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实验室常用液体配制标准操作规程.docx

1、实验室常用液体配制标准操作规程常用液体配制标准操作规程(SOP)国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心二八年九月修订一、细菌培养系统(责任人:郑子峥)二、DNA操作系统 (责任人:罗文新、陈瑛炜)三、蛋白质操作系统(责任人:李少伟、顾颖、潘晖榕)四、细胞培养相关(责任人:程通、张涛)五、单克隆抗体制备系统(责任人:陈毅歆、)六、EIA系统(责任人:葛胜祥、熊君辉)一、细菌培养系统1、LB培养基:每1000mL加分析纯NaCl 10g ,蛋白胨 10g,酵母粉5g,用ddH2O配制,再用10M NaOH调pH至(1000mL一般加450ul),高压蒸汽灭菌15min冷却后使用。2、固体培养基:

2、LB培养基中加入琼脂至,高压蒸汽灭菌15min后使用。3、10%(g/V) 氨苄青霉素钠(Ap): 注射用氨苄青霉素钠(粉末)50g溶于500ml无菌去离子水中,溶解后分装入4ml灭菌的EP管,全程超净工作台内操作,避免染菌,分装后20度保存,培养细菌时做1000使用。注:如果购买的氨苄青霉素粉末不是无菌包装的,溶解后需用滤膜过滤除菌后再分装。4、%(g/V)硫酸卡那霉素(Kan)注射用硫酸卡那霉素(液体)通常是2ml/支,内含卡那霉素。取25支药剂(50ml),加入450ml无菌去离子水中,分装入4ml灭菌的EP管,全程超净工作台内操作,避免染菌,分装后20度保存,培养细菌时做1000使用。

3、注:如果购买的卡那霉素是粉末状的非无菌包装,溶解后需用滤膜过滤除菌后再分装。5、细菌培养: 配制相应抗性培养基,每试管倒入34ml培养基(卡那霉素抗性培养采用标记试管),无菌牙签挑取单克隆至试管中,于37,220rpm培养。剩余培养基做好抗性和日期标记,置于4保存。6、化学感受态制备:1)原理:: 细菌处于容易吸收外源DNA的状态叫感受态,这时的菌细胞称为感受态细胞(Competent cell)。将细菌置于0,低渗CaCl2 溶液中时,菌细胞壁和膜的通透性增强,菌体膨胀成球型。外源DNA与Ca2+形成抗DNase的羟基-钙磷酸复合物黏附于细胞表面,在经42短暂的热冲击处理(一般热休克90s)

4、后能促进细胞吸收外源DNA复合物。2)仪器、材料与试剂: 超净工作台、低温离心机、摇床、-80冰箱,装液氮的泡沫盒及液氮、50ml的离心管2个,50ml的注射器及小过滤器各1个。高压灭菌的纸张、透气膜、的EP管约350-500个,两块10cm的平皿板及接种环。TB缓冲液:每200ml液体中含、Kcl、PIPES。(注:在电子天平上的误差50mg,因在PH=易溶故先将其它药品用超纯水溶解,并用KOH及HCL调PH至。在加入溶解后用超纯水定溶至相应的量,采用50ml的注射器及小过滤器过滤,一般储存在-20,时间25天,否则易被氧化颜色呈粉红。)LB液体培养基:参见前面介绍。 LB固体培养基:参见前

5、面介绍。1管DH5的菌种3)步骤: 倒无抗性的固体培养板,用接种环沾取感受态甘油菌画线,置于37恒温培养箱中培养过夜。 在超净台里采用小枪尖挑取培养板中的单克隆菌(菌落的大小约23mm)转接于200250ml的LB液体培养基中,盖上透气膜。 置于摇床上,18、200- 250rpm速度摇约需35天,使OD600=(对数生长期或对数生长前期)时开始制备。 取出TB缓冲液及无菌的50ml离心管置于4冰浴中,预冷低温高速离心机(4、2500rpm、10min)。 在50ml的离心管中加入约35ml-45ml的菌液,在4中冰浴10min。 取出后放置于离心机上离心4、2500rpm、10min。弃上清

