动 ,如酶代谢过程中的催化剂、负责翻 译的核糖体等 ,它们的主要成分均为蛋白质。 电子传递链是由蛋白质与细胞色素、 质体蓝素等相结合而构成的 ,对叶色起关键作用的光合色素同样需要与蛋白质结 合形成复合体而存在,同时叶绿体内膜系统的主要成分也是蛋白质 32,33(Kalmangara,1988;Ya
17、ronskaya,2003。) 一些叶绿体蛋白的突变可导致叶绿体 内部膜结构发育不完全 ,进而叶绿素及其他光合色素的合成及稳定性也受到影响 ,最终使叶绿体中各种色素的含量及比例发生改变 34(June,1969)。叶绿体基因和细胞核基因共同编码叶绿体中的蛋白质 ,其中大约 80个叶绿体蛋白质由叶绿体基 因组编码 ,而 3000 多个蛋白由核基因编码 ,在细胞质中合成后通过叶绿体外套上 的异位子进入叶绿体中35、36(sat。,1999;Gray,2003K此外谷氨酞一 tRNA还原 酶催化叶绿素合成的第一步反应 ,而叶绿体核糖体的突变直接影响谷氨酞一 tRNA还原酶的合成,减少叶绿素的含量33
18、(Yaronskaya,2003)b叶绿体膜转运蛋 白的突变可能阻碍叶绿体膜对蛋白及酶的识别、结合和转运 ,从而使叶绿素合成速率降低 37。1.1.5 叶色突变体表型与叶绿素含量的关系叶色突变体的叶绿素含量发生变化, 影响植株的光合作用, 从而影响植株的 多种生理活动。 叶色突变体在植物生理研究中的应用已经很广泛, 比如通过叶色 突变体研究叶绿素生物合成、 叶绿体分化与发育、 光合作用和光形态建成等基础 研究,尤其是对植物光合作用和光形态建成的研究中, 叶色突变体是理想的材料。 叶片是植株进行光合作用的场所, 叶色突变往往影响植物光合效率。 郭春爱等利 用水稻低叶绿素b突变体研究了低叶绿素b对
19、突变体光系统II热稳定性的影响 15。结果表明,低叶绿素b突变体对高温更敏感,PS II捕光色素蛋白复合体(LHC II)中叶绿素b减少可能降低了 PS II结构与功能的热稳定性。光敏色素由生色团 和蛋白质两部分组成, 是植物光形态建成的光受体。 光敏色素生色团生物合成受 阻,其含量降低将反馈抑制叶绿素合成,引起对光不敏感的叶色突变 16。生色团 含量影响光敏色素活性, 其含量降低,光敏色素的活性也随之下降 17,因此可利 用生色团缺失的突变体研究光敏色素在光形态建成中的作用。 叶色突变体除可直 接或间接影响叶绿素合成外,亦可影响激素的合成,改变突变体内源激素含量。 比如脱落酸 (ABA) ,
20、其生物合成途径中的基因突变,可直接导致 ABA 含量的下 降,突变体的生长发育便受到一定程度的影响,造成叶色突变 18;脱落酸生物合 成的起始反应在叶绿体中进行, 因此叶绿体的发育状况直接影响其合成是否能顺 利进行,叶绿体发育异常可影响脱落酸合成中关键酶的活性, 降低突变体的脱落 酸含量 19。1.1.6 叶色突变体的应用价值 目前很多农作物如水稻、油菜、小白菜、辣椒等都有关于叶色变异作为标记 性状鉴定杂交种字纯度的报道。 水稻中 ,余新桥等 (2000)利用淡绿叶色标记性状的 突变体,培育出带淡绿色叶色标记的不育系:标一 IA,标一 IA与中413、明恢63的 杂交后代均表现出较强的杂种优势
21、。曹立勇等 (1999)将紫叶标记转育到釉型光温 敏核不育系中,通过筛选培育出中紫S。油菜中,赵云等(2003)利用物理和化学诱变 复合处理,获得了幼叶黄化突变性状 Cr,将其突变性状和核不育性状同时导入到 油菜PolCMS中,成功地选育出了带Cr标记的双低双重不育三系。1.1.7.2叶色变异可应用于高光能育种的研究叶绿体是植物进行光合作用的场所 ,光合作用的效率受叶绿素含量、叶绿体 形态、结构和数目变化的共同影响。叶色突变不仅会影响叶绿素的含量 ,而且对叶绿体的分化和发育也有影响 ,因此 ,叶色突变体是研究光合作用的理想材料。 Gan 等(1995)利用转基因技术在烟草中获得了一个常绿突变体
