生物研究生开题报告模板.ppt

1、xxxxxxxx分子分子分子分子标记连锁图的构建标记连锁图的构建标记连锁图的构建标记连锁图的构建 报报 告告 人：人：指导教师：（研究员）指导教师：（研究员）主要内容主要内容1 国内外研究综述国内外研究综述 2 主要研究内容和研究意义主要研究内容和研究意义 3 研究材料和方法研究材料和方法 4 预期结果预期结果 5 研究进展研究进展 6 可行性和创新性分析可行性和创新性分析 7 可能出现的主要问题及解决方法可能出现的主要问题及解决方法 1 xx的基本生物学特性和产业现状的基本生物学特性和产业现状 一一 国内外研究综述国内外研究综述pxx主打品种的亲本来源较为局限，遗传多样性缺主打品种的亲本来源

2、较为局限，遗传多样性缺乏；乏；p近年来近年来xx生产中面临的问题日益严重；生产中面临的问题日益严重；p亟需拓宽亟需拓宽xx的遗传多样性，培养抗病、优质新品的遗传多样性，培养抗病、优质新品种。种。一一 国内外研究综述国内外研究综述2 国内外分子生物学研究现状国内外分子生物学研究现状p瓠瓜的分子生物学基础研究却远远落后于黄瓜、瓠瓜的分子生物学基础研究却远远落后于黄瓜、西瓜、甜瓜等其他瓜类作物；西瓜、甜瓜等其他瓜类作物；p目前主要依赖目前主要依赖RFLP、RAPD等分子标记对种质资等分子标记对种质资源进行遗传多样性研究；源进行遗传多样性研究；p最近本实验室利用最近本实验室利用Roche 454技术测

3、序了瓠瓜技术测序了瓠瓜10%的基因组；的基因组；p自主开发了自主开发了400对对SSR标记，并构建了基于标记，并构建了基于UPGMA的系统树图。的系统树图。一一 国内外研究综述国内外研究综述材料材料长度长度标记数标记数连锁群数连锁群数 平均间隔平均间隔黄瓜黄瓜RIL/F2群体群体 706cM13175.6cM西瓜西瓜测交群体测交群体1976cM360195.8cM甜瓜甜瓜瓠瓜瓠瓜RIL群体群体无无1116cM190155.9cM一一 国内外研究综述国内外研究综述（1）瓜类作物分子标记连锁图谱研究现状）瓜类作物分子标记连锁图谱研究现状3 瓜类作物分子遗传图谱研究进展瓜类作物分子遗传图谱研究进展（

4、2）遗传图谱构建意义和步骤）遗传图谱构建意义和步骤p遗传图谱的构建是分子生物学和基因遗传图谱的构建是分子生物学和基因组学研究的重要环节，是目的基因定组学研究的重要环节，是目的基因定位、标记辅助育种、背景选择和比较位、标记辅助育种、背景选择和比较基因组分析的前提；基因组分析的前提；p遗传图谱作图的基本原理是染色体的遗传图谱作图的基本原理是染色体的交换与重组。交换与重组。一一 国内外研究综述国内外研究综述 选择适选择适合的遗合的遗传标记传标记 构建构建群体群体 搜集遗搜集遗传标记传标记 构建构建连锁群连锁群 数据的处理分析，数据的处理分析，构建连锁群构建连锁群 建立一个能充分、准确反映染建立一个能

5、充分、准确反映染色体重组交换的分离群体色体重组交换的分离群体 搜集反映染色体交换信息的搜集反映染色体交换信息的遗传标记遗传标记 一一 国内外研究综述国内外研究综述研究内容：研究内容：二二 研究内容和意义研究内容和意义意义：意义：二二 研究内容和意义研究内容和意义技术路线技术路线三三 研究材料和方法研究材料和方法群体基因型分析群体基因型分析多态性分析多态性分析连锁作图连锁作图带型分析带型分析UU F2分离群体分离群体SSR基因型基因型数据化基因型数据化基因型F1SSR标记标记多态性多态性SSR引物引物xx分子标记连锁图分子标记连锁图比较基因图谱比较基因图谱已测序的模式基因组已测序的模式基因组比较

6、基因组学分析比较基因组学分析方法：方法：pDNA提取和提取和SSRs标记分析：标记分析：用改进的CTAB法提取DNA。首先在亲本间进行多态性标记筛选，选出的多态性引物进一步用于对F2群体的基因型分析。p连锁作图：连锁作图：对获得的标记基因型资料进行赋值，用卡平方法进行分离比的适合性测验。用软件对标记资料进行连锁分析，LOD值设定为3.0。利用函数计算遗传图距(cM)。三三 研究材料和方法研究材料和方法p图谱特征分析：图谱特征分析：p比较基因组学分析：比较基因组学分析：三三 研究材料和方法研究材料和方法p开发开发SSR引物引物1000对以上；对以上；p构建的构建的xx分子标记连锁图骨架图和其他研

7、究整合后，可分子标记连锁图骨架图和其他研究整合后，可构建一张高密度的分子标记连锁图；构建一张高密度的分子标记连锁图；p使用该高密度的分子标记连锁图和已定位的模式基因组使用该高密度的分子标记连锁图和已定位的模式基因组克隆比较分析，可绘制出比较基因组图谱。克隆比较分析，可绘制出比较基因组图谱。四四 预期结果预期结果五五 研究进展研究进展p现阶段，亲本已确定，而现阶段，亲本已确定，而F2群体也已构建完成群体也已构建完成。pSSR标记开发已完成，共开发出标记开发已完成，共开发出SSR标记标记1000对；对；p亲本亲本SSR标记筛选已完成，筛选出有多态的标记筛选已完成，筛选出有多态的SSR标记标记200

8、对对左右。左右。五五 研究进展研究进展六六 可行性和创新性分析可行性和创新性分析p可行性：可行性：p创新性：创新性：实验中出现的偏分离实验中出现的偏分离实验中出现的偏分离实验中出现的偏分离标记的处理标记的处理标记的处理标记的处理 共线性被打断区域的共线性被打断区域的共线性被打断区域的共线性被打断区域的比较基因组学分析比较基因组学分析比较基因组学分析比较基因组学分析 七七 可能出现的问题和解决方法可能出现的问题和解决方法起止日期起止日期主要研究内容主要研究内容预期期结果果2011.05-2011.12多多态引物的引物的筛选得到多得到多态性性SSR标记2012.01-2012.06F2群体基因型分析群体基因型分析得到分离群体得到分离群体SSR标记的基因型的基因型2012.07-2012.10带型分析型分析得到数据化基因型得到数据化基因型2012.11-2113.01连锁作作图和和比比较基因基因组学分析学分析得到分子得到分子标记连锁图和瓜和瓜类比比较图谱2013.02-2013.06发表表论文，文，毕业答答辩完成完成毕业论文文终稿稿研究进度及具体时间安排研究进度及具体时间安排