6、液,在灭过菌的吸水纸上扣干(可重复多次收集菌体),先用约515ml的TB缓冲液重悬,再加至35ml的量(在冰上操作)冰浴10min。 重复+的步骤一次。 在35ml的TB缓冲液重悬后缓慢加入终浓度为7%的DMSO,混匀后在冰上冰浴10min。 分装成100-150ul/管(的EP管)浸入液氮中速冻,分装约300多管后转移放置于-80冰箱保存。4)转化效率的评估: 采用小量质粒快转(冰浴10min42热休克90s冰浴2min加无抗性LB液体培养基200ul37摇床复温培养30min)。 涂Kn、AP抗性板并做阴性对照(采用ddH20代替鉴定用的大提标准质粒),可以评价出是否有染菌、突变、转化效率

7、。 可以用Er2566等感受态做平行对照,评估其的生长快慢情况及转化效率的高低。转化效率=转化子总数/质粒DNA加入量(1ug/ul),标准质粒为大提用的N31-EGFP。5)注意事项: 严格按照标准操作步骤,整个操作过程要注意温度(4冰上操作)且洁净的超净台环境防止污染。直接从-80取出的菌株培养致敏后比连续使用或4短期保存的细菌的转化率要高,一般是受体菌应处于对数生长期或生长前期即OD600=。转化鉴定时,42准确热休克90s不要振荡,迅速置于冰上2min,按照标准操作步骤进行评估。一般是感受态制备好在-80冰箱冻存2天后再做鉴定,更准确评估。质粒分子量的大小对转化效率也有影响,一般来说,

8、随着质粒分子量的增大,其转化效率会相应地降低。但当质粒在时,所得的转化率基本一致。7、电转感受态制备:1)准备工作:(提前一天)1、250ml LB液体盛于1L三角瓶中;2、1L超纯水;500mL离心管两支;10%甘油400mL;3、离心管和200ul枪头若干以上物品,120灭菌20分钟后 置于4保存备用4、电转杯经纯水洗净后这置于75%乙醇浸泡5、挑ER2738菌单克隆,接种于4mlTet抗性的LB中,于37 190rpm过夜振荡培养。2)感受态制备:1、取前一夜扩增的菌液3ml接种于 250mlTet抗性LB中,37 240rpm振荡培养,约2-3小时OD值可达(其间每1小时测一次OD,其

9、值在之间均可,但在时效率最好);2、将菌液置于冰水混合物中冷浴30分钟。同时将前一夜置于4保存的物品取出,置于冰水混合物中冷浴30分钟,同时将离心机预冷到4;3、将菌液全部转入500ml离心管中,2500rpm,4离心10分钟;4、弃上清,向离心管中加入约100ml预冷的无菌水,在冰水混合物中摇晃瓶身,使沉淀充分悬起,然后再补加200ml无菌水,与离心机中4000rpm,4 下离心10分钟;5、重复步骤4两次;6、以10%甘油代替无菌水重复步骤4一次;在离心的过程中将离心管插入冰中预冷;7、充分弃上清,加入200ul10%甘油,要换瓶身,使沉淀充分悬起,用预冷的枪头按100ul/支分装细胞于离

10、心管中;8、将分装好的细胞放入-80保存。3)质量控制:将电转杯从乙醇中取出,置于超净台中,用无菌风吹4小时从-80取出一支感受态,立即放入冰盒里;取1ul标准质粒(1ug/ml)加入感受态中,混匀后,加入预冷的电转杯中;将电转条件设为,电击2-3秒,立即加入1mlSOC培养基并混匀;将混合物转入离心管中于37,200rpm振荡恢复半小时;用LB将培养物稀释至103涂于Amp固体培养基上,倒置于37温箱中,过夜培养。计算效率:效率=菌落数103103。二、DNA操作系统1、溶液 I:葡萄糖50mmol/L,EDTA 10mmol/L,Tris-HCl 25mmol/L,。2、溶液 II:NaO