22、 ,此突变体在生长末期叶片持绿时间较长 ,衰老过程明显延迟 ,且能有效的吸收光能 ,延长光合作用 的时间 ,其生物量增加 40%、种子产量增加 52%,从而使实现高光效育种变得可能。 光抑制是植物在强光下光合作用受到抑制的现象。 当同时出现其他环境胁迫因素 如低温 ,高温和干旱等时 ,光抑制会加剧。一些黄化突变体 ,虽叶绿素含量减少 ,但叶 黄素含量明显较多 ,叶黄素在植物体内以紫黄质、环氧玉米黄质和玉米黄质三种 状态相互转化 ,使光系统避免伤害。如在水稻“ 249 黄”突变体中 ,虽叶绿素含量 减少 ,但光合结构对强光的耐受性升高 ,突变体的最大光合速率反而显著上升 (龚红兵等 ,2001)
23、。1.1.7.3叶色突变体可作为改良作物品质性状的资源叶色突变体叶绿素含量的改变 ,对植物的生长一般具有负面的影响。但少数 的叶色突变体使得植物具有特殊优良品质。 安吉白茶的返白现象与温度有较大的 关系。返白和复绿的过程中 ,叶绿素和类胡萝卜素含量均是由低到高变化 ,但氨基 酸总量的变化却是随白化程度的加深而升高 ,氨基酸总量高峰值可达 5%,有很高 的营养价值。在烟草中 ,叶片缺少叶绿素也有特殊的利用价值。烟草叶绿素缺乏 变异型分为白肋型、灰黄型、黄绿型等 ,其中白肋突变体来源于马里兰深色晒烟 , 叶绿素含量还有一些叶色突变体的颜色比较特殊 ,可培育成观赏植物。 Oud 等 (1995)利用
24、转基因植株进行多年相互杂交实验 ,培育出了橙色的矮牵牛新品种 7.4 叶色突变体在功能基因组学研究中的应用功能基因组学是指利用结构基因组学 研究得到的大量数据与信息评价基因的生化、细胞、发育和适应等功能 ,其主要方法结合了高通量、 大规模统计和计算机分析技术。 目前已有多种分析验证基因 功能的方法 ,其中突变体是最为有效的分析方法。 吴自明等 (2007)对水稻叶绿素合 成缺陷突变体进行研究 ,并利用图位克隆方法克隆了该基因 (YGLI) 。对其基因功 能研究表明 ,该基因编码叶绿素合成酶 ,其催化叶绿素 a 生物合成过程中的最后一 步反应。 Jung 等(2003)利用 T-DNA 插入的方
25、法获得水稻黄绿色突变体 ,经研究发 现,T-DNA的插入改变了基因 OsCHLH的结构,该基因最大的一个亚基一 CHLH 亚基 C 末端缺失 ,从而导致镁鳌合酶的活性降低 ,使该突变体叶绿素合成受阻 ,表 现出黄绿色的表型。刘文真 (2006)等利用 T-DNA 插入法获得了对低温敏感的水 稻叶色突变体 ,对该突变体的研究将更好的了解温敏叶色突变的分子机制。7.5 叶色突变体在植物生理研究中的应用叶色突变体的叶绿素含量发生变化 ,影响植株的光合作用 ,从而影响植株的多 种生理活动。叶色突变体在植物生理研究中的应用已经很广泛 ,比如通过叶色突变体研究叶绿素生物合成、 叶绿体分化与发育、 光合作用
26、和光形态建成等基础研 究,尤其是对植物光合作用和光形态建成的研究中 ,叶色突变体是理想的材料。叶 片是植株进行光合作用的场所 ,叶色突变往往影响植物光合效率。 郭春爱等 (2007) 利用水稻低叶绿素 b 突变体研究了低叶绿素 b 对突变体光系统 11 热稳定性的影 响。结果表明,低叶绿素b突变体对高温更敏感,PSII捕光色素蛋白复合体(LHCn) 中叶绿素 b 减少可能降低了 PsH 结构与功能的热稳定性。光敏色素由生色团和 蛋白质两部分组成 ,是植物光形态建成的光受体。光敏色素生色团生物合成受阻 ,其含量降低将反馈抑制叶绿素合成,引起对光不敏感的叶色突变(Terryetal.,华中 农业大
27、学 2011 届硕士研究生学位论文 1999)。生色团含量影响光敏色素活性 ,其 含量降低,光敏色素的活性也随之下降,(welleretal.,1997),因此可利用生色团缺失 的突变体研究光敏色素在光形态建成中的作用。叶色突变体除可直接或间接影响叶绿素合成外 ,亦可影响激素的合成 ,改变突 变体内源激素含量。比如脱落酸 (ABA), 其生物合成途径中的基因突变 ,可直接导 致 ABA 含量的下降 ,突变体的生长发育便受到一定程度的影响 ,造成叶色突变(Agrawaletal.,2001);脱落酸生物合成的起始反应在叶绿体中进行,因此叶绿体的发 育状况直接影响其合成是否能顺利进行 ,叶绿体发育