11、H L,SDS 1%,用ddH2O现配现用。3、溶液 :取5mol/L NaAc 60mL,冰乙酸,混合后加ddH2O至100mL。4、酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)以25:24:1的比例混匀平衡酚、氯仿、异戊醇,保存于棕色玻璃瓶中,上覆一层Tris-Cl水相,4储存备用。5、TE缓冲液:10mmol/L Tris-Cl ,1mmol/L EDTA ,灭菌后使用。实验室中配有100的TE母液,用时可用ddH2O稀释成1使用液,灭菌后使用。6、L CaCl2:在适量纯水中溶解54g ,定容至100mL,高压除菌后保存于4备用。7、10DNA上样buffer:母液:以500ml为例: 蔗糖:2

12、00g,溴酚蓝:, 取去离子水定容至500ml,完全溶解后放置于4保存。*该母液配制完正常颜色为棕红色,颜色与pH值有关;存储时间较长,每次使用时需摇匀,并注意是否长菌。染料:SYBER Green I(Molecular Probe)10,000每次取50ul染料加入50ml母液中,充分摇匀。分装于避光管中,即为10DNA上样buffer,配制好的buffer均需避光4保存。*配制者需督促使用者及时将避光管放回4,并经常检查溶液存量,染料需提前订购。8、RNase A(DNase free):RNase A干粉(Ameresco)溶解于L的CH3COONa(pH )中,使终浓度为1mg/ml

13、,加热至100,15min,室温冷却。用体积的1M Tris-Cl调pH至后,分装,于-20冻存。*500ul/管分装,供分子克隆实验使用;3ml/管分装,供大提质粒使用。RNase A干粉需提前订购,及时检查使用情况。三、蛋白质操作系统(一)、电泳1、30%丙烯酰胺将29g丙烯酰胺和1g N,N-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中,于磁力搅拌器上搅拌至完全溶解。补加水至终体积为100ml。以m孔径过滤溶液,去除不溶性杂质。查证该溶液的pH值应不大于,置棕色瓶中保存于室温。注意事项:丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具

14、。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。2、 Tris-HCl 400ml 水中溶解Tris-Base , 浓盐酸调PH至后定容至500ml3、 Tris-HCI400ml 水中溶解Tris-Base , 浓盐酸调PH至后定容至500ml4、10%SDS900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68助溶,加入几滴浓盐酸调节pH值至,加水定容至1L,分装备用。5、10过硫酸铵称取过硫酸铵2g,适量水溶解后,定容至20mL,分装成1mL/管,于-20保存备用。6、蛋白上样Buffer(6蛋白加样缓冲液)称取十二烷基硫酸钠12g、溴酚蓝,1M Tris-Cl (

15、pH= 30ml、甘油60ml、巯基乙醇5ml,定容至100ml。7、蛋白质电泳buffer(5)称取三羟甲基氨基甲烷、甘氨酸、十二烷基硫酸钠, 在水中溶解并定容至1L。(二) 染色1、染色液(考马斯亮蓝染液)甲醇45,冰乙酸10,去离子水45,加考马斯亮蓝R-250或G-250至%,过滤后使用。 2、10脱色液称取KCl ,加水定容至1L3、蛋白快速银染所需溶液(1)固定液:400mL 甲醇,500uL甲醛,加水定容至1L;(2)20% AgNO3溶液:20g AgNO3加水定容至100mL;(3)Na2S2O3溶液: Na2S2O33H2O,加水定容至1L;(4)显色液(未加甲醛):30g

16、 NaCO3,20mL 上述Na2S2O3溶液,加水定容至1L,(临用前加入甲醛,甲醛量如何确定)。(5)柠檬酸: C6H8O73H2O,加水定容至1 L。(三) 杂交1、电转液:称取TrisBase ,甘氨酸,先加4L水溶解,再加甲醇1200ml, 定容至6L。2、10TN:称取NaCl , Tris , 加入浓盐酸调节至PH ,定容至5L 。 3、封闭液(WB用): 称取5g 脱脂奶粉,加入TN,定容至100ml。4、TNT:TN中加 Tween-20至%。5、AP底物:氯化钠, ,TrisBase ,加水溶解,加浓盐酸320ul调节pH至, 定容至500ml注意事项:NBT、BCIP、N

17、-N-二甲基甲酰胺为有毒试剂,戴乳胶手套在通风橱中操作。配制用的EP管最好采用新管子,防止漏液,用后的空管注明有毒,用PE手套或是塑料袋包好再丢弃。6、NBT配制:500mg NBT粉末溶于7ml N-N-二甲基甲酰胺,3ml 去离子水中,颠倒混匀,溶解即可。7、BCIP配制:100mg BCIP粉末溶于10ml N-N-二甲基甲酰胺中,颠倒混匀,溶解即可。(四) 纯化1、10裂解液:50mmol/LTris-HCl(),10mmol/LEDTA,300mmol/LNaCl.。2、Buffer I:20mmol/LTris-HCl,5mmol/LEDTA,100mM NaCl。3、8M Ure

18、a:称取480g的尿素,用Buffer I定容至1升即可。四、细胞培养相关(一)胰酶的配制:(浓度为1 ,1L)1、认真清洗配制容器,自来水20遍,去离子水5遍,超纯水润洗3遍。2、称取牛胰蛋白酶;EDTA 2 g;3、用超纯水溶解;4、磁力搅拌器搅拌至胰酶完全溶解,溶液变得澄清;5、超纯水定容至1L;6、不锈钢滤器加滤纸两张高温灭菌后,在超净工作台过滤;7、在血清瓶中加入少量滤好的胰酶,置于细胞培养箱中检测是否染菌,其余置于4待用;8、过滤后洗净滤器再次灭菌,避免残留的胰酶降解蛋白。(二)DMEM配制:1、所需试剂及材料:试剂: DMEM干粉(GIBCO 10L)、超纯水(Milli-Q)、

19、Na2CO3 (Sigma)材料:10L玻璃瓶、 500ml盐水瓶(灭菌)、 滤膜、 滤器(事先放好两层滤膜并高压灭菌)、磁力搅拌器 大号搅拌子 蠕动泵 胶塞2、操作步骤:(1)10L玻璃瓶洗涤,自来水20遍,去离子水5遍,超纯水润洗3遍。(2)在10L玻璃瓶中加入超纯水,将DMEM干粉倒入,在磁力搅拌器上搅拌溶解。(3)按照L 加入Na2CO3 。(4)调节pH值至。(5)过滤分装,并注明名称及配制日期。此过程注意无菌操作!(6)最后用血清瓶取10ml左右置于细胞培养箱中检测是否染菌。(7)清洗滤器,10L玻璃瓶,软管,将所有实验器具归位。(三) 1640、MEM培养基的配制同上, Na2C

20、O3的用量见包装说明(四)细胞间100双抗(青霉素、链霉素)的配制青霉素及链霉素配制的终浓度为1万单位/毫升。配制的步骤以400ml为例:1.认真清洗配制容器,自来水20遍,去离子水5遍,超纯水润洗3遍。2.准备5瓶青霉素(80万单位/瓶)、4瓶链霉素(100万单位/瓶)。3.加入1-2ml细胞间专用PBS进入青霉素、链霉素的瓶子内,浸泡后吹吸数次至全部溶解,溶解后的液体吸入配制容器内。用PBS再次润洗装有青霉素及链霉素的小瓶子,将残留的青霉素及链霉素溶解,将液体并入配制容器内,重复润洗2次。4.用细胞间专用PBS定容至400ml,搅拌均匀。5.将配制的母液用的滤膜过滤除菌,分装到灭菌后的4m

21、l EP管内,2ml/ 管,冻存于-20。( 4mlEP管需提前一天灭菌,烘干过夜。)(五)100 L-谷氨酰胺配制(浓度200mM= L )所需试剂及材料:L-谷氨酰胺干粉(Sigma)、 超纯水(Mili-Q)、 1L烧杯、量筒、4ml EP管(灭菌)。步骤:1认真清洗配制容器,自来水20遍,去离子水5遍,超纯水润洗3遍。2称取相应质量的L-谷氨酰胺干粉,用超纯水溶解后,小滤器过滤除菌。按需要分装(如2ml/管) -20保存。注:勿高压灭菌,过滤后,尽快分装,切勿放在4过久!(六)100 丙酮酸钠配制 (浓度100mM 11g/L)所需试剂及材料:丙酮酸钠(Sigma) 超纯水(Mili-