28、异常可影响脱落酸合成中关键酶的活性 ,降低突变体的脱落酸含量 (Fambrinietal.,2004)。1.2 叶色性状基因定位方法1.2.1质量性状基因定位方法质量性状指能观察而不能测量的性状 , 即属性性状 ,它表现出质的中断性变 化。因此在相对性状间呈现非连续变异 , 其遗传上由一个或少数几个效应大的基 因 ( 或称主基因 ) 决定 , 受环境影响较小 , 因而能对群体内的个体进行明确的分 类。对多种突变体的研究表明,叶色突变多是由单基因控制的。胡远辉 (2004)等对甘蓝型油菜叶色突变体 Cr3529进行了研究,认为此突变性状受细胞核内 1对隐性基因控制20。刘海衡等对芥菜型油菜黄化突
29、变体 L638-y进行了研究,该黄化性状受 2 对隐性核基因控制 21。何瑞锋等研究“斑马叶 叶色突变体,发现由 于核基因改变其叶片间断失绿 22。吴殿星等对水稻转绿型白化突变系 W25 进行 研究,表明 W25 不育系的的叶色表型由单隐性核基因控制 23。1.2.2数量性状基因定位方法常用的数量性状基因定位方法有单标记分析法、 区间作图法、复合区间作图 法、多重区间作图法等。(1)单标记法(single marker analysis)包括标记分析方法( marker-based analysis)和性状分析方法(trait-based analysis两种,前者利用每个标记位点不 同基因型
30、和性状存在的差异, 通过传统的单因素方差分析法, 检测数量性状在标 记基因型间的差异是否显著,并进行 F 测验,若结果显著,则说明该标记位点 可能与一个或多个 QTL(quantitative trait locus)连锁。这种方法简单且符合 QTL 定位的基本统计原理, 同时不需要完整的分子标记连锁图。 性状分析方法的原理 是假设由于选择的结果使数量性状的高、低表型间等位基因增减频率改变,当QTL 等位基因与某一标记基因连锁时,由于其相互关联,导致高、低表型个体 间标记基因频率的差异。(2)区间作图法(Interval mapping, IM)是由 Lander和 Botstein、ense
31、n和 Knapp 等提出的, 其原理是利用饱和连锁图谱, 通过极大似然函数和线性回归模型对目 标性状进行全基因组扫描, 判断是否存在任意相邻标记位点和位点间任一位置上 具有对该性状有效应的位点 64-66。各个位点对性状的效应大小通过似然值 (LOD 值)来衡量,根据似然值绘制的曲线图可以确定 QTL 在染色体上可能的位置。(3)复合区间作图法(Composite interval mapping, CIM)由Zeng提出等,是在 区间作图的基础上发展起来的 ,该方法的原理是:检测某一特定标记区间时,将 与其它 QTL 连锁的标记也包括在模型中以控制背景遗传效应,实现了同时利用 多个遗传标记信
32、息对基因组的多个区间进行多个 QTL 的同步检测,是目前应用 最为广泛的方法之一 67。复合区间作图法的主要优点是:保留了区间作图法的 优点,利用 QTL 似然图来显示 QTL 的可能位置及显著程度; 一次只检验一个区 间;若不存在上位性和环境互作的影响, 其位置和效应的估计是接近无偏的; 利 用了整个基因组的标记信息; 以所选择的多个标记为条件, 控制了背景遗传效应, 提高了作图的精度和效率。 复合区间作图法存在的主要问题有: 若存在上位性及 QTL 与环境互作等复杂的遗传学问题则结果会出现偏离;需要从大量的标记中 筛选出部分有用的标记, 而筛选时采用的显著性水平以及筛选的方法均会影响定 位结果;由于拟合在模型中的标记会吸收其附近的 QTL 效应,复合区间作图法 需要为检验的区间开辟一个窗口, 窗口内的标记不能包括在模型中, 但适合的窗 口大小不易确定 68。(4)混合线性模型方法由朱军提出,该方法把群体均值、 QTL 的各项遗传主 效应作为固定效应,而把环境效应、 QTL 与环境互作效应、分子标记效应及其 与环境的互作效应
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