22、Q) 1L烧杯,量筒, EP管(灭菌)步骤:1认真清洗配制容器,自来水20遍,去离子水5遍,超纯水润洗3遍2称取相应质量的丙酮酸钠干粉,用超纯水溶解后,小滤器过滤除菌。按需要分装(如1ml/管) -20保存。注:勿高压灭菌 过滤后,尽快分装,切勿放在4过久!(七)Verson配制1.洗净容器:自来水10遍,去离子水5遍,超纯水3遍。2.配制Verson(超纯水配制):Verson (1)(g/L)KClKH2PO4NaClNaHCO3Na2HPO412H20EDTA3.分装到500ml盐水瓶,盖上胶塞(不用灭菌,煮过即可),插上针头(10mL以下的注射器针头),包上铝箔纸。4.120,20mi

23、n高压湿热灭菌,灭菌后,摆放至细胞间指定位置。(八)细胞间PBS配液 PBS 缓冲液配方:【1L体系】NaCl g,KCl g,Na2HPO412H2O g,KH2PO4 g调整pH 至具体步骤:1. 清洗配液瓶,自来水10遍,去离子水5遍,超纯水3遍。(一般使用细胞间配液瓶10 L 体系);2. 按上述配方准确称量物品,倒入配液瓶(注意:若药品潮解,应更换);3. 加入超纯水(细胞间配液用,R206),定容至准确体系,溶解完全;4. 使用细胞间pH计,调配pH至;5. 使用细胞间灭菌过的500mL 盐水瓶进行分装,标记,加橡胶塞针头,120,20min高压湿热灭菌;6. 灭菌完,摆放至细胞间

24、相应位置。(九)磷酸钙转染试剂配制试剂前,认真清洗配制容器,自来水10遍,去离子水5遍,超纯水3遍。CaCl2 M (500ml) (MW 147) SigmaUltra C5080 g 溶解于500ml超纯水,小滤器过滤除菌。50ml样品管分装后,冻存于-20C 。HeBS 2x (1000ml)NaCl (MW SigmaUltra S7653 g M final) HEPES (MW SigmaUltra H7523 g final) Na2HPO4, anhydrous (MW 142) SigmaUltra S7907 g mM final) 800 ml超纯水溶解后,用1Mol N

25、aOH溶液调PH值至,然后定容至1000ml。(准确的PH值对转染效率非常重要,请用细胞间内的精密PH计测量PH值,测量前要校正PH计,线型要在99101)小滤器过滤除菌。50ml样品管分装后,冻存于-20C 。(十)酸液配制(1L):重铬酸钾 120g浓硫酸 200ml去离子水补至 1000ml具体步骤:1 在通风橱中架好塑料桶和搅拌器,确保稳定,不会侧翻。2 在塑料桶中10L、15L、20L的位置划好刻度线,以利于后续步骤的定容。3 在塑料桶中加入半桶去离子水,开动磁力搅拌器,缓慢倒入浓硫酸(硫酸遇水放热,倒太快会导致液体飞溅)。4 缓慢倒入重铬酸钾,定容后,搅拌至完全溶解。注意事项:废酸

26、液应先用工业级的NaOH中和后方可倒往下水道,否则会腐蚀水管、污染环境,中和过程中会大量放热。五、单克隆抗体制备系统1、PRMI 1640HT培养基(10L):PRMI 1640干粉10包(10L),称取丙酮酸钠(Sodium Pyruvate,S)10L,适量ddH2O溶解后加入。称取黄嘌呤(hypoxanthn,H) 10L胸腺嘧啶核苷(thymidine,T)10L +谷氨酰胺(L-Glutamine,L-Glu)10L,置适量ddH2O 中在4550条件下溶解后加入。加ddH2O至10L,补加NaHCO3 20g/10L。用1mol/L HCl调节pH至(经验值是3ml/10L)。过滤

27、除菌。取少量的培养液置培养瓶中并放入 CO2培养箱中,一周后,如培养中未长菌,同一期配制的基础培养液方可使用。2、PRMI 1640培养基:PRMI 1640HT培养基配制时不加H(黄嘌呤)和T (胸腺嘧啶核苷)即可。3、过氧乙酸: 100ml的H2O2加入到200ml的乙酸中,再加入6ml浓H2SO4,放置过夜即可。4、细胞冻存液: 90mL胎牛血清10mL DMSO(二甲亚砜),4冻存。 EIA系统六、EIA系统(一)常用溶液: 1、20(1L):Na2CO3 ;NaHCO3 2、10(1L):Na2HPO47H2O ;NaH2PO4 3、2ED:1XPBS+%酪蛋白+2%明胶+%防腐剂(

28、proclin-300)(二)基本操作:1、标本的采取和保存大部分ELISA检测均以血清为标本。血清标本只要待血清自然凝固、血块收缩后即可取得。应注意避免溶血,红细胞溶解时会释放出具有过氧化物酶活性的物质,以HRP为标记的ELISA测定中,溶血标本可能会增加非特异性显色。冻结血清融解后,蛋白质局部浓缩,分布不均,应充分混匀宜轻缓,避免气泡,可上下颠倒混和,不要在混匀器上强烈振荡。混浊或有沉淀的血清标本应先离心或过滤,澄清后再检测。反复冻融会使抗体效价跌落,所以测抗体的血清标本如需保存作多次检测,宜少量分装冰存。2 试剂的准备 按试剂盒说明书的要求准备实验中需用的试剂。从冰箱中取出的试验用试剂应

29、待温度与室温平衡后使用。试剂盒中本次试验不需用的部分应及时放回冰箱保存。 3 加样 在ELISA中一般有3次加样步聚,即加标本,加酶结合物,加底物。加样时应将所加物加在ELISA板孔的底部,避免加在孔壁上部,并注意不可溅出,不可产生气泡。需稀释的样品可在板孔中加入稀释液,再在其中加入血清标本,然后在微型震荡器上震荡1分钟以保证混和。若每孔所加样品不同,每板的加样时间不宜超过7分钟,另一方面要注意不要造成孔间污染;加酶结合物和底物时可用定量多道加液器,使加液过程迅速完成。 4 保温 常见的ELISA中一般有两次抗原抗体反应,即加标本和加酶结合物后。抗原抗体反应的完成需要有一定的温度和时间,这一保

30、温过程称为温育(incubation),有人称之为孵育。 ELISA属固相免疫测定,抗原、抗体的结合只在固相表面上发生。以抗体包被的夹心法为例,加入板孔中的标本,其中的抗原并不是都有均等的和固相抗结合的机会,只有最贴近孔壁的一层溶液中的抗原直接与抗体接触。这是一个逐步平衡的过程,因此需经扩散才能达到反应的终点。在其后加入的酶标记抗体与固相抗原的结合也同样如此。这就是为什么ELISA反应总是需要一定时间的温育。37是实验室中常用的保温温度,也是大多数抗原抗体结合的合适温度。保温的方式本实验室为恒温箱中温育,为避免蒸发,板上应用封板膜覆盖板孔.反应板不宜叠放,板间要有一定的空间以保证各板的温度都能迅速平衡,另外,尽量不要将板紧贴恒温箱的侧壁,因侧壁的温度通常较高。应注意温育的温度和时间应按规定力求准确。为保证这一点,一个人操作时,一次不宜多于两块板同时测定。 5 洗涤 洗涤在ELISA过程中虽不是一个反应步骤,但却也决定着实验的成败。聚苯乙烯等塑料对蛋白质的吸附是普遍性的,而在洗涤时又应把这种非特异性吸附的干扰物质洗涤下来。洗板前要检查洗瓶中洗液是否够用,废液瓶中的废液是否超过警戒线,洗头的出液口与吸液口是否有堵塞,洗瓶、废液瓶、缓冲瓶瓶口是否旋紧,洗板程序是否正确。除包被后的洗板,一般洗板次数为5次,通常第一次洗板时不要离开,注意观察是否有异常,若没问

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